MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402

Total Repeats: 48562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011999	TGC	2	6	21223	21228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011999	GAA	2	6	21254	21259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011999	ATT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011999	ATG	2	6	21288	21293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011999	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	222150267
506	NC_011999	AAG	2	6	21364	21369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150267
507	NC_011999	AAT	2	6	21387	21392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150267
508	NC_011999	TTA	2	6	21396	21401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150267
509	NC_011999	AGA	2	6	21457	21462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150267
510	NC_011999	CAA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150267
511	NC_011999	GGT	2	6	21564	21569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150267
512	NC_011999	TCAG	2	8	21582	21589	25 %	25 %	25 %	25 %	222150267
513	NC_011999	TAAA	2	8	21613	21620	75 %	25 %	0 %	0 %	222150267
514	NC_011999	ATG	2	6	21661	21666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150267
515	NC_011999	AGG	2	6	21762	21767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_011999	ATA	2	6	21768	21773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150268
517	NC_011999	CAGT	2	8	21824	21831	25 %	25 %	25 %	25 %	222150268
518	NC_011999	TAT	2	6	21861	21866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150268
519	NC_011999	ACAG	2	8	21903	21910	50 %	0 %	25 %	25 %	222150268
520	NC_011999	AT	3	6	21921	21926	50 %	50 %	0 %	0 %	222150268
521	NC_011999	GAT	2	6	21934	21939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150268
522	NC_011999	TAG	2	6	21963	21968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150268
523	NC_011999	TGG	2	6	22021	22026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150268
524	NC_011999	CGA	2	6	22118	22123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150268
525	NC_011999	TAT	2	6	22144	22149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150268
526	NC_011999	TAT	2	6	22210	22215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150268
527	NC_011999	TAA	2	6	22282	22287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150268
528	NC_011999	GAA	2	6	22292	22297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150268
529	NC_011999	TGATC	2	10	22381	22390	20 %	40 %	20 %	20 %	222150268
530	NC_011999	ATT	2	6	22391	22396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150268
531	NC_011999	GCA	2	6	22397	22402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150268
532	NC_011999	GGTA	2	8	22411	22418	25 %	25 %	50 %	0 %	222150268
533	NC_011999	GTA	2	6	22545	22550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150268
534	NC_011999	ATGG	2	8	22589	22596	25 %	25 %	50 %	0 %	222150268
535	NC_011999	AGA	2	6	22597	22602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150268
536	NC_011999	AT	5	10	22647	22656	50 %	50 %	0 %	0 %	222150268
537	NC_011999	GAT	2	6	22658	22663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150268
538	NC_011999	AGA	2	6	22703	22708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150268
539	NC_011999	TGAT	2	8	22740	22747	25 %	50 %	25 %	0 %	222150268
540	NC_011999	ACA	2	6	22795	22800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150268
541	NC_011999	GA	3	6	22840	22845	50 %	0 %	50 %	0 %	222150268
542	NC_011999	CGTGG	2	10	22883	22892	0 %	20 %	60 %	20 %	222150268
543	NC_011999	ATG	2	6	22916	22921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150268
544	NC_011999	GAA	3	9	23021	23029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150268
545	NC_011999	ATT	3	9	23069	23077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150268
546	NC_011999	ATA	2	6	23133	23138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150268
547	NC_011999	TAAT	2	8	23229	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011999	TGT	2	6	23250	23255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011999	A	6	6	23265	23270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011999	A	6	6	23287	23292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011999	ATTA	2	8	23307	23314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011999	TTAA	2	8	23327	23334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011999	TA	3	6	23388	23393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011999	TTA	2	6	23416	23421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011999	TCA	2	6	23505	23510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150269
556	NC_011999	GTT	2	6	23517	23522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150269
557	NC_011999	AAGGTA	2	12	23542	23553	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	222150269
558	NC_011999	AGA	2	6	23573	23578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150269
559	NC_011999	GTA	2	6	23715	23720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150269
560	NC_011999	ATT	2	6	23735	23740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150269
561	NC_011999	GTG	2	6	23767	23772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150269
562	NC_011999	AGA	3	9	23846	23854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150269
563	NC_011999	GTG	2	6	23860	23865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222150269
564	NC_011999	ATA	2	6	23866	23871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150269
565	NC_011999	ACG	2	6	23880	23885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150269
566	NC_011999	A	6	6	23886	23891	100 %	0 %	0 %	0 %	222150269
567	NC_011999	ATT	2	6	24020	24025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150269
568	NC_011999	TAT	2	6	24066	24071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150269
