MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosphaerula palustris E1-9c chromosome

Total Repeats: 64513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011832	GTA	2	6	105733	105738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_011832	TCAAT	2	10	105773	105782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2503	NC_011832	AAT	2	6	105786	105791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011832	AGG	2	6	105841	105846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850780
2505	NC_011832	CGA	2	6	105858	105863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850780
2506	NC_011832	TCA	2	6	105866	105871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2507	NC_011832	TC	3	6	105874	105879	0 %	50 %	0 %	50 %	219850780
2508	NC_011832	CT	3	6	105887	105892	0 %	50 %	0 %	50 %	219850780
2509	NC_011832	CAA	2	6	105946	105951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219850780
2510	NC_011832	AGA	2	6	106005	106010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850780
2511	NC_011832	CGG	2	6	106066	106071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850780
2512	NC_011832	ATC	2	6	106106	106111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2513	NC_011832	CTG	2	6	106124	106129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850780
2514	NC_011832	AGA	2	6	106134	106139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850780
2515	NC_011832	GAG	2	6	106148	106153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850780
2516	NC_011832	GGT	2	6	106202	106207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850780
2517	NC_011832	CT	3	6	106275	106280	0 %	50 %	0 %	50 %	219850780
2518	NC_011832	GCC	2	6	106283	106288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850780
2519	NC_011832	AAT	2	6	106289	106294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219850780
2520	NC_011832	AAG	2	6	106310	106315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850780
2521	NC_011832	TGG	2	6	106327	106332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850780
2522	NC_011832	CT	3	6	106335	106340	0 %	50 %	0 %	50 %	219850780
2523	NC_011832	ATC	2	6	106349	106354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2524	NC_011832	ATC	2	6	106388	106393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2525	NC_011832	GAT	2	6	106394	106399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850780
2526	NC_011832	CGA	2	6	106416	106421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850780
2527	NC_011832	C	6	6	106506	106511	0 %	0 %	0 %	100 %	219850780
2528	NC_011832	CGCTC	2	10	106573	106582	0 %	20 %	20 %	60 %	219850780
2529	NC_011832	GAA	2	6	106589	106594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850780
2530	NC_011832	ATC	2	6	106628	106633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2531	NC_011832	GAG	2	6	106649	106654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850780
2532	NC_011832	CAT	2	6	106668	106673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850780
2533	NC_011832	CCA	2	6	106676	106681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850780
2534	NC_011832	CT	3	6	106716	106721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_011832	GAT	3	9	106803	106811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011832	GATC	2	8	106861	106868	25 %	25 %	25 %	25 %	219850781
2537	NC_011832	CT	4	8	106922	106929	0 %	50 %	0 %	50 %	219850781
2538	NC_011832	CAC	2	6	106945	106950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219850781
2539	NC_011832	TGG	2	6	107079	107084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219850781
2540	NC_011832	TAG	2	6	107144	107149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011832	AGA	2	6	107301	107306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219850782
2542	NC_011832	CAG	2	6	107341	107346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850782
2543	NC_011832	ATATC	2	10	107361	107370	40 %	40 %	0 %	20 %	219850782
2544	NC_011832	G	6	6	107433	107438	0 %	0 %	100 %	0 %	219850782
2545	NC_011832	ATC	2	6	107490	107495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_011832	T	9	9	107507	107515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_011832	ACCC	2	8	107543	107550	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2548	NC_011832	G	6	6	107596	107601	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011832	GAG	2	6	107634	107639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011832	AG	3	6	107638	107643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_011832	CTC	2	6	107651	107656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_011832	TCA	2	6	107793	107798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850783
2553	NC_011832	GGGC	2	8	107806	107813	0 %	0 %	75 %	25 %	219850783
2554	NC_011832	TCG	2	6	107871	107876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850783
2555	NC_011832	CTG	2	6	107879	107884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850783
2556	NC_011832	ATG	2	6	107934	107939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850783
2557	NC_011832	GGGA	2	8	107994	108001	25 %	0 %	75 %	0 %	219850783
2558	NC_011832	TGCCGG	2	12	108012	108023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	219850783
2559	NC_011832	GCC	2	6	108077	108082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850783
2560	NC_011832	TGGA	2	8	108097	108104	25 %	25 %	50 %	0 %	219850783
2561	NC_011832	CCT	2	6	108118	108123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219850783
2562	NC_011832	TG	3	6	108233	108238	0 %	50 %	50 %	0 %	219850783
2563	NC_011832	CGGG	2	8	108265	108272	0 %	0 %	75 %	25 %	219850783
2564	NC_011832	ATG	2	6	108306	108311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219850783
2565	NC_011832	GGA	3	9	108340	108348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850783
2566	NC_011832	CGGC	2	8	108407	108414	0 %	0 %	50 %	50 %	219850783
