MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 2745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	TA	4	8	290	297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009975	GT	3	6	934	939	0 %	50 %	50 %	0 %	159904397
3	NC_009975	AT	3	6	1876	1881	50 %	50 %	0 %	0 %	159904398
4	NC_009975	AT	3	6	2953	2958	50 %	50 %	0 %	0 %	159904398
5	NC_009975	AT	3	6	3585	3590	50 %	50 %	0 %	0 %	159904399
6	NC_009975	GA	3	6	4871	4876	50 %	0 %	50 %	0 %	159904399
7	NC_009975	AC	3	6	5381	5386	50 %	0 %	0 %	50 %	159904400
8	NC_009975	CT	3	6	5462	5467	0 %	50 %	0 %	50 %	159904400
9	NC_009975	TA	3	6	7477	7482	50 %	50 %	0 %	0 %	159904403
10	NC_009975	AT	3	6	9140	9145	50 %	50 %	0 %	0 %	159904406
11	NC_009975	AG	3	6	9375	9380	50 %	0 %	50 %	0 %	159904406
12	NC_009975	AG	3	6	9900	9905	50 %	0 %	50 %	0 %	159904406
13	NC_009975	AG	3	6	10723	10728	50 %	0 %	50 %	0 %	159904407
14	NC_009975	AT	3	6	11779	11784	50 %	50 %	0 %	0 %	159904409
15	NC_009975	AT	3	6	11886	11891	50 %	50 %	0 %	0 %	159904409
16	NC_009975	TA	3	6	11928	11933	50 %	50 %	0 %	0 %	159904409
17	NC_009975	TA	3	6	12128	12133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009975	AT	3	6	12172	12177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009975	AT	3	6	12203	12208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009975	AT	3	6	14978	14983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009975	TA	3	6	15312	15317	50 %	50 %	0 %	0 %	159904412
22	NC_009975	AT	3	6	15331	15336	50 %	50 %	0 %	0 %	159904412
23	NC_009975	AT	3	6	15942	15947	50 %	50 %	0 %	0 %	159904412
24	NC_009975	AT	3	6	16303	16308	50 %	50 %	0 %	0 %	159904412
25	NC_009975	TC	3	6	16706	16711	0 %	50 %	0 %	50 %	159904413
26	NC_009975	TA	3	6	16794	16799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009975	TA	3	6	16813	16818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009975	AT	4	8	16831	16838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009975	AT	3	6	18359	18364	50 %	50 %	0 %	0 %	159904416
30	NC_009975	AT	3	6	18416	18421	50 %	50 %	0 %	0 %	159904416
31	NC_009975	AT	3	6	18789	18794	50 %	50 %	0 %	0 %	159904417
32	NC_009975	AT	3	6	19075	19080	50 %	50 %	0 %	0 %	159904417
33	NC_009975	AT	3	6	19304	19309	50 %	50 %	0 %	0 %	159904417
34	NC_009975	AT	3	6	19322	19327	50 %	50 %	0 %	0 %	159904417
35	NC_009975	TA	3	6	19621	19626	50 %	50 %	0 %	0 %	159904417
36	NC_009975	TA	3	6	20921	20926	50 %	50 %	0 %	0 %	159904418
37	NC_009975	AT	3	6	21195	21200	50 %	50 %	0 %	0 %	159904418
38	NC_009975	TA	4	8	22274	22281	50 %	50 %	0 %	0 %	159904419
39	NC_009975	TA	3	6	22340	22345	50 %	50 %	0 %	0 %	159904419
40	NC_009975	TA	3	6	22839	22844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009975	GA	3	6	23690	23695	50 %	0 %	50 %	0 %	159904421
42	NC_009975	TA	3	6	23894	23899	50 %	50 %	0 %	0 %	159904421
43	NC_009975	AT	3	6	24434	24439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009975	CA	5	10	24512	24521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009975	TA	3	6	24544	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009975	CA	3	6	24680	24685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009975	TC	3	6	24876	24881	0 %	50 %	0 %	50 %	159904422
48	NC_009975	TA	3	6	25113	25118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009975	GA	3	6	25298	25303	50 %	0 %	50 %	0 %	159904423
50	NC_009975	TA	3	6	25434	25439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009975	GA	3	6	26091	26096	50 %	0 %	50 %	0 %	159904425
52	NC_009975	AT	3	6	27773	27778	50 %	50 %	0 %	0 %	159904426
53	NC_009975	AT	3	6	28398	28403	50 %	50 %	0 %	0 %	159904427
54	NC_009975	TA	3	6	30058	30063	50 %	50 %	0 %	0 %	159904432
55	NC_009975	GA	3	6	30618	30623	50 %	0 %	50 %	0 %	159904432
56	NC_009975	AT	3	6	31859	31864	50 %	50 %	0 %	0 %	159904433
57	NC_009975	GA	3	6	32675	32680	50 %	0 %	50 %	0 %	159904434
58	NC_009975	TG	3	6	32694	32699	0 %	50 %	50 %	0 %	159904434
59	NC_009975	GA	3	6	33071	33076	50 %	0 %	50 %	0 %	159904434
60	NC_009975	AT	4	8	33535	33542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009975	AT	3	6	33742	33747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009975	AT	3	6	33922	33927	50 %	50 %	0 %	0 %	159904435
63	NC_009975	AG	3	6	33943	33948	50 %	0 %	50 %	0 %	159904435
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65	NC_009975	CA	3	6	36545	36550	50 %	0 %	0 %	50 %	159904436
