MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	CGCC	2	8	137	144	0 %	0 %	25 %	75 %	220920001
2	NC_011893	CCCG	2	8	229	236	0 %	0 %	25 %	75 %	220920001
3	NC_011893	CCGG	2	8	722	729	0 %	0 %	50 %	50 %	220920001
4	NC_011893	ACGG	2	8	752	759	25 %	0 %	50 %	25 %	220920001
5	NC_011893	CTGA	2	8	1735	1742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011893	CACC	2	8	1858	1865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011893	CGCC	2	8	1916	1923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_011893	TTGT	2	8	1997	2004	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011893	ATCG	2	8	2201	2208	25 %	25 %	25 %	25 %	220920003
10	NC_011893	CTGA	2	8	2240	2247	25 %	25 %	25 %	25 %	220920003
11	NC_011893	GCCG	2	8	2434	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011893	CCGC	2	8	2517	2524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_011893	GCCG	2	8	3304	3311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011893	GGAA	2	8	3363	3370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011893	GCCC	2	8	3498	3505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_011893	GTTG	2	8	3584	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011893	TGAG	2	8	3596	3603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011893	CCCG	2	8	4461	4468	0 %	0 %	25 %	75 %	220920005
19	NC_011893	GCCC	2	8	4954	4961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_011893	CACG	2	8	5020	5027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011893	TGAG	2	8	6524	6531	25 %	25 %	50 %	0 %	220920007
22	NC_011893	CGCA	2	8	6568	6575	25 %	0 %	25 %	50 %	220920007
23	NC_011893	GCCG	2	8	7383	7390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011893	CCTT	2	8	7592	7599	0 %	50 %	0 %	50 %	220920008
25	NC_011893	CTCA	2	8	8297	8304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011893	GGCG	2	8	8388	8395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011893	GCGG	2	8	8403	8410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011893	ACCC	2	8	8725	8732	25 %	0 %	0 %	75 %	220920010
29	NC_011893	CGGC	2	8	9076	9083	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
30	NC_011893	GGCC	2	8	9244	9251	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
31	NC_011893	CAGC	2	8	9331	9338	25 %	0 %	25 %	50 %	220920010
32	NC_011893	CCAT	2	8	9612	9619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011893	CTGC	2	8	10055	10062	0 %	25 %	25 %	50 %	220920011
34	NC_011893	GACA	2	8	10651	10658	50 %	0 %	25 %	25 %	220920012
35	NC_011893	CATG	2	8	11002	11009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011893	CAAG	2	8	11056	11063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011893	CTGC	2	8	11550	11557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011893	GCGG	2	8	12106	12113	0 %	0 %	75 %	25 %	220920013
39	NC_011893	TCGC	2	8	13215	13222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011893	ATGG	2	8	13456	13463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011893	GCGG	2	8	13967	13974	0 %	0 %	75 %	25 %	220920017
42	NC_011893	ACGG	2	8	14487	14494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011893	GGAG	2	8	14508	14515	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011893	CGGG	2	8	14605	14612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011893	CGGC	2	8	14747	14754	0 %	0 %	50 %	50 %	220920019
46	NC_011893	TGCT	2	8	14850	14857	0 %	50 %	25 %	25 %	220920019
47	NC_011893	TGGA	2	8	15501	15508	25 %	25 %	50 %	0 %	220920020
48	NC_011893	TCGG	2	8	16128	16135	0 %	25 %	50 %	25 %	220920021
49	NC_011893	GCAA	2	8	16311	16318	50 %	0 %	25 %	25 %	220920022
50	NC_011893	TGGC	2	8	17213	17220	0 %	25 %	50 %	25 %	220920024
51	NC_011893	GAGC	2	8	17305	17312	25 %	0 %	50 %	25 %	220920024
52	NC_011893	CGAC	2	8	17448	17455	25 %	0 %	25 %	50 %	220920024
53	NC_011893	CCGC	2	8	17562	17569	0 %	0 %	25 %	75 %	220920024
54	NC_011893	CGGC	2	8	17810	17817	0 %	0 %	50 %	50 %	220920024
55	NC_011893	CGTG	2	8	18159	18166	0 %	25 %	50 %	25 %	220920025
56	NC_011893	CCGC	2	8	18269	18276	0 %	0 %	25 %	75 %	220920025
57	NC_011893	GCGG	2	8	18348	18355	0 %	0 %	75 %	25 %	220920025
58	NC_011893	CGGC	2	8	18396	18403	0 %	0 %	50 %	50 %	220920025
59	NC_011893	CGTG	2	8	18482	18489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011893	CCCG	2	8	18498	18505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011893	CCCG	2	8	18978	18985	0 %	0 %	25 %	75 %	220920026
62	NC_011893	CGAG	2	8	19348	19355	25 %	0 %	50 %	25 %	220920028
63	NC_011893	GCGA	2	8	19691	19698	25 %	0 %	50 %	25 %	220920029
