MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL1

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011995	GTGAT	2	10	1065	1074	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011995	CATCA	2	10	1175	1184	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_011995	TGGAT	2	10	1461	1470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011995	AATCC	2	10	1495	1504	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011995	ATTCA	2	10	1702	1711	40 %	40 %	0 %	20 %	222142563
6	NC_011995	CTTTT	2	10	1861	1870	0 %	80 %	0 %	20 %	222142563
7	NC_011995	AAAGT	2	10	2413	2422	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011995	ATAAA	2	10	3176	3185	80 %	20 %	0 %	0 %	222142564
9	NC_011995	TAAAG	2	10	3324	3333	60 %	20 %	20 %	0 %	222142564
10	NC_011995	TAAAT	2	10	3861	3870	60 %	40 %	0 %	0 %	222142565
11	NC_011995	AGAAA	2	10	4558	4567	80 %	0 %	20 %	0 %	222142566
12	NC_011995	ACTAG	2	10	5563	5572	40 %	20 %	20 %	20 %	222142567
13	NC_011995	ATTAA	2	10	6562	6571	60 %	40 %	0 %	0 %	222142568
14	NC_011995	TAATT	2	10	7720	7729	40 %	60 %	0 %	0 %	222142569
15	NC_011995	ATTTT	2	10	8709	8718	20 %	80 %	0 %	0 %	222142570
16	NC_011995	TTCAT	2	10	10734	10743	20 %	60 %	0 %	20 %	222142571
17	NC_011995	GTTTT	2	10	12149	12158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011995	AGAGT	2	10	13655	13664	40 %	20 %	40 %	0 %	222142573
19	NC_011995	TTTTG	2	10	15217	15226	0 %	80 %	20 %	0 %	222142575

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.