MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD03

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010514	ATCC	2	8	354	361	25 %	25 %	0 %	50 %	170745567
2	NC_010514	GTCG	2	8	457	464	0 %	25 %	50 %	25 %	170745567
3	NC_010514	ACAT	2	8	596	603	50 %	25 %	0 %	25 %	170745567
4	NC_010514	GCTC	2	8	1044	1051	0 %	25 %	25 %	50 %	170745567
5	NC_010514	CGCA	2	8	1243	1250	25 %	0 %	25 %	50 %	170745567
6	NC_010514	CCGA	2	8	1265	1272	25 %	0 %	25 %	50 %	170745567
7	NC_010514	TCGG	2	8	1414	1421	0 %	25 %	50 %	25 %	170745567
8	NC_010514	GATG	2	8	1425	1432	25 %	25 %	50 %	0 %	170745567
9	NC_010514	CCAC	2	8	1524	1531	25 %	0 %	0 %	75 %	170745567
10	NC_010514	GCAC	2	8	1810	1817	25 %	0 %	25 %	50 %	170745567
11	NC_010514	CGGG	2	8	2028	2035	0 %	0 %	75 %	25 %	170745567
12	NC_010514	GATC	2	8	2121	2128	25 %	25 %	25 %	25 %	170745567
13	NC_010514	ACCG	2	8	2469	2476	25 %	0 %	25 %	50 %	170745567
14	NC_010514	GCTG	2	8	2967	2974	0 %	25 %	50 %	25 %	170745567
15	NC_010514	ACGC	2	8	3217	3224	25 %	0 %	25 %	50 %	170745568
16	NC_010514	CGGC	2	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	170745569
17	NC_010514	TGCC	2	8	4113	4120	0 %	25 %	25 %	50 %	170745570
18	NC_010514	GGCC	2	8	4145	4152	0 %	0 %	50 %	50 %	170745570
19	NC_010514	GCTC	2	8	4324	4331	0 %	25 %	25 %	50 %	170745570
20	NC_010514	GGCC	2	8	4679	4686	0 %	0 %	50 %	50 %	170745570
21	NC_010514	GTCC	2	8	4774	4781	0 %	25 %	25 %	50 %	170745571
22	NC_010514	CACC	2	8	5418	5425	25 %	0 %	0 %	75 %	170745572
23	NC_010514	TATG	2	8	5993	6000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010514	GGTC	2	8	6749	6756	0 %	25 %	50 %	25 %	170745573
25	NC_010514	GATC	2	8	6826	6833	25 %	25 %	25 %	25 %	170745573
26	NC_010514	CGGT	2	8	7706	7713	0 %	25 %	50 %	25 %	170745574
27	NC_010514	CGAC	2	8	7782	7789	25 %	0 %	25 %	50 %	170745574
28	NC_010514	CGGC	2	8	7905	7912	0 %	0 %	50 %	50 %	170745574
29	NC_010514	GCCA	2	8	8117	8124	25 %	0 %	25 %	50 %	170745574
30	NC_010514	GGCC	2	8	8176	8183	0 %	0 %	50 %	50 %	170745574
31	NC_010514	CGGC	2	8	8421	8428	0 %	0 %	50 %	50 %	170745574
32	NC_010514	CCCG	2	8	8740	8747	0 %	0 %	25 %	75 %	170745575
33	NC_010514	CGAT	2	8	8842	8849	25 %	25 %	25 %	25 %	170745575
34	NC_010514	GAGC	2	8	9123	9130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010514	GCGT	2	8	9385	9392	0 %	25 %	50 %	25 %	170745576
36	NC_010514	CGCC	2	8	9768	9775	0 %	0 %	25 %	75 %	170745576
37	NC_010514	GTCG	2	8	9915	9922	0 %	25 %	50 %	25 %	170745576
38	NC_010514	GGTC	2	8	9987	9994	0 %	25 %	50 %	25 %	170745576
39	NC_010514	TCGG	2	8	10360	10367	0 %	25 %	50 %	25 %	170745576
40	NC_010514	GCAC	2	8	10439	10446	25 %	0 %	25 %	50 %	170745576
41	NC_010514	GCCG	2	8	10713	10720	0 %	0 %	50 %	50 %	170745576
42	NC_010514	GCCC	2	8	10864	10871	0 %	0 %	25 %	75 %	170745576
43	NC_010514	GTGG	2	8	10945	10952	0 %	25 %	75 %	0 %	170745576
44	NC_010514	AAGG	2	8	10978	10985	50 %	0 %	50 %	0 %	170745576
45	NC_010514	CCGG	2	8	11475	11482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_010514	TCGA	2	8	11890	11897	25 %	25 %	25 %	25 %	170745578
47	NC_010514	CGTG	2	8	12039	12046	0 %	25 %	50 %	25 %	170745578
48	NC_010514	CGTG	2	8	12162	12169	0 %	25 %	50 %	25 %	170745578
