MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 5535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTAA	2	8	66	73	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TTAA	2	8	132	139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	TTAT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013407	AATA	2	8	689	696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013407	TATG	2	8	746	753	25 %	50 %	25 %	0 %	261402132
6	NC_013407	TAAC	2	8	1379	1386	50 %	25 %	0 %	25 %	261402133
7	NC_013407	CATT	2	8	1464	1471	25 %	50 %	0 %	25 %	261402133
8	NC_013407	ACAA	2	8	1688	1695	75 %	0 %	0 %	25 %	261402133
9	NC_013407	TAAA	2	8	2024	2031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013407	TAAA	2	8	2260	2267	75 %	25 %	0 %	0 %	261402134
11	NC_013407	CTTT	2	8	2386	2393	0 %	75 %	0 %	25 %	261402134
12	NC_013407	AATC	2	8	2567	2574	50 %	25 %	0 %	25 %	261402134
13	NC_013407	TTTC	2	8	2594	2601	0 %	75 %	0 %	25 %	261402134
14	NC_013407	CATA	2	8	2707	2714	50 %	25 %	0 %	25 %	261402134
15	NC_013407	TCAA	2	8	3989	3996	50 %	25 %	0 %	25 %	261402135
16	NC_013407	CTTC	2	8	4070	4077	0 %	50 %	0 %	50 %	261402135
17	NC_013407	CTTT	2	8	4439	4446	0 %	75 %	0 %	25 %	261402135
18	NC_013407	TTAG	2	8	4810	4817	25 %	50 %	25 %	0 %	261402136
19	NC_013407	CCTT	2	8	5084	5091	0 %	50 %	0 %	50 %	261402136
20	NC_013407	CAAA	2	8	5237	5244	75 %	0 %	0 %	25 %	261402136
21	NC_013407	CCCT	2	8	5377	5384	0 %	25 %	0 %	75 %	261402136
22	NC_013407	AATT	2	8	5621	5628	50 %	50 %	0 %	0 %	261402137
23	NC_013407	TTGA	2	8	5791	5798	25 %	50 %	25 %	0 %	261402137
24	NC_013407	AGTT	2	8	5987	5994	25 %	50 %	25 %	0 %	261402137
25	NC_013407	ATAA	2	8	6038	6045	75 %	25 %	0 %	0 %	261402137
26	NC_013407	ATTA	2	8	6296	6303	50 %	50 %	0 %	0 %	261402137
27	NC_013407	AACT	2	8	6467	6474	50 %	25 %	0 %	25 %	261402137
28	NC_013407	TCTT	2	8	6680	6687	0 %	75 %	0 %	25 %	261402138
29	NC_013407	TCCC	2	8	7637	7644	0 %	25 %	0 %	75 %	261402138
30	NC_013407	TTTC	2	8	7746	7753	0 %	75 %	0 %	25 %	261402138
31	NC_013407	CAGC	2	8	7806	7813	25 %	0 %	25 %	50 %	261402138
32	NC_013407	GTTT	2	8	7936	7943	0 %	75 %	25 %	0 %	261402138
33	NC_013407	TAAA	2	8	8321	8328	75 %	25 %	0 %	0 %	261402138
34	NC_013407	TTTA	2	8	8734	8741	25 %	75 %	0 %	0 %	261402138
35	NC_013407	TTTA	2	8	8824	8831	25 %	75 %	0 %	0 %	261402138
36	NC_013407	AAAT	2	8	8989	8996	75 %	25 %	0 %	0 %	261402138
37	NC_013407	GAAA	2	8	9669	9676	75 %	0 %	25 %	0 %	261402139
38	NC_013407	ATTA	2	8	9835	9842	50 %	50 %	0 %	0 %	261402139
39	NC_013407	ATAA	2	8	10382	10389	75 %	25 %	0 %	0 %	261402140
40	NC_013407	ATTT	2	8	10654	10661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013407	TTTC	2	8	10909	10916	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013407	GAAA	2	8	11035	11042	75 %	0 %	25 %	0 %	261402141
43	NC_013407	CTTA	2	8	11287	11294	25 %	50 %	0 %	25 %	261402141
44	NC_013407	AAAG	2	8	11475	11482	75 %	0 %	25 %	0 %	261402141
45	NC_013407	AACG	2	8	11846	11853	50 %	0 %	25 %	25 %	261402141
46	NC_013407	AAAC	2	8	12025	12032	75 %	0 %	0 %	25 %	261402141
47	NC_013407	ATTA	2	8	12394	12401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013407	TAGG	2	8	12576	12583	25 %	25 %	50 %	0 %	261402142
49	NC_013407	AGAA	2	8	12838	12845	75 %	0 %	25 %	0 %	261402143
50	NC_013407	TTGT	2	8	13355	13362	0 %	75 %	25 %	0 %	261402143
