MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 1446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	ACAGT	2	10	2734	2743	40 %	20 %	20 %	20 %	159904398
2	NC_009975	GGATG	2	10	3195	3204	20 %	20 %	60 %	0 %	159904399
3	NC_009975	GAAAA	2	10	5570	5579	80 %	0 %	20 %	0 %	159904400
4	NC_009975	TACTT	2	10	5585	5594	20 %	60 %	0 %	20 %	159904400
5	NC_009975	GGTAA	2	10	6260	6269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009975	GCTTG	2	10	7524	7533	0 %	40 %	40 %	20 %	159904403
7	NC_009975	CAAAT	2	10	7675	7684	60 %	20 %	0 %	20 %	159904404
8	NC_009975	AAACA	2	10	8363	8372	80 %	0 %	0 %	20 %	159904405
9	NC_009975	AATTT	2	10	8722	8731	40 %	60 %	0 %	0 %	159904405
10	NC_009975	GAAAG	2	10	9063	9072	60 %	0 %	40 %	0 %	159904406
11	NC_009975	GTTTT	2	10	9355	9364	0 %	80 %	20 %	0 %	159904406
12	NC_009975	AATCT	2	10	9924	9933	40 %	40 %	0 %	20 %	159904406
13	NC_009975	ATTCC	2	10	14197	14206	20 %	40 %	0 %	40 %	159904411
14	NC_009975	TTTAG	2	10	14919	14928	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009975	TTTAC	2	10	17449	17458	20 %	60 %	0 %	20 %	159904415
16	NC_009975	GGAAT	2	10	17874	17883	40 %	20 %	40 %	0 %	159904415
17	NC_009975	TGTTT	2	10	17983	17992	0 %	80 %	20 %	0 %	159904415
18	NC_009975	TAAAT	2	10	19499	19508	60 %	40 %	0 %	0 %	159904417
19	NC_009975	ATATT	2	10	22045	22054	40 %	60 %	0 %	0 %	159904419
20	NC_009975	CATTA	2	10	22968	22977	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009975	ATTTA	2	10	23831	23840	40 %	60 %	0 %	0 %	159904421
22	NC_009975	AAATT	2	10	24162	24171	60 %	40 %	0 %	0 %	159904421
23	NC_009975	AAATA	2	10	24440	24449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009975	AAATT	2	10	25125	25134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009975	TAATT	2	10	25446	25455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009975	AGAAA	2	10	25520	25529	80 %	0 %	20 %	0 %	159904424
27	NC_009975	AAAAC	2	10	25823	25832	80 %	0 %	0 %	20 %	159904425
28	NC_009975	AGACC	2	10	26028	26037	40 %	0 %	20 %	40 %	159904425
29	NC_009975	GAAAT	2	10	26138	26147	60 %	20 %	20 %	0 %	159904425
30	NC_009975	GAAAA	2	10	26667	26676	80 %	0 %	20 %	0 %	159904426
31	NC_009975	TTTGA	2	10	27600	27609	20 %	60 %	20 %	0 %	159904426
32	NC_009975	CATTA	2	10	28830	28839	40 %	40 %	0 %	20 %	159904428
33	NC_009975	AAATG	2	10	30672	30681	60 %	20 %	20 %	0 %	159904432
34	NC_009975	TAAAC	2	10	31303	31312	60 %	20 %	0 %	20 %	159904433
35	NC_009975	TATAA	2	10	32561	32570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009975	TTTAT	2	10	32857	32866	20 %	80 %	0 %	0 %	159904434
37	NC_009975	TATAA	2	10	33771	33780	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009975	GGTGT	2	10	36200	36209	0 %	40 %	60 %	0 %	159904436
39	NC_009975	CAAAA	2	10	39566	39575	80 %	0 %	0 %	20 %	159904437
40	NC_009975	TAAAA	2	10	39638	39647	80 %	20 %	0 %	0 %	159904437
41	NC_009975	CCTTT	2	10	39942	39951	0 %	60 %	0 %	40 %	159904439
42	NC_009975	ATTAT	2	10	40306	40315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009975	ATAAA	2	10	40575	40584	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009975	ACAAA	2	10	44212	44221	80 %	0 %	0 %	20 %	159904445
45	NC_009975	TATAT	2	10	44260	44269	40 %	60 %	0 %	0 %	159904445
46	NC_009975	ATTTT	2	10	44324	44333	20 %	80 %	0 %	0 %	159904445
47	NC_009975	TTTTA	2	10	44334	44343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009975	ATTTA	2	10	44355	44364	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009975	AAATC	2	10	44762	44771	60 %	20 %	0 %	20 %	159904446