49	NC_010514	AAGG	2	8	12660	12667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010514	CGTA	2	8	12923	12930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010514	TGGC	2	8	13035	13042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010514	GCCG	2	8	13202	13209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010514	GCCC	2	8	13214	13221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_010514	GTAC	2	8	13359	13366	25 %	25 %	25 %	25 %	170745579
55	NC_010514	GCCC	2	8	13424	13431	0 %	0 %	25 %	75 %	170745579
56	NC_010514	GAGC	2	8	13669	13676	25 %	0 %	50 %	25 %	170745579
57	NC_010514	GCTG	2	8	13787	13794	0 %	25 %	50 %	25 %	170745579
58	NC_010514	CGTC	2	8	14002	14009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010514	GCCA	2	8	14075	14082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010514	AGCG	2	8	14131	14138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010514	TGAA	2	8	14364	14371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010514	GGCG	2	8	14808	14815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010514	CGAA	2	8	15555	15562	50 %	0 %	25 %	25 %	170745581
64	NC_010514	TGGC	2	8	16702	16709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010514	TCAG	2	8	16852	16859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010514	CGCA	2	8	17774	17781	25 %	0 %	25 %	50 %	170745584
67	NC_010514	GTCG	2	8	19137	19144	0 %	25 %	50 %	25 %	170745585
68	NC_010514	TTTG	2	8	20047	20054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010514	ACCG	2	8	20374	20381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010514	GGCC	2	8	20612	20619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010514	CGGC	2	8	21423	21430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010514	AGCA	2	8	21512	21519	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010514	CCGC	2	8	21567	21574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_010514	CCAC	2	8	21907	21914	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_010514	CAGC	2	8	22325	22332	25 %	0 %	25 %	50 %	170745586
76	NC_010514	GCAG	2	8	22358	22365	25 %	0 %	50 %	25 %	170745586
77	NC_010514	GCAG	2	8	23452	23459	25 %	0 %	50 %	25 %	170745586
78	NC_010514	CCCA	2	8	23530	23537	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_010514	ACCG	2	8	24973	24980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010514	GCTC	2	8	24990	24997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010514	GGAA	2	8	25011	25018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010514	GGGC	2	8	25185	25192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010514	CGCT	2	8	25553	25560	0 %	25 %	25 %	50 %	170745588
84	NC_010514	CGGC	2	8	25702	25709	0 %	0 %	50 %	50 %	170745588
85	NC_010514	GCGG	2	8	25916	25923	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010514	CCTG	2	8	26177	26184	0 %	25 %	25 %	50 %	170745589
87	NC_010514	GCGG	2	8	26238	26245	0 %	0 %	75 %	25 %	170745589
88	NC_010514	GACG	2	8	26278	26285	25 %	0 %	50 %	25 %	170745589
89	NC_010514	GCGA	2	8	26593	26600	25 %	0 %	50 %	25 %	170745590
90	NC_010514	GATC	2	8	26953	26960	25 %	25 %	25 %	25 %	170745591
91	NC_010514	CCTG	2	8	27025	27032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010514	ACGC	2	8	27097	27104	25 %	0 %	25 %	50 %	170745592
93	NC_010514	GGGT	2	8	27279	27286	0 %	25 %	75 %	0 %	170745592
94	NC_010514	CGTC	2	8	27469	27476	0 %	25 %	25 %	50 %	170745592
95	NC_010514	CGAT	2	8	27681	27688	25 %	25 %	25 %	25 %	170745592
96	NC_010514	CGCC	2	8	28136	28143	0 %	0 %	25 %	75 %	170745593
