MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip02

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012972	TGC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028271
2	NC_012972	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028271
3	NC_012972	CTT	2	6	407	412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028272
4	NC_012972	CTC	2	6	568	573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254028272
5	NC_012972	ATT	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028272
6	NC_012972	CAG	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028272
7	NC_012972	ATT	2	6	913	918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028272
8	NC_012972	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028272
9	NC_012972	ACA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028272
10	NC_012972	TAA	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028272
11	NC_012972	ATC	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028273
12	NC_012972	TTA	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
13	NC_012972	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028273
14	NC_012972	GTT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028273
15	NC_012972	TGA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028273
16	NC_012972	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
17	NC_012972	TCA	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028273
18	NC_012972	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
19	NC_012972	TCT	2	6	1317	1322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
20	NC_012972	ATT	2	6	1344	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
21	NC_012972	TTA	2	6	1360	1365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
22	NC_012972	AGA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
23	NC_012972	TAA	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
24	NC_012972	TCT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
25	NC_012972	AAT	2	6	1628	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
26	NC_012972	GCT	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028273
27	NC_012972	TCC	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254028273
28	NC_012972	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
29	NC_012972	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
30	NC_012972	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
31	NC_012972	CAT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028274
32	NC_012972	GCA	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
33	NC_012972	CAG	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
34	NC_012972	CTT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028274
35	NC_012972	CAG	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
36	NC_012972	AGC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
37	NC_012972	TAA	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028274
38	NC_012972	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012972	TGC	3	9	3829	3837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028275
40	NC_012972	TCA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028275
41	NC_012972	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028275
42	NC_012972	ATT	2	6	3900	3905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028275
43	NC_012972	TCA	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028275
44	NC_012972	CAG	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028275
45	NC_012972	AAC	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028275
46	NC_012972	ATG	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028275
47	NC_012972	CGC	2	6	4511	4516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028275
48	NC_012972	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012972	GGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012972	CCG	2	6	4980	4985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028276
51	NC_012972	CGT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
52	NC_012972	TTA	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028276
53	NC_012972	TCG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
54	NC_012972	CAG	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
55	NC_012972	GTC	2	6	5245	5250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
56	NC_012972	GCG	2	6	5331	5336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028276
57	NC_012972	TTC	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028276
58	NC_012972	CCG	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028276
59	NC_012972	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028276
60	NC_012972	TGC	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
61	NC_012972	CAT	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028276
62	NC_012972	GCA	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
63	NC_012972	TCA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028276
64	NC_012972	CAG	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
65	NC_012972	CGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028277
66	NC_012972	AGG	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028277
67	NC_012972	CCG	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028277
68	NC_012972	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028277
69	NC_012972	CAG	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028277
70	NC_012972	CCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028277
71	NC_012972	GCA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028277
72	NC_012972	AAT	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028277
73	NC_012972	GTT	2	6	6522	6527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028278
74	NC_012972	CGC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028278
75	NC_012972	GGT	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
76	NC_012972	GAC	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028278
77	NC_012972	AAC	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028278
78	NC_012972	TGG	2	6	6872	6877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
79	NC_012972	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028278
80	NC_012972	GTG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
81	NC_012972	AGG	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028278
82	NC_012972	ACC	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028278
83	NC_012972	TGG	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
84	NC_012972	TGT	2	6	7284	7289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028278
85	NC_012972	GAA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028278
86	NC_012972	ACC	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028278
87	NC_012972	AAT	2	6	7545	7550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028278
88	NC_012972	TTC	2	6	7560	7565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028278
89	NC_012972	CTT	2	6	7772	7777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028279
90	NC_012972	ACC	2	6	7788	7793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028279
91	NC_012972	GCA	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028279
92	NC_012972	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028279
93	NC_012972	CGG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028280
94	NC_012972	CGG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028280
95	NC_012972	CCG	2	6	8227	8232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028280
96	NC_012972	GCG	2	6	8512	8517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
97	NC_012972	GCG	2	6	8573	8578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
98	NC_012972	GGT	2	6	8712	8717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028281
99	NC_012972	AGG	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028281
100	NC_012972	GCG	2	6	8947	8952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
101	NC_012972	TTC	2	6	8971	8976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028281
102	NC_012972	CCA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028281
103	NC_012972	GCC	2	6	9228	9233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012972	CTA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028282
105	NC_012972	TCT	2	6	9722	9727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028283
106	NC_012972	ACG	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028283

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.