MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium liflandii 128FXT plasmid pMUM002

Total Repeats: 423

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011355	TGCT	2	8	809	816	0 %	50 %	25 %	25 %	209418038
2	NC_011355	AAAC	2	8	913	920	75 %	0 %	0 %	25 %	209418038
3	NC_011355	GCCG	2	8	955	962	0 %	0 %	50 %	50 %	209418038
4	NC_011355	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	209418038
5	NC_011355	GATC	2	8	1174	1181	25 %	25 %	25 %	25 %	209418038
6	NC_011355	TAAG	2	8	1636	1643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011355	TTAC	2	8	1710	1717	25 %	50 %	0 %	25 %	209418040
8	NC_011355	TCAC	2	8	1958	1965	25 %	25 %	0 %	50 %	209418040
9	NC_011355	CTCG	2	8	2076	2083	0 %	25 %	25 %	50 %	209418040
10	NC_011355	TCCT	2	8	2309	2316	0 %	50 %	0 %	50 %	209418041
11	NC_011355	GGCC	2	8	2681	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	209418041
12	NC_011355	TGCG	2	8	2694	2701	0 %	25 %	50 %	25 %	209418041
13	NC_011355	GACG	2	8	3548	3555	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
14	NC_011355	CGGA	2	8	3585	3592	25 %	0 %	50 %	25 %	209418042
15	NC_011355	CGCA	2	8	4764	4771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011355	GTGG	2	8	5320	5327	0 %	25 %	75 %	0 %	209418043
17	NC_011355	GGCC	2	8	5379	5386	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
18	NC_011355	ATGG	2	8	5656	5663	25 %	25 %	50 %	0 %	209418043
19	NC_011355	GCGT	2	8	5730	5737	0 %	25 %	50 %	25 %	209418043
20	NC_011355	CACC	2	8	5982	5989	25 %	0 %	0 %	75 %	209418043
21	NC_011355	CCGG	2	8	6027	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	209418043
22	NC_011355	GACC	2	8	6481	6488	25 %	0 %	25 %	50 %	209418044
23	NC_011355	AGGC	2	8	6500	6507	25 %	0 %	50 %	25 %	209418044
24	NC_011355	CGCT	2	8	7617	7624	0 %	25 %	25 %	50 %	209418045
25	NC_011355	GCAC	2	8	7703	7710	25 %	0 %	25 %	50 %	209418045
26	NC_011355	GAGC	2	8	7722	7729	25 %	0 %	50 %	25 %	209418045
27	NC_011355	GCAC	2	8	7830	7837	25 %	0 %	25 %	50 %	209418046
28	NC_011355	CCTA	2	8	7970	7977	25 %	25 %	0 %	50 %	209418046
29	NC_011355	CCTC	2	8	8003	8010	0 %	25 %	0 %	75 %	209418046
30	NC_011355	ACCG	2	8	8364	8371	25 %	0 %	25 %	50 %	209418047
31	NC_011355	TTGT	2	8	8391	8398	0 %	75 %	25 %	0 %	209418047
32	NC_011355	ACTT	2	8	8457	8464	25 %	50 %	0 %	25 %	209418047
33	NC_011355	TGGC	2	8	8700	8707	0 %	25 %	50 %	25 %	209418047
34	NC_011355	GCAA	2	8	9260	9267	50 %	0 %	25 %	25 %	209418048
35	NC_011355	GATC	2	8	9718	9725	25 %	25 %	25 %	25 %	209418049
36	NC_011355	CAGC	2	8	10406	10413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011355	CAGC	2	8	10446	10453	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011355	CATT	2	8	10861	10868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011355	TCCG	2	8	10946	10953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011355	CCGC	2	8	11587	11594	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_011355	CTGC	2	8	12935	12942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011355	CACC	2	8	12962	12969	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_011355	AACA	2	8	13513	13520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011355	CAAG	2	8	14673	14680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011355	CTAC	2	8	14840	14847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011355	CGCA	2	8	14912	14919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011355	AAAC	2	8	14964	14971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011355	CTGG	2	8	15587	15594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011355	CAGG	2	8	15759	15766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011355	GCAC	2	8	16041	16048	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011355	CGCC	2	8	16184	16191	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_011355	CACC	2	8	16646	16653	25 %	0 %	0 %	75 %	209418050
