MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011999	CACTTA	2	12	1278011	1278022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222151416
502	NC_011999	TTTACA	2	12	1278495	1278506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151418
503	NC_011999	AGGAGA	2	12	1280443	1280454	50 %	0 %	50 %	0 %	222151420
504	NC_011999	TTTCTT	2	12	1280589	1280600	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222151420
505	NC_011999	TAAAAA	2	12	1280776	1280787	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011999	TCATCT	2	12	1281950	1281961	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151422
507	NC_011999	TAAAAA	2	12	1288435	1288446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222151428
508	NC_011999	ATTCTC	2	12	1289863	1289874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151431
509	NC_011999	TTTTCT	2	12	1293700	1293711	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222151435
510	NC_011999	TACTGA	2	12	1294325	1294336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222151437
511	NC_011999	CCTTAT	2	12	1296586	1296597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151439
512	NC_011999	TATCAC	2	12	1298364	1298375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222151441
513	NC_011999	TCTTTA	2	12	1302409	1302420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222151446
514	NC_011999	GTGATG	2	12	1307934	1307945	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	222151451
515	NC_011999	AAACAA	2	12	1309831	1309842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_011999	TCAATA	2	12	1311190	1311201	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151455
517	NC_011999	TTCGAT	2	12	1311492	1311503	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222151455
518	NC_011999	CCTGAA	2	12	1312642	1312653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222151456
519	NC_011999	CGTGAC	2	12	1321467	1321478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222151464
520	NC_011999	GCTTCC	2	12	1326740	1326751	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	222151473
521	NC_011999	ACGATA	2	12	1327532	1327543	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222151473
522	NC_011999	TTTACG	2	12	1328376	1328387	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
523	NC_011999	AATACG	2	12	1329320	1329331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222151475
524	NC_011999	GACTTC	2	12	1332070	1332081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151478
525	NC_011999	TTGACT	2	12	1333002	1333013	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
526	NC_011999	CTTTTT	2	12	1333247	1333258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222151479
527	NC_011999	ATGAAG	2	12	1333421	1333432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222151479
528	NC_011999	GTTTCT	2	12	1335442	1335453	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222151480
529	NC_011999	CCCGGC	2	12	1336910	1336921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222151482
530	NC_011999	GAATAT	2	12	1337659	1337670	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222151482
531	NC_011999	GAAATG	2	12	1340919	1340930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222151484
532	NC_011999	ATTTGG	2	12	1341255	1341266	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011999	AATAAG	2	12	1342205	1342216	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222151485
534	NC_011999	ATCAAA	2	12	1348363	1348374	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222151493
535	NC_011999	ACCTGA	2	12	1352133	1352144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222151497
536	NC_011999	TTTTCT	2	12	1356105	1356116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222151501
537	NC_011999	ACTTCC	2	12	1357699	1357710	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222151505
538	NC_011999	CTTTTA	2	12	1357868	1357879	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222151505
539	NC_011999	CTGGTC	2	12	1361241	1361252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222151506
540	NC_011999	TTATAG	2	12	1373239	1373250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222151515
541	NC_011999	TATGCA	2	12	1373376	1373387	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_011999	TGCATC	2	12	1374814	1374825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151517
543	NC_011999	TGCACT	2	12	1375719	1375730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151518
544	NC_011999	TTCATA	2	12	1377491	1377502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151519
545	NC_011999	CTTCAT	2	12	1379138	1379149	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151520
546	NC_011999	TATTAA	2	12	1381518	1381529	50 %	50 %	0 %	0 %	222151522
547	NC_011999	ATTTTA	2	12	1384276	1384287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222151523
548	NC_011999	TCAGCA	2	12	1387010	1387021	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222151525
549	NC_011999	ACTTTC	2	12	1388555	1388566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151527
550	NC_011999	TTTATA	2	12	1389166	1389177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222151528
551	NC_011999	AAATTC	2	12	1389352	1389363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151529
552	NC_011999	TCATAT	2	12	1390655	1390666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151530
553	NC_011999	ACTTTA	2	12	1393066	1393077	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151534
554	NC_011999	TATTAA	2	12	1399767	1399778	50 %	50 %	0 %	0 %	222151540
