MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013156	GAAA	2	8	127418	127425	75 %	0 %	25 %	0 %	256810108
3502	NC_013156	G	6	6	127442	127447	0 %	0 %	100 %	0 %	256810108
3503	NC_013156	CAG	2	6	127475	127480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810108
3504	NC_013156	GTT	2	6	127496	127501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810108
3505	NC_013156	AG	3	6	127556	127561	50 %	0 %	50 %	0 %	256810108
3506	NC_013156	GGATG	2	10	127577	127586	20 %	20 %	60 %	0 %	256810108
3507	NC_013156	GAA	2	6	127601	127606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810108
3508	NC_013156	ATA	2	6	127619	127624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810108
3509	NC_013156	TGC	2	6	127651	127656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810108
3510	NC_013156	AG	4	8	127659	127666	50 %	0 %	50 %	0 %	256810108
3511	NC_013156	ATG	2	6	127689	127694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810108
3512	NC_013156	AG	3	6	127695	127700	50 %	0 %	50 %	0 %	256810108
3513	NC_013156	AAC	2	6	127768	127773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810108
3514	NC_013156	TA	4	8	127776	127783	50 %	50 %	0 %	0 %	256810108
3515	NC_013156	AAG	2	6	127801	127806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810108
3516	NC_013156	TTA	2	6	127817	127822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810108
3517	NC_013156	CATT	2	8	128006	128013	25 %	50 %	0 %	25 %	256810108
3518	NC_013156	TAT	2	6	128124	128129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_013156	TCA	2	6	128134	128139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013156	T	6	6	128210	128215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013156	TGT	2	6	128238	128243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013156	AATT	2	8	128245	128252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013156	TAC	2	6	128307	128312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_013156	TGA	2	6	128322	128327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_013156	AACA	2	8	128339	128346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_013156	ATT	2	6	128390	128395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013156	ATT	2	6	128404	128409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013156	T	6	6	128423	128428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013156	GGA	2	6	128429	128434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013156	TAT	2	6	128437	128442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013156	A	8	8	128465	128472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013156	ATC	2	6	128479	128484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013156	AGA	2	6	128510	128515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013156	CTT	2	6	128573	128578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013156	TA	3	6	128625	128630	50 %	50 %	0 %	0 %	256810109
3536	NC_013156	TAT	2	6	128655	128660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810109
3537	NC_013156	A	6	6	128670	128675	100 %	0 %	0 %	0 %	256810109
3538	NC_013156	TGA	2	6	128725	128730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810109
3539	NC_013156	TC	3	6	128739	128744	0 %	50 %	0 %	50 %	256810109
3540	NC_013156	GAAA	2	8	128764	128771	75 %	0 %	25 %	0 %	256810109
3541	NC_013156	TGA	2	6	128777	128782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810109
3542	NC_013156	ACT	2	6	128808	128813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810109
3543	NC_013156	CAGACG	2	12	128875	128886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810109
3544	NC_013156	TGG	2	6	128930	128935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810109
3545	NC_013156	ATG	2	6	128977	128982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810109
3546	NC_013156	AT	3	6	128987	128992	50 %	50 %	0 %	0 %	256810109
3547	NC_013156	AAAAT	2	10	129148	129157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013156	ATA	2	6	129206	129211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_013156	ATTG	2	8	129344	129351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_013156	TTC	2	6	129364	129369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013156	TAA	2	6	129468	129473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013156	ATA	2	6	129509	129514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013156	TTCAA	2	10	129565	129574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3554	NC_013156	TTTC	2	8	129654	129661	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_013156	CTTTAT	2	12	129679	129690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3556	NC_013156	ATA	2	6	129770	129775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013156	CTT	2	6	129809	129814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013156	A	6	6	129824	129829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013156	TTC	2	6	129830	129835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013156	TTGTA	2	10	129859	129868	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013156	TAT	2	6	129880	129885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013156	T	6	6	129885	129890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013156	AT	3	6	129895	129900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013156	TA	4	8	129946	129953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013156	A	6	6	130004	130009	100 %	0 %	0 %	0 %	256810110