53	NC_011355	GCAG	2	8	17153	17160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011355	ACAA	2	8	17863	17870	75 %	0 %	0 %	25 %	209418051
55	NC_011355	CTGC	2	8	18076	18083	0 %	25 %	25 %	50 %	209418051
56	NC_011355	GGCC	2	8	18369	18376	0 %	0 %	50 %	50 %	209418051
57	NC_011355	TGCG	2	8	19285	19292	0 %	25 %	50 %	25 %	209418052
58	NC_011355	TTGA	2	8	20091	20098	25 %	50 %	25 %	0 %	209418053
59	NC_011355	ACGC	2	8	20153	20160	25 %	0 %	25 %	50 %	209418053
60	NC_011355	CAGT	2	8	20246	20253	25 %	25 %	25 %	25 %	209418053
61	NC_011355	CGCC	2	8	20732	20739	0 %	0 %	25 %	75 %	209418054
62	NC_011355	GGCT	2	8	20751	20758	0 %	25 %	50 %	25 %	209418054
63	NC_011355	GACC	2	8	20804	20811	25 %	0 %	25 %	50 %	209418054
64	NC_011355	GCGT	2	8	20854	20861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011355	TGGA	2	8	20904	20911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011355	AGCA	2	8	21419	21426	50 %	0 %	25 %	25 %	209418055
67	NC_011355	GCCG	2	8	21930	21937	0 %	0 %	50 %	50 %	209418055
68	NC_011355	GCAC	2	8	21955	21962	25 %	0 %	25 %	50 %	209418055
69	NC_011355	GCTG	2	8	22254	22261	0 %	25 %	50 %	25 %	209418055
70	NC_011355	CGAT	2	8	23416	23423	25 %	25 %	25 %	25 %	209418056
71	NC_011355	GGAG	2	8	23477	23484	25 %	0 %	75 %	0 %	209418056
72	NC_011355	GGTC	2	8	24313	24320	0 %	25 %	50 %	25 %	209418057
73	NC_011355	GGTT	2	8	24663	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	209418057
74	NC_011355	CCGG	2	8	24790	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	209418057
75	NC_011355	GCTG	2	8	24894	24901	0 %	25 %	50 %	25 %	209418057
76	NC_011355	AACA	2	8	25161	25168	75 %	0 %	0 %	25 %	209418057
77	NC_011355	ACCG	2	8	25406	25413	25 %	0 %	25 %	50 %	209418057
78	NC_011355	CAAG	2	8	25446	25453	50 %	0 %	25 %	25 %	209418057
79	NC_011355	ATCG	2	8	25660	25667	25 %	25 %	25 %	25 %	209418058
80	NC_011355	TGCG	2	8	26102	26109	0 %	25 %	50 %	25 %	209418058
81	NC_011355	CTGG	2	8	26651	26658	0 %	25 %	50 %	25 %	209418059
82	NC_011355	GACG	2	8	26895	26902	25 %	0 %	50 %	25 %	209418059
83	NC_011355	GCGG	2	8	27343	27350	0 %	0 %	75 %	25 %	209418060
84	NC_011355	GGCG	2	8	27363	27370	0 %	0 %	75 %	25 %	209418060
85	NC_011355	TCGG	2	8	27473	27480	0 %	25 %	50 %	25 %	209418060
86	NC_011355	CGGC	2	8	27561	27568	0 %	0 %	50 %	50 %	209418060
87	NC_011355	CAGC	2	8	27720	27727	25 %	0 %	25 %	50 %	209418060
88	NC_011355	CCAA	2	8	28315	28322	50 %	0 %	0 %	50 %	209418061
89	NC_011355	GCTG	2	8	29442	29449	0 %	25 %	50 %	25 %	209418063
90	NC_011355	CGGT	2	8	29494	29501	0 %	25 %	50 %	25 %	209418063
91	NC_011355	CAGC	2	8	29891	29898	25 %	0 %	25 %	50 %	209418063
92	NC_011355	GCGG	2	8	30193	30200	0 %	0 %	75 %	25 %	209418063
93	NC_011355	GCCT	2	8	30257	30264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011355	CAAA	2	8	30288	30295	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011355	TGCA	2	8	30564	30571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011355	TTGA	2	8	30572	30579	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011355	GTCG	2	8	30637	30644	0 %	25 %	50 %	25 %	209418064
98	NC_011355	ACCC	2	8	30697	30704	25 %	0 %	0 %	75 %	209418064
99	NC_011355	GCAC	2	8	31328	31335	25 %	0 %	25 %	50 %	209418064
