MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 plasmid pMEFER01

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013157	ATAA	2	8	58	65	75 %	25 %	0 %	0 %	256811521
2	NC_013157	CATG	2	8	219	226	25 %	25 %	25 %	25 %	256811521
3	NC_013157	TCAA	2	8	233	240	50 %	25 %	0 %	25 %	256811521
4	NC_013157	ATGT	2	8	587	594	25 %	50 %	25 %	0 %	256811521
5	NC_013157	TTTC	2	8	1124	1131	0 %	75 %	0 %	25 %	256811521
6	NC_013157	TATT	2	8	1387	1394	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013157	ATTC	2	8	1488	1495	25 %	50 %	0 %	25 %	256811522
8	NC_013157	CTAA	2	8	2203	2210	50 %	25 %	0 %	25 %	256811523
9	NC_013157	TTCT	2	8	2352	2359	0 %	75 %	0 %	25 %	256811523
10	NC_013157	AAAG	2	8	3025	3032	75 %	0 %	25 %	0 %	256811524
11	NC_013157	TTTA	2	8	3163	3170	25 %	75 %	0 %	0 %	256811525
12	NC_013157	CACC	2	8	3822	3829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_013157	AGAA	2	8	3950	3957	75 %	0 %	25 %	0 %	256811528
14	NC_013157	TGCT	2	8	3994	4001	0 %	50 %	25 %	25 %	256811528
15	NC_013157	ACTG	2	8	4572	4579	25 %	25 %	25 %	25 %	256811529
16	NC_013157	CTGC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	25 %	50 %	256811530
17	NC_013157	GCTT	2	8	5158	5165	0 %	50 %	25 %	25 %	256811530
18	NC_013157	CTTT	2	8	5175	5182	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
19	NC_013157	AAGC	2	8	5260	5267	50 %	0 %	25 %	25 %	256811530
20	NC_013157	TTTC	2	8	5274	5281	0 %	75 %	0 %	25 %	256811530
21	NC_013157	TAAC	2	8	5340	5347	50 %	25 %	0 %	25 %	256811530
22	NC_013157	TCCT	2	8	5459	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	256811530
23	NC_013157	TAAG	2	8	6034	6041	50 %	25 %	25 %	0 %	256811530
24	NC_013157	ATTT	2	8	6223	6230	25 %	75 %	0 %	0 %	256811530
25	NC_013157	TTCA	2	8	6409	6416	25 %	50 %	0 %	25 %	256811530
26	NC_013157	TTTA	2	8	6991	6998	25 %	75 %	0 %	0 %	256811531
27	NC_013157	AATG	2	8	7469	7476	50 %	25 %	25 %	0 %	256811531
28	NC_013157	GTAA	2	8	7708	7715	50 %	25 %	25 %	0 %	256811531
29	NC_013157	AATC	2	8	8607	8614	50 %	25 %	0 %	25 %	256811532
30	NC_013157	TTGT	2	8	8761	8768	0 %	75 %	25 %	0 %	256811532
31	NC_013157	CAAT	2	8	9604	9611	50 %	25 %	0 %	25 %	256811534
32	NC_013157	ATCA	2	8	9623	9630	50 %	25 %	0 %	25 %	256811534
33	NC_013157	TTTA	2	8	9774	9781	25 %	75 %	0 %	0 %	256811535
34	NC_013157	ATAA	2	8	10099	10106	75 %	25 %	0 %	0 %	256811536
35	NC_013157	AACT	2	8	10323	10330	50 %	25 %	0 %	25 %	256811537
36	NC_013157	TATC	2	8	10408	10415	25 %	50 %	0 %	25 %	256811537
37	NC_013157	ATCT	2	8	10424	10431	25 %	50 %	0 %	25 %	256811537
38	NC_013157	CATC	2	8	11536	11543	25 %	25 %	0 %	50 %	256811541
39	NC_013157	GAAT	2	8	12225	12232	50 %	25 %	25 %	0 %	256811543
40	NC_013157	AATA	2	8	12446	12453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013157	CCCA	2	8	12524	12531	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_013157	ATAA	2	8	12653	12660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013157	TTAT	2	8	13102	13109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013157	TTAT	2	8	13189	13196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013157	TTAT	2	8	13298	13305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013157	GCAG	2	8	13548	13555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013157	AAAT	2	8	13560	13567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013157	TTGA	2	8	13645	13652	25 %	50 %	25 %	0 %	256811545
49	NC_013157	GGAA	2	8	13653	13660	50 %	0 %	50 %	0 %	256811545
50	NC_013157	TTAA	2	8	13702	13709	50 %	50 %	0 %	0 %	256811545
51	NC_013157	ACAT	2	8	13811	13818	50 %	25 %	0 %	25 %	256811545
52	NC_013157	AGAT	2	8	15254	15261	50 %	25 %	25 %	0 %	256811545
53	NC_013157	GAAA	2	8	15498	15505	75 %	0 %	25 %	0 %	256811545
54	NC_013157	AAGA	2	8	15562	15569	75 %	0 %	25 %	0 %	256811545
55	NC_013157	GGTA	2	8	15745	15752	25 %	25 %	50 %	0 %	256811545
56	NC_013157	TGGA	2	8	16143	16150	25 %	25 %	50 %	0 %	256811546
57	NC_013157	GTTG	2	8	16407	16414	0 %	50 %	50 %	0 %	256811546
58	NC_013157	AATA	2	8	16614	16621	75 %	25 %	0 %	0 %	256811546
59	NC_013157	TTAA	2	8	16698	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	256811546
60	NC_013157	TGGA	2	8	16927	16934	25 %	25 %	50 %	0 %	256811546
61	NC_013157	ACAA	2	8	16979	16986	75 %	0 %	0 %	25 %	256811546
62	NC_013157	TTAA	2	8	17147	17154	50 %	50 %	0 %	0 %	256811546
63	NC_013157	TTGC	2	8	17550	17557	0 %	50 %	25 %	25 %	256811547
64	NC_013157	AATA	2	8	17724	17731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013157	GGAA	2	8	18417	18424	50 %	0 %	50 %	0 %	256811549
66	NC_013157	TACA	2	8	19214	19221	50 %	25 %	0 %	25 %	256811550
67	NC_013157	TTTC	2	8	19675	19682	0 %	75 %	0 %	25 %	256811550
68	NC_013157	ATGC	2	8	19800	19807	25 %	25 %	25 %	25 %	256811551
69	NC_013157	AATT	2	8	19808	19815	50 %	50 %	0 %	0 %	256811551
70	NC_013157	AGTG	2	8	19863	19870	25 %	25 %	50 %	0 %	256811551
71	NC_013157	TGTT	2	8	20283	20290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013157	TAAA	2	8	20360	20367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013157	TTCT	2	8	20817	20824	0 %	75 %	0 %	25 %	256811553
74	NC_013157	CTGG	2	8	21000	21007	0 %	25 %	50 %	25 %	256811553
75	NC_013157	GTTG	2	8	21305	21312	0 %	50 %	50 %	0 %	256811554
76	NC_013157	ACTA	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	256811554
77	NC_013157	ACAT	2	8	21874	21881	50 %	25 %	0 %	25 %	256811555
78	NC_013157	TTTC	2	8	22007	22014	0 %	75 %	0 %	25 %	256811555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.