MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013156	AG	4	8	108878	108885	50 %	0 %	50 %	0 %	256810087
3002	NC_013156	TAAA	2	8	108887	108894	75 %	25 %	0 %	0 %	256810087
3003	NC_013156	AAG	2	6	108926	108931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810088
3004	NC_013156	ACT	2	6	109011	109016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810088
3005	NC_013156	T	6	6	109023	109028	0 %	100 %	0 %	0 %	256810088
3006	NC_013156	TTC	2	6	109061	109066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810088
3007	NC_013156	AAT	2	6	109093	109098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810088
3008	NC_013156	TTAT	2	8	109158	109165	25 %	75 %	0 %	0 %	256810088
3009	NC_013156	ATT	2	6	109203	109208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810088
3010	NC_013156	CAT	2	6	109216	109221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810088
3011	NC_013156	CT	3	6	109222	109227	0 %	50 %	0 %	50 %	256810088
3012	NC_013156	T	7	7	109251	109257	0 %	100 %	0 %	0 %	256810088
3013	NC_013156	ATC	2	6	109310	109315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810088
3014	NC_013156	AGAT	2	8	109333	109340	50 %	25 %	25 %	0 %	256810088
3015	NC_013156	CAA	2	6	109399	109404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810088
3016	NC_013156	CTTT	2	8	109409	109416	0 %	75 %	0 %	25 %	256810088
3017	NC_013156	TTA	2	6	109468	109473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810089
3018	NC_013156	ATA	2	6	109541	109546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810089
3019	NC_013156	ATT	2	6	109559	109564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810089
3020	NC_013156	CTT	2	6	109571	109576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810089
3021	NC_013156	TCT	2	6	109583	109588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810089
3022	NC_013156	T	6	6	109638	109643	0 %	100 %	0 %	0 %	256810089
3023	NC_013156	T	6	6	109660	109665	0 %	100 %	0 %	0 %	256810089
3024	NC_013156	T	6	6	109695	109700	0 %	100 %	0 %	0 %	256810089
3025	NC_013156	T	7	7	109713	109719	0 %	100 %	0 %	0 %	256810089
3026	NC_013156	TCT	2	6	109739	109744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810089
3027	NC_013156	TAT	2	6	109792	109797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810090
3028	NC_013156	CAAAT	2	10	109799	109808	60 %	20 %	0 %	20 %	256810090
3029	NC_013156	ATT	2	6	109818	109823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810090
3030	NC_013156	AAT	2	6	109844	109849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810090
3031	NC_013156	ATA	2	6	109896	109901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810090
3032	NC_013156	CCA	2	6	109950	109955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810090
3033	NC_013156	GCT	2	6	110055	110060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810090
3034	NC_013156	TA	4	8	110105	110112	50 %	50 %	0 %	0 %	256810090
3035	NC_013156	TCTT	2	8	110136	110143	0 %	75 %	0 %	25 %	256810090
3036	NC_013156	T	6	6	110156	110161	0 %	100 %	0 %	0 %	256810090
3037	NC_013156	CCA	2	6	110167	110172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810090
3038	NC_013156	T	7	7	110174	110180	0 %	100 %	0 %	0 %	256810090
3039	NC_013156	AAC	2	6	110330	110335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810090
3040	NC_013156	T	6	6	110385	110390	0 %	100 %	0 %	0 %	256810090
3041	NC_013156	TA	3	6	110465	110470	50 %	50 %	0 %	0 %	256810090
3042	NC_013156	CTT	2	6	110515	110520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810090
3043	NC_013156	CTC	2	6	110540	110545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810090
3044	NC_013156	CAT	2	6	110566	110571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810090
3045	NC_013156	TAT	2	6	110582	110587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810090
3046	NC_013156	AAC	2	6	110595	110600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810090
3047	NC_013156	AAC	2	6	110654	110659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810090
3048	NC_013156	CATC	2	8	110667	110674	25 %	25 %	0 %	50 %	256810090
3049	NC_013156	GTT	3	9	110693	110701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810090
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3053	NC_013156	CAT	2	6	110824	110829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810090
3054	NC_013156	ATT	2	6	110844	110849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810090
3055	NC_013156	ATTGG	2	10	110868	110877	20 %	40 %	40 %	0 %	256810090
3056	NC_013156	TTC	2	6	110908	110913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810090
3057	NC_013156	GTT	2	6	110926	110931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810090