555	NC_011999	CGTATG	2	12	1400474	1400485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151541
556	NC_011999	GCAGAA	2	12	1401021	1401032	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	222151542
557	NC_011999	TTCATT	2	12	1408928	1408939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222151547
558	NC_011999	TTAATT	2	12	1409055	1409066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222151548
559	NC_011999	TTCAAG	2	12	1410628	1410639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222151549
560	NC_011999	TAAAAA	2	12	1413572	1413583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222151552
561	NC_011999	CACGTT	2	12	1414199	1414210	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151553
562	NC_011999	TGATCT	2	12	1417108	1417119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222151555
563	NC_011999	ACTGTT	2	12	1418537	1418548	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222151556
564	NC_011999	TCCGAT	2	12	1419955	1419966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151558
565	NC_011999	AAATTT	2	12	1423921	1423932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011999	ATATCA	2	12	1425014	1425025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151565
567	NC_011999	TCACCT	2	12	1426307	1426318	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222151565
568	NC_011999	GATAAA	2	12	1426795	1426806	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222151566
569	NC_011999	AAATTC	2	12	1432770	1432781	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151570
570	NC_011999	TTCAAT	2	12	1437412	1437423	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151573
571	NC_011999	CCTTTA	2	12	1438293	1438304	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151574
572	NC_011999	TTATTT	2	12	1439510	1439521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_011999	TCAATA	2	12	1441382	1441393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151576
574	NC_011999	GAAATT	2	12	1442617	1442628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222151578
575	NC_011999	AATCAT	2	12	1449114	1449125	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151583
576	NC_011999	TTTCAA	2	12	1450570	1450581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151584
577	NC_011999	ACTTTA	2	12	1456751	1456762	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151592
578	NC_011999	AAACTT	2	12	1456903	1456914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151592
579	NC_011999	TCGGAA	2	12	1457751	1457762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222151593
580	NC_011999	TAGCTC	2	12	1460260	1460271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151594
581	NC_011999	CTTAAT	2	12	1461974	1461985	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151595
582	NC_011999	ATCAAA	2	12	1462990	1463001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222151596
583	NC_011999	ATTTAT	2	12	1464075	1464086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011999	AATATT	2	12	1464594	1464605	50 %	50 %	0 %	0 %	222151598
585	NC_011999	TTACCT	2	12	1466272	1466283	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151601
586	NC_011999	CAATAT	2	12	1466372	1466383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151601
587	NC_011999	CGAATA	2	12	1469914	1469925	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222151604
588	NC_011999	AATACC	2	12	1475254	1475265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222151608
589	NC_011999	TTCTTA	2	12	1477355	1477366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222151610
590	NC_011999	TCTTTA	2	12	1481459	1481470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
591	NC_011999	ATCAAT	2	12	1486044	1486055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151616
592	NC_011999	TCAAAG	2	12	1487392	1487403	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222151617
593	NC_011999	TCCATG	2	12	1490360	1490371	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151620
594	NC_011999	TGAGAT	2	12	1492227	1492238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222151622
595	NC_011999	AAGGCG	2	12	1498474	1498485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222151629
596	NC_011999	GTTAAA	2	12	1499541	1499552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222151630
597	NC_011999	AATGAA	2	12	1501879	1501890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222151633
598	NC_011999	AAATTT	2	12	1505123	1505134	50 %	50 %	0 %	0 %	222151635
599	NC_011999	TTACAA	2	12	1506387	1506398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151637
600	NC_011999	AGAGAT	2	12	1515333	1515344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011999	ATATTT	2	12	1519453	1519464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011999	GAAACA	2	12	1519717	1519728	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	222151650
603	NC_011999	ACCGCC	2	12	1520856	1520867	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	222151651
604	NC_011999	TATACA	2	12	1524683	1524694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222151654
605	NC_011999	CTACGA	2	12	1527032	1527043	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	222151655
606	NC_011999	GTGAAG	2	12	1531911	1531922	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	222151659
607	NC_011999	CTGGAT	2	12	1533678	1533689	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151661
608	NC_011999	TGTATG	2	12	1535168	1535179	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	222151662
609	NC_011999	CTTTCT	2	12	1538761	1538772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222151665
