MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 plasmid pMETVU01

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013408	ACC	2	6	105	110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013408	CTA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013408	AAC	2	6	228	233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013408	CCG	2	6	246	251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013408	AAG	2	6	263	268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013408	CCT	2	6	279	284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_013408	TCT	2	6	303	308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013408	ATT	3	9	330	338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013408	CTA	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013408	GAA	2	6	668	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013408	CCA	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013408	GGT	2	6	754	759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013408	TGA	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013408	TCC	2	6	908	913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403860
15	NC_013408	AGA	2	6	942	947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403860
16	NC_013408	GAA	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403860
17	NC_013408	GCG	2	6	1073	1078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403860
18	NC_013408	TTA	2	6	1368	1373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403861
19	NC_013408	ATT	2	6	1403	1408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403861
20	NC_013408	CCA	2	6	1497	1502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_013408	TTA	2	6	1530	1535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013408	AGT	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013408	AGG	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013408	CGG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403862
25	NC_013408	CTA	2	6	1862	1867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403863
26	NC_013408	ATA	2	6	1922	1927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403863
27	NC_013408	GGA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403864
28	NC_013408	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403864
29	NC_013408	TGA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403864
30	NC_013408	CTA	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403864
31	NC_013408	AGG	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403864
32	NC_013408	ACC	2	6	2672	2677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403865
33	NC_013408	TCT	2	6	2752	2757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403865
34	NC_013408	TTA	2	6	2830	2835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403865
35	NC_013408	CTC	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013408	TTA	2	6	2949	2954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013408	TAA	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013408	ACA	2	6	3058	3063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013408	ACC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403866
40	NC_013408	ACT	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403866
41	NC_013408	AGT	2	6	3459	3464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403866
42	NC_013408	AGA	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403866
43	NC_013408	CTC	2	6	3667	3672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403866
44	NC_013408	GGA	2	6	3749	3754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403866
45	NC_013408	TTA	2	6	3755	3760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403866
46	NC_013408	TCC	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013408	GCT	2	6	4164	4169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013408	AAG	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013408	CTA	2	6	4351	4356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013408	CCA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013408	CCA	2	6	4789	4794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013408	ACT	2	6	5021	5026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013408	ACT	2	6	5099	5104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013408	CGA	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013408	ATG	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013408	ATA	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013408	GGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403867
58	NC_013408	CTC	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403867
59	NC_013408	GGA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403867
60	NC_013408	TAG	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403868
61	NC_013408	AGG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403868
62	NC_013408	AAT	2	6	5670	5675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403868
63	NC_013408	TGA	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403869
64	NC_013408	AGG	3	9	5917	5925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
65	NC_013408	AAG	2	6	5976	5981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
66	NC_013408	GAG	3	9	5985	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
67	NC_013408	TAA	2	6	6020	6025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
68	NC_013408	ACC	2	6	6031	6036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
69	NC_013408	CTC	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403869
70	NC_013408	CAT	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
71	NC_013408	GAG	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
72	NC_013408	GAG	2	6	6357	6362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
73	NC_013408	GAG	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
74	NC_013408	TTA	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403869
75	NC_013408	CCG	2	6	6426	6431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	261403869
76	NC_013408	AAG	2	6	6474	6479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
77	NC_013408	TAC	2	6	6528	6533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
78	NC_013408	GGA	2	6	6553	6558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
79	NC_013408	AAG	2	6	6576	6581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
80	NC_013408	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403869
81	NC_013408	AAG	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403869
82	NC_013408	GAG	2	6	6678	6683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
83	NC_013408	AGG	2	6	6712	6717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
84	NC_013408	CCA	2	6	6727	6732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
85	NC_013408	GAG	2	6	6786	6791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
86	NC_013408	ATA	2	6	6856	6861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
87	NC_013408	CTC	2	6	6892	6897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403869
88	NC_013408	GGA	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
89	NC_013408	CTA	2	6	6993	6998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
90	NC_013408	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
91	NC_013408	GAG	2	6	7062	7067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
92	NC_013408	ACC	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403869
93	NC_013408	AAT	2	6	7262	7267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403869
94	NC_013408	CGA	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	261403869
95	NC_013408	GGA	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
96	NC_013408	GGA	2	6	7400	7405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
97	NC_013408	GAG	2	6	7416	7421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
98	NC_013408	GGA	2	6	7433	7438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403869
99	NC_013408	CTA	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403869
100	NC_013408	CGG	2	6	7570	7575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	261403869
101	NC_013408	ATT	2	6	7708	7713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
102	NC_013408	ATT	2	6	7762	7767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
103	NC_013408	TAC	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
104	NC_013408	CTT	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261403870
105	NC_013408	GGA	2	6	8043	8048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
106	NC_013408	TAT	2	6	8170	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261403870
107	NC_013408	CCA	2	6	8177	8182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261403870
108	NC_013408	TCC	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403870
109	NC_013408	GAG	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
110	NC_013408	TGA	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403870
111	NC_013408	GGT	2	6	8544	8549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403870
112	NC_013408	GTA	2	6	8834	8839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403870
113	NC_013408	AAG	2	6	8905	8910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403870
114	NC_013408	GAG	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
115	NC_013408	CTA	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
116	NC_013408	GGT	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261403870
117	NC_013408	GAG	2	6	9328	9333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403870
118	NC_013408	AAG	2	6	9345	9350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403870
119	NC_013408	CTA	2	6	9394	9399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261403870
120	NC_013408	GGA	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013408	AAG	2	6	9517	9522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
122	NC_013408	TAA	2	6	9527	9532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403871
123	NC_013408	AGG	2	6	9578	9583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
124	NC_013408	AGA	2	6	9603	9608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
125	NC_013408	AGG	2	6	9614	9619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
126	NC_013408	AGA	2	6	9629	9634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403871
127	NC_013408	CTC	2	6	9790	9795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403871
128	NC_013408	GAG	2	6	9802	9807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	261403871
129	NC_013408	TAA	2	6	9851	9856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403871
130	NC_013408	TGA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403871
131	NC_013408	TTA	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013408	CCA	2	6	10074	10079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013408	CTC	2	6	10165	10170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261403872
134	NC_013408	ATA	2	6	10180	10185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261403872
135	NC_013408	AGT	2	6	10283	10288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261403872
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138	NC_013408	AAG	2	6	10519	10524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261403872

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.