MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL2

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011996	AT	3	6	272	277	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
2	NC_011996	AT	3	6	350	355	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
3	NC_011996	AT	3	6	1241	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	222142577
4	NC_011996	AG	3	6	1455	1460	50 %	0 %	50 %	0 %	222142577
5	NC_011996	AT	3	6	1778	1783	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
6	NC_011996	AT	3	6	2277	2282	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
7	NC_011996	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	222142578
8	NC_011996	GA	3	6	3883	3888	50 %	0 %	50 %	0 %	222142578
9	NC_011996	AT	3	6	4709	4714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011996	AT	3	6	5260	5265	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
11	NC_011996	AT	3	6	5513	5518	50 %	50 %	0 %	0 %	222142579
12	NC_011996	AG	3	6	5578	5583	50 %	0 %	50 %	0 %	222142580
13	NC_011996	AT	3	6	5629	5634	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
14	NC_011996	AT	3	6	5706	5711	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
15	NC_011996	AC	3	6	6112	6117	50 %	0 %	0 %	50 %	222142580
16	NC_011996	AT	4	8	6119	6126	50 %	50 %	0 %	0 %	222142580
17	NC_011996	TA	3	6	6151	6156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011996	TA	3	6	6170	6175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011996	AT	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	222142581
20	NC_011996	GT	3	6	8593	8598	0 %	50 %	50 %	0 %	222142582
21	NC_011996	AT	3	6	8602	8607	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
22	NC_011996	AT	3	6	9054	9059	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
23	NC_011996	TA	3	6	9178	9183	50 %	50 %	0 %	0 %	222142582
24	NC_011996	AT	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
25	NC_011996	AT	3	6	9904	9909	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
26	NC_011996	AT	3	6	10012	10017	50 %	50 %	0 %	0 %	222142583
27	NC_011996	GA	3	6	10111	10116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011996	AG	3	6	10513	10518	50 %	0 %	50 %	0 %	222142584
29	NC_011996	TG	3	6	10995	11000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011996	TA	3	6	11017	11022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011996	GA	3	6	11278	11283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011996	GA	3	6	11428	11433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011996	TA	3	6	12175	12180	50 %	50 %	0 %	0 %	222142586
34	NC_011996	TA	3	6	12914	12919	50 %	50 %	0 %	0 %	222142586
35	NC_011996	AG	3	6	13273	13278	50 %	0 %	50 %	0 %	222142586
36	NC_011996	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	222142586
37	NC_011996	AG	3	6	14287	14292	50 %	0 %	50 %	0 %	222142588
38	NC_011996	AT	3	6	14772	14777	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
39	NC_011996	TA	3	6	15236	15241	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
40	NC_011996	AT	4	8	15344	15351	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
41	NC_011996	AT	3	6	15383	15388	50 %	50 %	0 %	0 %	222142588
42	NC_011996	GA	3	6	15390	15395	50 %	0 %	50 %	0 %	222142588
43	NC_011996	CA	3	6	15399	15404	50 %	0 %	0 %	50 %	222142588
44	NC_011996	GA	3	6	15653	15658	50 %	0 %	50 %	0 %	222142589
45	NC_011996	AG	3	6	15825	15830	50 %	0 %	50 %	0 %	222142589
46	NC_011996	TA	3	6	16679	16684	50 %	50 %	0 %	0 %	222142589
47	NC_011996	TA	3	6	16895	16900	50 %	50 %	0 %	0 %	222142589
48	NC_011996	TA	4	8	17631	17638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011996	AT	3	6	17681	17686	50 %	50 %	0 %	0 %	222142590
50	NC_011996	CA	3	6	18053	18058	50 %	0 %	0 %	50 %	222142590
51	NC_011996	TA	3	6	18191	18196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011996	TA	3	6	19445	19450	50 %	50 %	0 %	0 %	222142591
53	NC_011996	TA	5	10	20016	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	222142592
54	NC_011996	AT	3	6	20080	20085	50 %	50 %	0 %	0 %	222142593
55	NC_011996	CA	3	6	20626	20631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011996	AT	3	6	20728	20733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011996	AT	3	6	21259	21264	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
58	NC_011996	TA	3	6	21486	21491	50 %	50 %	0 %	0 %	222142594
59	NC_011996	AT	3	6	21649	21654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011996	AT	3	6	21766	21771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011996	TA	3	6	21847	21852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011996	AC	3	6	23300	23305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011996	TA	3	6	23927	23932	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
64	NC_011996	AT	3	6	24479	24484	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
65	NC_011996	AT	3	6	24569	24574	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
66	NC_011996	TA	3	6	24991	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
67	NC_011996	TA	3	6	25090	25095	50 %	50 %	0 %	0 %	222142598
68	NC_011996	AT	3	6	25477	25482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011996	TA	4	8	26512	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
70	NC_011996	AT	3	6	27228	27233	50 %	50 %	0 %	0 %	222142599