64	NC_011893	CGGC	2	8	19705	19712	0 %	0 %	50 %	50 %	220920029
65	NC_011893	CAGT	2	8	20052	20059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011893	GGCG	2	8	20267	20274	0 %	0 %	75 %	25 %	220920030
67	NC_011893	CGGG	2	8	20558	20565	0 %	0 %	75 %	25 %	220920031
68	NC_011893	CCCT	2	8	20767	20774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_011893	GCCG	2	8	21207	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011893	ATCC	2	8	21549	21556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011893	CGGC	2	8	22286	22293	0 %	0 %	50 %	50 %	220920033
72	NC_011893	CGGC	2	8	22389	22396	0 %	0 %	50 %	50 %	220920033
73	NC_011893	GCCT	2	8	22428	22435	0 %	25 %	25 %	50 %	220920033
74	NC_011893	TCGC	2	8	22651	22658	0 %	25 %	25 %	50 %	220920034
75	NC_011893	CATT	2	8	22777	22784	25 %	50 %	0 %	25 %	220920034
76	NC_011893	GCTG	2	8	23146	23153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011893	CGGC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011893	GACT	2	8	23372	23379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011893	CGGG	2	8	23638	23645	0 %	0 %	75 %	25 %	220920035
80	NC_011893	TATT	2	8	23857	23864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011893	GGCG	2	8	24569	24576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011893	CGAC	2	8	24768	24775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011893	GCCG	2	8	25418	25425	0 %	0 %	50 %	50 %	220920038
84	NC_011893	CCTC	2	8	26314	26321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_011893	CCCA	2	8	26871	26878	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_011893	GGGA	2	8	26946	26953	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011893	CGAC	2	8	26963	26970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011893	ATCG	2	8	27097	27104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011893	AACC	2	8	27255	27262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011893	TCCA	2	8	27465	27472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011893	GCCC	2	8	28130	28137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_011893	AGGC	2	8	28703	28710	25 %	0 %	50 %	25 %	220920040
93	NC_011893	ACCG	2	8	28961	28968	25 %	0 %	25 %	50 %	220920040
94	NC_011893	GACC	2	8	28996	29003	25 %	0 %	25 %	50 %	220920040
95	NC_011893	GCCG	2	8	29036	29043	0 %	0 %	50 %	50 %	220920040
96	NC_011893	TGAC	2	8	29108	29115	25 %	25 %	25 %	25 %	220920040
97	NC_011893	CGGC	2	8	29285	29292	0 %	0 %	50 %	50 %	220920040
98	NC_011893	ACCC	2	8	31134	31141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_011893	CCTG	2	8	32211	32218	0 %	25 %	25 %	50 %	220920043
100	NC_011893	GGAC	2	8	32446	32453	25 %	0 %	50 %	25 %	220920044
101	NC_011893	GGCA	2	8	32465	32472	25 %	0 %	50 %	25 %	220920044
102	NC_011893	TCGG	2	8	32703	32710	0 %	25 %	50 %	25 %	220920044
103	NC_011893	GGGC	2	8	33301	33308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011893	CTGG	2	8	33575	33582	0 %	25 %	50 %	25 %	220920045
105	NC_011893	TGGC	2	8	33659	33666	0 %	25 %	50 %	25 %	220920045
106	NC_011893	CTAA	2	8	34123	34130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011893	CCGC	2	8	34718	34725	0 %	0 %	25 %	75 %	220920046
108	NC_011893	CCGC	2	8	35000	35007	0 %	0 %	25 %	75 %	220920046
109	NC_011893	CTGC	2	8	35282	35289	0 %	25 %	25 %	50 %	220920046
110	NC_011893	CTGC	2	8	35423	35430	0 %	25 %	25 %	50 %	220920046
111	NC_011893	AGCG	2	8	35752	35759	25 %	0 %	50 %	25 %	220920046
112	NC_011893	GGCC	2	8	35885	35892	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
113	NC_011893	CCGC	2	8	36412	36419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_011893	CCGG	2	8	36793	36800	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
115	NC_011893	CGGC	2	8	37107	37114	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
116	NC_011893	TCGC	2	8	37203	37210	0 %	25 %	25 %	50 %	220920047
117	NC_011893	TGAG	2	8	37215	37222	25 %	25 %	50 %	0 %	220920047
118	NC_011893	CCCG	2	8	37425	37432	0 %	0 %	25 %	75 %	220920048
119	NC_011893	CAGG	2	8	37852	37859	25 %	0 %	50 %	25 %	220920049
120	NC_011893	GCCT	2	8	37868	37875	0 %	25 %	25 %	50 %	220920049
121	NC_011893	CCGC	2	8	38348	38355	0 %	0 %	25 %	75 %	220920051
122	NC_011893	CTGC	2	8	38675	38682	0 %	25 %	25 %	50 %	220920051
123	NC_011893	ATCG	2	8	38883	38890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011893	GGCG	2	8	39438	39445	0 %	0 %	75 %	25 %	220920052
125	NC_011893	ATGC	2	8	39469	39476	25 %	25 %	25 %	25 %	220920052
126	NC_011893	TGCC	2	8	39663	39670	0 %	25 %	25 %	50 %	220920052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.