50	NC_009975	ATTTA	2	10	45144	45153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009975	AAAGA	2	10	46161	46170	80 %	0 %	20 %	0 %	159904450
52	NC_009975	ATTGT	2	10	47721	47730	20 %	60 %	20 %	0 %	159904451
53	NC_009975	TAAAA	2	10	48795	48804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009975	AGGGC	2	10	48843	48852	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009975	AAAGG	2	10	49120	49129	60 %	0 %	40 %	0 %	159904452
56	NC_009975	ATGAA	2	10	50536	50545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009975	AAGTT	2	10	52026	52035	40 %	40 %	20 %	0 %	159904457
58	NC_009975	ATTCA	2	10	52716	52725	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009975	ATGCA	2	10	53976	53985	40 %	20 %	20 %	20 %	159904462
60	NC_009975	ACATA	2	10	56482	56491	60 %	20 %	0 %	20 %	159904466
61	NC_009975	TTAAA	2	10	58208	58217	60 %	40 %	0 %	0 %	159904467
62	NC_009975	ATAAA	2	10	58633	58642	80 %	20 %	0 %	0 %	159904468
63	NC_009975	TTGGA	2	10	60688	60697	20 %	40 %	40 %	0 %	159904471
64	NC_009975	TGCAG	2	10	62794	62803	20 %	20 %	40 %	20 %	159904472
65	NC_009975	TCGAG	2	10	64991	65000	20 %	20 %	40 %	20 %	159904473
66	NC_009975	AATCG	2	10	66572	66581	40 %	20 %	20 %	20 %	159904474
67	NC_009975	AAGTT	2	10	68946	68955	40 %	40 %	20 %	0 %	159904476
68	NC_009975	AATCT	2	10	69034	69043	40 %	40 %	0 %	20 %	159904476
69	NC_009975	GTACT	2	10	71017	71026	20 %	40 %	20 %	20 %	159904480
70	NC_009975	TTTTC	2	10	73107	73116	0 %	80 %	0 %	20 %	159904484
71	NC_009975	TTTCT	2	10	73705	73714	0 %	80 %	0 %	20 %	159904485
72	NC_009975	ATTTA	2	10	76443	76452	40 %	60 %	0 %	0 %	159904490
73	NC_009975	AGACC	2	10	76666	76675	40 %	0 %	20 %	40 %	159904490
74	NC_009975	ATTGT	2	10	77619	77628	20 %	60 %	20 %	0 %	159904491
75	NC_009975	AAAGG	2	10	79224	79233	60 %	0 %	40 %	0 %	159904492
76	NC_009975	TTTTG	2	10	79670	79679	0 %	80 %	20 %	0 %	159904493
77	NC_009975	CTGGA	2	10	80423	80432	20 %	20 %	40 %	20 %	159904493
78	NC_009975	ATTAT	2	10	81050	81059	40 %	60 %	0 %	0 %	159904495
79	NC_009975	TAAAA	2	10	81846	81855	80 %	20 %	0 %	0 %	159904496
80	NC_009975	TCTTT	2	10	83394	83403	0 %	80 %	0 %	20 %	159904498
81	NC_009975	TTCTT	2	10	83648	83657	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009975	ATTTT	2	10	83897	83906	20 %	80 %	0 %	0 %	159904499
83	NC_009975	TTCCA	2	10	83950	83959	20 %	40 %	0 %	40 %	159904499
84	NC_009975	ACAGA	2	10	84522	84531	60 %	0 %	20 %	20 %	159904500
85	NC_009975	ATAAG	2	10	85349	85358	60 %	20 %	20 %	0 %	159904502
86	NC_009975	GATCA	2	10	86431	86440	40 %	20 %	20 %	20 %	159904502
87	NC_009975	AAAGA	2	10	87031	87040	80 %	0 %	20 %	0 %	159904502
88	NC_009975	TAAAA	2	10	89588	89597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009975	ATTTA	2	10	90811	90820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009975	TTTTA	2	10	90962	90971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009975	TTTAA	2	10	91282	91291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009975	AAATC	2	10	92093	92102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_009975	TTAAA	2	10	92493	92502	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009975	TGCAA	2	10	93551	93560	40 %	20 %	20 %	20 %	159904509
