MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	GCGCG	2	10	666	675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012807	GCACG	3	15	2007	2021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012807	TCCCC	2	10	4506	4515	0 %	20 %	0 %	80 %	240111942
4	NC_012807	GTGGA	2	10	5714	5723	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012807	CGGCG	2	10	5736	5745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012807	CAGGG	2	10	7531	7540	20 %	0 %	60 %	20 %	240111944
7	NC_012807	GGGGA	2	10	8847	8856	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012807	GCCGG	2	10	9383	9392	0 %	0 %	60 %	40 %	240111945
9	NC_012807	GAGAG	2	10	10714	10723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012807	TCACA	2	10	11101	11110	40 %	20 %	0 %	40 %	240111948
11	NC_012807	ACAGG	2	10	13430	13439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012807	CAGAC	2	10	13512	13521	40 %	0 %	20 %	40 %	240111952
13	NC_012807	CGGCG	2	10	14452	14461	0 %	0 %	60 %	40 %	240111954
14	NC_012807	CAGCG	2	10	16511	16520	20 %	0 %	40 %	40 %	240111957
15	NC_012807	GCGCC	2	10	17594	17603	0 %	0 %	40 %	60 %	240111957
16	NC_012807	GTCGC	2	10	17653	17662	0 %	20 %	40 %	40 %	240111957
17	NC_012807	TCGGG	2	10	18724	18733	0 %	20 %	60 %	20 %	240111957
18	NC_012807	GCCGA	2	10	19004	19013	20 %	0 %	40 %	40 %	240111957
19	NC_012807	GCGCC	2	10	20048	20057	0 %	0 %	40 %	60 %	240111958
20	NC_012807	GTGCG	2	10	20805	20814	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012807	GCCGC	2	10	21750	21759	0 %	0 %	40 %	60 %	240111961
22	NC_012807	ATCGG	2	10	23159	23168	20 %	20 %	40 %	20 %	240111962
23	NC_012807	CGGCG	2	10	24216	24225	0 %	0 %	60 %	40 %	240111963
24	NC_012807	CGACC	2	10	26389	26398	20 %	0 %	20 %	60 %	240111966
25	NC_012807	GAGCG	2	10	26420	26429	20 %	0 %	60 %	20 %	240111966
26	NC_012807	TCCAC	2	10	26759	26768	20 %	20 %	0 %	60 %	240111967
27	NC_012807	GCTGA	2	10	27797	27806	20 %	20 %	40 %	20 %	240111969
28	NC_012807	GCAGT	2	10	29045	29054	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012807	GCCGC	2	10	31198	31207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_012807	CGACG	2	10	31286	31295	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_012807	TCCCG	2	10	32815	32824	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_012807	GTTTG	2	10	32865	32874	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012807	CGAGC	2	10	33271	33280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_012807	GTCCG	2	10	35989	35998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_012807	GCGTT	2	10	36422	36431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012807	TTAAT	2	10	36599	36608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012807	AGCGC	2	10	37951	37960	20 %	0 %	40 %	40 %	240111971
38	NC_012807	GGCTG	2	10	37974	37983	0 %	20 %	60 %	20 %	240111971
39	NC_012807	TCCGC	2	10	38419	38428	0 %	20 %	20 %	60 %	240111971
40	NC_012807	GCGCC	2	10	40079	40088	0 %	0 %	40 %	60 %	240111971
41	NC_012807	TCGGC	2	10	40632	40641	0 %	20 %	40 %	40 %	240111971
42	NC_012807	CGCTC	2	10	40899	40908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_012807	GCCGA	2	10	42427	42436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012807	GCCGG	2	10	43906	43915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.