97	NC_010514	GAGC	2	8	28368	28375	25 %	0 %	50 %	25 %	170745593
98	NC_010514	GTCG	2	8	28479	28486	0 %	25 %	50 %	25 %	170745593
99	NC_010514	GCCA	2	8	28542	28549	25 %	0 %	25 %	50 %	170745593
100	NC_010514	TGAC	2	8	28673	28680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010514	GACG	2	8	28854	28861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010514	GGCC	2	8	29536	29543	0 %	0 %	50 %	50 %	170745595
103	NC_010514	CGGC	2	8	29849	29856	0 %	0 %	50 %	50 %	170745595
104	NC_010514	CAGG	2	8	29924	29931	25 %	0 %	50 %	25 %	170745595
105	NC_010514	ATGC	2	8	30235	30242	25 %	25 %	25 %	25 %	170745596
106	NC_010514	CTGT	2	8	30375	30382	0 %	50 %	25 %	25 %	170745596
107	NC_010514	CTGC	2	8	30402	30409	0 %	25 %	25 %	50 %	170745596
108	NC_010514	GTCG	2	8	30628	30635	0 %	25 %	50 %	25 %	170745596
109	NC_010514	CGAG	2	8	30806	30813	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010514	CGTG	2	8	31082	31089	0 %	25 %	50 %	25 %	170745597
111	NC_010514	CTGG	2	8	31960	31967	0 %	25 %	50 %	25 %	170745599
112	NC_010514	CGCC	2	8	32503	32510	0 %	0 %	25 %	75 %	170745600
113	NC_010514	CGGT	2	8	33149	33156	0 %	25 %	50 %	25 %	170745601
114	NC_010514	CGGT	2	8	33449	33456	0 %	25 %	50 %	25 %	170745601
115	NC_010514	GGGC	2	8	33471	33478	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010514	GATG	2	8	33529	33536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010514	CTGA	2	8	34044	34051	25 %	25 %	25 %	25 %	170745602
118	NC_010514	CCGG	2	8	34093	34100	0 %	0 %	50 %	50 %	170745602
119	NC_010514	CAGC	2	8	34113	34120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_010514	GGCC	2	8	34653	34660	0 %	0 %	50 %	50 %	170745603
121	NC_010514	TGCT	2	8	34770	34777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010514	CATT	2	8	35109	35116	25 %	50 %	0 %	25 %	170745604
123	NC_010514	TGCC	2	8	35456	35463	0 %	25 %	25 %	50 %	170745604
124	NC_010514	GAAA	2	8	35497	35504	75 %	0 %	25 %	0 %	170745604
125	NC_010514	AGCG	2	8	36407	36414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010514	GCCG	2	8	36564	36571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_010514	CAGT	2	8	36637	36644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010514	GCGA	2	8	36752	36759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010514	GGCT	2	8	37605	37612	0 %	25 %	50 %	25 %	170745605
130	NC_010514	TGGA	2	8	38075	38082	25 %	25 %	50 %	0 %	170745605
131	NC_010514	CCGG	2	8	38174	38181	0 %	0 %	50 %	50 %	170745605
132	NC_010514	ATTT	2	8	38514	38521	25 %	75 %	0 %	0 %	170745605
133	NC_010514	GTCC	2	8	38574	38581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_010514	ACGC	2	8	38756	38763	25 %	0 %	25 %	50 %	170745606
135	NC_010514	GGCG	2	8	38776	38783	0 %	0 %	75 %	25 %	170745606
136	NC_010514	CATC	2	8	38979	38986	25 %	25 %	0 %	50 %	170745606
137	NC_010514	TGCA	2	8	39302	39309	25 %	25 %	25 %	25 %	170745606
138	NC_010514	CCGG	2	8	39365	39372	0 %	0 %	50 %	50 %	170745606
139	NC_010514	CAGG	2	8	41632	41639	25 %	0 %	50 %	25 %	170745607
140	NC_010514	GGAC	2	8	41785	41792	25 %	0 %	50 %	25 %	170745607
141	NC_010514	CTTA	2	8	42560	42567	25 %	50 %	0 %	25 %	170745609
142	NC_010514	TTGC	2	8	42927	42934	0 %	50 %	25 %	25 %	170745609
143	NC_010514	GGTT	2	8	42951	42958	0 %	50 %	50 %	0 %	170745609

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.