MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylocella silvestris BL2 chromosome

Total Repeats: 4119

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011666	CGATC	2	10	206	215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011666	ATGGG	2	10	1976	1985	20 %	20 %	60 %	0 %	217976202
3	NC_011666	AGCGA	2	10	2336	2345	40 %	0 %	40 %	20 %	217976202
4	NC_011666	CCCAG	2	10	3191	3200	20 %	0 %	20 %	60 %	217976204
5	NC_011666	CGAGC	2	10	3668	3677	20 %	0 %	40 %	40 %	217976204
6	NC_011666	CGGCA	2	10	4732	4741	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011666	ATCTC	2	10	5235	5244	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011666	GGCGC	2	10	5487	5496	0 %	0 %	60 %	40 %	217976205
9	NC_011666	CGCAA	2	10	6865	6874	40 %	0 %	20 %	40 %	217976206
10	NC_011666	CAATT	2	10	7026	7035	40 %	40 %	0 %	20 %	217976206
11	NC_011666	CCGGT	2	10	12664	12673	0 %	20 %	40 %	40 %	217976212
12	NC_011666	TCGAT	2	10	12676	12685	20 %	40 %	20 %	20 %	217976212
13	NC_011666	CGCTG	2	10	12830	12839	0 %	20 %	40 %	40 %	217976212
14	NC_011666	CGATC	2	10	15275	15284	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011666	GGCGC	2	10	18447	18456	0 %	0 %	60 %	40 %	217976216
16	NC_011666	AAACC	2	10	18696	18705	60 %	0 %	0 %	40 %	217976216
17	NC_011666	CGAGC	2	10	19685	19694	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011666	GCTGC	3	15	19695	19709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011666	AGCCC	2	10	20128	20137	20 %	0 %	20 %	60 %	217976219
20	NC_011666	GATGT	2	10	20420	20429	20 %	40 %	40 %	0 %	217976219
21	NC_011666	CGCGA	2	10	20954	20963	20 %	0 %	40 %	40 %	217976219
22	NC_011666	GAAAA	2	10	21207	21216	80 %	0 %	20 %	0 %	217976220
23	NC_011666	GATGA	2	10	21852	21861	40 %	20 %	40 %	0 %	217976220
24	NC_011666	CGCTA	2	10	21994	22003	20 %	20 %	20 %	40 %	217976220
25	NC_011666	CGGCG	2	10	23066	23075	0 %	0 %	60 %	40 %	217976222
26	NC_011666	GGCGC	2	10	25142	25151	0 %	0 %	60 %	40 %	217976226
27	NC_011666	CGGCG	2	10	28495	28504	0 %	0 %	60 %	40 %	217976231
28	NC_011666	CGGCG	2	10	30514	30523	0 %	0 %	60 %	40 %	217976233
29	NC_011666	AGGCA	2	10	32661	32670	40 %	0 %	40 %	20 %	217976235
30	NC_011666	GATCG	2	10	33493	33502	20 %	20 %	40 %	20 %	217976235
31	NC_011666	GCCGA	2	10	33749	33758	20 %	0 %	40 %	40 %	217976235
32	NC_011666	CCGCG	2	10	34306	34315	0 %	0 %	40 %	60 %	217976236
33	NC_011666	GCTGC	2	10	34972	34981	0 %	20 %	40 %	40 %	217976236
34	NC_011666	GCAAC	2	10	36024	36033	40 %	0 %	20 %	40 %	217976237
35	NC_011666	GCCGG	2	10	37162	37171	0 %	0 %	60 %	40 %	217976238
36	NC_011666	CCAGT	2	10	38168	38177	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011666	CTGGC	2	10	40710	40719	0 %	20 %	40 %	40 %	217976241
38	NC_011666	TGGCG	2	10	42200	42209	0 %	20 %	60 %	20 %	217976242
39	NC_011666	GGCGA	2	10	42493	42502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011666	GTCCT	2	10	43902	43911	0 %	40 %	20 %	40 %	217976246
41	NC_011666	CGCTG	2	10	45241	45250	0 %	20 %	40 %	40 %	217976247
42	NC_011666	CAGAT	2	10	45530	45539	40 %	20 %	20 %	20 %	217976247
43	NC_011666	CGCCA	2	10	46423	46432	20 %	0 %	20 %	60 %	217976247
44	NC_011666	TCCGG	2	10	46647	46656	0 %	20 %	40 %	40 %	217976248
45	NC_011666	ATGCC	2	10	49665	49674	20 %	20 %	20 %	40 %	217976253
46	NC_011666	GCGCC	2	10	50266	50275	0 %	0 %	40 %	60 %	217976254
47	NC_011666	CGGGG	2	10	50295	50304	0 %	0 %	80 %	20 %	217976254
48	NC_011666	GGTCG	2	10	50439	50448	0 %	20 %	60 %	20 %	217976254
