MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	TAACTG	2	12	2024	2035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904398
2	NC_009975	TGCAGT	2	12	3242	3253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159904399
3	NC_009975	GGAATT	2	12	3285	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904399
4	NC_009975	GAAAAA	2	12	10343	10354	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904407
5	NC_009975	CAATTG	2	12	11417	11428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904409
6	NC_009975	TTTATT	2	12	12929	12940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	159904411
7	NC_009975	ATTTTT	2	12	18235	18246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009975	TTATTT	2	12	20687	20698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	159904418
9	NC_009975	AAAGTA	2	12	21511	21522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904419
10	NC_009975	TAAAAA	2	12	24705	24716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009975	TTGAAA	2	12	25985	25996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904425
12	NC_009975	AAAATG	2	12	27049	27060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904426
13	NC_009975	ACTTTC	2	12	29859	29870	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904431
14	NC_009975	TTAAAA	2	12	32525	32536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009975	GAAAAA	2	12	33095	33106	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904434
16	NC_009975	TTTTTA	2	12	33503	33514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009975	TTAAAA	2	12	38318	38329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904436
18	NC_009975	TCAATT	2	12	38990	39001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904437
19	NC_009975	CATTTC	2	12	40096	40107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904439
20	NC_009975	GCTTTA	2	12	40179	40190	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	159904439
21	NC_009975	TTATTT	2	12	40705	40716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009975	ATTAAA	2	12	40872	40883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009975	AGAATA	2	12	43403	43414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904444
24	NC_009975	TGAAAT	2	12	44854	44865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904447
25	NC_009975	GATATT	2	12	44952	44963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904447
26	NC_009975	AAGATT	2	12	47111	47122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904451
27	NC_009975	ATTTTT	2	12	48326	48337	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009975	AATTTA	2	12	50243	50254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009975	ACTGAA	2	12	55939	55950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009975	ATTAAT	2	12	56032	56043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009975	CTACTG	2	12	58425	58436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904468
32	NC_009975	ATCTGA	2	12	59281	59292	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904468
33	NC_009975	TTTCAT	2	12	61242	61253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	159904471
34	NC_009975	CTGCAA	2	12	64493	64504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159904473
35	NC_009975	TAATCT	2	12	68411	68422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904475
36	NC_009975	TCAATA	2	12	72218	72229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904483
37	NC_009975	GAAAAA	2	12	79006	79017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	159904491
38	NC_009975	TCAAAA	2	12	79859	79870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159904493
39	NC_009975	TAATTT	2	12	80553	80564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009975	ATCTCC	2	12	90039	90050	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	159904506
41	NC_009975	TCACAC	2	12	90280	90291	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	159904506
42	NC_009975	TTTTAA	2	12	91545	91556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009975	ATGAAT	2	12	92728	92739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009975	ATTAAT	2	12	96458	96469	50 %	50 %	0 %	0 %	159904512
45	NC_009975	TTCTTT	2	12	99095	99106	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	159904517
46	NC_009975	ATTTCC	2	12	99166	99177	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904517
47	NC_009975	TTCAGA	2	12	99652	99663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904518
48	NC_009975	AATGTC	2	12	99781	99792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904518
49	NC_009975	GTTGAA	2	12	104331	104342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904526
50	NC_009975	TTGACA	2	12	105772	105783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904526
51	NC_009975	ACAATA	2	12	108595	108606	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	159904530
52	NC_009975	ATGGAT	2	12	109134	109145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904530
53	NC_009975	TTTTAA	2	12	111270	111281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009975	CATTTA	2	12	115594	115605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904534
55	NC_009975	ATGTAA	2	12	116496	116507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
56	NC_009975	ATGTAA	2	12	116847	116858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
57	NC_009975	ATGTAA	2	12	117198	117209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904534
58	NC_009975	AAGTTC	2	12	118807	118818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904534
59	NC_009975	AAGTTC	2	12	118975	118986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904534
60	NC_009975	TTTGAA	2	12	122466	122477	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904538
61	NC_009975	ATCGTC	2	12	122750	122761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904538
62	NC_009975	TTCCAA	2	12	123130	123141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904538
63	NC_009975	AATTAA	2	12	124664	124675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904539
64	NC_009975	AAAATA	2	12	124826	124837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	159904539