51	NC_013407	TTGA	2	8	13405	13412	25 %	50 %	25 %	0 %	261402144
52	NC_013407	ATTT	2	8	13541	13548	25 %	75 %	0 %	0 %	261402144
53	NC_013407	TAAT	2	8	14018	14025	50 %	50 %	0 %	0 %	261402144
54	NC_013407	TAAA	3	12	14293	14304	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013407	TTTC	2	8	14381	14388	0 %	75 %	0 %	25 %	261402145
56	NC_013407	TCTT	2	8	14495	14502	0 %	75 %	0 %	25 %	261402145
57	NC_013407	TTCT	2	8	14895	14902	0 %	75 %	0 %	25 %	261402146
58	NC_013407	ATTA	2	8	14928	14935	50 %	50 %	0 %	0 %	261402146
59	NC_013407	AATT	2	8	15138	15145	50 %	50 %	0 %	0 %	261402146
60	NC_013407	CATT	2	8	15266	15273	25 %	50 %	0 %	25 %	261402146
61	NC_013407	ATTA	2	8	15353	15360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013407	TAAT	3	12	15364	15375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013407	AATG	2	8	15524	15531	50 %	25 %	25 %	0 %	261402147
64	NC_013407	CTTA	2	8	16213	16220	25 %	50 %	0 %	25 %	261402147
65	NC_013407	ATAA	2	8	16285	16292	75 %	25 %	0 %	0 %	261402147
66	NC_013407	TTAA	2	8	16874	16881	50 %	50 %	0 %	0 %	261402148
67	NC_013407	GCTT	2	8	16957	16964	0 %	50 %	25 %	25 %	261402148
68	NC_013407	AATA	2	8	17170	17177	75 %	25 %	0 %	0 %	261402148
69	NC_013407	ATAG	2	8	17222	17229	50 %	25 %	25 %	0 %	261402148
70	NC_013407	TTAG	2	8	17723	17730	25 %	50 %	25 %	0 %	261402148
71	NC_013407	GAAG	2	8	17935	17942	50 %	0 %	50 %	0 %	261402148
72	NC_013407	ATAA	2	8	18017	18024	75 %	25 %	0 %	0 %	261402148
73	NC_013407	TAAC	2	8	18061	18068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013407	ATAG	2	8	18222	18229	50 %	25 %	25 %	0 %	261402149
75	NC_013407	CAAA	2	8	18490	18497	75 %	0 %	0 %	25 %	261402149
76	NC_013407	CATC	2	8	18680	18687	25 %	25 %	0 %	50 %	261402149
77	NC_013407	TCTA	2	8	18835	18842	25 %	50 %	0 %	25 %	261402149
78	NC_013407	CATG	2	8	18848	18855	25 %	25 %	25 %	25 %	261402149
79	NC_013407	CAAC	2	8	19212	19219	50 %	0 %	0 %	50 %	261402149
80	NC_013407	CAAC	2	8	19245	19252	50 %	0 %	0 %	50 %	261402149
81	NC_013407	CTTT	2	8	19432	19439	0 %	75 %	0 %	25 %	261402150
82	NC_013407	AATC	2	8	20680	20687	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
83	NC_013407	ATGC	2	8	21197	21204	25 %	25 %	25 %	25 %	261402152
84	NC_013407	ACAG	2	8	21358	21365	50 %	0 %	25 %	25 %	261402152
85	NC_013407	TTCT	2	8	21406	21413	0 %	75 %	0 %	25 %	261402152
86	NC_013407	CATA	2	8	21528	21535	50 %	25 %	0 %	25 %	261402152
87	NC_013407	TATC	2	8	21549	21556	25 %	50 %	0 %	25 %	261402152
88	NC_013407	TCCC	2	8	21974	21981	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_013407	ACTA	2	8	22128	22135	50 %	25 %	0 %	25 %	261402153
90	NC_013407	ATTT	2	8	22296	22303	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
91	NC_013407	AAAT	2	8	22399	22406	75 %	25 %	0 %	0 %	261402154
92	NC_013407	TTAT	2	8	22571	22578	25 %	75 %	0 %	0 %	261402154
93	NC_013407	TTAA	2	8	22625	22632	50 %	50 %	0 %	0 %	261402154
94	NC_013407	GTTT	2	8	22992	22999	0 %	75 %	25 %	0 %	261402155
95	NC_013407	AACA	2	8	23077	23084	75 %	0 %	0 %	25 %	261402155
96	NC_013407	AAAT	2	8	23173	23180	75 %	25 %	0 %	0 %	261402155
97	NC_013407	GTAT	2	8	23341	23348	25 %	50 %	25 %	0 %	261402155
