MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylovorus glucosetrophus SIP3-4 plasmid pMsip02

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012972	GA	3	6	138	143	50 %	0 %	50 %	0 %	254028271
2	NC_012972	GGCAG	2	10	157	166	20 %	0 %	60 %	20 %	254028271
3	NC_012972	CAAAG	2	10	191	200	60 %	0 %	20 %	20 %	254028271
4	NC_012972	TTAA	2	8	202	209	50 %	50 %	0 %	0 %	254028271
5	NC_012972	AG	3	6	219	224	50 %	0 %	50 %	0 %	254028271
6	NC_012972	TGC	2	6	279	284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028271
7	NC_012972	TACT	2	8	286	293	25 %	50 %	0 %	25 %	254028271
8	NC_012972	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028271
9	NC_012972	TAAA	2	8	377	384	75 %	25 %	0 %	0 %	254028272
10	NC_012972	CTT	2	6	407	412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028272
11	NC_012972	TC	3	6	433	438	0 %	50 %	0 %	50 %	254028272
12	NC_012972	AAGAG	2	10	442	451	60 %	0 %	40 %	0 %	254028272
13	NC_012972	CTC	2	6	568	573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254028272
14	NC_012972	ATT	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028272
15	NC_012972	ACTTTT	2	12	731	742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254028272
16	NC_012972	T	6	6	739	744	0 %	100 %	0 %	0 %	254028272
17	NC_012972	TA	3	6	759	764	50 %	50 %	0 %	0 %	254028272
18	NC_012972	CATC	2	8	801	808	25 %	25 %	0 %	50 %	254028272
19	NC_012972	AT	3	6	843	848	50 %	50 %	0 %	0 %	254028272
20	NC_012972	CAG	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028272
21	NC_012972	ATT	2	6	913	918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028272
22	NC_012972	ACC	2	6	923	928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028272
23	NC_012972	ACTT	2	8	940	947	25 %	50 %	0 %	25 %	254028272
24	NC_012972	ACA	2	6	1016	1021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028272
25	NC_012972	ATTC	2	8	1027	1034	25 %	50 %	0 %	25 %	254028272
26	NC_012972	TAA	2	6	1035	1040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028272
27	NC_012972	ATC	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028273
28	NC_012972	TTA	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
29	NC_012972	GAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028273
30	NC_012972	GTT	2	6	1209	1214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028273
31	NC_012972	TGA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028273
32	NC_012972	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
33	NC_012972	AATT	2	8	1261	1268	50 %	50 %	0 %	0 %	254028273
34	NC_012972	CATT	2	8	1270	1277	25 %	50 %	0 %	25 %	254028273
35	NC_012972	TCA	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028273
36	NC_012972	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
37	NC_012972	TCT	2	6	1317	1322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
38	NC_012972	ATT	2	6	1344	1349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
39	NC_012972	TTA	2	6	1360	1365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
40	NC_012972	AGA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
41	NC_012972	TTTC	2	8	1407	1414	0 %	75 %	0 %	25 %	254028273
42	NC_012972	AGGAG	2	10	1425	1434	40 %	0 %	60 %	0 %	254028273
43	NC_012972	GCTCC	2	10	1456	1465	0 %	20 %	20 %	60 %	254028273
44	NC_012972	TAA	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
45	NC_012972	TCT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
46	NC_012972	AAT	2	6	1628	1633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028273
47	NC_012972	GCT	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028273
48	NC_012972	TCC	2	6	1775	1780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254028273
49	NC_012972	A	6	6	1807	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	254028273
50	NC_012972	GA	3	6	1854	1859	50 %	0 %	50 %	0 %	254028273
51	NC_012972	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028273
52	NC_012972	TTA	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028273
53	NC_012972	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028273
54	NC_012972	ATATC	2	10	2113	2122	40 %	40 %	0 %	20 %	254028273
55	NC_012972	CAT	2	6	2201	2206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028274
56	NC_012972	GCA	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
57	NC_012972	T	6	6	2427	2432	0 %	100 %	0 %	0 %	254028274
58	NC_012972	CAG	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
59	NC_012972	TGTT	2	8	2536	2543	0 %	75 %	25 %	0 %	254028274
60	NC_012972	CTT	2	6	2567	2572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028274
61	NC_012972	CTTGC	2	10	2595	2604	0 %	40 %	20 %	40 %	254028274
62	NC_012972	CTGT	2	8	2650	2657	0 %	50 %	25 %	25 %	254028274