610	NC_011999	TTCAAT	2	12	1538885	1538896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151665
611	NC_011999	ACCTGC	2	12	1542022	1542033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	222151669
612	NC_011999	CTGCCG	2	12	1542246	1542257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222151669
613	NC_011999	GCAACA	2	12	1542635	1542646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222151669
614	NC_011999	TACTGT	2	12	1543541	1543552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222151670
615	NC_011999	ATAAAA	2	12	1547919	1547930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_011999	CAGATT	2	12	1548073	1548084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222151675
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622	NC_011999	GGCAAT	2	12	1560773	1560784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222151685
623	NC_011999	TATGAA	2	12	1562603	1562614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222151688
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627	NC_011999	CATGTG	2	12	1574595	1574606	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151702
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629	NC_011999	CATCTA	2	12	1578010	1578021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222151704
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631	NC_011999	CATCTC	2	12	1583245	1583256	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222151709
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634	NC_011999	ATATAA	2	12	1595799	1595810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011999	TAATTT	2	12	1599926	1599937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222151725
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637	NC_011999	ATCTGG	2	12	1606250	1606261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151730
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642	NC_011999	GTTGCA	2	12	1616311	1616322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151740
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645	NC_011999	GTTCAA	2	12	1622594	1622605	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222151745
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652	NC_011999	CCATTT	2	12	1639965	1639976	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222151761
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662	NC_011999	TTATTT	2	12	1667417	1667428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_011999	CTTACG	2	12	1676812	1676823	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151796
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668	NC_011999	TCCATA	2	12	1686138	1686149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222151805
669	NC_011999	TCCGAT	2	12	1687664	1687675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222151807
670	NC_011999	ATGCCG	2	12	1692133	1692144	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222151811
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678	NC_011999	TTAAAT	2	12	1713138	1713149	50 %	50 %	0 %	0 %	222151829
679	NC_011999	TACACC	2	12	1717152	1717163	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
680	NC_011999	CTTGAT	2	12	1720744	1720755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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693	NC_011999	AGAACC	2	12	1759342	1759353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	222151869
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701	NC_011999	AGCTTG	2	12	1778122	1778133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222151885
702	NC_011999	TGCACG	2	12	1780221	1780232	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222151886
703	NC_011999	ACCCTA	2	12	1783587	1783598	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222151889
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710	NC_011999	GTGCAC	2	12	1797568	1797579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222151903
711	NC_011999	GACTGG	2	12	1805202	1805213	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
712	NC_011999	ATAAAA	2	12	1807721	1807732	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222151913
713	NC_011999	TAAAGA	2	12	1811029	1811040	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222151916
714	NC_011999	GCATAT	2	12	1811689	1811700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222151917
715	NC_011999	ATTAGA	2	12	1812407	1812418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222151918
716	NC_011999	TATTGA	2	12	1813147	1813158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	222151918
717	NC_011999	ATTCAT	2	12	1816451	1816462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222151921
718	NC_011999	GAAAAA	2	12	1821311	1821322	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222151927
719	NC_011999	ATCAAC	2	12	1822202	1822213	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222151927
720	NC_011999	CACCTT	2	12	1824648	1824659	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	222151929
721	NC_011999	TGTGAA	2	12	1826018	1826029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222151930
722	NC_011999	CGCGTG	2	12	1833205	1833216	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	222151939
723	NC_011999	AAATAT	2	12	1840198	1840209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
724	NC_011999	CTTTAT	2	12	1843565	1843576	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222151951
725	NC_011999	TTTATC	2	12	1843903	1843914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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