569	NC_011999	GTAAC	2	10	24235	24244	40 %	20 %	20 %	20 %	222150269
570	NC_011999	GTT	2	6	24282	24287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150269
571	NC_011999	ATT	2	6	24341	24346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150269
572	NC_011999	TGA	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150269
573	NC_011999	TCA	2	6	24359	24364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150269
574	NC_011999	CGT	2	6	24411	24416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150269
575	NC_011999	GGTT	2	8	24420	24427	0 %	50 %	50 %	0 %	222150269
576	NC_011999	TGT	2	6	24434	24439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150269
577	NC_011999	TGGA	2	8	24544	24551	25 %	25 %	50 %	0 %	222150269
578	NC_011999	GAA	2	6	24612	24617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150269
579	NC_011999	ACGC	2	8	24676	24683	25 %	0 %	25 %	50 %	222150269
580	NC_011999	TCT	2	6	24730	24735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150269
581	NC_011999	ACTT	2	8	24763	24770	25 %	50 %	0 %	25 %	222150269
582	NC_011999	ATC	2	6	24798	24803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_011999	TAAAA	2	10	24823	24832	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011999	TCTT	2	8	24885	24892	0 %	75 %	0 %	25 %	222150270
585	NC_011999	CAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150270
586	NC_011999	TCA	2	6	24948	24953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150270
587	NC_011999	TTC	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222150270
588	NC_011999	AGA	2	6	25006	25011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150270
589	NC_011999	TCA	2	6	25023	25028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150270
590	NC_011999	TGA	2	6	25117	25122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150270
591	NC_011999	TCG	2	6	25140	25145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222150270
592	NC_011999	TTG	2	6	25151	25156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150270
593	NC_011999	AAG	2	6	25251	25256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150270
594	NC_011999	TTG	2	6	25299	25304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150270
595	NC_011999	ACC	2	6	25340	25345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150270
596	NC_011999	AAT	2	6	25440	25445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150270
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598	NC_011999	A	6	6	25527	25532	100 %	0 %	0 %	0 %	222150270
599	NC_011999	TCA	2	6	25585	25590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222150270
600	NC_011999	CAA	2	6	25603	25608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222150270
601	NC_011999	ACC	2	6	25610	25615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222150270
602	NC_011999	TAG	2	6	25619	25624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150270
603	NC_011999	AAT	2	6	25641	25646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150270
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605	NC_011999	TAA	2	6	25735	25740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150270
606	NC_011999	TGT	2	6	25762	25767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150270
607	NC_011999	AT	4	8	25781	25788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011999	TAA	2	6	25789	25794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011999	A	6	6	25803	25808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_011999	ATT	2	6	25815	25820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011999	AATC	2	8	25859	25866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_011999	A	7	7	25874	25880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011999	CGG	2	6	25921	25926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011999	GTG	2	6	25989	25994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011999	TGCC	2	8	26007	26014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
616	NC_011999	AAG	2	6	26061	26066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011999	TCT	2	6	26080	26085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011999	T	6	6	26085	26090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011999	AGT	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011999	ATGAG	2	10	26162	26171	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011999	AT	3	6	26177	26182	50 %	50 %	0 %	0 %	222150271
622	NC_011999	GTT	2	6	26196	26201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222150271
623	NC_011999	GAT	2	6	26205	26210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150271
624	NC_011999	AT	3	6	26227	26232	50 %	50 %	0 %	0 %	222150271
625	NC_011999	A	6	6	26247	26252	100 %	0 %	0 %	0 %	222150271
626	NC_011999	ATG	2	6	26278	26283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150271
627	NC_011999	GAT	2	6	26286	26291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150271
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629	NC_011999	ATT	2	6	26406	26411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222150271
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745	NC_011999	TA	3	6	31475	31480	50 %	50 %	0 %	0 %	222150275
746	NC_011999	ATA	2	6	31501	31506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150275
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752	NC_011999	GAAT	2	8	31879	31886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
753	NC_011999	AAT	2	6	31902	31907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222150276
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756	NC_011999	AAG	2	6	32063	32068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222150276
757	NC_011999	GAT	2	6	32095	32100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222150276
758	NC_011999	AGC	2	6	32132	32137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222150276
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