MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP02

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010721	GAG	2	6	42	47	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579260
2	NC_010721	ACG	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579260
3	NC_010721	CGC	2	6	107	112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579260
4	NC_010721	CGC	2	6	128	133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579260
5	NC_010721	CCT	3	9	242	250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579260
6	NC_010721	TCG	2	6	384	389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579261
7	NC_010721	GCG	2	6	397	402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
8	NC_010721	GAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579261
9	NC_010721	GGC	2	6	455	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
10	NC_010721	GGC	2	6	488	493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579261
11	NC_010721	CAC	2	6	574	579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579261
12	NC_010721	GCC	2	6	762	767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
13	NC_010721	CGC	2	6	840	845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
14	NC_010721	GCC	2	6	952	957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579262
15	NC_010721	CGA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579262
16	NC_010721	CGA	2	6	981	986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579262
17	NC_010721	CTC	2	6	994	999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579262
18	NC_010721	CGT	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579262
19	NC_010721	GAG	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579262
20	NC_010721	CGA	2	6	1157	1162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579263
21	NC_010721	CGC	2	6	1205	1210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579263
22	NC_010721	GAG	2	6	1263	1268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579263
23	NC_010721	CAC	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579263
24	NC_010721	TGA	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579264
25	NC_010721	GCC	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
26	NC_010721	GAA	2	6	1675	1680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579264
27	NC_010721	TCG	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579264
28	NC_010721	CGC	2	6	1732	1737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
29	NC_010721	CGC	2	6	1771	1776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579264
30	NC_010721	CGA	2	6	1783	1788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579264
31	NC_010721	GAC	2	6	1796	1801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579264
32	NC_010721	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010721	CTC	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010721	GAA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010721	CGA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010721	GCA	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010721	CGG	2	6	1975	1980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010721	CTC	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010721	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010721	CGG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010721	GCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010721	GTG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010721	CGA	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010721	ACA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010721	ATC	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010721	ACG	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010721	GAG	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010721	TCG	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010721	GAG	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010721	CAC	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010721	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010721	CGA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010721	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010721	TGC	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010721	CGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010721	TCG	2	6	3060	3065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010721	TCG	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010721	GCC	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010721	TCG	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010721	CGG	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010721	GGT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010721	CGG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010721	TCG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
64	NC_010721	TTG	2	6	3502	3507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188579265
65	NC_010721	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188579265
66	NC_010721	GGC	2	6	3563	3568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
67	NC_010721	GAG	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
68	NC_010721	GAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
69	NC_010721	CAC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188579265
70	NC_010721	GCA	2	6	3710	3715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
71	NC_010721	GCA	2	6	3794	3799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
72	NC_010721	CTC	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
73	NC_010721	TCA	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
74	NC_010721	CGT	2	6	3911	3916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
75	NC_010721	CGC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
76	NC_010721	CGA	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
77	NC_010721	GAG	2	6	4044	4049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
78	NC_010721	CGG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
79	NC_010721	CGA	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
80	NC_010721	TCG	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
81	NC_010721	TCG	2	6	4351	4356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
82	NC_010721	GGC	2	6	4382	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
83	NC_010721	CGA	2	6	4393	4398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
84	NC_010721	AGC	2	6	4513	4518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
85	NC_010721	CGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
86	NC_010721	CGG	2	6	4580	4585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
87	NC_010721	CGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
88	NC_010721	GGC	2	6	4617	4622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
89	NC_010721	GCC	2	6	4662	4667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
90	NC_010721	CTC	2	6	4695	4700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
91	NC_010721	GAG	2	6	4701	4706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
92	NC_010721	TCG	2	6	4732	4737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
93	NC_010721	GAG	2	6	4740	4745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
94	NC_010721	GCC	2	6	4750	4755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
95	NC_010721	GAG	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
96	NC_010721	GAG	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
97	NC_010721	GAC	2	6	4934	4939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
98	NC_010721	GAG	2	6	4944	4949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
99	NC_010721	GGC	2	6	4992	4997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
100	NC_010721	GGC	2	6	5021	5026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
101	NC_010721	GAG	2	6	5097	5102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
102	NC_010721	CGC	2	6	5132	5137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
103	NC_010721	GAC	2	6	5138	5143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
104	NC_010721	GAG	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
105	NC_010721	GTC	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
106	NC_010721	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
107	NC_010721	GAA	2	6	5297	5302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579265
108	NC_010721	CTC	2	6	5309	5314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
109	NC_010721	AAG	2	6	5364	5369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188579265
110	NC_010721	CGA	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
111	NC_010721	CGC	2	6	5609	5614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
112	NC_010721	GGC	2	6	5615	5620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
113	NC_010721	GCG	3	9	5641	5649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
114	NC_010721	CTC	2	6	5702	5707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
115	NC_010721	GAG	2	6	5802	5807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188579265
116	NC_010721	GCC	2	6	5814	5819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
117	NC_010721	TCA	2	6	5872	5877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
118	NC_010721	CGT	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
119	NC_010721	CGA	2	6	5921	5926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
120	NC_010721	GGC	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
121	NC_010721	CGC	2	6	6011	6016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
122	NC_010721	CGC	2	6	6041	6046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	188579265
123	NC_010721	GTC	2	6	6080	6085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188579265
124	NC_010721	GGC	2	6	6098	6103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
125	NC_010721	CGA	2	6	6154	6159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188579265
126	NC_010721	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188579265
127	NC_010721	CGG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
128	NC_010721	CTC	2	6	6308	6313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188579265
129	NC_010721	CGG	2	6	6338	6343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
130	NC_010721	CGG	2	6	6359	6364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
131	NC_010721	GGC	2	6	6375	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
132	NC_010721	GTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579265
133	NC_010721	CGG	2	6	6509	6514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
134	NC_010721	CGG	2	6	6551	6556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579265
135	NC_010721	GTG	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188579265
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139	NC_010721	AGT	2	6	6745	6750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188579265
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141	NC_010721	CGA	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010721	GTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_010721	GGC	2	6	14483	14488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_010721	GCA	2	6	14524	14529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_010721	CCT	2	6	14658	14663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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260	NC_010721	CGA	2	6	14722	14727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_010721	GGC	2	6	14790	14795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	188579273
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384	NC_010721	TCC	2	6	23365	23370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.