3058	NC_013156	TCA	2	6	110988	110993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810090
3059	NC_013156	TG	3	6	111046	111051	0 %	50 %	50 %	0 %	256810090
3060	NC_013156	GAG	2	6	111052	111057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810090
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3063	NC_013156	AAG	2	6	111274	111279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810090
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3067	NC_013156	T	6	6	111600	111605	0 %	100 %	0 %	0 %	256810090
3068	NC_013156	CAG	2	6	111607	111612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810090
3069	NC_013156	ATA	2	6	111613	111618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810090
3070	NC_013156	TTC	2	6	111683	111688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810090
3071	NC_013156	ATT	3	9	111739	111747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013156	AT	3	6	111771	111776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013156	AAT	3	9	111777	111785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_013156	TAT	2	6	111792	111797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013156	TA	3	6	111830	111835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013156	TGT	2	6	111894	111899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810091
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3082	NC_013156	A	6	6	112097	112102	100 %	0 %	0 %	0 %	256810091
3083	NC_013156	GA	4	8	112126	112133	50 %	0 %	50 %	0 %	256810091
3084	NC_013156	CAT	2	6	112146	112151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810091
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3086	NC_013156	TAAAA	2	10	112194	112203	80 %	20 %	0 %	0 %	256810091
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3088	NC_013156	TAT	2	6	112260	112265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810091
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3092	NC_013156	TA	3	6	112521	112526	50 %	50 %	0 %	0 %	256810091
3093	NC_013156	CAA	2	6	112538	112543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810091
3094	NC_013156	CAGG	2	8	112545	112552	25 %	0 %	50 %	25 %	256810091
3095	NC_013156	A	6	6	112579	112584	100 %	0 %	0 %	0 %	256810091
3096	NC_013156	TGA	2	6	112596	112601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810091
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3098	NC_013156	TTG	2	6	112628	112633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810091
3099	NC_013156	TA	5	10	112644	112653	50 %	50 %	0 %	0 %	256810091
3100	NC_013156	TGT	2	6	112658	112663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810091
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3105	NC_013156	T	6	6	112770	112775	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3106	NC_013156	CCCT	2	8	112781	112788	0 %	25 %	0 %	75 %	256810092
3107	NC_013156	TCA	2	6	112792	112797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810092
3108	NC_013156	TTG	3	9	112817	112825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810092
3109	NC_013156	AT	3	6	112850	112855	50 %	50 %	0 %	0 %	256810092
3110	NC_013156	AAT	2	6	112866	112871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810092
3111	NC_013156	T	6	6	112913	112918	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3112	NC_013156	T	6	6	112924	112929	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3113	NC_013156	TAT	2	6	112950	112955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810092
3114	NC_013156	TAT	2	6	113024	113029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810092
3115	NC_013156	T	7	7	113037	113043	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3116	NC_013156	T	6	6	113091	113096	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3117	NC_013156	GAT	2	6	113140	113145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810092
3118	NC_013156	CT	3	6	113160	113165	0 %	50 %	0 %	50 %	256810092
3119	NC_013156	C	6	6	113193	113198	0 %	0 %	0 %	100 %	256810092
3120	NC_013156	ACA	2	6	113200	113205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810092
3121	NC_013156	T	8	8	113209	113216	0 %	100 %	0 %	0 %	256810092
3122	NC_013156	AG	3	6	113280	113285	50 %	0 %	50 %	0 %	256810093
3123	NC_013156	TCAT	2	8	113299	113306	25 %	50 %	0 %	25 %	256810093
3124	NC_013156	TTC	2	6	113331	113336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810093
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3246	NC_013156	TCTCAA	2	12	117566	117577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810097
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3250	NC_013156	A	6	6	117702	117707	100 %	0 %	0 %	0 %	256810097
3251	NC_013156	TAAA	2	8	117737	117744	75 %	25 %	0 %	0 %	256810097
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