2567	NC_011832	A	6	6	108515	108520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011832	CAC	2	6	108526	108531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2569	NC_011832	GCG	2	6	108749	108754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_011832	CTC	2	6	108787	108792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2571	NC_011832	CCT	2	6	108794	108799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_011832	CTG	2	6	108838	108843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_011832	CCA	2	6	108867	108872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2574	NC_011832	CTCCC	2	10	108947	108956	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2575	NC_011832	TCT	2	6	108984	108989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_011832	ATC	2	6	108991	108996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_011832	CCAT	2	8	109046	109053	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2578	NC_011832	TGGT	2	8	109073	109080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_011832	GCC	2	6	109188	109193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2580	NC_011832	CGG	2	6	109212	109217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_011832	GGGC	2	8	109253	109260	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_011832	CTG	2	6	109296	109301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_011832	GA	3	6	109343	109348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_011832	TGC	2	6	109365	109370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_011832	AGG	2	6	109418	109423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_011832	GT	3	6	109433	109438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2587	NC_011832	TCC	2	6	109460	109465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_011832	C	6	6	109468	109473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2589	NC_011832	GCC	3	9	109511	109519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_011832	TCC	2	6	109556	109561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_011832	TCG	2	6	109643	109648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_011832	CTCG	2	8	109669	109676	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2593	NC_011832	TTC	2	6	109706	109711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_011832	TGA	2	6	109719	109724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_011832	GGCC	2	8	109741	109748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_011832	CGT	2	6	109755	109760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_011832	ACG	2	6	109810	109815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_011832	CCGC	2	8	109821	109828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2599	NC_011832	TCG	2	6	109893	109898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_011832	TC	3	6	109899	109904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_011832	GCG	2	6	109913	109918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_011832	GCCG	2	8	109981	109988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2603	NC_011832	CCG	2	6	110060	110065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2604	NC_011832	CGAT	2	8	110129	110136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2605	NC_011832	CTG	2	6	110187	110192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_011832	CCG	2	6	110275	110280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_011832	TCC	2	6	110294	110299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2608	NC_011832	GATC	2	8	110355	110362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2609	NC_011832	CCT	2	6	110397	110402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2610	NC_011832	TCA	2	6	110439	110444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_011832	AGG	2	6	110559	110564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011832	TCT	2	6	110577	110582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_011832	TCC	2	6	110594	110599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_011832	CCGG	2	8	110602	110609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_011832	CGA	2	6	110643	110648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_011832	CGA	2	6	110700	110705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_011832	GGT	2	6	110758	110763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011832	CGT	2	6	110787	110792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_011832	CT	3	6	110930	110935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2620	NC_011832	TCAT	2	8	111020	111027	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2621	NC_011832	CTG	2	6	111053	111058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_011832	GTT	2	6	111112	111117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011832	TGATCG	2	12	111119	111130	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2624	NC_011832	GGC	2	6	111153	111158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_011832	TCG	2	6	111162	111167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_011832	TCT	2	6	111206	111211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2627	NC_011832	AAT	2	6	111271	111276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_011832	CTG	2	6	111285	111290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_011832	GAG	2	6	111416	111421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219850784
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2872	NC_011832	CGG	2	6	123378	123383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850787
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2992	NC_011832	TCG	2	6	128317	128322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850790
2993	NC_011832	CGC	2	6	128329	128334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850790
2994	NC_011832	CAT	2	6	128416	128421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219850791
2995	NC_011832	CCG	2	6	128434	128439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219850791
2996	NC_011832	CGGT	2	8	128469	128476	0 %	25 %	50 %	25 %	219850791
2997	NC_011832	GCA	2	6	128536	128541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219850791
2998	NC_011832	GAAC	2	8	128644	128651	50 %	0 %	25 %	25 %	219850791
2999	NC_011832	CGG	2	6	128660	128665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219850791
3000	NC_011832	CTG	2	6	128699	128704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219850791

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