MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 1922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	ATTAA	2	10	200	209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TAAAA	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	TTATT	2	10	1587	1596	20 %	80 %	0 %	0 %	261402133
4	NC_013407	TTTTC	2	10	1958	1967	0 %	80 %	0 %	20 %	261402133
5	NC_013407	TATAT	2	10	2116	2125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013407	TTTTC	2	10	3410	3419	0 %	80 %	0 %	20 %	261402135
7	NC_013407	ATAGG	2	10	4593	4602	40 %	20 %	40 %	0 %	261402135
8	NC_013407	AATAA	2	10	4645	4654	80 %	20 %	0 %	0 %	261402135
9	NC_013407	TTTGC	2	10	6478	6487	0 %	60 %	20 %	20 %	261402137
10	NC_013407	TAGTT	2	10	9040	9049	20 %	60 %	20 %	0 %	261402138
11	NC_013407	TAAAA	2	10	9440	9449	80 %	20 %	0 %	0 %	261402139
12	NC_013407	CTGAT	2	10	10514	10523	20 %	40 %	20 %	20 %	261402140
13	NC_013407	AGCAA	2	10	12506	12515	60 %	0 %	20 %	20 %	261402142
14	NC_013407	ATCTT	2	10	13121	13130	20 %	60 %	0 %	20 %	261402143
15	NC_013407	TAATT	2	10	13495	13504	40 %	60 %	0 %	0 %	261402144
16	NC_013407	CAACC	2	10	15000	15009	40 %	0 %	0 %	60 %	261402146
17	NC_013407	CAAAA	2	10	15476	15485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013407	TCAGT	2	10	16083	16092	20 %	40 %	20 %	20 %	261402147
19	NC_013407	CTTTT	2	10	16198	16207	0 %	80 %	0 %	20 %	261402147
20	NC_013407	TTCTC	2	10	17373	17382	0 %	60 %	0 %	40 %	261402148
21	NC_013407	ATTAC	2	10	18521	18530	40 %	40 %	0 %	20 %	261402149
22	NC_013407	AAAAT	2	10	20420	20429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013407	TTAAA	2	10	20431	20440	60 %	40 %	0 %	0 %	261402152
24	NC_013407	GTATT	2	10	21012	21021	20 %	60 %	20 %	0 %	261402152
25	NC_013407	AATCA	2	10	22137	22146	60 %	20 %	0 %	20 %	261402153
26	NC_013407	TAAAA	2	10	23054	23063	80 %	20 %	0 %	0 %	261402155
27	NC_013407	CTTAT	2	10	23540	23549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013407	CGAAG	2	10	23868	23877	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013407	AAATA	2	10	24578	24587	80 %	20 %	0 %	0 %	261402156
30	NC_013407	ATCCT	2	10	27358	27367	20 %	40 %	0 %	40 %	261402158
31	NC_013407	CAAAA	2	10	28113	28122	80 %	0 %	0 %	20 %	261402160
32	NC_013407	ATTAA	2	10	29803	29812	60 %	40 %	0 %	0 %	261402160
33	NC_013407	AAAAT	2	10	33037	33046	80 %	20 %	0 %	0 %	261402162
34	NC_013407	AAAAT	2	10	33871	33880	80 %	20 %	0 %	0 %	261402163
35	NC_013407	CTTAT	2	10	34297	34306	20 %	60 %	0 %	20 %	261402163
36	NC_013407	TTACA	2	10	35338	35347	40 %	40 %	0 %	20 %	261402165
37	NC_013407	CTCAT	2	10	36463	36472	20 %	40 %	0 %	40 %	261402166
38	NC_013407	TTTTA	2	10	36880	36889	20 %	80 %	0 %	0 %	261402167
39	NC_013407	ACATC	2	10	37804	37813	40 %	20 %	0 %	40 %	261402167
40	NC_013407	ATAAC	2	10	39639	39648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013407	TATAT	2	10	40452	40461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013407	TTTTA	2	10	40905	40914	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
43	NC_013407	TTATT	2	10	40919	40928	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
44	NC_013407	TTTCA	2	10	41304	41313	20 %	60 %	0 %	20 %	261402170
45	NC_013407	TTATT	2	10	41348	41357	20 %	80 %	0 %	0 %	261402170
46	NC_013407	TGAGA	2	10	43511	43520	40 %	20 %	40 %	0 %	261402172
47	NC_013407	TATGA	2	10	43628	43637	40 %	40 %	20 %	0 %	261402172
48	NC_013407	ATAAA	2	10	44529	44538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013407	CTCTT	2	10	45139	45148	0 %	60 %	0 %	40 %	261402173
50	NC_013407	TTTAT	2	10	45664	45673	20 %	80 %	0 %	0 %	261402173
51	NC_013407	TATCT	2	10	46193	46202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013407	ATTAA	2	10	46666	46675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013407	TTTGA	2	10	46861	46870	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013407	ACACT	2	10	47296	47305	40 %	20 %	0 %	40 %	261402175
55	NC_013407	ATGCC	2	10	47920	47929	20 %	20 %	20 %	40 %	261402175
56	NC_013407	TTCTT	2	10	48442	48451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013407	GATAT	2	10	49381	49390	40 %	40 %	20 %	0 %	261402176
