MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 1160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTTAAG	2	12	447	458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TCTTAT	2	12	1713	1724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402133
3	NC_013407	TTGCTT	2	12	2438	2449	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261402134
4	NC_013407	TGCTAT	2	12	5747	5758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261402137
5	NC_013407	TGGATA	2	12	6691	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402138
6	NC_013407	TTCGAA	2	12	10071	10082	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261402140
7	NC_013407	TTTCAT	2	12	12846	12857	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402143
8	NC_013407	CAATTT	2	12	14064	14075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402144
9	NC_013407	GTATCA	2	12	15956	15967	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261402147
10	NC_013407	CAAAAT	2	12	16573	16584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013407	CAACAG	2	12	17697	17708	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	261402148
12	NC_013407	ATTAAA	2	12	19413	19424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402150
13	NC_013407	CTAAAA	2	12	19960	19971	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402150
14	NC_013407	AGTTAA	2	12	21700	21711	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402152
15	NC_013407	CTCTTG	2	12	22172	22183	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	261402153
16	NC_013407	GTTGGT	2	12	24413	24424	0 %	50 %	50 %	0 %	261402156
17	NC_013407	CTTTTG	2	12	26281	26292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261402157
18	NC_013407	AAGATT	2	12	26759	26770	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013407	TAAATT	2	12	28551	28562	50 %	50 %	0 %	0 %	261402160
20	NC_013407	TTTTAC	2	12	29129	29140	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402160
21	NC_013407	ATAAAA	2	12	30330	30341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013407	TAAAAA	2	12	32594	32605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261402162
23	NC_013407	TAAAAA	2	12	34550	34561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013407	TTTTAT	2	12	34616	34627	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013407	ATCTCA	2	12	37174	37185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402167
26	NC_013407	CCTCTG	2	12	37508	37519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	261402167
27	NC_013407	AAATTA	2	12	39304	39315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013407	TTAATT	2	12	39343	39354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013407	TTATCT	2	12	41964	41975	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402171
30	NC_013407	GCTGAT	2	12	42117	42128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261402171
31	NC_013407	CCAACT	2	12	42477	42488	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	261402171
32	NC_013407	GGGAGG	2	12	43340	43351	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	261402172
33	NC_013407	TTTCAT	2	12	43482	43493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402172
34	NC_013407	TAGCAT	2	12	43576	43587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	261402172
35	NC_013407	AAATTA	2	12	44270	44281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013407	ATGATA	2	12	44986	44997	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402173
37	NC_013407	CATTAT	2	12	46077	46088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013407	ACTGGA	2	12	49813	49824	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	261402176
39	NC_013407	TCCAAC	2	12	51544	51555	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	261402178
40	NC_013407	TTTTAT	2	12	51679	51690	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402178
41	NC_013407	ATTGAT	2	12	54089	54100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261402181
42	NC_013407	AAATAA	2	12	55493	55504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261402183
43	NC_013407	CCAAAA	2	12	56085	56096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402184
44	NC_013407	TCAAAA	2	12	58188	58199	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402187
45	NC_013407	ATTGAT	2	12	59340	59351	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261402188
46	NC_013407	ATGTTG	2	12	59668	59679	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	261402188
47	NC_013407	TTAGAA	2	12	63704	63715	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402190
48	NC_013407	GTTTAT	2	12	64447	64458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	261402191
49	NC_013407	TTATAT	2	12	66468	66479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013407	ATTTGA	2	12	66705	66716	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261402194
51	NC_013407	TTTTTA	2	12	69322	69333	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402196
52	NC_013407	TTTTGA	2	12	70300	70311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	261402197
53	NC_013407	TCATTT	2	12	70812	70823	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402198
54	NC_013407	ACATCC	2	12	72628	72639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	261402199
55	NC_013407	ATTTTT	2	12	73048	73059	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402200
56	NC_013407	ATTTAT	2	12	77920	77931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402204
57	NC_013407	ATTTTT	2	12	78104	78115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402204
58	NC_013407	ATGAAG	2	12	81021	81032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261402207
59	NC_013407	AAAGAT	2	12	82409	82420	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402209
60	NC_013407	AAGATT	2	12	84721	84732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	261402211
61	NC_013407	ATTTTT	2	12	85703	85714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402212
62	NC_013407	TTTTAA	2	12	86090	86101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013407	ATTTTT	2	12	86621	86632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402213
64	NC_013407	TTTTTA	2	12	88061	88072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402213
65	NC_013407	CATTTA	2	12	89949	89960	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402213
66	NC_013407	TTTTTA	2	12	90594	90605	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402213
67	NC_013407	AGGTAG	2	12	91289	91300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	261402213
68	NC_013407	AATGAA	2	12	96123	96134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402217
