MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	AT	3	6	67	72	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011995	GC	4	8	869	876	0 %	0 %	50 %	50 %	222142562
3	NC_011995	AT	3	6	2014	2019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011995	GA	3	6	2811	2816	50 %	0 %	50 %	0 %	222142564
5	NC_011995	GA	3	6	3194	3199	50 %	0 %	50 %	0 %	222142564
6	NC_011995	AT	3	6	3355	3360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011995	AT	3	6	3460	3465	50 %	50 %	0 %	0 %	222142565
8	NC_011995	AT	4	8	4356	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
9	NC_011995	TC	3	6	4459	4464	0 %	50 %	0 %	50 %	222142566
10	NC_011995	TA	3	6	4506	4511	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
11	NC_011995	AT	4	8	4521	4528	50 %	50 %	0 %	0 %	222142566
12	NC_011995	GA	3	6	4740	4745	50 %	0 %	50 %	0 %	222142567
13	NC_011995	TA	3	6	4842	4847	50 %	50 %	0 %	0 %	222142567
14	NC_011995	TA	3	6	5064	5069	50 %	50 %	0 %	0 %	222142567
15	NC_011995	AT	3	6	5288	5293	50 %	50 %	0 %	0 %	222142567
16	NC_011995	AT	3	6	5375	5380	50 %	50 %	0 %	0 %	222142567
17	NC_011995	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	222142567
18	NC_011995	TA	3	6	6075	6080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011995	AT	3	6	6106	6111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011995	TA	3	6	6196	6201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011995	AG	4	8	7357	7364	50 %	0 %	50 %	0 %	222142569
22	NC_011995	AT	3	6	7577	7582	50 %	50 %	0 %	0 %	222142569
23	NC_011995	TA	3	6	7630	7635	50 %	50 %	0 %	0 %	222142569
24	NC_011995	TA	4	8	8152	8159	50 %	50 %	0 %	0 %	222142569
25	NC_011995	AG	3	6	8426	8431	50 %	0 %	50 %	0 %	222142570
26	NC_011995	TA	3	6	8621	8626	50 %	50 %	0 %	0 %	222142570
27	NC_011995	TA	3	6	8663	8668	50 %	50 %	0 %	0 %	222142570
28	NC_011995	TA	3	6	8932	8937	50 %	50 %	0 %	0 %	222142570
29	NC_011995	AT	3	6	9668	9673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011995	TA	3	6	9715	9720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011995	TA	3	6	10078	10083	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
32	NC_011995	AT	3	6	10202	10207	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
33	NC_011995	AT	3	6	10215	10220	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
34	NC_011995	TA	4	8	10324	10331	50 %	50 %	0 %	0 %	222142571
35	NC_011995	AT	3	6	11019	11024	50 %	50 %	0 %	0 %	222142572
36	NC_011995	AT	3	6	11145	11150	50 %	50 %	0 %	0 %	222142572
37	NC_011995	TA	3	6	11857	11862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011995	CA	3	6	11922	11927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011995	TA	3	6	11997	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011995	TC	3	6	12239	12244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011995	AT	3	6	12290	12295	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
42	NC_011995	TA	3	6	12749	12754	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
43	NC_011995	TA	3	6	13284	13289	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
44	NC_011995	AT	3	6	13423	13428	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
45	NC_011995	TA	3	6	13665	13670	50 %	50 %	0 %	0 %	222142573
46	NC_011995	GA	4	8	13765	13772	50 %	0 %	50 %	0 %	222142573

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.