MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD04

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010517	CGCT	2	8	72	79	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_010517	CTTT	2	8	253	260	0 %	75 %	0 %	25 %	170752138
3	NC_010517	AGCG	2	8	963	970	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010517	GTGG	2	8	1012	1019	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010517	TCGA	2	8	1186	1193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010517	TGCT	2	8	2019	2026	0 %	50 %	25 %	25 %	170752139
7	NC_010517	CTCC	2	8	3091	3098	0 %	25 %	0 %	75 %	170752140
8	NC_010517	CTGC	2	8	3826	3833	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
9	NC_010517	CTGC	2	8	3862	3869	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
10	NC_010517	GCCT	2	8	4292	4299	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
11	NC_010517	TCGC	2	8	4929	4936	0 %	25 %	25 %	50 %	170752141
12	NC_010517	GTTT	2	8	5297	5304	0 %	75 %	25 %	0 %	170752142
13	NC_010517	GGGC	2	8	5925	5932	0 %	0 %	75 %	25 %	170752142
14	NC_010517	CGAT	2	8	6007	6014	25 %	25 %	25 %	25 %	170752142
15	NC_010517	TGGT	2	8	6446	6453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010517	TTGG	2	8	6667	6674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010517	GACG	2	8	6895	6902	25 %	0 %	50 %	25 %	170752143
18	NC_010517	GGAC	2	8	7017	7024	25 %	0 %	50 %	25 %	170752143
19	NC_010517	TCGC	2	8	7227	7234	0 %	25 %	25 %	50 %	170752143
20	NC_010517	GGGC	2	8	7236	7243	0 %	0 %	75 %	25 %	170752143
21	NC_010517	ACCG	2	8	7267	7274	25 %	0 %	25 %	50 %	170752143
22	NC_010517	CAGG	2	8	9093	9100	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010517	ACCC	2	8	9102	9109	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_010517	GGGC	2	8	9170	9177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010517	CGCT	2	8	9538	9545	0 %	25 %	25 %	50 %	170752145
26	NC_010517	CGGC	2	8	9687	9694	0 %	0 %	50 %	50 %	170752145
27	NC_010517	GCGG	2	8	9901	9908	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010517	CCTG	2	8	10162	10169	0 %	25 %	25 %	50 %	170752146
29	NC_010517	GCGG	2	8	10223	10230	0 %	0 %	75 %	25 %	170752146
30	NC_010517	GACG	2	8	10263	10270	25 %	0 %	50 %	25 %	170752146
31	NC_010517	GCGA	2	8	10578	10585	25 %	0 %	50 %	25 %	170752147
32	NC_010517	GATC	2	8	10938	10945	25 %	25 %	25 %	25 %	170752148
33	NC_010517	CCTG	2	8	11010	11017	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010517	ACGC	2	8	11082	11089	25 %	0 %	25 %	50 %	170752149
35	NC_010517	GGGT	2	8	11264	11271	0 %	25 %	75 %	0 %	170752149
36	NC_010517	CGTC	2	8	11454	11461	0 %	25 %	25 %	50 %	170752149
37	NC_010517	CGAT	2	8	11666	11673	25 %	25 %	25 %	25 %	170752149
38	NC_010517	CGCC	2	8	12121	12128	0 %	0 %	25 %	75 %	170752150
39	NC_010517	GAGC	2	8	12353	12360	25 %	0 %	50 %	25 %	170752150
40	NC_010517	GTCG	2	8	12464	12471	0 %	25 %	50 %	25 %	170752150
41	NC_010517	GCCA	2	8	12527	12534	25 %	0 %	25 %	50 %	170752150
42	NC_010517	TGAC	2	8	12658	12665	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010517	GACG	2	8	12839	12846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010517	GGCC	2	8	13521	13528	0 %	0 %	50 %	50 %	170752152
45	NC_010517	CGGC	2	8	13834	13841	0 %	0 %	50 %	50 %	170752152
46	NC_010517	CAGG	2	8	13909	13916	25 %	0 %	50 %	25 %	170752152
47	NC_010517	ATGC	2	8	14220	14227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010517	CTGT	2	8	14360	14367	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010517	CTGC	2	8	14387	14394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010517	GTCG	2	8	14613	14620	0 %	25 %	50 %	25 %	170752153
51	NC_010517	CGAG	2	8	14791	14798	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010517	CGTG	2	8	15067	15074	0 %	25 %	50 %	25 %	170752154
53	NC_010517	CGAG	2	8	15980	15987	25 %	0 %	50 %	25 %	170752156
54	NC_010517	AATC	2	8	16340	16347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010517	CGAT	2	8	16358	16365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010517	TGGA	2	8	16400	16407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010517	GCCA	2	8	16822	16829	25 %	0 %	25 %	50 %	170752157