65	NC_009975	AAATTA	2	12	128564	128575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159904544
66	NC_009975	AAATTG	2	12	132331	132342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904547
67	NC_009975	ATGAAA	2	12	132571	132582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904547
68	NC_009975	GTTGCA	2	12	133214	133225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159904549
69	NC_009975	TGCAAT	2	12	133702	133713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904550
70	NC_009975	TTTCAA	2	12	134757	134768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904550
71	NC_009975	ATTTTA	2	12	139854	139865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009975	CAATAT	2	12	140438	140449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904553
73	NC_009975	AATATA	2	12	140957	140968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009975	ATTTCC	2	12	141247	141258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904555
75	NC_009975	ATTTGA	2	12	141282	141293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	159904555
76	NC_009975	TCAATT	2	12	142130	142141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904556
77	NC_009975	ATGCAT	2	12	146078	146089	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904561
78	NC_009975	GTATTT	2	12	151975	151986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	159904566
79	NC_009975	ATGCAA	2	12	153558	153569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159904567
80	NC_009975	CAAACC	2	12	154285	154296	50 %	0 %	0 %	50 %	159904567
81	NC_009975	TAGGAT	2	12	158494	158505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159904571
82	NC_009975	AATTGA	2	12	159960	159971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904572
83	NC_009975	ATTGCA	2	12	165795	165806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904578
84	NC_009975	ATTTTT	2	12	166349	166360	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009975	TTTTGA	2	12	167651	167662	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	159904580
86	NC_009975	CATTTC	2	12	167887	167898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159904580
87	NC_009975	GAAAAG	2	12	173350	173361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904583
88	NC_009975	TACGCA	2	12	175350	175361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	159904584
89	NC_009975	ATGAAA	2	12	176384	176395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904586
90	NC_009975	GTGCAA	2	12	177964	177975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159904587
91	NC_009975	AAAGTT	2	12	179767	179778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904588
92	NC_009975	AGCATT	2	12	180741	180752	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904590
93	NC_009975	TTTTGG	2	12	185500	185511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159904594
94	NC_009975	ATGGAA	2	12	186584	186595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	159904596
95	NC_009975	CAAAAG	2	12	187035	187046	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	159904596
96	NC_009975	AACTGT	2	12	188446	188457	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904598
97	NC_009975	AAGGAA	2	12	188904	188915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159904598
98	NC_009975	CAAAAC	2	12	190149	190160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159904599
99	NC_009975	ATATAC	2	12	193923	193934	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	159904603
100	NC_009975	AGAAAT	2	12	195143	195154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	159904604
101	NC_009975	TTGCCA	2	12	196042	196053	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159904605
102	NC_009975	ATAAAA	2	12	197018	197029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	159904605
103	NC_009975	TAAAAA	2	12	198234	198245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009975	TTATAA	2	12	201740	201751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009975	TAAATG	2	12	209750	209761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904619
106	NC_009975	GTTTCT	2	12	213468	213479	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	159904624
107	NC_009975	TTTAAA	2	12	214705	214716	50 %	50 %	0 %	0 %	159904625
108	NC_009975	ATCTAT	2	12	219615	219626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	159904630
109	NC_009975	CAAGTG	2	12	219767	219778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159904630
110	NC_009975	CAAATC	2	12	221328	221339	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	159904631
111	NC_009975	GCAATT	2	12	226664	226675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904637
112	NC_009975	AAATTA	2	12	229055	229066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009975	TCCAAT	2	12	229836	229847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159904642
114	NC_009975	GAATCA	2	12	232294	232305	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	159904644
115	NC_009975	TTGCAA	2	12	233747	233758	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904645
116	NC_009975	GTCTTT	2	12	235616	235627	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	159904647
117	NC_009975	GCAATT	2	12	235749	235760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904647
118	NC_009975	CTGAAT	2	12	236612	236623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	159904648
119	NC_009975	GATTAA	2	12	237429	237440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009975	ATTGAA	2	12	239272	239283	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	159904651
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354	NC_009975	ATCTTC	2	12	661024	661035	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	159905109
355	NC_009975	CTATTG	2	12	669370	669381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	159905117
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357	NC_009975	TGCCAT	2	12	672310	672321	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159905121
358	NC_009975	TACGAG	2	12	673935	673946	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159905122
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