MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 109595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012943	AGG	2	6	105425	105430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_012943	GGC	2	6	105439	105444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2503	NC_012943	ATGG	2	8	105451	105458	25 %	25 %	50 %	0 %	253797014
2504	NC_012943	ACC	2	6	105463	105468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797014
2505	NC_012943	TTG	2	6	105519	105524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797014
2506	NC_012943	GCA	2	6	105529	105534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2507	NC_012943	TTG	2	6	105587	105592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797014
2508	NC_012943	CAG	2	6	105607	105612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2509	NC_012943	CCG	2	6	105624	105629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2510	NC_012943	CTGGC	2	10	105662	105671	0 %	20 %	40 %	40 %	253797014
2511	NC_012943	CCG	2	6	105702	105707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2512	NC_012943	GCTGCC	2	12	105722	105733	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	253797014
2513	NC_012943	CAG	2	6	105765	105770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2514	NC_012943	GCC	2	6	105776	105781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2515	NC_012943	CCA	2	6	105810	105815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797014
2516	NC_012943	CTT	2	6	105817	105822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797014
2517	NC_012943	GCC	2	6	105884	105889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2518	NC_012943	GCC	2	6	105899	105904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2519	NC_012943	CG	3	6	105968	105973	0 %	0 %	50 %	50 %	253797014
2520	NC_012943	CGG	2	6	105976	105981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797014
2521	NC_012943	GTC	2	6	106118	106123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2522	NC_012943	TTG	2	6	106131	106136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253797014
2523	NC_012943	CTTT	2	8	106153	106160	0 %	75 %	0 %	25 %	253797014
2524	NC_012943	CCTGCT	2	12	106186	106197	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	253797014
2525	NC_012943	TTC	2	6	106202	106207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797014
2526	NC_012943	GC	3	6	106239	106244	0 %	0 %	50 %	50 %	253797014
2527	NC_012943	CGC	2	6	106288	106293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2528	NC_012943	TGGCTG	2	12	106329	106340	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	253797014
2529	NC_012943	CGG	2	6	106353	106358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797014
2530	NC_012943	CGG	2	6	106366	106371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797014
2531	NC_012943	GCCC	2	8	106374	106381	0 %	0 %	25 %	75 %	253797014
2532	NC_012943	CGCC	2	8	106395	106402	0 %	0 %	25 %	75 %	253797014
2533	NC_012943	CCG	3	9	106524	106532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2534	NC_012943	GCA	2	6	106553	106558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2535	NC_012943	GAA	2	6	106584	106589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797014
2536	NC_012943	GCG	2	6	106602	106607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797014
2537	NC_012943	CGA	2	6	106627	106632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2538	NC_012943	CGC	2	6	106660	106665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797014
2539	NC_012943	GCG	2	6	106749	106754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797014
2540	NC_012943	GTC	2	6	106777	106782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2541	NC_012943	GCACA	2	10	106783	106792	40 %	0 %	20 %	40 %	253797014
2542	NC_012943	TGC	2	6	106809	106814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797014
2543	NC_012943	ACC	2	6	106940	106945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797015
2544	NC_012943	TCA	2	6	107019	107024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797015
2545	NC_012943	ACC	2	6	107085	107090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797015
2546	NC_012943	TCC	2	6	107105	107110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797015
2547	NC_012943	TGC	2	6	107199	107204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797015
2548	NC_012943	CGC	2	6	107275	107280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797015
2549	NC_012943	CAC	2	6	107476	107481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797015
2550	NC_012943	TGC	2	6	107523	107528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797015
2551	NC_012943	CATA	2	8	107581	107588	50 %	25 %	0 %	25 %	253797015
2552	NC_012943	CAT	2	6	107611	107616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797015
2553	NC_012943	GAC	2	6	107677	107682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797015
2554	NC_012943	CTG	2	6	107803	107808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797016
2555	NC_012943	TCGA	2	8	108046	108053	25 %	25 %	25 %	25 %	253797016
2556	NC_012943	ACT	2	6	108056	108061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797016
2557	NC_012943	CT	3	6	108073	108078	0 %	50 %	0 %	50 %	253797016
2558	NC_012943	CAT	2	6	108098	108103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797016
2559	NC_012943	CCT	2	6	108147	108152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797016
2560	NC_012943	CGAA	2	8	108174	108181	50 %	0 %	25 %	25 %	253797016
2561	NC_012943	CGG	2	6	108231	108236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797016
2562	NC_012943	GGC	2	6	108237	108242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797016
2563	NC_012943	GGA	2	6	108290	108295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797017
2564	NC_012943	AAG	2	6	108296	108301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253797017
2565	NC_012943	GCA	2	6	108361	108366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797017