63	NC_012972	CAG	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
64	NC_012972	GCCC	2	8	2793	2800	0 %	0 %	25 %	75 %	254028274
65	NC_012972	ACCTG	2	10	2823	2832	20 %	20 %	20 %	40 %	254028274
66	NC_012972	TTTTG	2	10	2863	2872	0 %	80 %	20 %	0 %	254028274
67	NC_012972	AC	3	6	2974	2979	50 %	0 %	0 %	50 %	254028274
68	NC_012972	AGC	2	6	3046	3051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028274
69	NC_012972	GC	3	6	3075	3080	0 %	0 %	50 %	50 %	254028274
70	NC_012972	TAA	2	6	3256	3261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028274
71	NC_012972	TATT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012972	ACAAA	2	10	3546	3555	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_012972	A	6	6	3597	3602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012972	ATT	2	6	3677	3682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012972	TGC	3	9	3829	3837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028275
76	NC_012972	TCA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028275
77	NC_012972	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028275
78	NC_012972	ATT	2	6	3900	3905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028275
79	NC_012972	TCA	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028275
80	NC_012972	CAG	2	6	3947	3952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028275
81	NC_012972	CT	3	6	3975	3980	0 %	50 %	0 %	50 %	254028275
82	NC_012972	T	7	7	4065	4071	0 %	100 %	0 %	0 %	254028275
83	NC_012972	CCTAA	2	10	4123	4132	40 %	20 %	0 %	40 %	254028275
84	NC_012972	AAC	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028275
85	NC_012972	TAGC	2	8	4172	4179	25 %	25 %	25 %	25 %	254028275
86	NC_012972	TCAAT	2	10	4229	4238	40 %	40 %	0 %	20 %	254028275
87	NC_012972	GTCCA	2	10	4299	4308	20 %	20 %	20 %	40 %	254028275
88	NC_012972	T	6	6	4332	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	254028275
89	NC_012972	ATG	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254028275
90	NC_012972	CGC	2	6	4511	4516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028275
91	NC_012972	ACAG	2	8	4573	4580	50 %	0 %	25 %	25 %	254028275
92	NC_012972	TTTC	2	8	4661	4668	0 %	75 %	0 %	25 %	254028275
93	NC_012972	TTTATT	2	12	4694	4705	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012972	TAA	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012972	GGC	2	6	4762	4767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012972	A	7	7	4818	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012972	T	6	6	4840	4845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012972	CCG	2	6	4980	4985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028276
99	NC_012972	CGT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
100	NC_012972	GTTG	2	8	5049	5056	0 %	50 %	50 %	0 %	254028276
101	NC_012972	TTA	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254028276
102	NC_012972	TCG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
103	NC_012972	CATC	2	8	5145	5152	25 %	25 %	0 %	50 %	254028276
104	NC_012972	CAG	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
105	NC_012972	GTC	2	6	5245	5250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
106	NC_012972	GCG	2	6	5331	5336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028276
107	NC_012972	GCTG	2	8	5339	5346	0 %	25 %	50 %	25 %	254028276
108	NC_012972	TTC	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028276
109	NC_012972	CCG	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028276
110	NC_012972	TGG	2	6	5583	5588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028276
111	NC_012972	A	6	6	5647	5652	100 %	0 %	0 %	0 %	254028276
112	NC_012972	TGC	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028276
113	NC_012972	CAT	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028276
114	NC_012972	GCA	2	6	5786	5791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
115	NC_012972	TCA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028276
116	NC_012972	CAG	2	6	5871	5876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028276
117	NC_012972	CGC	2	6	6075	6080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028277
118	NC_012972	AGG	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028277
119	NC_012972	CCG	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028277
120	NC_012972	GGC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028277
121	NC_012972	CAG	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028277
122	NC_012972	CCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028277
123	NC_012972	GCA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028277
