MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_013156	ATT	2	6	1479584	1479589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
40002	NC_013156	ATTA	2	8	1479592	1479599	50 %	50 %	0 %	0 %	256811516
40003	NC_013156	A	6	6	1479606	1479611	100 %	0 %	0 %	0 %	256811516
40004	NC_013156	AGA	2	6	1479615	1479620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256811516
40005	NC_013156	T	6	6	1479646	1479651	0 %	100 %	0 %	0 %	256811516
40006	NC_013156	ATT	2	6	1479653	1479658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
40007	NC_013156	ATG	2	6	1479743	1479748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811516
40008	NC_013156	TTG	2	6	1479761	1479766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
40009	NC_013156	AG	3	6	1479777	1479782	50 %	0 %	50 %	0 %	256811516
40010	NC_013156	ACA	2	6	1479807	1479812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811516
40011	NC_013156	ATG	2	6	1479815	1479820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811516
40012	NC_013156	ATT	2	6	1479859	1479864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
40013	NC_013156	ATT	2	6	1479901	1479906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
40014	NC_013156	CTT	2	6	1479910	1479915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811516
40015	NC_013156	GAG	2	6	1480015	1480020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
40016	NC_013156	TGT	2	6	1480026	1480031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
40017	NC_013156	AGG	2	6	1480162	1480167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
40018	NC_013156	AGG	2	6	1480187	1480192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256811516
40019	NC_013156	TTG	2	6	1480255	1480260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
40020	NC_013156	TAC	2	6	1480317	1480322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811516
40021	NC_013156	TTA	2	6	1480367	1480372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811516
40022	NC_013156	GTT	2	6	1480377	1480382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811516
40023	NC_013156	TTAT	2	8	1480399	1480406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40024	NC_013156	GTTG	2	8	1480413	1480420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40025	NC_013156	GTT	2	6	1480455	1480460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40026	NC_013156	AGT	2	6	1480480	1480485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40027	NC_013156	AGA	2	6	1480518	1480523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40028	NC_013156	GTGTG	2	10	1480529	1480538	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
40029	NC_013156	AAC	2	6	1480612	1480617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40030	NC_013156	CAA	2	6	1480626	1480631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40031	NC_013156	A	6	6	1480636	1480641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40032	NC_013156	AAT	2	6	1480681	1480686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40033	NC_013156	A	7	7	1480697	1480703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40034	NC_013156	A	6	6	1480731	1480736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40035	NC_013156	A	7	7	1480756	1480762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40036	NC_013156	T	6	6	1480846	1480851	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40037	NC_013156	TCA	2	6	1480877	1480882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40038	NC_013156	T	6	6	1480886	1480891	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40039	NC_013156	ATC	2	6	1480906	1480911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40040	NC_013156	TA	3	6	1480918	1480923	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40041	NC_013156	TA	3	6	1480942	1480947	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40042	NC_013156	TAC	2	6	1480951	1480956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40043	NC_013156	AT	3	6	1480980	1480985	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40044	NC_013156	TTA	2	6	1481042	1481047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
40045	NC_013156	TCA	2	6	1481078	1481083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40046	NC_013156	TA	3	6	1481119	1481124	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40047	NC_013156	CTC	2	6	1481128	1481133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
40048	NC_013156	ACA	2	6	1481144	1481149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
40049	NC_013156	AT	3	6	1481160	1481165	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40050	NC_013156	CCAA	2	8	1481215	1481222	50 %	0 %	0 %	50 %	256811517
40051	NC_013156	ATC	2	6	1481227	1481232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40052	NC_013156	T	8	8	1481253	1481260	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40053	NC_013156	TA	3	6	1481313	1481318	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40054	NC_013156	CTT	2	6	1481383	1481388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811517
40055	NC_013156	TCA	2	6	1481442	1481447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40056	NC_013156	CCT	2	6	1481476	1481481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
40057	NC_013156	TTA	2	6	1481523	1481528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
40058	NC_013156	ATGG	2	8	1481556	1481563	25 %	25 %	50 %	0 %	256811517
40059	NC_013156	AT	3	6	1481569	1481574	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40060	NC_013156	ACT	2	6	1481702	1481707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40061	NC_013156	TTG	2	6	1481742	1481747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256811517
40062	NC_013156	AATTTT	2	12	1481777	1481788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
40063	NC_013156	CCA	2	6	1481789	1481794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811517
40064	NC_013156	AAC	2	6	1481821	1481826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
40065	NC_013156	TA	3	6	1481835	1481840	50 %	50 %	0 %	0 %	256811517
40066	NC_013156	A	6	6	1481846	1481851	100 %	0 %	0 %	0 %	256811517