71	NC_011996	CT	3	6	27977	27982	0 %	50 %	0 %	50 %	222142600
72	NC_011996	AT	3	6	28550	28555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011996	AG	3	6	28705	28710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011996	AT	3	6	28737	28742	50 %	50 %	0 %	0 %	222142601
75	NC_011996	CT	3	6	28863	28868	0 %	50 %	0 %	50 %	222142601
76	NC_011996	AT	3	6	28970	28975	50 %	50 %	0 %	0 %	222142601
77	NC_011996	AT	3	6	30351	30356	50 %	50 %	0 %	0 %	222142602
78	NC_011996	GA	3	6	30363	30368	50 %	0 %	50 %	0 %	222142602
79	NC_011996	TA	3	6	30908	30913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011996	AT	3	6	31106	31111	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
81	NC_011996	TA	3	6	31693	31698	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
82	NC_011996	AG	3	6	31856	31861	50 %	0 %	50 %	0 %	222142603
83	NC_011996	TC	3	6	31905	31910	0 %	50 %	0 %	50 %	222142603
84	NC_011996	TA	3	6	31967	31972	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
85	NC_011996	TA	3	6	32151	32156	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
86	NC_011996	TA	3	6	32279	32284	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
87	NC_011996	TA	3	6	32294	32299	50 %	50 %	0 %	0 %	222142603
88	NC_011996	GA	4	8	32483	32490	50 %	0 %	50 %	0 %	222142603
89	NC_011996	AT	3	6	32944	32949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011996	TA	3	6	34504	34509	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
91	NC_011996	TA	3	6	34537	34542	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
92	NC_011996	AT	4	8	34547	34554	50 %	50 %	0 %	0 %	222142606
93	NC_011996	AT	3	6	35180	35185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011996	AT	3	6	35275	35280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011996	AT	4	8	35393	35400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011996	TA	3	6	35676	35681	50 %	50 %	0 %	0 %	222142607
97	NC_011996	TA	4	8	35713	35720	50 %	50 %	0 %	0 %	222142607
98	NC_011996	AT	3	6	36221	36226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011996	TA	3	6	36286	36291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011996	AT	3	6	37155	37160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_011996	AT	4	8	37492	37499	50 %	50 %	0 %	0 %	222142609
103	NC_011996	AT	3	6	37854	37859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011996	AT	3	6	38472	38477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011996	AT	4	8	38516	38523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011996	AT	3	6	39069	39074	50 %	50 %	0 %	0 %	222142611
107	NC_011996	AT	3	6	40677	40682	50 %	50 %	0 %	0 %	222142612
108	NC_011996	TA	3	6	40711	40716	50 %	50 %	0 %	0 %	222142612
109	NC_011996	TA	3	6	40966	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	222142612
110	NC_011996	AT	3	6	41517	41522	50 %	50 %	0 %	0 %	222142613
111	NC_011996	AT	3	6	42569	42574	50 %	50 %	0 %	0 %	222142614
112	NC_011996	AT	3	6	42653	42658	50 %	50 %	0 %	0 %	222142614
113	NC_011996	TA	3	6	42671	42676	50 %	50 %	0 %	0 %	222142614
114	NC_011996	TA	3	6	42976	42981	50 %	50 %	0 %	0 %	222142615
115	NC_011996	AC	3	6	43501	43506	50 %	0 %	0 %	50 %	222142616
116	NC_011996	TA	3	6	43771	43776	50 %	50 %	0 %	0 %	222142616
117	NC_011996	CT	3	6	43798	43803	0 %	50 %	0 %	50 %	222142616
118	NC_011996	AT	3	6	44391	44396	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
119	NC_011996	TA	3	6	44413	44418	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
120	NC_011996	AT	3	6	44513	44518	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
121	NC_011996	AT	3	6	44895	44900	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
122	NC_011996	TA	3	6	45162	45167	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
123	NC_011996	TA	3	6	45216	45221	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
124	NC_011996	TA	3	6	45386	45391	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
125	NC_011996	AT	3	6	45439	45444	50 %	50 %	0 %	0 %	222142617
126	NC_011996	TC	3	6	45692	45697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011996	GT	3	6	45922	45927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011996	CA	3	6	46542	46547	50 %	0 %	0 %	50 %	222142618
129	NC_011996	TA	3	6	46790	46795	50 %	50 %	0 %	0 %	222142618
130	NC_011996	TA	3	6	47256	47261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_011996	AT	3	6	49522	49527	50 %	50 %	0 %	0 %	222142620
133	NC_011996	GA	3	6	50388	50393	50 %	0 %	50 %	0 %	222142620
134	NC_011996	AT	3	6	51048	51053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011996	GA	3	6	51237	51242	50 %	0 %	50 %	0 %	222142621
136	NC_011996	TA	3	6	51340	51345	50 %	50 %	0 %	0 %	222142621
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138	NC_011996	AT	3	6	54316	54321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011996	AT	3	6	54385	54390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011996	TC	3	6	54637	54642	0 %	50 %	0 %	50 %	222142622
141	NC_011996	AT	3	6	54727	54732	50 %	50 %	0 %	0 %	222142622
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145	NC_011996	TA	3	6	55146	55151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011996	TA	3	6	55291	55296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011996	AG	3	6	55427	55432	50 %	0 %	50 %	0 %	222142623
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.