58	NC_013407	ATAGT	2	10	50321	50330	40 %	40 %	20 %	0 %	261402177
59	NC_013407	TAATT	2	10	50573	50582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013407	TTTAA	2	10	50583	50592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013407	ATCCT	2	10	50814	50823	20 %	40 %	0 %	40 %	261402178
62	NC_013407	ATAAA	2	10	52223	52232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013407	TTTAC	2	10	53138	53147	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013407	TTCTT	2	10	53278	53287	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013407	AAGAG	2	10	56535	56544	60 %	0 %	40 %	0 %	261402185
66	NC_013407	TATTT	2	10	57623	57632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013407	TCTAT	2	10	57846	57855	20 %	60 %	0 %	20 %	261402187
68	NC_013407	AGTTT	2	10	58462	58471	20 %	60 %	20 %	0 %	261402187
69	NC_013407	GGATT	2	10	58823	58832	20 %	40 %	40 %	0 %	261402187
70	NC_013407	TTTAA	2	10	58897	58906	40 %	60 %	0 %	0 %	261402187
71	NC_013407	TATAA	2	10	59209	59218	60 %	40 %	0 %	0 %	261402187
72	NC_013407	GCTAT	2	10	59965	59974	20 %	40 %	20 %	20 %	261402188
73	NC_013407	ATAAA	2	10	60625	60634	80 %	20 %	0 %	0 %	261402188
74	NC_013407	TTATA	2	10	61145	61154	40 %	60 %	0 %	0 %	261402188
75	NC_013407	ATAAA	2	10	63969	63978	80 %	20 %	0 %	0 %	261402190
76	NC_013407	AAGAA	2	10	64419	64428	80 %	0 %	20 %	0 %	261402191
77	NC_013407	AGTTG	2	10	64617	64626	20 %	40 %	40 %	0 %	261402191
78	NC_013407	TTTAT	2	10	65200	65209	20 %	80 %	0 %	0 %	261402192
79	NC_013407	TGGAT	2	10	65958	65967	20 %	40 %	40 %	0 %	261402193
80	NC_013407	TTTTA	2	10	69700	69709	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
81	NC_013407	TTAAT	2	10	69987	69996	40 %	60 %	0 %	0 %	261402197
82	NC_013407	ATTTT	2	10	70253	70262	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
83	NC_013407	TTTAT	2	10	70661	70670	20 %	80 %	0 %	0 %	261402197
84	NC_013407	TAAAT	2	10	71186	71195	60 %	40 %	0 %	0 %	261402198
85	NC_013407	TAATT	2	10	71240	71249	40 %	60 %	0 %	0 %	261402198
86	NC_013407	TTTGC	2	10	72266	72275	0 %	60 %	20 %	20 %	261402199
87	NC_013407	TTTGT	2	10	72756	72765	0 %	80 %	20 %	0 %	261402199
88	NC_013407	TCATT	2	10	72856	72865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013407	ATTTT	2	10	73068	73077	20 %	80 %	0 %	0 %	261402200
90	NC_013407	ATTTA	2	10	74145	74154	40 %	60 %	0 %	0 %	261402201
91	NC_013407	CTTTT	2	10	74532	74541	0 %	80 %	0 %	20 %	261402201
92	NC_013407	CTTTT	2	10	76190	76199	0 %	80 %	0 %	20 %	261402203
93	NC_013407	TATTT	2	10	76767	76776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013407	ATTTT	2	10	77046	77055	20 %	80 %	0 %	0 %	261402204
95	NC_013407	CATTT	2	10	77290	77299	20 %	60 %	0 %	20 %	261402204
96	NC_013407	ATAAA	2	10	79092	79101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013407	AATTA	2	10	79230	79239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013407	TTATT	2	10	79247	79256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013407	ATTTA	2	10	79400	79409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013407	AAAAT	2	10	80074	80083	80 %	20 %	0 %	0 %	261402206
101	NC_013407	CCTCT	2	10	85494	85503	0 %	40 %	0 %	60 %	261402212
102	NC_013407	CATCC	2	10	85620	85629	20 %	20 %	0 %	60 %	261402212
103	NC_013407	TCTTT	2	10	87054	87063	0 %	80 %	0 %	20 %	261402213
104	NC_013407	TTCAA	2	10	87263	87272	40 %	40 %	0 %	20 %	261402213
105	NC_013407	TTTTA	2	10	87511	87520	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
106	NC_013407	TAAAT	2	10	87904	87913	60 %	40 %	0 %	0 %	261402213
107	NC_013407	TATCT	2	10	88651	88660	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
108	NC_013407	ATTTC	2	10	88793	88802	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
109	NC_013407	TTTTA	2	10	88885	88894	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
110	NC_013407	CTTTT	2	10	89515	89524	0 %	80 %	0 %	20 %	261402213
111	NC_013407	ATTCC	2	10	90579	90588	20 %	40 %	0 %	40 %	261402213
112	NC_013407	TTTAT	2	10	91193	91202	20 %	80 %	0 %	0 %	261402213
113	NC_013407	TCTAT	2	10	91217	91226	20 %	60 %	0 %	20 %	261402213