40067	NC_013156	ATC	2	6	1481866	1481871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40068	NC_013156	CCA	2	6	1481882	1481887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256811517
40069	NC_013156	CCT	2	6	1481909	1481914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811517
40070	NC_013156	A	6	6	1481956	1481961	100 %	0 %	0 %	0 %	256811517
40071	NC_013156	CAA	2	6	1481970	1481975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
40072	NC_013156	TCT	2	6	1481981	1481986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811517
40073	NC_013156	T	6	6	1482023	1482028	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40074	NC_013156	TCG	2	6	1482065	1482070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256811517
40075	NC_013156	T	7	7	1482075	1482081	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40076	NC_013156	T	6	6	1482137	1482142	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40077	NC_013156	C	6	6	1482166	1482171	0 %	0 %	0 %	100 %	256811517
40078	NC_013156	CAA	2	6	1482183	1482188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811517
40079	NC_013156	T	7	7	1482229	1482235	0 %	100 %	0 %	0 %	256811517
40080	NC_013156	TCA	2	6	1482245	1482250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811517
40081	NC_013156	TAA	2	6	1482261	1482266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811517
40082	NC_013156	ATT	2	6	1482269	1482274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811517
40083	NC_013156	TCA	2	6	1482379	1482384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
40084	NC_013156	GTA	2	6	1482405	1482410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811518
40085	NC_013156	TC	3	6	1482443	1482448	0 %	50 %	0 %	50 %	256811518
40086	NC_013156	ATCTTT	2	12	1482540	1482551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	256811518
40087	NC_013156	ATA	2	6	1482552	1482557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
40088	NC_013156	ATC	2	6	1482753	1482758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
40089	NC_013156	T	6	6	1482898	1482903	0 %	100 %	0 %	0 %	256811518
40090	NC_013156	T	6	6	1482940	1482945	0 %	100 %	0 %	0 %	256811518
40091	NC_013156	AAT	2	6	1482946	1482951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
40092	NC_013156	TTAAC	2	10	1482989	1482998	40 %	40 %	0 %	20 %	256811518
40093	NC_013156	TCT	2	6	1483080	1483085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811518
40094	NC_013156	ATAC	2	8	1483205	1483212	50 %	25 %	0 %	25 %	256811518
40095	NC_013156	ACT	2	6	1483231	1483236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811518
40096	NC_013156	TTC	2	6	1483248	1483253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811518
40097	NC_013156	TC	3	6	1483363	1483368	0 %	50 %	0 %	50 %	256811518
40098	NC_013156	ATA	2	6	1483378	1483383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811518
40099	NC_013156	TGAA	2	8	1483441	1483448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40100	NC_013156	T	6	6	1483458	1483463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40101	NC_013156	TTC	2	6	1483558	1483563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40102	NC_013156	T	7	7	1483591	1483597	0 %	100 %	0 %	0 %	256811519
40103	NC_013156	TTC	2	6	1483629	1483634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40104	NC_013156	CTT	2	6	1483645	1483650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40105	NC_013156	TAA	2	6	1483661	1483666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
40106	NC_013156	AAGT	2	8	1483705	1483712	50 %	25 %	25 %	0 %	256811519
40107	NC_013156	AAC	2	6	1483896	1483901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
40108	NC_013156	C	6	6	1483944	1483949	0 %	0 %	0 %	100 %	256811519
40109	NC_013156	CTTTC	2	10	1483970	1483979	0 %	60 %	0 %	40 %	256811519
40110	NC_013156	TATC	2	8	1483982	1483989	25 %	50 %	0 %	25 %	256811519
40111	NC_013156	ACA	2	6	1484029	1484034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
40112	NC_013156	TCA	2	6	1484068	1484073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
40113	NC_013156	ATA	2	6	1484091	1484096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
40114	NC_013156	CTT	2	6	1484113	1484118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40115	NC_013156	TCA	2	6	1484155	1484160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
40116	NC_013156	AAC	2	6	1484235	1484240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
40117	NC_013156	TCA	2	6	1484326	1484331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
40118	NC_013156	CTT	2	6	1484387	1484392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40119	NC_013156	ATTT	2	8	1484417	1484424	25 %	75 %	0 %	0 %	256811519
40120	NC_013156	TAA	2	6	1484438	1484443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256811519
40121	NC_013156	TCC	2	6	1484447	1484452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256811519
40122	NC_013156	AT	3	6	1484481	1484486	50 %	50 %	0 %	0 %	256811519
40123	NC_013156	ATC	2	6	1484571	1484576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
40124	NC_013156	AAC	2	6	1484619	1484624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
40125	NC_013156	CTTT	2	8	1484656	1484663	0 %	75 %	0 %	25 %	256811519
40126	NC_013156	T	7	7	1484666	1484672	0 %	100 %	0 %	0 %	256811519
40127	NC_013156	A	6	6	1484677	1484682	100 %	0 %	0 %	0 %	256811519
40128	NC_013156	TCT	2	6	1484854	1484859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256811519
40129	NC_013156	TTA	2	6	1484920	1484925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256811519
40130	NC_013156	TGA	2	6	1484973	1484978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256811519
40131	NC_013156	CAA	2	6	1484984	1484989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256811519
40132	NC_013156	TCA	2	6	1485011	1485016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256811519
40133	NC_013156	T	6	6	1485025	1485030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40134	NC_013156	T	7	7	1485041	1485047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40135	NC_013156	ATTA	2	8	1485051	1485058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.