MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013156	AGA	2	6	54925	54930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810024
1502	NC_013156	TGA	2	6	54936	54941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810024
1503	NC_013156	AG	3	6	54961	54966	50 %	0 %	50 %	0 %	256810024
1504	NC_013156	AAG	2	6	54971	54976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810024
1505	NC_013156	AG	3	6	54980	54985	50 %	0 %	50 %	0 %	256810024
1506	NC_013156	ATGA	2	8	55002	55009	50 %	25 %	25 %	0 %	256810024
1507	NC_013156	TCC	2	6	55024	55029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810025
1508	NC_013156	GATT	2	8	55033	55040	25 %	50 %	25 %	0 %	256810025
1509	NC_013156	GTA	2	6	55096	55101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810025
1510	NC_013156	TCT	2	6	55128	55133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810025
1511	NC_013156	TGAA	2	8	55145	55152	50 %	25 %	25 %	0 %	256810025
1512	NC_013156	CT	3	6	55221	55226	0 %	50 %	0 %	50 %	256810025
1513	NC_013156	TTG	2	6	55306	55311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810025
1514	NC_013156	ATA	2	6	55387	55392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810025
1515	NC_013156	GAT	2	6	55436	55441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810025
1516	NC_013156	TC	3	6	55442	55447	0 %	50 %	0 %	50 %	256810025
1517	NC_013156	AT	3	6	55457	55462	50 %	50 %	0 %	0 %	256810025
1518	NC_013156	T	6	6	55487	55492	0 %	100 %	0 %	0 %	256810025
1519	NC_013156	A	6	6	55515	55520	100 %	0 %	0 %	0 %	256810025
1520	NC_013156	AT	3	6	55552	55557	50 %	50 %	0 %	0 %	256810026
1521	NC_013156	CAA	2	6	55614	55619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810026
1522	NC_013156	TAA	2	6	55695	55700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810026
1523	NC_013156	CAA	2	6	55716	55721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810026
1524	NC_013156	AGT	2	6	55735	55740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810026
1525	NC_013156	TAAA	2	8	55803	55810	75 %	25 %	0 %	0 %	256810026
1526	NC_013156	TCTA	2	8	55825	55832	25 %	50 %	0 %	25 %	256810026
1527	NC_013156	CA	3	6	55872	55877	50 %	0 %	0 %	50 %	256810026
1528	NC_013156	GTT	2	6	55945	55950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810026
1529	NC_013156	CCA	2	6	55976	55981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810026
1530	NC_013156	CAA	2	6	56048	56053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810026
1531	NC_013156	GTT	2	6	56110	56115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810026
1532	NC_013156	CA	3	6	56118	56123	50 %	0 %	0 %	50 %	256810026
1533	NC_013156	AAC	2	6	56179	56184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810026
1534	NC_013156	TGT	2	6	56253	56258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810026
1535	NC_013156	CA	3	6	56304	56309	50 %	0 %	0 %	50 %	256810026
1536	NC_013156	AGG	2	6	56316	56321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810026
1537	NC_013156	ATAA	2	8	56364	56371	75 %	25 %	0 %	0 %	256810026
1538	NC_013156	AAC	2	6	56382	56387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810026
1539	NC_013156	TTC	2	6	56455	56460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810026
1540	NC_013156	TAA	2	6	56539	56544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810026
1541	NC_013156	CA	3	6	56595	56600	50 %	0 %	0 %	50 %	256810026
1542	NC_013156	CTT	2	6	56623	56628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810026
1543	NC_013156	TCTA	2	8	56704	56711	25 %	50 %	0 %	25 %	256810026
1544	NC_013156	GTA	2	6	56713	56718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810026
1545	NC_013156	TTA	2	6	56798	56803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810026
1546	NC_013156	TAA	2	6	56806	56811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810026
1547	NC_013156	TTC	2	6	56881	56886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_013156	ATC	2	6	56915	56920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_013156	TTAAAT	2	12	56936	56947	50 %	50 %	0 %	0 %	256810027
1550	NC_013156	AAT	2	6	56974	56979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810027
1551	NC_013156	ATAA	2	8	56997	57004	75 %	25 %	0 %	0 %	256810027
1552	NC_013156	ATA	2	6	57028	57033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810027
1553	NC_013156	A	6	6	57047	57052	100 %	0 %	0 %	0 %	256810027
1554	NC_013156	CAAT	2	8	57120	57127	50 %	25 %	0 %	25 %	256810027
1555	NC_013156	CAAA	2	8	57132	57139	75 %	0 %	0 %	25 %	256810027
1556	NC_013156	AAT	2	6	57165	57170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810027
1557	NC_013156	ATT	2	6	57176	57181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810027
1558	NC_013156	ACC	2	6	57198	57203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_013156	T	6	6	57231	57236	0 %	100 %	0 %	0 %	256810028
1560	NC_013156	GCA	2	6	57269	57274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810028
1561	NC_013156	ATA	2	6	57326	57331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810028
1562	NC_013156	AT	3	6	57368	57373	50 %	50 %	0 %	0 %	256810028
1563	NC_013156	TAA	2	6	57401	57406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810028
1564	NC_013156	CCT	2	6	57407	57412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810028
1565	NC_013156	TC	3	6	57469	57474	0 %	50 %	0 %	50 %	256810028