58	NC_010517	CGGG	2	8	18206	18213	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010517	AAGA	2	8	18306	18313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010517	GGCC	2	8	19479	19486	0 %	0 %	50 %	50 %	170752159
61	NC_010517	CCGG	2	8	19774	19781	0 %	0 %	50 %	50 %	170752159
62	NC_010517	AGCG	2	8	20253	20260	25 %	0 %	50 %	25 %	170752160
63	NC_010517	CATC	2	8	20313	20320	25 %	25 %	0 %	50 %	170752160
64	NC_010517	GATG	2	8	21258	21265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010517	TGAT	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	170752162
66	NC_010517	GGCT	2	8	22065	22072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010517	GGAC	2	8	22524	22531	25 %	0 %	50 %	25 %	170752164
68	NC_010517	CGGT	2	8	22687	22694	0 %	25 %	50 %	25 %	170752164
69	NC_010517	GCCG	2	8	23320	23327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010517	GCCT	2	8	23913	23920	0 %	25 %	25 %	50 %	170752165
71	NC_010517	ATGA	2	8	24510	24517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010517	CAGG	2	8	25425	25432	25 %	0 %	50 %	25 %	170752167
73	NC_010517	GGAC	2	8	25550	25557	25 %	0 %	50 %	25 %	170752167
74	NC_010517	CACC	2	8	25751	25758	25 %	0 %	0 %	75 %	170752167
75	NC_010517	CTGC	2	8	25820	25827	0 %	25 %	25 %	50 %	170752167
76	NC_010517	CGGC	2	8	25952	25959	0 %	0 %	50 %	50 %	170752167
77	NC_010517	TCCG	2	8	26232	26239	0 %	25 %	25 %	50 %	170752167
78	NC_010517	GATC	2	8	26813	26820	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010517	TCGA	2	8	27134	27141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010517	TGGC	2	8	27175	27182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010517	CTTC	2	8	27394	27401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010517	CGGA	2	8	27717	27724	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010517	CGAG	2	8	28526	28533	25 %	0 %	50 %	25 %	170752168
84	NC_010517	GTCC	2	8	29379	29386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010517	AACG	2	8	29660	29667	50 %	0 %	25 %	25 %	170752170
86	NC_010517	CAGT	2	8	29977	29984	25 %	25 %	25 %	25 %	170752170
87	NC_010517	TTCG	2	8	30084	30091	0 %	50 %	25 %	25 %	170752170
88	NC_010517	CCCG	2	8	30661	30668	0 %	0 %	25 %	75 %	170752171
89	NC_010517	GCGA	2	8	30923	30930	25 %	0 %	50 %	25 %	170752171
90	NC_010517	GTCT	2	8	31197	31204	0 %	50 %	25 %	25 %	170752171
91	NC_010517	GCAG	2	8	31265	31272	25 %	0 %	50 %	25 %	170752171
92	NC_010517	TTGC	2	8	31559	31566	0 %	50 %	25 %	25 %	170752172
93	NC_010517	AGCC	2	8	31892	31899	25 %	0 %	25 %	50 %	170752173
94	NC_010517	GCGG	2	8	32222	32229	0 %	0 %	75 %	25 %	170752173
95	NC_010517	GACA	2	8	32319	32326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010517	GCCT	2	8	32426	32433	0 %	25 %	25 %	50 %	170752174
97	NC_010517	GATC	2	8	32544	32551	25 %	25 %	25 %	25 %	170752174
98	NC_010517	GCCC	2	8	32916	32923	0 %	0 %	25 %	75 %	170752174
99	NC_010517	TGGG	2	8	33212	33219	0 %	25 %	75 %	0 %	170752174
100	NC_010517	TCCG	2	8	33324	33331	0 %	25 %	25 %	50 %	170752174
101	NC_010517	TTGG	2	8	33365	33372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010517	CCTG	2	8	33455	33462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010517	TGCG	2	8	33762	33769	0 %	25 %	50 %	25 %	170752175
104	NC_010517	CCCG	2	8	34277	34284	0 %	0 %	25 %	75 %	170752176
105	NC_010517	GCCG	2	8	34461	34468	0 %	0 %	50 %	50 %	170752176
106	NC_010517	ACCG	2	8	34654	34661	25 %	0 %	25 %	50 %	170752176
107	NC_010517	GCGA	2	8	34723	34730	25 %	0 %	50 %	25 %	170752176
108	NC_010517	GATC	2	8	35040	35047	25 %	25 %	25 %	25 %	170752176
109	NC_010517	TGGA	2	8	35054	35061	25 %	25 %	50 %	0 %	170752176
110	NC_010517	TTGG	2	8	35434	35441	0 %	50 %	50 %	0 %	170752176
111	NC_010517	ATGT	2	8	35562	35569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010517	GGGC	2	8	35729	35736	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010517	TGAC	2	8	35869	35876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010517	GCTG	2	8	36541	36548	0 %	25 %	50 %	25 %	170752177

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.