49	NC_011666	CGCTT	2	10	51695	51704	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011666	AAGAC	2	10	51989	51998	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011666	TGCGT	2	10	52231	52240	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011666	GGCCG	2	10	52361	52370	0 %	0 %	60 %	40 %	217976256
53	NC_011666	CGCGC	2	10	52582	52591	0 %	0 %	40 %	60 %	217976256
54	NC_011666	CGCGC	2	10	52809	52818	0 %	0 %	40 %	60 %	217976256
55	NC_011666	CTGTC	2	10	54260	54269	0 %	40 %	20 %	40 %	217976258
56	NC_011666	CGGAG	2	10	54778	54787	20 %	0 %	60 %	20 %	217976258
57	NC_011666	TCATG	2	10	57057	57066	20 %	40 %	20 %	20 %	217976262
58	NC_011666	GGCGC	2	10	57686	57695	0 %	0 %	60 %	40 %	217976262
59	NC_011666	ACGGA	2	10	59030	59039	40 %	0 %	40 %	20 %	217976264
60	NC_011666	TCCGG	2	10	59522	59531	0 %	20 %	40 %	40 %	217976265
61	NC_011666	CGAGG	2	10	60528	60537	20 %	0 %	60 %	20 %	217976265
62	NC_011666	CGGCT	2	10	60766	60775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011666	CGCGG	2	10	62520	62529	0 %	0 %	60 %	40 %	217976268
64	NC_011666	GCCGC	2	10	62859	62868	0 %	0 %	40 %	60 %	217976268
65	NC_011666	GCCGC	2	10	63744	63753	0 %	0 %	40 %	60 %	217976270
66	NC_011666	CGGCG	2	10	63897	63906	0 %	0 %	60 %	40 %	217976270
67	NC_011666	TTGGA	2	10	64312	64321	20 %	40 %	40 %	0 %	217976270
68	NC_011666	GCCGC	2	10	64675	64684	0 %	0 %	40 %	60 %	217976270
69	NC_011666	CGAGG	2	10	68690	68699	20 %	0 %	60 %	20 %	217976275
70	NC_011666	CGGCG	2	10	68715	68724	0 %	0 %	60 %	40 %	217976275
71	NC_011666	CAGGG	2	10	69505	69514	20 %	0 %	60 %	20 %	217976275
72	NC_011666	TCGCC	2	10	70139	70148	0 %	20 %	20 %	60 %	217976276
73	NC_011666	TGACC	2	10	70160	70169	20 %	20 %	20 %	40 %	217976276
74	NC_011666	GCGCA	2	10	70219	70228	20 %	0 %	40 %	40 %	217976276
75	NC_011666	CCAGC	2	10	72713	72722	20 %	0 %	20 %	60 %	217976279
76	NC_011666	CGGTC	2	10	73187	73196	0 %	20 %	40 %	40 %	217976279
77	NC_011666	TCCGA	2	10	75408	75417	20 %	20 %	20 %	40 %	217976281
78	NC_011666	AGGCG	2	10	75631	75640	20 %	0 %	60 %	20 %	217976281
79	NC_011666	ATGGG	2	10	75915	75924	20 %	20 %	60 %	0 %	217976281
80	NC_011666	GGGGA	2	10	76179	76188	20 %	0 %	80 %	0 %	217976281
81	NC_011666	GCCGC	2	10	76420	76429	0 %	0 %	40 %	60 %	217976281
82	NC_011666	GCCTT	2	10	77037	77046	0 %	40 %	20 %	40 %	217976281
83	NC_011666	TGGGC	2	10	77320	77329	0 %	20 %	60 %	20 %	217976281
84	NC_011666	GACGC	2	10	77487	77496	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011666	GCCGG	2	10	77881	77890	0 %	0 %	60 %	40 %	217976282
86	NC_011666	CCAAG	2	10	78525	78534	40 %	0 %	20 %	40 %	217976283
87	NC_011666	TTGAA	2	10	80427	80436	40 %	40 %	20 %	0 %	217976286
88	NC_011666	CCGAT	2	10	81195	81204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011666	GAGCT	2	10	83064	83073	20 %	20 %	40 %	20 %	217976288
90	NC_011666	CGGGC	2	10	83371	83380	0 %	0 %	60 %	40 %	217976288
91	NC_011666	ATCGA	2	10	83511	83520	40 %	20 %	20 %	20 %	217976288
92	NC_011666	CGTCG	2	10	84306	84315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_011666	CAGCG	2	10	87771	87780	20 %	0 %	40 %	40 %	217976291
94	NC_011666	GGGCG	2	10	88320	88329	0 %	0 %	80 %	20 %	217976292
95	NC_011666	GCCGC	2	10	88665	88674	0 %	0 %	40 %	60 %	217976292
96	NC_011666	CTAGC	2	10	88821	88830	20 %	20 %	20 %	40 %	217976293
97	NC_011666	TCCGG	2	10	95378	95387	0 %	20 %	40 %	40 %	217976300
98	NC_011666	GCCTT	2	10	97187	97196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011666	TTCGC	2	10	98436	98445	0 %	40 %	20 %	40 %	217976303