98	NC_013407	GACA	2	8	23662	23669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_013407	CCCT	2	8	23769	23776	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_013407	CCCA	2	8	23912	23919	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_013407	CGCC	2	8	23978	23985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_013407	CAAT	2	8	24624	24631	50 %	25 %	0 %	25 %	261402156
103	NC_013407	AACT	2	8	24909	24916	50 %	25 %	0 %	25 %	261402156
104	NC_013407	AAAT	2	8	25499	25506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013407	TGTT	2	8	26145	26152	0 %	75 %	25 %	0 %	261402157
106	NC_013407	TAAA	2	8	26840	26847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013407	TGCA	2	8	27079	27086	25 %	25 %	25 %	25 %	261402158
108	NC_013407	TTAT	2	8	27557	27564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013407	ATTA	2	8	27587	27594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013407	AGAA	2	8	27855	27862	75 %	0 %	25 %	0 %	261402159
111	NC_013407	TAAT	2	8	28025	28032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013407	TTGT	2	8	28256	28263	0 %	75 %	25 %	0 %	261402160
113	NC_013407	CAGT	2	8	28592	28599	25 %	25 %	25 %	25 %	261402160
114	NC_013407	TCAT	2	8	29053	29060	25 %	50 %	0 %	25 %	261402160
115	NC_013407	CCAA	2	8	29299	29306	50 %	0 %	0 %	50 %	261402160
116	NC_013407	ATTG	2	8	29413	29420	25 %	50 %	25 %	0 %	261402160
117	NC_013407	TCTG	2	8	29448	29455	0 %	50 %	25 %	25 %	261402160
118	NC_013407	GAAA	2	8	29757	29764	75 %	0 %	25 %	0 %	261402160
119	NC_013407	ATAA	2	8	30276	30283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013407	ATTA	2	8	30297	30304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013407	TACT	2	8	30609	30616	25 %	50 %	0 %	25 %	261402161
122	NC_013407	TAGA	2	8	30947	30954	50 %	25 %	25 %	0 %	261402161
123	NC_013407	CGAT	2	8	31004	31011	25 %	25 %	25 %	25 %	261402161
124	NC_013407	GGCA	2	8	31190	31197	25 %	0 %	50 %	25 %	261402161
125	NC_013407	AGAA	2	8	31638	31645	75 %	0 %	25 %	0 %	261402161
126	NC_013407	CAAA	2	8	32461	32468	75 %	0 %	0 %	25 %	261402161
127	NC_013407	AAAC	2	8	32534	32541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013407	ACAA	2	8	32756	32763	75 %	0 %	0 %	25 %	261402162
129	NC_013407	CAAT	2	8	33370	33377	50 %	25 %	0 %	25 %	261402162
130	NC_013407	CTAT	2	8	33765	33772	25 %	50 %	0 %	25 %	261402163
131	NC_013407	TTCT	2	8	35833	35840	0 %	75 %	0 %	25 %	261402166
132	NC_013407	TCTT	2	8	35919	35926	0 %	75 %	0 %	25 %	261402166
133	NC_013407	CATT	2	8	36071	36078	25 %	50 %	0 %	25 %	261402166
134	NC_013407	TTTG	2	8	36185	36192	0 %	75 %	25 %	0 %	261402166
135	NC_013407	CAAC	2	8	36575	36582	50 %	0 %	0 %	50 %	261402166
136	NC_013407	CAAC	2	8	36596	36603	50 %	0 %	0 %	50 %	261402166
137	NC_013407	TCCC	2	8	36788	36795	0 %	25 %	0 %	75 %	261402166
138	NC_013407	AGAC	2	8	36814	36821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013407	AAGA	2	8	38426	38433	75 %	0 %	25 %	0 %	261402168
140	NC_013407	TGCT	2	8	38988	38995	0 %	50 %	25 %	25 %	261402168
141	NC_013407	GTTT	2	8	39110	39117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013407	TAAA	2	8	39173	39180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013407	AAAC	2	8	39288	39295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013407	CTTG	2	8	39834	39841	0 %	50 %	25 %	25 %	261402169
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