69	NC_013407	AGAAAA	2	12	100399	100410	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	261402223
70	NC_013407	GATAAA	2	12	100517	100528	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402223
71	NC_013407	GTTAAT	2	12	103053	103064	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261402227
72	NC_013407	GAGTTA	2	12	104871	104882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402228
73	NC_013407	CAATAA	2	12	109662	109673	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402231
74	NC_013407	TCATTT	2	12	117833	117844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402237
75	NC_013407	TTAACT	2	12	119868	119879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402239
76	NC_013407	CTTTAA	2	12	122047	122058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402242
77	NC_013407	CTTTTT	2	12	124681	124692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	261402246
78	NC_013407	GTTGGA	2	12	124854	124865	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261402246
79	NC_013407	TGTTTT	2	12	125036	125047	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	261402246
80	NC_013407	AAATAA	2	12	128420	128431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013407	CGTTAG	2	12	128563	128574	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261402248
82	NC_013407	ATCTAC	2	12	129666	129677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402249
83	NC_013407	AGGCAA	2	12	132417	132428	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	261402252
84	NC_013407	TAAAAG	2	12	132949	132960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402253
85	NC_013407	AATGAG	2	12	137833	137844	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	261402257
86	NC_013407	TAAAAA	2	12	138949	138960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013407	TAAAGA	2	12	139130	139141	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402258
88	NC_013407	TCTAAA	2	12	139393	139404	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261402258
89	NC_013407	TTTTGG	2	12	140080	140091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402259
90	NC_013407	TAGAAA	2	12	143594	143605	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013407	TGATTT	2	12	147501	147512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	261402268
92	NC_013407	CTGTTT	2	12	150797	150808	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261402271
93	NC_013407	ACTTAA	2	12	152845	152856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261402273
94	NC_013407	TGGAGT	2	12	156976	156987	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	261402277
95	NC_013407	AAATAA	2	12	159938	159949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013407	TAAAGA	2	12	164148	164159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402286
97	NC_013407	TATGAT	2	12	164263	164274	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	261402286
98	NC_013407	AGTAAA	2	12	167890	167901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	CAATAT	2	12	169389	169400	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261402292
100	NC_013407	ACAAAT	2	12	169712	169723	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013407	TTTTTG	2	12	172811	172822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013407	AAATAT	2	12	172926	172937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013407	GGTTCT	2	12	175941	175952	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	261402297
104	NC_013407	TATAAA	2	12	176310	176321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	TAAAAT	2	12	178688	178699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013407	TATTTT	2	12	180226	180237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402301
107	NC_013407	TAATTT	2	12	181151	181162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013407	TTAATA	2	12	181213	181224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013407	TCATAT	2	12	181874	181885	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402303
110	NC_013407	ATCTAT	2	12	182929	182940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	261402303
111	NC_013407	TAATTT	2	12	183792	183803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	TAAAAT	2	12	185090	185101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013407	ATTTTA	2	12	188351	188362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013407	ATTTTA	2	12	189264	189275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	TCTAAC	2	12	189738	189749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402311
116	NC_013407	CAATAA	2	12	191178	191189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402313
117	NC_013407	TTTTAT	2	12	192860	192871	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402315
118	NC_013407	AACATA	2	12	194216	194227	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	261402316
119	NC_013407	TAAAAA	2	12	197159	197170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	261402320
120	NC_013407	ATTTTA	2	12	199108	199119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	TTTATT	2	12	199251	199262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	261402322
122	NC_013407	ACATTA	2	12	199445	199456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	261402322
123	NC_013407	ATTAAA	2	12	203124	203135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013407	GAAAAT	2	12	206646	206657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	261402330
125	NC_013407	TAAAAA	2	12	209855	209866	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013407	TTCCTC	2	12	210209	210220	0 %	50 %	0 %	50 %	261402334
127	NC_013407	TGTTTC	2	12	210672	210683	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261402335
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236	NC_013407	AAAATG	2	12	373266	373277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_013407	TTTTGG	2	12	379983	379994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402522
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245	NC_013407	GGCATT	2	12	384900	384911	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	261402525
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358	NC_013407	ATTCCC	2	12	568182	568193	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	261402732
359	NC_013407	CATTTT	2	12	570607	570618	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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484	NC_013407	ATCTTA	2	12	745847	745858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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