66	NC_009975	AT	3	6	36720	36725	50 %	50 %	0 %	0 %	159904436
67	NC_009975	AT	3	6	38578	38583	50 %	50 %	0 %	0 %	159904437
68	NC_009975	AG	3	6	39664	39669	50 %	0 %	50 %	0 %	159904438
69	NC_009975	AC	3	6	40203	40208	50 %	0 %	0 %	50 %	159904439
70	NC_009975	AT	4	8	40337	40344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009975	AT	3	6	40433	40438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009975	TA	3	6	40569	40574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009975	TA	3	6	40830	40835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009975	TA	3	6	40850	40855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009975	AT	3	6	41014	41019	50 %	50 %	0 %	0 %	159904440
76	NC_009975	GC	3	6	41237	41242	0 %	0 %	50 %	50 %	159904440
77	NC_009975	TA	3	6	42442	42447	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
78	NC_009975	AT	3	6	42917	42922	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
79	NC_009975	AT	3	6	43075	43080	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
80	NC_009975	AT	3	6	43257	43262	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
81	NC_009975	AT	3	6	43326	43331	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
82	NC_009975	AT	3	6	43627	43632	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
83	NC_009975	AT	4	8	44384	44391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009975	AT	3	6	44752	44757	50 %	50 %	0 %	0 %	159904446
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86	NC_009975	AT	3	6	45173	45178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009975	TA	3	6	45875	45880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009975	AT	3	6	46083	46088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009975	TC	3	6	46135	46140	0 %	50 %	0 %	50 %	159904450
90	NC_009975	AT	3	6	46759	46764	50 %	50 %	0 %	0 %	159904450
91	NC_009975	TA	3	6	47032	47037	50 %	50 %	0 %	0 %	159904451
92	NC_009975	AT	3	6	47343	47348	50 %	50 %	0 %	0 %	159904451
93	NC_009975	AT	3	6	47433	47438	50 %	50 %	0 %	0 %	159904451
94	NC_009975	AT	3	6	47868	47873	50 %	50 %	0 %	0 %	159904451
95	NC_009975	AT	3	6	48273	48278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009975	AT	3	6	49726	49731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009975	CA	3	6	50104	50109	50 %	0 %	0 %	50 %	159904453
98	NC_009975	CT	3	6	50226	50231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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100	NC_009975	AT	3	6	52538	52543	50 %	50 %	0 %	0 %	159904458
101	NC_009975	AT	3	6	54456	54461	50 %	50 %	0 %	0 %	159904463
102	NC_009975	AT	3	6	55468	55473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009975	AT	3	6	55815	55820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009975	AT	3	6	56447	56452	50 %	50 %	0 %	0 %	159904466
105	NC_009975	TA	3	6	57643	57648	50 %	50 %	0 %	0 %	159904467
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108	NC_009975	AT	3	6	59499	59504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009975	AT	3	6	59715	59720	50 %	50 %	0 %	0 %	159904469
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111	NC_009975	AT	3	6	60321	60326	50 %	50 %	0 %	0 %	159904470
112	NC_009975	TA	3	6	61699	61704	50 %	50 %	0 %	0 %	159904471
113	NC_009975	AT	3	6	61787	61792	50 %	50 %	0 %	0 %	159904471
114	NC_009975	AT	3	6	62320	62325	50 %	50 %	0 %	0 %	159904472
115	NC_009975	AT	3	6	62508	62513	50 %	50 %	0 %	0 %	159904472
116	NC_009975	AT	3	6	62770	62775	50 %	50 %	0 %	0 %	159904472
117	NC_009975	TA	3	6	62868	62873	50 %	50 %	0 %	0 %	159904472
118	NC_009975	AT	3	6	63283	63288	50 %	50 %	0 %	0 %	159904473
119	NC_009975	AT	3	6	64139	64144	50 %	50 %	0 %	0 %	159904473
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125	NC_009975	AT	3	6	67223	67228	50 %	50 %	0 %	0 %	159904474
126	NC_009975	AT	3	6	67395	67400	50 %	50 %	0 %	0 %	159904474
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133	NC_009975	AT	3	6	73153	73158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009975	TA	3	6	73204	73209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009975	TA	3	6	73240	73245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009975	AT	3	6	73421	73426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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