MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013156	TGTTT	2	10	19090	19099	0 %	80 %	20 %	0 %	256809994
502	NC_013156	ATT	2	6	19120	19125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809994
503	NC_013156	ATG	2	6	19130	19135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809994
504	NC_013156	AAC	2	6	19195	19200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809994
505	NC_013156	AAT	2	6	19267	19272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809994
506	NC_013156	TCA	2	6	19319	19324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809994
507	NC_013156	ATTA	2	8	19502	19509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013156	AATT	2	8	19513	19520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013156	TA	4	8	19539	19546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013156	TAAT	2	8	19557	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013156	A	6	6	19627	19632	100 %	0 %	0 %	0 %	256809995
512	NC_013156	TGA	2	6	19707	19712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809995
513	NC_013156	A	8	8	19712	19719	100 %	0 %	0 %	0 %	256809995
514	NC_013156	TAA	2	6	19722	19727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809995
515	NC_013156	AAT	2	6	19775	19780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809995
516	NC_013156	GTT	2	6	19812	19817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809996
517	NC_013156	GGA	2	6	19830	19835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809996
518	NC_013156	A	6	6	19859	19864	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
519	NC_013156	AGA	2	6	19943	19948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809996
520	NC_013156	GTT	2	6	19986	19991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809996
521	NC_013156	A	6	6	20021	20026	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
522	NC_013156	GA	3	6	20067	20072	50 %	0 %	50 %	0 %	256809996
523	NC_013156	AAG	2	6	20110	20115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809996
524	NC_013156	CAG	2	6	20137	20142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809996
525	NC_013156	AG	4	8	20153	20160	50 %	0 %	50 %	0 %	256809996
526	NC_013156	ATT	2	6	20167	20172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809996
527	NC_013156	AGC	2	6	20231	20236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256809996
528	NC_013156	A	6	6	20286	20291	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
529	NC_013156	TTG	2	6	20340	20345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809996
530	NC_013156	ATG	2	6	20355	20360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809996
531	NC_013156	AGG	2	6	20390	20395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809996
532	NC_013156	A	6	6	20456	20461	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
533	NC_013156	ATT	2	6	20473	20478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809996
534	NC_013156	AGA	2	6	20480	20485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809996
535	NC_013156	GGA	2	6	20550	20555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809996
536	NC_013156	A	6	6	20578	20583	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
537	NC_013156	GTT	2	6	20604	20609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256809996
538	NC_013156	TGC	2	6	20615	20620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256809996
539	NC_013156	GGA	2	6	20643	20648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809996
540	NC_013156	GAAA	2	8	20759	20766	75 %	0 %	25 %	0 %	256809996
541	NC_013156	TGA	2	6	20782	20787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809996
542	NC_013156	TGA	3	9	20825	20833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809996
543	NC_013156	GA	3	6	20860	20865	50 %	0 %	50 %	0 %	256809996
544	NC_013156	A	6	6	20886	20891	100 %	0 %	0 %	0 %	256809996
545	NC_013156	TAC	2	6	20947	20952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256809996
546	NC_013156	GTT	2	6	21009	21014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013156	ATT	2	6	21015	21020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809997
548	NC_013156	T	7	7	21022	21028	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
549	NC_013156	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
550	NC_013156	AAC	2	6	21037	21042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809997
551	NC_013156	TAA	2	6	21066	21071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809997
552	NC_013156	TAA	2	6	21091	21096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809997
553	NC_013156	T	6	6	21148	21153	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
554	NC_013156	CAA	2	6	21168	21173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809997
555	NC_013156	TTCC	2	8	21189	21196	0 %	50 %	0 %	50 %	256809997
556	NC_013156	T	6	6	21238	21243	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
557	NC_013156	T	6	6	21248	21253	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
558	NC_013156	CTC	2	6	21268	21273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256809997
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561	NC_013156	CAA	2	6	21339	21344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809997
562	NC_013156	TTC	2	6	21374	21379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256809997
563	NC_013156	T	7	7	21444	21450	0 %	100 %	0 %	0 %	256809997
564	NC_013156	TGATTT	2	12	21471	21482	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013156	ATT	2	6	21483	21488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013156	TTA	2	6	21489	21494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013156	TAT	2	6	21506	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013156	TATAA	2	10	21524	21533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013156	AT	3	6	21549	21554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013156	TTC	2	6	21560	21565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013156	T	6	6	21604	21609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013156	TAA	2	6	21616	21621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013156	TAT	2	6	21638	21643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013156	T	6	6	21662	21667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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576	NC_013156	TA	3	6	21706	21711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013156	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013156	T	6	6	21753	21758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013156	AT	3	6	21759	21764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013156	ATA	2	6	21776	21781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809998
581	NC_013156	ACA	2	6	21889	21894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256809998
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583	NC_013156	A	7	7	21908	21914	100 %	0 %	0 %	0 %	256809998
584	NC_013156	TGA	2	6	21996	22001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809998
585	NC_013156	AT	3	6	22017	22022	50 %	50 %	0 %	0 %	256809998
586	NC_013156	GGA	2	6	22023	22028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809998
587	NC_013156	GCAGAT	2	12	22078	22089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	256809998
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589	NC_013156	AAT	3	9	22135	22143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809998
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592	NC_013156	TGA	2	6	22221	22226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809998
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594	NC_013156	TGA	2	6	22299	22304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809998
595	NC_013156	A	7	7	22314	22320	100 %	0 %	0 %	0 %	256809998
596	NC_013156	ATA	2	6	22364	22369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256809998
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598	NC_013156	ATAAG	2	10	22424	22433	60 %	20 %	20 %	0 %	256809998
599	NC_013156	GGA	2	6	22444	22449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256809998
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602	NC_013156	ATG	2	6	22547	22552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256809998
603	NC_013156	TTA	2	6	22556	22561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809998
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611	NC_013156	A	6	6	22803	22808	100 %	0 %	0 %	0 %	256809998
612	NC_013156	AGA	2	6	22812	22817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809998
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614	NC_013156	GATA	2	8	22914	22921	50 %	25 %	25 %	0 %	256809998
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618	NC_013156	GAAT	2	8	23033	23040	50 %	25 %	25 %	0 %	256809998
619	NC_013156	GA	3	6	23048	23053	50 %	0 %	50 %	0 %	256809998
620	NC_013156	AGA	2	6	23121	23126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809998
621	NC_013156	TTA	2	6	23156	23161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256809998
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627	NC_013156	A	6	6	23468	23473	100 %	0 %	0 %	0 %	256809998
628	NC_013156	TTAA	2	8	23491	23498	50 %	50 %	0 %	0 %	256809998
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632	NC_013156	AAG	2	6	23792	23797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256809998
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