MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 40135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013156	A	7	7	182338	182344	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5002	NC_013156	A	6	6	182399	182404	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5003	NC_013156	A	6	6	182414	182419	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5004	NC_013156	TAT	2	6	182423	182428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810161
5005	NC_013156	A	6	6	182439	182444	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5006	NC_013156	TAA	3	9	182455	182463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810161
5007	NC_013156	A	6	6	182462	182467	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5008	NC_013156	A	7	7	182484	182490	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5009	NC_013156	AGGTA	2	10	182492	182501	40 %	20 %	40 %	0 %	256810161
5010	NC_013156	AGG	2	6	182542	182547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810161
5011	NC_013156	GTT	2	6	182621	182626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810161
5012	NC_013156	A	6	6	182636	182641	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5013	NC_013156	GAG	2	6	182649	182654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256810161
5014	NC_013156	TAT	2	6	182666	182671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810161
5015	NC_013156	TGT	2	6	182672	182677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810161
5016	NC_013156	TCA	2	6	182712	182717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256810161
5017	NC_013156	CAACAT	2	12	182746	182757	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256810161
5018	NC_013156	ACTCC	2	10	182775	182784	20 %	20 %	0 %	60 %	256810161
5019	NC_013156	AC	3	6	182795	182800	50 %	0 %	0 %	50 %	256810161
5020	NC_013156	TAG	2	6	182815	182820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810161
5021	NC_013156	A	6	6	182874	182879	100 %	0 %	0 %	0 %	256810161
5022	NC_013156	ATG	2	6	182936	182941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810161
5023	NC_013156	GAT	2	6	182950	182955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810162
5024	NC_013156	TGTT	2	8	183029	183036	0 %	75 %	25 %	0 %	256810162
5025	NC_013156	TTG	2	6	183050	183055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810162
5026	NC_013156	ATA	2	6	183071	183076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810162
5027	NC_013156	A	8	8	183224	183231	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5028	NC_013156	A	6	6	183235	183240	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5029	NC_013156	A	6	6	183247	183252	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5030	NC_013156	GAT	2	6	183343	183348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810162
5031	NC_013156	AT	3	6	183351	183356	50 %	50 %	0 %	0 %	256810162
5032	NC_013156	A	6	6	183375	183380	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5033	NC_013156	A	6	6	183420	183425	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5034	NC_013156	AGC	3	9	183432	183440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256810162
5035	NC_013156	GTT	2	6	183520	183525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810162
5036	NC_013156	ATGAA	2	10	183542	183551	60 %	20 %	20 %	0 %	256810162
5037	NC_013156	AG	3	6	183603	183608	50 %	0 %	50 %	0 %	256810162
5038	NC_013156	AAG	2	6	183614	183619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810162
5039	NC_013156	AGA	3	9	183648	183656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810162
5040	NC_013156	GAGG	2	8	183669	183676	25 %	0 %	75 %	0 %	256810162
5041	NC_013156	TTA	2	6	183679	183684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810162
5042	NC_013156	TGA	2	6	183708	183713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810162
5043	NC_013156	AGA	2	6	183735	183740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810162
5044	NC_013156	TGA	2	6	183756	183761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810162
5045	NC_013156	AAAT	2	8	183764	183771	75 %	25 %	0 %	0 %	256810162
5046	NC_013156	AAT	2	6	183798	183803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810162
5047	NC_013156	AAAG	2	8	183905	183912	75 %	0 %	25 %	0 %	256810162
5048	NC_013156	ATT	2	6	183925	183930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810162
5049	NC_013156	A	6	6	183931	183936	100 %	0 %	0 %	0 %	256810162
5050	NC_013156	ATT	2	6	183952	183957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810162
5051	NC_013156	ATA	2	6	183986	183991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810162
5052	NC_013156	AG	3	6	184035	184040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013156	ATGA	2	8	184049	184056	50 %	25 %	25 %	0 %	256810163
5054	NC_013156	TTAT	2	8	184076	184083	25 %	75 %	0 %	0 %	256810163
5055	NC_013156	A	6	6	184131	184136	100 %	0 %	0 %	0 %	256810163
5056	NC_013156	ATT	2	6	184166	184171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810163
5057	NC_013156	AGA	2	6	184270	184275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810163
5058	NC_013156	TTG	3	9	184278	184286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810163
5059	NC_013156	ATG	2	6	184290	184295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810163
5060	NC_013156	A	6	6	184373	184378	100 %	0 %	0 %	0 %	256810163
5061	NC_013156	TAA	2	6	184450	184455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810163
5062	NC_013156	TAT	2	6	184471	184476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810163
5063	NC_013156	A	6	6	184544	184549	100 %	0 %	0 %	0 %	256810163
5064	NC_013156	A	6	6	184573	184578	100 %	0 %	0 %	0 %	256810163
5065	NC_013156	T	6	6	184734	184739	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
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5075	NC_013156	T	6	6	185018	185023	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
5076	NC_013156	TA	3	6	185087	185092	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
5077	NC_013156	TA	3	6	185136	185141	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
5078	NC_013156	CTT	2	6	185146	185151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
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5080	NC_013156	ATT	2	6	185226	185231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810164
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5084	NC_013156	TTC	2	6	185427	185432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256810164
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5086	NC_013156	AT	3	6	185467	185472	50 %	50 %	0 %	0 %	256810164
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5089	NC_013156	TAG	2	6	185526	185531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256810164
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5093	NC_013156	TG	3	6	185640	185645	0 %	50 %	50 %	0 %	256810164
5094	NC_013156	T	7	7	185653	185659	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
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5097	NC_013156	AAC	2	6	185781	185786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256810164
5098	NC_013156	T	6	6	185794	185799	0 %	100 %	0 %	0 %	256810164
5099	NC_013156	CTG	2	6	185831	185836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256810164
5100	NC_013156	TAA	2	6	185855	185860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810164
5101	NC_013156	ATC	2	6	185871	185876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013156	TA	4	8	185885	185892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013156	T	7	7	185893	185899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_013156	AAAT	2	8	185900	185907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013156	CCA	2	6	185946	185951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_013156	TAA	2	6	185952	185957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013156	TTAA	2	8	185975	185982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_013156	ATCA	2	8	185993	186000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5109	NC_013156	TAAAAA	2	12	186001	186012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013156	TAT	2	6	186048	186053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013156	TAAA	2	8	186124	186131	75 %	25 %	0 %	0 %	256810165
5112	NC_013156	ATT	2	6	186158	186163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810165
5113	NC_013156	AAG	2	6	186167	186172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256810165
5114	NC_013156	TTG	2	6	186238	186243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810165
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5118	NC_013156	AG	3	6	186343	186348	50 %	0 %	50 %	0 %	256810165
5119	NC_013156	TAA	2	6	186358	186363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256810165
5120	NC_013156	TGT	2	6	186431	186436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256810165
5121	NC_013156	ATAAA	2	10	186484	186493	80 %	20 %	0 %	0 %	256810165
5122	NC_013156	CATT	2	8	186496	186503	25 %	50 %	0 %	25 %	256810165
5123	NC_013156	AAATG	2	10	186626	186635	60 %	20 %	20 %	0 %	256810166
5124	NC_013156	ATT	2	6	186675	186680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810166
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5126	NC_013156	ATT	2	6	186698	186703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256810166
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5250	NC_013156	TCCC	2	8	191657	191664	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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