3566	NC_013156	TAG	3	9	130038	130046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810110
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3569	NC_013156	TGT	2	6	130135	130140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810110
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3571	NC_013156	GAA	2	6	130199	130204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810110
3572	NC_013156	A	6	6	130203	130208	100 %	0 %	0 %	0 %	256810110
3573	NC_013156	CCT	2	6	130220	130225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810110
3574	NC_013156	AGA	2	6	130306	130311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810110
3575	NC_013156	ATA	2	6	130349	130354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810110
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3577	NC_013156	T	6	6	130465	130470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013156	TTC	2	6	130499	130504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_013156	T	7	7	130534	130540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_013156	TTC	2	6	130543	130548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_013156	A	6	6	130568	130573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013156	TA	3	6	130596	130601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013156	ATT	2	6	130619	130624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_013156	A	6	6	130642	130647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_013156	TAAA	2	8	130651	130658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_013156	ATA	2	6	130664	130669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013156	TAAA	2	8	130671	130678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_013156	CAAA	2	8	130681	130688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_013156	T	8	8	130712	130719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_013156	GCAG	2	8	130869	130876	25 %	0 %	50 %	25 %	256810111
3593	NC_013156	GCA	2	6	130885	130890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810111
3594	NC_013156	ATG	2	6	131045	131050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810111
3595	NC_013156	TTTA	2	8	131076	131083	25 %	75 %	0 %	0 %	256810111
3596	NC_013156	AGA	2	6	131121	131126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810111
3597	NC_013156	GCT	2	6	131146	131151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810111
3598	NC_013156	ACT	2	6	131164	131169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810111
3599	NC_013156	GA	3	6	131219	131224	50 %	0 %	50 %	0 %	256810111
3600	NC_013156	A	7	7	131307	131313	100 %	0 %	0 %	0 %	256810111
3601	NC_013156	AG	3	6	131337	131342	50 %	0 %	50 %	0 %	256810111
3602	NC_013156	TGG	2	6	131358	131363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810111
3603	NC_013156	AGA	2	6	131388	131393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810111
3604	NC_013156	AGA	2	6	131463	131468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810111
3605	NC_013156	ATA	2	6	131617	131622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810111
3606	NC_013156	CTG	2	6	131639	131644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810111
3607	NC_013156	A	6	6	131691	131696	100 %	0 %	0 %	0 %	256810111
3608	NC_013156	GA	3	6	131761	131766	50 %	0 %	50 %	0 %	256810111
3609	NC_013156	A	6	6	131778	131783	100 %	0 %	0 %	0 %	256810111
3610	NC_013156	ATG	2	6	131797	131802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810111
3611	NC_013156	GAC	2	6	131809	131814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810111
3612	NC_013156	A	6	6	131883	131888	100 %	0 %	0 %	0 %	256810111
3613	NC_013156	AAC	2	6	131898	131903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810111
3614	NC_013156	AAG	2	6	131958	131963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810111
3615	NC_013156	GGT	2	6	131977	131982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810111
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3617	NC_013156	GGA	2	6	132070	132075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810111
3618	NC_013156	CAA	2	6	132101	132106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810111
3619	NC_013156	GTT	2	6	132127	132132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810111
3620	NC_013156	GTAT	2	8	132133	132140	25 %	50 %	25 %	0 %	256810111
3621	NC_013156	TAT	2	6	132187	132192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810111
3622	NC_013156	GCAGAG	2	12	132195	132206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256810111
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3624	NC_013156	GGA	2	6	132391	132396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810111
3625	NC_013156	TAGAG	2	10	132423	132432	40 %	20 %	40 %	0 %	256810111
3626	NC_013156	A	7	7	132466	132472	100 %	0 %	0 %	0 %	256810111
3627	NC_013156	TTTAA	2	10	132513	132522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3876	NC_013156	ATTT	2	8	142105	142112	25 %	75 %	0 %	0 %	256810118
3877	NC_013156	TG	3	6	142124	142129	0 %	50 %	50 %	0 %	256810118
3878	NC_013156	T	7	7	142181	142187	0 %	100 %	0 %	0 %	256810118
3879	NC_013156	AAC	2	6	142253	142258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810118
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