MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium marinum M plasmid pMM23

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010604	GGCT	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	184152626
2	NC_010604	GGTG	2	8	281	288	0 %	25 %	75 %	0 %	184152626
3	NC_010604	GTTG	2	8	646	653	0 %	50 %	50 %	0 %	184152626
4	NC_010604	CGCC	2	8	1166	1173	0 %	0 %	25 %	75 %	184152626
5	NC_010604	TCAC	2	8	1395	1402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_010604	ACCC	2	8	1489	1496	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_010604	GCCG	2	8	1829	1836	0 %	0 %	50 %	50 %	184152627
8	NC_010604	GTTG	2	8	1872	1879	0 %	50 %	50 %	0 %	184152627
9	NC_010604	CACT	2	8	3056	3063	25 %	25 %	0 %	50 %	184152627
10	NC_010604	GGCG	2	8	3157	3164	0 %	0 %	75 %	25 %	184152627
11	NC_010604	CGGC	2	8	3726	3733	0 %	0 %	50 %	50 %	184152627
12	NC_010604	ACCG	2	8	3779	3786	25 %	0 %	25 %	50 %	184152627
13	NC_010604	CGGC	2	8	4045	4052	0 %	0 %	50 %	50 %	184152627
14	NC_010604	ACCG	2	8	4538	4545	25 %	0 %	25 %	50 %	184152627
15	NC_010604	GAGG	2	8	4639	4646	25 %	0 %	75 %	0 %	184152627
16	NC_010604	CGGC	2	8	4723	4730	0 %	0 %	50 %	50 %	184152627
17	NC_010604	CGCC	2	8	4807	4814	0 %	0 %	25 %	75 %	184152627
18	NC_010604	ACCC	2	8	4899	4906	25 %	0 %	0 %	75 %	184152627
19	NC_010604	GAAC	2	8	4925	4932	50 %	0 %	25 %	25 %	184152627
20	NC_010604	CGCT	2	8	5129	5136	0 %	25 %	25 %	50 %	184152628
21	NC_010604	CCAG	2	8	5900	5907	25 %	0 %	25 %	50 %	184152629
22	NC_010604	GGCC	2	8	5951	5958	0 %	0 %	50 %	50 %	184152629
23	NC_010604	GGTT	2	8	6302	6309	0 %	50 %	50 %	0 %	184152629
24	NC_010604	TGCA	2	8	6317	6324	25 %	25 %	25 %	25 %	184152629
25	NC_010604	GAAC	2	8	6521	6528	50 %	0 %	25 %	25 %	184152629
26	NC_010604	CGCC	2	8	6530	6537	0 %	0 %	25 %	75 %	184152629
27	NC_010604	ACCG	2	8	6819	6826	25 %	0 %	25 %	50 %	184152629
28	NC_010604	CGGC	2	8	6986	6993	0 %	0 %	50 %	50 %	184152629
29	NC_010604	GCCT	2	8	7746	7753	0 %	25 %	25 %	50 %	184152629
30	NC_010604	CCCG	2	8	7966	7973	0 %	0 %	25 %	75 %	184152629
31	NC_010604	GACA	2	8	8728	8735	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010604	AGTC	2	8	8967	8974	25 %	25 %	25 %	25 %	184152631
33	NC_010604	CAGC	2	8	9755	9762	25 %	0 %	25 %	50 %	184152632
34	NC_010604	CGAT	2	8	9898	9905	25 %	25 %	25 %	25 %	184152632
35	NC_010604	CTCG	2	8	10808	10815	0 %	25 %	25 %	50 %	184152633
36	NC_010604	GCCG	2	8	10995	11002	0 %	0 %	50 %	50 %	184152633
37	NC_010604	GCCA	2	8	11772	11779	25 %	0 %	25 %	50 %	184152634
38	NC_010604	CCGT	2	8	12029	12036	0 %	25 %	25 %	50 %	184152634
39	NC_010604	GAGT	2	8	12263	12270	25 %	25 %	50 %	0 %	184152634
40	NC_010604	CAGC	2	8	12801	12808	25 %	0 %	25 %	50 %	184152635
41	NC_010604	ACCG	2	8	13095	13102	25 %	0 %	25 %	50 %	184152636
42	NC_010604	GCGG	2	8	13297	13304	0 %	0 %	75 %	25 %	184152636
43	NC_010604	GGCG	2	8	13728	13735	0 %	0 %	75 %	25 %	184152636
44	NC_010604	CGTT	2	8	14758	14765	0 %	50 %	25 %	25 %	184152637
45	NC_010604	CCGT	2	8	14862	14869	0 %	25 %	25 %	50 %	184152638
46	NC_010604	ACCG	2	8	15075	15082	25 %	0 %	25 %	50 %	184152638
47	NC_010604	CGCC	2	8	15430	15437	0 %	0 %	25 %	75 %	184152639
48	NC_010604	AGGC	3	12	15836	15847	25 %	0 %	50 %	25 %	184152639
49	NC_010604	GCCG	2	8	16206	16213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010604	GTCG	2	8	16458	16465	0 %	25 %	50 %	25 %	184152642
51	NC_010604	GATC	2	8	16655	16662	25 %	25 %	25 %	25 %	184152643
52	NC_010604	ACCG	2	8	17195	17202	25 %	0 %	25 %	50 %	184152644
53	NC_010604	CGGT	2	8	17419	17426	0 %	25 %	50 %	25 %	184152645
54	NC_010604	CGTC	2	8	17519	17526	0 %	25 %	25 %	50 %	184152645
55	NC_010604	GCCG	2	8	17873	17880	0 %	0 %	50 %	50 %	184152645
56	NC_010604	CGGG	2	8	18062	18069	0 %	0 %	75 %	25 %	184152645
57	NC_010604	AGCA	2	8	18553	18560	50 %	0 %	25 %	25 %	184152646
58	NC_010604	TCGA	2	8	18583	18590	25 %	25 %	25 %	25 %	184152646
59	NC_010604	GCCG	2	8	18936	18943	0 %	0 %	50 %	50 %	184152646
60	NC_010604	CATA	2	8	19356	19363	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010604	TGCA	2	8	19402	19409	25 %	25 %	25 %	25 %	184152647
62	NC_010604	GGCC	2	8	19899	19906	0 %	0 %	50 %	50 %	184152647
63	NC_010604	ACGT	2	8	20036	20043	25 %	25 %	25 %	25 %	184152647
64	NC_010604	GCCG	2	8	20339	20346	0 %	0 %	50 %	50 %	184152648
65	NC_010604	CCCG	2	8	20372	20379	0 %	0 %	25 %	75 %	184152648
66	NC_010604	GGGC	2	8	20625	20632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010604	GCCC	2	8	20712	20719	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_010604	ATCC	2	8	21109	21116	25 %	25 %	0 %	50 %	184152649
69	NC_010604	GGTG	2	8	21368	21375	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010604	CGGG	2	8	21473	21480	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010604	GCAT	3	12	21734	21745	25 %	25 %	25 %	25 %	184152650
72	NC_010604	TTGC	2	8	21781	21788	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010604	GCAC	2	8	21795	21802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010604	CGGT	2	8	22000	22007	0 %	25 %	50 %	25 %	184152651
75	NC_010604	GGCA	2	8	22156	22163	25 %	0 %	50 %	25 %	184152652
76	NC_010604	GGCT	2	8	22442	22449	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010604	CGGC	2	8	22755	22762	0 %	0 %	50 %	50 %	184152653
78	NC_010604	CAGC	2	8	23030	23037	25 %	0 %	25 %	50 %	184152654

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.