95	NC_009975	AATTT	2	10	93927	93936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009975	GTATC	2	10	93939	93948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_009975	ATTAT	2	10	94067	94076	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009975	AATTT	2	10	94114	94123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009975	ATTAT	2	10	94180	94189	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009975	ATTTA	2	10	94573	94582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009975	ATTAA	2	10	96030	96039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009975	TAAAT	2	10	97086	97095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009975	ACTTA	2	10	97896	97905	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009975	AGTTT	2	10	98206	98215	20 %	60 %	20 %	0 %	159904515
105	NC_009975	AAAAT	2	10	98282	98291	80 %	20 %	0 %	0 %	159904515
106	NC_009975	TTCTT	2	10	98515	98524	0 %	80 %	0 %	20 %	159904516
107	NC_009975	ATTTT	2	10	98525	98534	20 %	80 %	0 %	0 %	159904516
108	NC_009975	TTTTA	2	10	99290	99299	20 %	80 %	0 %	0 %	159904517
109	NC_009975	TCAAA	2	10	100789	100798	60 %	20 %	0 %	20 %	159904520
110	NC_009975	TTAAG	2	10	102371	102380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009975	GGTGA	2	10	102419	102428	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009975	TTAAT	2	10	106213	106222	40 %	60 %	0 %	0 %	159904527
113	NC_009975	TTTAT	2	10	107176	107185	20 %	80 %	0 %	0 %	159904528
114	NC_009975	TATAA	2	10	107850	107859	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009975	TAAAT	2	10	110376	110385	60 %	40 %	0 %	0 %	159904531
116	NC_009975	AATTT	2	10	121309	121318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009975	TTATT	2	10	123724	123733	20 %	80 %	0 %	0 %	159904538
118	NC_009975	GTTAT	2	10	124457	124466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009975	ATTAA	2	10	125990	125999	60 %	40 %	0 %	0 %	159904539
120	NC_009975	TGAAA	2	10	126901	126910	60 %	20 %	20 %	0 %	159904540
121	NC_009975	AATCA	2	10	127780	127789	60 %	20 %	0 %	20 %	159904541
122	NC_009975	AAATT	2	10	128058	128067	60 %	40 %	0 %	0 %	159904542
123	NC_009975	ATTTT	2	10	128403	128412	20 %	80 %	0 %	0 %	159904543
124	NC_009975	TTCTT	2	10	129155	129164	0 %	80 %	0 %	20 %	159904544
125	NC_009975	ACCGC	2	10	129351	129360	20 %	0 %	20 %	60 %	159904544
126	NC_009975	CTAAA	2	10	129913	129922	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_009975	TTAAT	2	10	131974	131983	40 %	60 %	0 %	0 %	159904547
128	NC_009975	TTGAT	2	10	132067	132076	20 %	60 %	20 %	0 %	159904547
129	NC_009975	AATTA	2	10	135994	136003	60 %	40 %	0 %	0 %	159904550
130	NC_009975	ACTTC	2	10	136069	136078	20 %	40 %	0 %	40 %	159904550
131	NC_009975	GCACC	2	10	136807	136816	20 %	0 %	20 %	60 %	159904551
132	NC_009975	TAAAA	2	10	137552	137561	80 %	20 %	0 %	0 %	159904551
133	NC_009975	ATTTT	2	10	140496	140505	20 %	80 %	0 %	0 %	159904553
134	NC_009975	GTTTT	2	10	141023	141032	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009975	CAAAA	2	10	141129	141138	80 %	0 %	0 %	20 %	159904555
136	NC_009975	ATTTA	2	10	142589	142598	40 %	60 %	0 %	0 %	159904557
137	NC_009975	TAAAA	2	10	144138	144147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009975	TTGAT	2	10	144305	144314	20 %	60 %	20 %	0 %	159904558
139	NC_009975	GGAAA	2	10	144529	144538	60 %	0 %	40 %	0 %	159904558
140	NC_009975	ACATT	2	10	144997	145006	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009975	TAAAT	2	10	145315	145324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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