124	NC_012972	AAT	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028277
125	NC_012972	GTT	2	6	6522	6527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028278
126	NC_012972	ATCGC	2	10	6655	6664	20 %	20 %	20 %	40 %	254028278
127	NC_012972	CGCAT	2	10	6678	6687	20 %	20 %	20 %	40 %	254028278
128	NC_012972	CGC	2	6	6711	6716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028278
129	NC_012972	TTTCG	2	10	6771	6780	0 %	60 %	20 %	20 %	254028278
130	NC_012972	GGT	2	6	6819	6824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
131	NC_012972	GAC	2	6	6828	6833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028278
132	NC_012972	AAC	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254028278
133	NC_012972	TGG	2	6	6872	6877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
134	NC_012972	GCT	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254028278
135	NC_012972	GTG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
136	NC_012972	AGG	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028278
137	NC_012972	ACC	2	6	7011	7016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028278
138	NC_012972	TGG	2	6	7079	7084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028278
139	NC_012972	AGCA	2	8	7091	7098	50 %	0 %	25 %	25 %	254028278
140	NC_012972	TGCCAT	2	12	7106	7117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254028278
141	NC_012972	TGT	2	6	7284	7289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254028278
142	NC_012972	GAA	2	6	7337	7342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254028278
143	NC_012972	ACC	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028278
144	NC_012972	T	6	6	7507	7512	0 %	100 %	0 %	0 %	254028278
145	NC_012972	AAT	2	6	7545	7550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254028278
146	NC_012972	TTC	2	6	7560	7565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028278
147	NC_012972	A	6	6	7694	7699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012972	CTT	2	6	7772	7777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028279
149	NC_012972	ACC	2	6	7788	7793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028279
150	NC_012972	TTCACC	2	12	7826	7837	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	254028279
151	NC_012972	GGCTTG	2	12	7871	7882	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	254028279
152	NC_012972	GCA	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028279
153	NC_012972	TTC	2	6	7947	7952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028279
154	NC_012972	AATGA	2	10	7978	7987	60 %	20 %	20 %	0 %	254028280
155	NC_012972	CGG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028280
156	NC_012972	AC	3	6	8110	8115	50 %	0 %	0 %	50 %	254028280
157	NC_012972	CGG	2	6	8183	8188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028280
158	NC_012972	CCG	2	6	8227	8232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254028280
159	NC_012972	GT	3	6	8405	8410	0 %	50 %	50 %	0 %	254028281
160	NC_012972	ATGG	2	8	8440	8447	25 %	25 %	50 %	0 %	254028281
161	NC_012972	GCTT	2	8	8500	8507	0 %	50 %	25 %	25 %	254028281
162	NC_012972	GCG	2	6	8512	8517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
163	NC_012972	GCG	2	6	8573	8578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
164	NC_012972	GGT	2	6	8712	8717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254028281
165	NC_012972	AGG	2	6	8894	8899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254028281
166	NC_012972	GCG	2	6	8947	8952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254028281
167	NC_012972	TTC	2	6	8971	8976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028281
168	NC_012972	T	6	6	9003	9008	0 %	100 %	0 %	0 %	254028281
169	NC_012972	CCA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254028281
170	NC_012972	TA	3	6	9141	9146	50 %	50 %	0 %	0 %	254028281
171	NC_012972	GCC	2	6	9228	9233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_012972	CT	3	6	9277	9282	0 %	50 %	0 %	50 %	254028282
173	NC_012972	CTGA	2	8	9286	9293	25 %	25 %	25 %	25 %	254028282
174	NC_012972	AGCC	2	8	9366	9373	25 %	0 %	25 %	50 %	254028282
175	NC_012972	CTA	2	6	9411	9416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254028282
176	NC_012972	GT	3	6	9518	9523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012972	TTGA	2	8	9533	9540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012972	TCT	2	6	9722	9727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254028283
179	NC_012972	ACG	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254028283
180	NC_012972	AGTG	2	8	9798	9805	25 %	25 %	50 %	0 %	254028283

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.