MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella paludicola SANAE chromosome

Total Repeats: 60015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013665	GTC	2	6	92122	92127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162773
2003	NC_013665	GAGGTT	2	12	92191	92202	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	282162773
2004	NC_013665	CTA	2	6	92220	92225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162773
2005	NC_013665	CGT	2	6	92238	92243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162773
2006	NC_013665	TTC	2	6	92261	92266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	282162773
2007	NC_013665	CGG	2	6	92274	92279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162773
2008	NC_013665	CTTCTC	2	12	92287	92298	0 %	50 %	0 %	50 %	282162773
2009	NC_013665	TGA	2	6	92379	92384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162773
2010	NC_013665	TGT	2	6	92537	92542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_013665	AGCG	2	8	92569	92576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2012	NC_013665	AAGC	2	8	92596	92603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_013665	GAT	2	6	92609	92614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_013665	AT	4	8	92636	92643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_013665	CCG	2	6	92690	92695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_013665	GCA	2	6	92729	92734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2017	NC_013665	GGC	2	6	92742	92747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_013665	CGT	2	6	92822	92827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162774
2019	NC_013665	CCATGA	2	12	92867	92878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	282162774
2020	NC_013665	CCA	2	6	92897	92902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	282162774
2021	NC_013665	GCC	2	6	92906	92911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162774
2022	NC_013665	CCG	3	9	92936	92944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162774
2023	NC_013665	CGT	2	6	92952	92957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162774
2024	NC_013665	TGG	2	6	92963	92968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	282162774
2025	NC_013665	GCG	2	6	92971	92976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162774
2026	NC_013665	GCC	2	6	93016	93021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162774
2027	NC_013665	GAC	2	6	93042	93047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162774
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2029	NC_013665	GAT	2	6	93087	93092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162774
2030	NC_013665	CCGG	2	8	93111	93118	0 %	0 %	50 %	50 %	282162774
2031	NC_013665	CGA	2	6	93131	93136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162774
2032	NC_013665	CGT	2	6	93170	93175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162774
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2034	NC_013665	CGG	2	6	93232	93237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162774
2035	NC_013665	GGC	2	6	93333	93338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162774
2036	NC_013665	GAC	2	6	93366	93371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162774
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2038	NC_013665	GAC	2	6	93532	93537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162774
2039	NC_013665	GAG	2	6	93594	93599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162774
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2041	NC_013665	CG	3	6	93660	93665	0 %	0 %	50 %	50 %	282162774
2042	NC_013665	GCGT	2	8	93682	93689	0 %	25 %	50 %	25 %	282162774
2043	NC_013665	A	7	7	93693	93699	100 %	0 %	0 %	0 %	282162774
2044	NC_013665	GCCC	2	8	93725	93732	0 %	0 %	25 %	75 %	282162774
2045	NC_013665	CGG	2	6	93740	93745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162774
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2047	NC_013665	C	7	7	93878	93884	0 %	0 %	0 %	100 %	282162774
2048	NC_013665	GAG	2	6	93916	93921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	282162774
2049	NC_013665	GAT	2	6	93954	93959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162774
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2051	NC_013665	GAT	2	6	94056	94061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162774
2052	NC_013665	TCG	2	6	94162	94167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162774
2053	NC_013665	ATG	2	6	94195	94200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162774
2054	NC_013665	GCC	2	6	94260	94265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162774
2055	NC_013665	GTC	2	6	94275	94280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	282162774
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2058	NC_013665	GCA	2	6	94385	94390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162775
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2071	NC_013665	TA	3	6	94997	95002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2072	NC_013665	AT	3	6	95015	95020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2075	NC_013665	GCCGT	2	10	95287	95296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2109	NC_013665	CAT	2	6	96576	96581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	282162777
2110	NC_013665	CGA	2	6	96585	96590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	282162777
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2122	NC_013665	CGG	2	6	97039	97044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	282162778
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2125	NC_013665	GCC	2	6	97140	97145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	282162778
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2127	NC_013665	GAT	2	6	97217	97222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	282162778
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2144	NC_013665	TA	3	6	97889	97894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2252	NC_013665	AGGC	2	8	102836	102843	25 %	0 %	50 %	25 %	282162783
2253	NC_013665	AGGC	2	8	102848	102855	25 %	0 %	50 %	25 %	282162783
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2365	NC_013665	GAG	2	6	107657	107662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2366	NC_013665	AGGA	2	8	107700	107707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_013665	GTA	2	6	107868	107873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2369	NC_013665	ACC	2	6	107934	107939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2370	NC_013665	G	6	6	107998	108003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2371	NC_013665	CCT	2	6	108049	108054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2372	NC_013665	ACG	2	6	108064	108069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2373	NC_013665	A	7	7	108113	108119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_013665	AAC	2	6	108170	108175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2375	NC_013665	CGC	2	6	108247	108252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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