MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 6288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013665	AGTT	2	8	171	178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013665	ACAT	2	8	539	546	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013665	TCGA	2	8	656	663	25 %	25 %	25 %	25 %	282162671
4	NC_013665	GACC	2	8	1687	1694	25 %	0 %	25 %	50 %	282162671
5	NC_013665	CGCC	2	8	1846	1853	0 %	0 %	25 %	75 %	282162671
6	NC_013665	AGCC	2	8	1886	1893	25 %	0 %	25 %	50 %	282162671
7	NC_013665	CCAG	2	8	2793	2800	25 %	0 %	25 %	50 %	282162673
8	NC_013665	GCCC	2	8	3391	3398	0 %	0 %	25 %	75 %	282162674
9	NC_013665	CGCC	2	8	3539	3546	0 %	0 %	25 %	75 %	282162675
10	NC_013665	GCAG	2	8	3633	3640	25 %	0 %	50 %	25 %	282162675
11	NC_013665	ACGT	2	8	4136	4143	25 %	25 %	25 %	25 %	282162676
12	NC_013665	CCCG	2	8	4255	4262	0 %	0 %	25 %	75 %	282162676
13	NC_013665	CCTG	2	8	4580	4587	0 %	25 %	25 %	50 %	282162676
14	NC_013665	TTAT	2	8	5593	5600	25 %	75 %	0 %	0 %	282162677
15	NC_013665	GCCA	2	8	5617	5624	25 %	0 %	25 %	50 %	282162677
16	NC_013665	CGCC	2	8	6209	6216	0 %	0 %	25 %	75 %	282162677
17	NC_013665	CCCG	2	8	6301	6308	0 %	0 %	25 %	75 %	282162677
18	NC_013665	CTGA	2	8	6466	6473	25 %	25 %	25 %	25 %	282162677
19	NC_013665	CCAG	2	8	7091	7098	25 %	0 %	25 %	50 %	282162677
20	NC_013665	TCCT	2	8	8026	8033	0 %	50 %	0 %	50 %	282162678
21	NC_013665	CGCC	2	8	8501	8508	0 %	0 %	25 %	75 %	282162679
22	NC_013665	TGCT	2	8	8824	8831	0 %	50 %	25 %	25 %	282162680
23	NC_013665	CTTT	2	8	9806	9813	0 %	75 %	0 %	25 %	282162682
24	NC_013665	GGGT	2	8	9940	9947	0 %	25 %	75 %	0 %	282162683
25	NC_013665	TTCC	2	8	10115	10122	0 %	50 %	0 %	50 %	282162684
26	NC_013665	TGAT	2	8	10135	10142	25 %	50 %	25 %	0 %	282162684
27	NC_013665	TGCC	2	8	10230	10237	0 %	25 %	25 %	50 %	282162684
28	NC_013665	CCCG	2	8	10507	10514	0 %	0 %	25 %	75 %	282162684
29	NC_013665	GAGT	2	8	10826	10833	25 %	25 %	50 %	0 %	282162685
30	NC_013665	CGTC	2	8	12806	12813	0 %	25 %	25 %	50 %	282162688
31	NC_013665	GGCA	2	8	13024	13031	25 %	0 %	50 %	25 %	282162688
32	NC_013665	GCCC	2	8	13038	13045	0 %	0 %	25 %	75 %	282162688
33	NC_013665	GCCG	2	8	13948	13955	0 %	0 %	50 %	50 %	282162690
34	NC_013665	CTCG	2	8	14212	14219	0 %	25 %	25 %	50 %	282162690
35	NC_013665	CGCC	2	8	14421	14428	0 %	0 %	25 %	75 %	282162690
36	NC_013665	GCCA	2	8	14938	14945	25 %	0 %	25 %	50 %	282162691
37	NC_013665	TTCG	2	8	15310	15317	0 %	50 %	25 %	25 %	282162692
38	NC_013665	GGGC	2	8	15801	15808	0 %	0 %	75 %	25 %	282162693
39	NC_013665	GGGC	2	8	16556	16563	0 %	0 %	75 %	25 %	282162694
40	NC_013665	ACCG	2	8	16584	16591	25 %	0 %	25 %	50 %	282162694
41	NC_013665	GACC	2	8	16691	16698	25 %	0 %	25 %	50 %	282162694
42	NC_013665	TATT	2	8	16818	16825	25 %	75 %	0 %	0 %	282162694
43	NC_013665	CGGG	2	8	17045	17052	0 %	0 %	75 %	25 %	282162694
44	NC_013665	CTGG	2	8	17122	17129	0 %	25 %	50 %	25 %	282162695
45	NC_013665	CTCC	2	8	17925	17932	0 %	25 %	0 %	75 %	282162695
46	NC_013665	CTCG	2	8	18034	18041	0 %	25 %	25 %	50 %	282162695
47	NC_013665	GGCG	2	8	18046	18053	0 %	0 %	75 %	25 %	282162695
48	NC_013665	CGCC	2	8	18234	18241	0 %	0 %	25 %	75 %	282162696