100	NC_011666	CCGCT	2	10	100444	100453	0 %	20 %	20 %	60 %	217976305
101	NC_011666	GCACA	2	10	102100	102109	40 %	0 %	20 %	40 %	217976306
102	NC_011666	TTGTG	2	10	104836	104845	0 %	60 %	40 %	0 %	217976308
103	NC_011666	CGGTC	2	10	105305	105314	0 %	20 %	40 %	40 %	217976308
104	NC_011666	GCGCC	2	10	106901	106910	0 %	0 %	40 %	60 %	217976310
105	NC_011666	CAAAG	2	10	107421	107430	60 %	0 %	20 %	20 %	217976310
106	NC_011666	AGCCG	2	10	107492	107501	20 %	0 %	40 %	40 %	217976310
107	NC_011666	CGCGC	2	10	107931	107940	0 %	0 %	40 %	60 %	217976310
108	NC_011666	GGCCG	2	10	111431	111440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011666	AGCGC	2	10	111913	111922	20 %	0 %	40 %	40 %	217976314
110	NC_011666	GGCGC	2	10	113701	113710	0 %	0 %	60 %	40 %	217976316
111	NC_011666	AGGCG	2	10	115586	115595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011666	CGGCC	2	10	117355	117364	0 %	0 %	40 %	60 %	217976320
113	NC_011666	CGGCG	2	10	117576	117585	0 %	0 %	60 %	40 %	217976320
114	NC_011666	CTCAT	2	10	125052	125061	20 %	40 %	0 %	40 %	217976327
115	NC_011666	CGAGC	2	10	125663	125672	20 %	0 %	40 %	40 %	217976327
116	NC_011666	GGCTT	2	10	127238	127247	0 %	40 %	40 %	20 %	217976328
117	NC_011666	AGCCG	2	10	127296	127305	20 %	0 %	40 %	40 %	217976328
118	NC_011666	AGGGC	2	10	127514	127523	20 %	0 %	60 %	20 %	217976328
119	NC_011666	GCGCC	2	10	131911	131920	0 %	0 %	40 %	60 %	217976333
120	NC_011666	TCGCG	2	10	132630	132639	0 %	20 %	40 %	40 %	217976334
121	NC_011666	GGCGC	2	10	133464	133473	0 %	0 %	60 %	40 %	217976334
122	NC_011666	GCGCG	2	10	134004	134013	0 %	0 %	60 %	40 %	217976335
123	NC_011666	GCCGC	2	10	134213	134222	0 %	0 %	40 %	60 %	217976335
124	NC_011666	GCGAG	2	10	134280	134289	20 %	0 %	60 %	20 %	217976335
125	NC_011666	GCGCC	2	10	135941	135950	0 %	0 %	40 %	60 %	217976337
126	NC_011666	GCCGC	2	10	137742	137751	0 %	0 %	40 %	60 %	217976337
127	NC_011666	CTCGC	2	10	140091	140100	0 %	20 %	20 %	60 %	217976339
128	NC_011666	GGTCT	2	10	140448	140457	0 %	40 %	40 %	20 %	217976339
129	NC_011666	GGCGA	2	10	140630	140639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011666	TGGCG	2	10	141239	141248	0 %	20 %	60 %	20 %	217976341
131	NC_011666	CGGGC	2	10	141753	141762	0 %	0 %	60 %	40 %	217976342
132	NC_011666	CCGCG	2	10	142268	142277	0 %	0 %	40 %	60 %	217976342
133	NC_011666	GGCGC	2	10	142423	142432	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011666	CGATC	2	10	142607	142616	20 %	20 %	20 %	40 %	217976343
135	NC_011666	ACGGA	2	10	143726	143735	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011666	CTTGC	2	10	143889	143898	0 %	40 %	20 %	40 %	217976344
137	NC_011666	TAGGA	2	10	144558	144567	40 %	20 %	40 %	0 %	217976344
138	NC_011666	CGCGG	2	10	145389	145398	0 %	0 %	60 %	40 %	217976345
139	NC_011666	CGAAT	2	10	145665	145674	40 %	20 %	20 %	20 %	217976345
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141	NC_011666	CGCGG	2	10	147632	147641	0 %	0 %	60 %	40 %	217976348
142	NC_011666	CCGCG	2	10	148009	148018	0 %	0 %	40 %	60 %	217976348
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161	NC_011666	CGATC	2	10	156767	156776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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399	NC_011666	GCCGC	3	15	402739	402753	0 %	0 %	40 %	60 %	217976559
400	NC_011666	TTGGA	2	10	402960	402969	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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