114	NC_013407	TATTT	2	10	91489	91498	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013407	TATCA	2	10	93705	93714	40 %	40 %	0 %	20 %	261402215
116	NC_013407	TATTT	2	10	94206	94215	20 %	80 %	0 %	0 %	261402216
117	NC_013407	AAAAT	2	10	95008	95017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013407	TAAAT	2	10	95537	95546	60 %	40 %	0 %	0 %	261402217
119	NC_013407	ATAAA	2	10	96518	96527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	TTTTA	2	10	96569	96578	20 %	80 %	0 %	0 %	261402218
121	NC_013407	CAACT	2	10	96854	96863	40 %	20 %	0 %	40 %	261402218
122	NC_013407	AGGTA	2	10	97288	97297	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013407	AGATG	2	10	97298	97307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013407	CCTAA	2	10	97970	97979	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_013407	AAACC	2	10	98314	98323	60 %	0 %	0 %	40 %	261402220
126	NC_013407	CATTG	2	10	98851	98860	20 %	40 %	20 %	20 %	261402221
127	NC_013407	GAAAA	2	10	99749	99758	80 %	0 %	20 %	0 %	261402222
128	NC_013407	AGGGG	2	10	100281	100290	20 %	0 %	80 %	0 %	261402223
129	NC_013407	CTACA	2	10	101594	101603	40 %	20 %	0 %	40 %	261402225
130	NC_013407	GAGAG	2	10	102736	102745	40 %	0 %	60 %	0 %	261402227
131	NC_013407	AGAAC	2	10	103188	103197	60 %	0 %	20 %	20 %	261402227
132	NC_013407	ATTGG	2	10	103845	103854	20 %	40 %	40 %	0 %	261402228
133	NC_013407	GTATG	2	10	104231	104240	20 %	40 %	40 %	0 %	261402228
134	NC_013407	GAAGA	2	10	104817	104826	60 %	0 %	40 %	0 %	261402228
135	NC_013407	ATTTA	2	10	105015	105024	40 %	60 %	0 %	0 %	261402229
136	NC_013407	AAAAG	2	10	107222	107231	80 %	0 %	20 %	0 %	261402230
137	NC_013407	ATCCT	2	10	108745	108754	20 %	40 %	0 %	40 %	261402231
138	NC_013407	GAAAT	2	10	109614	109623	60 %	20 %	20 %	0 %	261402231
139	NC_013407	TATAA	2	10	109862	109871	60 %	40 %	0 %	0 %	261402231
140	NC_013407	TTGTT	2	10	112309	112318	0 %	80 %	20 %	0 %	261402234
141	NC_013407	ATTTT	2	10	113445	113454	20 %	80 %	0 %	0 %	261402235
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155	NC_013407	ATAAC	2	10	128728	128737	60 %	20 %	0 %	20 %	261402248
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258	NC_013407	TATTT	2	10	229721	229730	20 %	80 %	0 %	0 %	261402365
259	NC_013407	TAAAA	2	10	230682	230691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_013407	TTTAA	2	10	238096	238105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_013407	TGATA	2	10	238110	238119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_013407	CATTT	2	10	240907	240916	20 %	60 %	0 %	20 %	261402374
274	NC_013407	TCCCC	2	10	241869	241878	0 %	20 %	0 %	80 %	261402374
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390	NC_013407	GATAA	2	10	351652	351661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
391	NC_013407	ATTAT	2	10	352257	352266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_013407	ATTTT	2	10	354728	354737	20 %	80 %	0 %	0 %	261402493
393	NC_013407	GCGTT	2	10	355521	355530	0 %	40 %	40 %	20 %	261402494
394	NC_013407	TTATT	2	10	356387	356396	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_013407	TTAAT	2	10	356409	356418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_013407	GAATT	2	10	357405	357414	40 %	40 %	20 %	0 %	261402497
397	NC_013407	TAAGA	2	10	357521	357530	60 %	20 %	20 %	0 %	261402497
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401	NC_013407	TTGTT	2	10	361367	361376	0 %	80 %	20 %	0 %	261402500
402	NC_013407	ATCTT	2	10	363704	363713	20 %	60 %	0 %	20 %	261402503
403	NC_013407	ATGGA	2	10	364478	364487	40 %	20 %	40 %	0 %	261402504
404	NC_013407	ATCTG	2	10	364575	364584	20 %	40 %	20 %	20 %	261402504
405	NC_013407	CAGAT	2	10	368045	368054	40 %	20 %	20 %	20 %	261402509
406	NC_013407	ATGGA	2	10	368134	368143	40 %	20 %	40 %	0 %	261402509
407	NC_013407	ATCCA	2	10	368696	368705	40 %	20 %	0 %	40 %	261402510
408	NC_013407	GAGAA	2	10	371191	371200	60 %	0 %	40 %	0 %	261402512
409	NC_013407	ACACC	2	10	372203	372212	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
410	NC_013407	ACACG	2	10	372602	372611	40 %	0 %	20 %	40 %	261402514
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