1566	NC_013156	GCT	3	9	57539	57547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810028
1567	NC_013156	CCT	2	6	57557	57562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810028
1568	NC_013156	CCT	2	6	57569	57574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810028
1569	NC_013156	CCCA	2	8	57589	57596	25 %	0 %	0 %	75 %	256810028
1570	NC_013156	ATT	2	6	57656	57661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810028
1571	NC_013156	TA	3	6	57691	57696	50 %	50 %	0 %	0 %	256810028
1572	NC_013156	TGT	2	6	57738	57743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810028
1573	NC_013156	CAA	2	6	57786	57791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810028
1574	NC_013156	TA	3	6	57865	57870	50 %	50 %	0 %	0 %	256810028
1575	NC_013156	ACA	2	6	57884	57889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810028
1576	NC_013156	CAA	2	6	57963	57968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810028
1577	NC_013156	ACC	2	6	57994	57999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256810029
1578	NC_013156	AG	3	6	58040	58045	50 %	0 %	50 %	0 %	256810029
1579	NC_013156	AAC	2	6	58050	58055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810029
1580	NC_013156	CTTAAA	2	12	58085	58096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	256810029
1581	NC_013156	AGC	2	6	58130	58135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810029
1582	NC_013156	CAAA	2	8	58141	58148	75 %	0 %	0 %	25 %	256810029
1583	NC_013156	T	6	6	58159	58164	0 %	100 %	0 %	0 %	256810029
1584	NC_013156	AAC	2	6	58200	58205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810029
1585	NC_013156	CTT	2	6	58264	58269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810029
1586	NC_013156	T	7	7	58278	58284	0 %	100 %	0 %	0 %	256810029
1587	NC_013156	ATTA	2	8	58317	58324	50 %	50 %	0 %	0 %	256810030
1588	NC_013156	AAT	2	6	58333	58338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810030
1589	NC_013156	ATT	2	6	58401	58406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810030
1590	NC_013156	TCA	2	6	58488	58493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810030
1591	NC_013156	TAAAT	2	10	58506	58515	60 %	40 %	0 %	0 %	256810030
1592	NC_013156	TCA	2	6	58525	58530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810030
1593	NC_013156	ACTA	2	8	58550	58557	50 %	25 %	0 %	25 %	256810030
1594	NC_013156	GCC	2	6	58599	58604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256810030
1595	NC_013156	AGCA	2	8	58607	58614	50 %	0 %	25 %	25 %	256810030
1596	NC_013156	TGG	2	6	58640	58645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256810030
1597	NC_013156	TCC	2	6	58736	58741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810030
1598	NC_013156	CAA	2	6	58819	58824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810030
1599	NC_013156	CAA	2	6	58892	58897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810030
1600	NC_013156	ACA	2	6	58929	58934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810030
1601	NC_013156	AATCC	2	10	58993	59002	40 %	20 %	0 %	40 %	256810030
1602	NC_013156	CTA	2	6	59035	59040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810030
1603	NC_013156	ATGGA	2	10	59117	59126	40 %	20 %	40 %	0 %	256810030
1604	NC_013156	CAA	2	6	59152	59157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810030
1605	NC_013156	CAG	2	6	59162	59167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810030
1606	NC_013156	TAA	2	6	59246	59251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810030
1607	NC_013156	TGC	2	6	59279	59284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810030
1608	NC_013156	AT	3	6	59301	59306	50 %	50 %	0 %	0 %	256810030
1609	NC_013156	A	6	6	59381	59386	100 %	0 %	0 %	0 %	256810030
1610	NC_013156	ATC	2	6	59405	59410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810030
1611	NC_013156	TGC	2	6	59423	59428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810030
1612	NC_013156	AACA	2	8	59459	59466	75 %	0 %	0 %	25 %	256810030
1613	NC_013156	TTGT	2	8	59469	59476	0 %	75 %	25 %	0 %	256810030
1614	NC_013156	GA	3	6	59507	59512	50 %	0 %	50 %	0 %	256810030
1615	NC_013156	CTGC	2	8	59539	59546	0 %	25 %	25 %	50 %	256810030
1616	NC_013156	CATC	2	8	59583	59590	25 %	25 %	0 %	50 %	256810030
1617	NC_013156	AAC	2	6	59591	59596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810030
1618	NC_013156	TCC	2	6	59603	59608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256810030
1619	NC_013156	AGT	2	6	59611	59616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810030
1620	NC_013156	TAA	2	6	59632	59637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810030
1621	NC_013156	AAT	2	6	59645	59650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810030
1622	NC_013156	TA	3	6	59675	59680	50 %	50 %	0 %	0 %	256810030
1623	NC_013156	CTTTT	2	10	59690	59699	0 %	80 %	0 %	20 %	256810030
1624	NC_013156	GTA	2	6	59704	59709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810030
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1626	NC_013156	TAAT	2	8	59728	59735	50 %	50 %	0 %	0 %	256810030
1627	NC_013156	AGT	2	6	59758	59763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810030
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1629	NC_013156	T	6	6	59825	59830	0 %	100 %	0 %	0 %	256810031
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