MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012943	CG	5	10	127380	127389	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3002	NC_012943	GCA	2	6	127397	127402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3003	NC_012943	CGG	2	6	127406	127411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3004	NC_012943	GGT	2	6	127422	127427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797025
3005	NC_012943	TGC	2	6	127457	127462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3006	NC_012943	GC	3	6	127469	127474	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3007	NC_012943	ACC	2	6	127477	127482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3008	NC_012943	GCGAG	2	10	127557	127566	20 %	0 %	60 %	20 %	253797025
3009	NC_012943	GCG	2	6	127600	127605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3010	NC_012943	CCA	2	6	127625	127630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3011	NC_012943	GCA	2	6	127706	127711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3012	NC_012943	GCC	2	6	127734	127739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3013	NC_012943	GCA	2	6	127754	127759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3014	NC_012943	GCC	2	6	127798	127803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3015	NC_012943	CCG	2	6	127820	127825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3016	NC_012943	CG	3	6	127830	127835	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3017	NC_012943	GCG	2	6	127840	127845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3018	NC_012943	CG	3	6	127872	127877	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3019	NC_012943	CGA	2	6	127889	127894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3020	NC_012943	TGC	2	6	127898	127903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3021	NC_012943	TCG	2	6	127996	128001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3022	NC_012943	CCA	2	6	128018	128023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3023	NC_012943	GC	3	6	128028	128033	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3024	NC_012943	CCG	2	6	128036	128041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3025	NC_012943	ACC	2	6	128044	128049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3026	NC_012943	GCC	2	6	128128	128133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3027	NC_012943	CCG	2	6	128159	128164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3028	NC_012943	CAC	3	9	128166	128174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3029	NC_012943	CGG	2	6	128210	128215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3030	NC_012943	CCG	2	6	128216	128221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3031	NC_012943	TCA	2	6	128267	128272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797025
3032	NC_012943	TGC	2	6	128300	128305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3033	NC_012943	TGC	2	6	128319	128324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3034	NC_012943	GCG	2	6	128417	128422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3035	NC_012943	GTC	2	6	128445	128450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3036	NC_012943	GCC	2	6	128459	128464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3037	NC_012943	GCC	2	6	128502	128507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3038	NC_012943	GGGGT	2	10	128566	128575	0 %	20 %	80 %	0 %	253797025
3039	NC_012943	GCA	2	6	128585	128590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3040	NC_012943	GGC	2	6	128595	128600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3041	NC_012943	GCGGCA	2	12	128629	128640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	253797025
3042	NC_012943	GCTG	2	8	128667	128674	0 %	25 %	50 %	25 %	253797025
3043	NC_012943	TGG	2	6	128678	128683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797025
3044	NC_012943	CAA	2	6	128706	128711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797025
3045	NC_012943	GGT	2	6	128724	128729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797025
3046	NC_012943	CCG	2	6	128801	128806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3047	NC_012943	TCG	2	6	128863	128868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3048	NC_012943	CG	3	6	128967	128972	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3049	NC_012943	ACC	2	6	129067	129072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3050	NC_012943	GCA	2	6	129098	129103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3051	NC_012943	CCCAC	2	10	129128	129137	20 %	0 %	0 %	80 %	253797025
3052	NC_012943	ACC	2	6	129166	129171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3053	NC_012943	TCGGGT	2	12	129268	129279	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253797025
3054	NC_012943	GTC	3	9	129324	129332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3055	NC_012943	TGCA	2	8	129354	129361	25 %	25 %	25 %	25 %	253797025
3056	NC_012943	ACC	2	6	129406	129411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3057	NC_012943	GGC	2	6	129425	129430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3058	NC_012943	CCG	2	6	129488	129493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3059	NC_012943	GCCG	2	8	129546	129553	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
3060	NC_012943	ACC	2	6	129564	129569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3061	NC_012943	CCA	2	6	129575	129580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3062	NC_012943	CCGGC	2	10	129638	129647	0 %	0 %	40 %	60 %	253797025
3063	NC_012943	CCG	2	6	129688	129693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3064	NC_012943	ACG	2	6	129697	129702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3065	NC_012943	GCC	2	6	129718	129723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
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3067	NC_012943	CGA	2	6	129768	129773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
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3069	NC_012943	CAC	2	6	129783	129788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3070	NC_012943	GCC	2	6	129853	129858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
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3072	NC_012943	GCC	3	9	129931	129939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3073	NC_012943	GCG	2	6	129946	129951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