2566	NC_012943	TCG	2	6	108426	108431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797017
2567	NC_012943	TGG	2	6	108439	108444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797017
2568	NC_012943	TCG	2	6	108639	108644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797017
2569	NC_012943	CCG	2	6	108669	108674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797017
2570	NC_012943	CAGC	2	8	108756	108763	25 %	0 %	25 %	50 %	253797017
2571	NC_012943	GAT	2	6	108805	108810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797017
2572	NC_012943	CTT	2	6	108865	108870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253797017
2573	NC_012943	GTC	2	6	108920	108925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797017
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2577	NC_012943	CCTG	2	8	108987	108994	0 %	25 %	25 %	50 %	253797017
2578	NC_012943	CGG	2	6	109000	109005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797017
2579	NC_012943	TG	3	6	109008	109013	0 %	50 %	50 %	0 %	253797017
2580	NC_012943	CGG	2	6	109018	109023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797017
2581	NC_012943	CAC	2	6	109054	109059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797017
2582	NC_012943	CGA	2	6	109071	109076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797017
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2584	NC_012943	AGTT	2	8	109104	109111	25 %	50 %	25 %	0 %	253797017
2585	NC_012943	CTGAA	2	10	109113	109122	40 %	20 %	20 %	20 %	253797017
2586	NC_012943	GGT	2	6	109166	109171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797017
2587	NC_012943	CCGA	2	8	109274	109281	25 %	0 %	25 %	50 %	253797017
2588	NC_012943	CCGT	2	8	109321	109328	0 %	25 %	25 %	50 %	253797017
2589	NC_012943	CTG	2	6	109511	109516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797017
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2591	NC_012943	GAT	2	6	109564	109569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253797017
2592	NC_012943	TGG	2	6	109576	109581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797017
2593	NC_012943	CGA	2	6	109597	109602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797017
2594	NC_012943	ATCGC	2	10	109608	109617	20 %	20 %	20 %	40 %	253797017
2595	NC_012943	GC	3	6	109677	109682	0 %	0 %	50 %	50 %	253797017
2596	NC_012943	TGG	2	6	109683	109688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797017
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2599	NC_012943	TCGT	2	8	109896	109903	0 %	50 %	25 %	25 %	253797017
2600	NC_012943	CGC	2	6	109931	109936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797018
2601	NC_012943	CGA	2	6	109958	109963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797018
2602	NC_012943	CGA	2	6	109982	109987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797018
2603	NC_012943	CTG	2	6	110031	110036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797018
2604	NC_012943	AGC	2	6	110041	110046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253797018
2605	NC_012943	TG	3	6	110129	110134	0 %	50 %	50 %	0 %	253797018
2606	NC_012943	CCG	2	6	110233	110238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797019
2607	NC_012943	CACC	2	8	110494	110501	25 %	0 %	0 %	75 %	253797019
2608	NC_012943	CTG	2	6	110507	110512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797019
2609	NC_012943	CGG	2	6	110515	110520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797019
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2611	NC_012943	CGG	2	6	110571	110576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797019
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2616	NC_012943	TGG	2	6	110850	110855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797019
2617	NC_012943	GCG	2	6	110858	110863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797019
2618	NC_012943	TCTGA	2	10	110942	110951	20 %	40 %	20 %	20 %	253797019
2619	NC_012943	GAG	2	6	111080	111085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253797019
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2621	NC_012943	CGGTC	2	10	111217	111226	0 %	20 %	40 %	40 %	253797019
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2744	NC_012943	TGC	2	6	116256	116261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797019
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2984	NC_012943	CGT	2	6	126641	126646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253797025
2985	NC_012943	GCC	2	6	126694	126699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
2986	NC_012943	CGG	2	6	126749	126754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
2987	NC_012943	CCT	2	6	126770	126775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253797025
2988	NC_012943	CG	3	6	126811	126816	0 %	0 %	50 %	50 %	253797025
2989	NC_012943	CCG	2	6	126818	126823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
2990	NC_012943	GGCG	2	8	126836	126843	0 %	0 %	75 %	25 %	253797025
2991	NC_012943	CAC	2	6	126882	126887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
2992	NC_012943	GCGTCG	2	12	127000	127011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797025
2993	NC_012943	TCA	2	6	127018	127023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797025
2994	NC_012943	GGT	2	6	127026	127031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253797025
2995	NC_012943	TGCGC	2	10	127046	127055	0 %	20 %	40 %	40 %	253797025
2996	NC_012943	CGG	2	6	127220	127225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253797025
2997	NC_012943	CAC	2	6	127263	127268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253797025
2998	NC_012943	CTA	2	6	127288	127293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253797025
2999	NC_012943	GCC	2	6	127315	127320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253797025
3000	NC_012943	GCGTGC	2	12	127342	127353	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253797025

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