MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL7

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012002	GGA	2	6	53	58	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012002	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
3	NC_012002	TTC	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
4	NC_012002	TCG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143514
5	NC_012002	TCA	2	6	535	540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143514
6	NC_012002	ACA	2	6	658	663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143514
7	NC_012002	CCA	2	6	676	681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222143514
8	NC_012002	CTT	2	6	728	733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
9	NC_012002	TTC	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143514
10	NC_012002	AAT	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143514
11	NC_012002	TTA	2	6	808	813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143514
12	NC_012002	TCC	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143515
13	NC_012002	CTT	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
14	NC_012002	TTG	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
15	NC_012002	GTT	2	6	1112	1117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222143515
16	NC_012002	AAC	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143515
17	NC_012002	TCT	2	6	1176	1181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143515
18	NC_012002	CAA	2	6	1510	1515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012002	CAG	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012002	CCT	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012002	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143516
22	NC_012002	GAC	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
23	NC_012002	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143516
24	NC_012002	TTC	3	9	2077	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
25	NC_012002	AAG	2	6	2172	2177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143516
26	NC_012002	GCA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222143516
27	NC_012002	TTC	2	6	2244	2249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143516
28	NC_012002	CTC	2	6	2281	2286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012002	TGG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012002	ATC	2	6	2316	2321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012002	TCA	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222143517
32	NC_012002	TCT	2	6	2467	2472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
33	NC_012002	GTA	2	6	2724	2729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222143517
34	NC_012002	TTC	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
35	NC_012002	TTA	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222143517
36	NC_012002	ACA	2	6	2923	2928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143517
37	NC_012002	TCC	2	6	2950	2955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222143517
38	NC_012002	AAT	2	6	3162	3167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143517
39	NC_012002	GAA	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222143517
40	NC_012002	TTC	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143517
41	NC_012002	ATT	2	6	3299	3304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012002	TTA	2	6	3464	3469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012002	AGT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012002	CTG	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
45	NC_012002	TCT	2	6	3661	3666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518
46	NC_012002	CTG	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222143518
47	NC_012002	GAG	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222143518
48	NC_012002	ATA	2	6	3756	3761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222143518
49	NC_012002	CAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222143518
50	NC_012002	TTC	2	6	3960	3965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222143518
51	NC_012002	GTC	2	6	4017	4022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.