100	NC_011355	CGCA	2	8	31525	31532	25 %	0 %	25 %	50 %	209418064
101	NC_011355	CCGA	2	8	31665	31672	25 %	0 %	25 %	50 %	209418065
102	NC_011355	CGCT	2	8	32081	32088	0 %	25 %	25 %	50 %	209418066
103	NC_011355	GCAC	2	8	32167	32174	25 %	0 %	25 %	50 %	209418066
104	NC_011355	GAGC	2	8	32186	32193	25 %	0 %	50 %	25 %	209418066
105	NC_011355	ATCT	2	8	32295	32302	25 %	50 %	0 %	25 %	209418067
106	NC_011355	GGGT	2	8	32547	32554	0 %	25 %	75 %	0 %	209418067
107	NC_011355	CTTG	2	8	32611	32618	0 %	50 %	25 %	25 %	209418067
108	NC_011355	ACTG	2	8	33167	33174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011355	AACG	2	8	33316	33323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011355	TGTT	2	8	33542	33549	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011355	GGGC	2	8	33571	33578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011355	GGCT	2	8	33688	33695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011355	CGCC	2	8	34542	34549	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_011355	GGGC	2	8	34854	34861	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011355	TTGG	2	8	35105	35112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011355	CGTC	2	8	36971	36978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011355	CAGG	2	8	37339	37346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011355	CCGA	2	8	37433	37440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011355	CCCG	2	8	37721	37728	0 %	0 %	25 %	75 %	209418071
120	NC_011355	GTTG	2	8	37789	37796	0 %	50 %	50 %	0 %	209418071
121	NC_011355	GCGG	2	8	38278	38285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011355	CCGA	2	8	38432	38439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011355	GCGA	2	8	38750	38757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011355	GGGT	2	8	39752	39759	0 %	25 %	75 %	0 %	209418073
125	NC_011355	CGTT	2	8	40699	40706	0 %	50 %	25 %	25 %	209418074
126	NC_011355	GCAC	2	8	41599	41606	25 %	0 %	25 %	50 %	209418075
127	NC_011355	CACC	2	8	42297	42304	25 %	0 %	0 %	75 %	209418075
128	NC_011355	TGCG	2	8	43552	43559	0 %	25 %	50 %	25 %	209418076
129	NC_011355	GGCA	2	8	43591	43598	25 %	0 %	50 %	25 %	209418076
130	NC_011355	ACCG	2	8	43760	43767	25 %	0 %	25 %	50 %	209418076
131	NC_011355	CCCG	2	8	43797	43804	0 %	0 %	25 %	75 %	209418076
132	NC_011355	CCGG	2	8	43876	43883	0 %	0 %	50 %	50 %	209418076
133	NC_011355	CTGG	2	8	43972	43979	0 %	25 %	50 %	25 %	209418076
134	NC_011355	AAGG	2	8	44326	44333	50 %	0 %	50 %	0 %	209418076
135	NC_011355	CAGA	2	8	44593	44600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011355	GGGC	2	8	45024	45031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011355	TTGG	2	8	45275	45282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011355	AGGT	2	8	46371	46378	25 %	25 %	50 %	0 %	209418077
139	NC_011355	GCCC	2	8	46499	46506	0 %	0 %	25 %	75 %	209418077
140	NC_011355	ACCG	2	8	46738	46745	25 %	0 %	25 %	50 %	209418077
141	NC_011355	GAAC	2	8	47011	47018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011355	GCGT	2	8	48629	48636	0 %	25 %	50 %	25 %	209418078
143	NC_011355	GCAG	2	8	48757	48764	25 %	0 %	50 %	25 %	209418078
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419	NC_011355	ATCA	2	8	187798	187805	50 %	25 %	0 %	25 %	209418105
420	NC_011355	TCGG	2	8	187832	187839	0 %	25 %	50 %	25 %	209418105
421	NC_011355	ACAG	2	8	189741	189748	50 %	0 %	25 %	25 %	209418107
422	NC_011355	CCAG	2	8	189968	189975	25 %	0 %	25 %	50 %	209418107
423	NC_011355	AGAA	2	8	190169	190176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.