49	NC_013665	GGAG	2	8	19372	19379	25 %	0 %	75 %	0 %	282162697
50	NC_013665	GGCG	2	8	19380	19387	0 %	0 %	75 %	25 %	282162697
51	NC_013665	CCCG	2	8	19400	19407	0 %	0 %	25 %	75 %	282162697
52	NC_013665	GGCA	2	8	19478	19485	25 %	0 %	50 %	25 %	282162697
53	NC_013665	GGCC	2	8	19739	19746	0 %	0 %	50 %	50 %	282162697
54	NC_013665	GGCG	2	8	20225	20232	0 %	0 %	75 %	25 %	282162697
55	NC_013665	CACG	2	8	20304	20311	25 %	0 %	25 %	50 %	282162698
56	NC_013665	CTGG	2	8	21129	21136	0 %	25 %	50 %	25 %	282162699
57	NC_013665	CGGC	2	8	23297	23304	0 %	0 %	50 %	50 %	282162701
58	NC_013665	CCTT	2	8	24138	24145	0 %	50 %	0 %	50 %	282162703
59	NC_013665	ATAA	2	8	24256	24263	75 %	25 %	0 %	0 %	282162703
60	NC_013665	CTTT	2	8	24837	24844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013665	GCAG	2	8	25118	25125	25 %	0 %	50 %	25 %	282162704
62	NC_013665	CTTT	2	8	25266	25273	0 %	75 %	0 %	25 %	282162704
63	NC_013665	CGAC	2	8	26103	26110	25 %	0 %	25 %	50 %	282162704
64	NC_013665	CCGG	2	8	26148	26155	0 %	0 %	50 %	50 %	282162704
65	NC_013665	AGGA	2	8	26189	26196	50 %	0 %	50 %	0 %	282162704
66	NC_013665	CCGG	2	8	26286	26293	0 %	0 %	50 %	50 %	282162704
67	NC_013665	CGCT	2	8	26828	26835	0 %	25 %	25 %	50 %	282162704
68	NC_013665	AATA	2	8	27047	27054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013665	CTGG	2	8	28337	28344	0 %	25 %	50 %	25 %	282162708
70	NC_013665	CGCC	2	8	28393	28400	0 %	0 %	25 %	75 %	282162708
71	NC_013665	GGTC	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	282162710
72	NC_013665	CGGG	2	8	29831	29838	0 %	0 %	75 %	25 %	282162710
73	NC_013665	ATAA	2	8	30049	30056	75 %	25 %	0 %	0 %	282162710
74	NC_013665	TCCA	2	8	30158	30165	25 %	25 %	0 %	50 %	282162710
75	NC_013665	CCGC	2	8	30567	30574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_013665	CTCG	2	8	31039	31046	0 %	25 %	25 %	50 %	282162711
77	NC_013665	CCTC	2	8	31128	31135	0 %	25 %	0 %	75 %	282162711
78	NC_013665	GACA	2	8	31201	31208	50 %	0 %	25 %	25 %	282162711
79	NC_013665	GCGG	2	8	31588	31595	0 %	0 %	75 %	25 %	282162711
80	NC_013665	CGTC	2	8	31668	31675	0 %	25 %	25 %	50 %	282162711
81	NC_013665	CGTG	2	8	31899	31906	0 %	25 %	50 %	25 %	282162711
82	NC_013665	CGGG	2	8	32055	32062	0 %	0 %	75 %	25 %	282162711
83	NC_013665	TGGA	2	8	32216	32223	25 %	25 %	50 %	0 %	282162711
84	NC_013665	GAGC	2	8	32239	32246	25 %	0 %	50 %	25 %	282162711
85	NC_013665	TCTG	2	8	32335	32342	0 %	50 %	25 %	25 %	282162711
86	NC_013665	TTAT	2	8	32839	32846	25 %	75 %	0 %	0 %	282162712
87	NC_013665	GGCC	2	8	33192	33199	0 %	0 %	50 %	50 %	282162712
88	NC_013665	CTCG	2	8	33553	33560	0 %	25 %	25 %	50 %	282162712
89	NC_013665	CGGA	2	8	34537	34544	25 %	0 %	50 %	25 %	282162714
90	NC_013665	CCAG	2	8	34673	34680	25 %	0 %	25 %	50 %	282162714
91	NC_013665	CCAG	2	8	35114	35121	25 %	0 %	25 %	50 %	282162714
92	NC_013665	TCCT	2	8	36843	36850	0 %	50 %	0 %	50 %	282162717
93	NC_013665	GGCC	2	8	36852	36859	0 %	0 %	50 %	50 %	282162717
94	NC_013665	GTGG	2	8	37016	37023	0 %	25 %	75 %	0 %	282162717
95	NC_013665	GCTC	2	8	37927	37934	0 %	25 %	25 %	50 %	282162718
96	NC_013665	ACCC	2	8	37945	37952	25 %	0 %	0 %	75 %	282162719