3074	NC_012943	TGG	2	6	130040	130045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797025
3075	NC_012943	TGCGG	2	10	130048	130057	0 %	20 %	60 %	20 %	253797025
3076	NC_012943	CGA	2	6	130182	130187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797025
3077	NC_012943	CCAG	2	8	130195	130202	25 %	0 %	25 %	50 %	253797025
3078	NC_012943	ACC	2	6	130285	130290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3079	NC_012943	CTC	2	6	130350	130355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797025
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3082	NC_012943	CAC	2	6	130512	130517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3083	NC_012943	CAC	2	6	130524	130529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3084	NC_012943	CCG	2	6	130571	130576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3085	NC_012943	CTGT	2	8	130613	130620	0 %	50 %	25 %	25 %	253797025
3086	NC_012943	CAC	2	6	130637	130642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
3087	NC_012943	GCGA	2	8	130799	130806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3088	NC_012943	CGGG	2	8	130842	130849	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_012943	ACG	2	6	130899	130904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_012943	G	6	6	131007	131012	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_012943	CGA	2	6	131014	131019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012943	GGT	2	6	131038	131043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797026
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3094	NC_012943	TGG	2	6	131097	131102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797026
3095	NC_012943	CAC	2	6	131126	131131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797026
3096	NC_012943	CGG	2	6	131348	131353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_012943	GCTC	2	8	131354	131361	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3098	NC_012943	GGT	2	6	131365	131370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012943	CCA	2	6	131477	131482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797027
3100	NC_012943	ATCAC	2	10	131527	131536	40 %	20 %	0 %	40 %	253797027
3101	NC_012943	GCG	2	6	131551	131556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3102	NC_012943	ATCGG	2	10	131575	131584	20 %	20 %	40 %	20 %	253797027
3103	NC_012943	CGA	2	6	131618	131623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797027
3104	NC_012943	GCA	2	6	131826	131831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797027
3105	NC_012943	CCCA	2	8	131857	131864	25 %	0 %	0 %	75 %	253797027
3106	NC_012943	ATC	2	6	131884	131889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797027
3107	NC_012943	CGG	2	6	131937	131942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
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3109	NC_012943	CGG	2	6	131976	131981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3110	NC_012943	GGT	2	6	131995	132000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797027
3111	NC_012943	CGG	2	6	132003	132008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3112	NC_012943	CGG	2	6	132030	132035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3113	NC_012943	CGG	2	6	132039	132044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3114	NC_012943	CGG	2	6	132048	132053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3115	NC_012943	GCGG	2	8	132073	132080	0 %	0 %	75 %	25 %	253797027
3116	NC_012943	GGCG	2	8	132081	132088	0 %	0 %	75 %	25 %	253797027
3117	NC_012943	GCT	2	6	132099	132104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797027
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3120	NC_012943	CAC	2	6	132144	132149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797027
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3122	NC_012943	CGG	2	6	132213	132218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3123	NC_012943	GCG	2	6	132224	132229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
3124	NC_012943	CGG	2	6	132231	132236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797027
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3229	NC_012943	CGTTG	2	10	135702	135711	0 %	40 %	40 %	20 %	253797029
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3231	NC_012943	CGACC	2	10	135774	135783	20 %	0 %	20 %	60 %	253797029
3232	NC_012943	AGCG	2	8	135812	135819	25 %	0 %	50 %	25 %	253797029
3233	NC_012943	CAC	2	6	135858	135863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797029
3234	NC_012943	CGG	2	6	135879	135884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797029
3235	NC_012943	GGA	2	6	135912	135917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797029
3236	NC_012943	CAA	2	6	135999	136004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253797029
3237	NC_012943	CCG	2	6	136142	136147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3238	NC_012943	TG	3	6	136188	136193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_012943	TGA	2	6	136209	136214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_012943	GTG	2	6	136225	136230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_012943	GC	4	8	136323	136330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3242	NC_012943	ATG	2	6	136452	136457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797030
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3244	NC_012943	CTAC	2	8	136507	136514	25 %	25 %	0 %	50 %	253797030
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3368	NC_012943	CGC	2	6	142563	142568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797036
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3487	NC_012943	TGA	2	6	147463	147468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797038
3488	NC_012943	CG	3	6	147473	147478	0 %	0 %	50 %	50 %	253797038
3489	NC_012943	TCG	2	6	147525	147530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797038
3490	NC_012943	CGG	2	6	147568	147573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797038
3491	NC_012943	CGA	2	6	147625	147630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797038
3492	NC_012943	CGT	2	6	147646	147651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797038
3493	NC_012943	TCG	2	6	147705	147710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797038
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3500	NC_012943	CCA	2	6	147817	147822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797038

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