97	NC_013665	GCCC	2	8	38153	38160	0 %	0 %	25 %	75 %	282162719
98	NC_013665	CCGG	2	8	38607	38614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013665	GGGC	2	8	39153	39160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013665	CAGG	2	8	39222	39229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013665	GGCG	2	8	40521	40528	0 %	0 %	75 %	25 %	282162722
102	NC_013665	GCTG	2	8	40998	41005	0 %	25 %	50 %	25 %	282162722
103	NC_013665	CATC	2	8	41175	41182	25 %	25 %	0 %	50 %	282162722
104	NC_013665	ATTA	2	8	41710	41717	50 %	50 %	0 %	0 %	282162722
105	NC_013665	TCAA	2	8	42332	42339	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013665	GTAC	2	8	42873	42880	25 %	25 %	25 %	25 %	282162723
107	NC_013665	GCCC	2	8	43178	43185	0 %	0 %	25 %	75 %	282162723
108	NC_013665	TGGC	2	8	43540	43547	0 %	25 %	50 %	25 %	282162724
109	NC_013665	CTCG	2	8	44582	44589	0 %	25 %	25 %	50 %	282162724
110	NC_013665	CTGC	2	8	44605	44612	0 %	25 %	25 %	50 %	282162724
111	NC_013665	CTTC	2	8	44899	44906	0 %	50 %	0 %	50 %	282162724
112	NC_013665	ACGG	2	8	45190	45197	25 %	0 %	50 %	25 %	282162724
113	NC_013665	CCGC	2	8	46127	46134	0 %	0 %	25 %	75 %	282162725
114	NC_013665	CCAT	2	8	46521	46528	25 %	25 %	0 %	50 %	282162725
115	NC_013665	CTAA	2	8	46543	46550	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013665	TCAT	2	8	47359	47366	25 %	50 %	0 %	25 %	282162726
117	NC_013665	GTCC	2	8	47394	47401	0 %	25 %	25 %	50 %	282162726
118	NC_013665	AGAA	2	8	47697	47704	75 %	0 %	25 %	0 %	282162727
119	NC_013665	GCCG	2	8	48223	48230	0 %	0 %	50 %	50 %	282162727
120	NC_013665	CCGG	2	8	48754	48761	0 %	0 %	50 %	50 %	282162727
121	NC_013665	AGGA	2	8	48839	48846	50 %	0 %	50 %	0 %	282162727
122	NC_013665	GAGG	2	8	49804	49811	25 %	0 %	75 %	0 %	282162727
123	NC_013665	CCGG	2	8	50224	50231	0 %	0 %	50 %	50 %	282162728
124	NC_013665	AAGA	2	8	50981	50988	75 %	0 %	25 %	0 %	282162728
125	NC_013665	TATT	3	12	51093	51104	25 %	75 %	0 %	0 %	282162729
126	NC_013665	CATC	2	8	51611	51618	25 %	25 %	0 %	50 %	282162729
127	NC_013665	TTAA	2	8	51989	51996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013665	CGAG	2	8	54715	54722	25 %	0 %	50 %	25 %	282162733
129	NC_013665	TCGT	2	8	54996	55003	0 %	50 %	25 %	25 %	282162733
130	NC_013665	GTGG	2	8	55639	55646	0 %	25 %	75 %	0 %	282162734
131	NC_013665	TCGT	2	8	55763	55770	0 %	50 %	25 %	25 %	282162734
132	NC_013665	GTAC	2	8	56151	56158	25 %	25 %	25 %	25 %	282162734
133	NC_013665	CTCG	2	8	56583	56590	0 %	25 %	25 %	50 %	282162734
134	NC_013665	CGCC	2	8	56820	56827	0 %	0 %	25 %	75 %	282162734
135	NC_013665	CGGG	2	8	57332	57339	0 %	0 %	75 %	25 %	282162734
136	NC_013665	AATA	2	8	57635	57642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013665	CCCT	2	8	57931	57938	0 %	25 %	0 %	75 %	282162735
138	NC_013665	CGCC	2	8	58647	58654	0 %	0 %	25 %	75 %	282162736
139	NC_013665	CTTT	2	8	58935	58942	0 %	75 %	0 %	25 %	282162736
140	NC_013665	GGCC	2	8	58960	58967	0 %	0 %	50 %	50 %	282162736
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142	NC_013665	GCTC	2	8	59462	59469	0 %	25 %	25 %	50 %	282162737
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