MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C6 chromosome

Total Repeats: 4338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009975	AGGG	2	8	107	114	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009975	TCCC	2	8	397	404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_009975	TTTA	2	8	683	690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009975	AATG	2	8	995	1002	50 %	25 %	25 %	0 %	159904397
5	NC_009975	TTAT	2	8	1367	1374	25 %	75 %	0 %	0 %	159904398
6	NC_009975	TCCC	2	8	4107	4114	0 %	25 %	0 %	75 %	159904399
7	NC_009975	TATT	2	8	5548	5555	25 %	75 %	0 %	0 %	159904400
8	NC_009975	TTAT	2	8	5628	5635	25 %	75 %	0 %	0 %	159904400
9	NC_009975	ATGG	2	8	5804	5811	25 %	25 %	50 %	0 %	159904401
10	NC_009975	TCTT	2	8	5941	5948	0 %	75 %	0 %	25 %	159904401
11	NC_009975	TTAA	2	8	6108	6115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009975	ACTG	2	8	8161	8168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009975	AAAT	2	8	8484	8491	75 %	25 %	0 %	0 %	159904405
14	NC_009975	GTAT	2	8	8666	8673	25 %	50 %	25 %	0 %	159904405
15	NC_009975	TAAT	2	8	11314	11321	50 %	50 %	0 %	0 %	159904408
16	NC_009975	ATTT	2	8	11657	11664	25 %	75 %	0 %	0 %	159904409
17	NC_009975	GATA	2	8	12159	12166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009975	AAAT	2	8	12921	12928	75 %	25 %	0 %	0 %	159904410
19	NC_009975	TCAT	2	8	13399	13406	25 %	50 %	0 %	25 %	159904411
20	NC_009975	CTTT	2	8	13974	13981	0 %	75 %	0 %	25 %	159904411
21	NC_009975	CATG	2	8	14406	14413	25 %	25 %	25 %	25 %	159904411
22	NC_009975	TTCT	3	12	14559	14570	0 %	75 %	0 %	25 %	159904411
23	NC_009975	TTTA	2	8	15051	15058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009975	ATTT	2	8	15271	15278	25 %	75 %	0 %	0 %	159904412
25	NC_009975	GGCT	2	8	16085	16092	0 %	25 %	50 %	25 %	159904412
26	NC_009975	TAAA	2	8	16152	16159	75 %	25 %	0 %	0 %	159904412
27	NC_009975	GAAT	2	8	17037	17044	50 %	25 %	25 %	0 %	159904414
28	NC_009975	CATG	2	8	17392	17399	25 %	25 %	25 %	25 %	159904415
29	NC_009975	GAAA	2	8	18152	18159	75 %	0 %	25 %	0 %	159904415
30	NC_009975	ATTT	2	8	18250	18257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009975	CTTT	2	8	18309	18316	0 %	75 %	0 %	25 %	159904416
32	NC_009975	AAAT	2	8	18740	18747	75 %	25 %	0 %	0 %	159904417
33	NC_009975	ACAT	2	8	18960	18967	50 %	25 %	0 %	25 %	159904417
34	NC_009975	TTCA	2	8	19100	19107	25 %	50 %	0 %	25 %	159904417
35	NC_009975	TAAA	2	8	19940	19947	75 %	25 %	0 %	0 %	159904417
36	NC_009975	TAAA	2	8	20345	20352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009975	AATT	2	8	20813	20820	50 %	50 %	0 %	0 %	159904418
38	NC_009975	TATG	2	8	21039	21046	25 %	50 %	25 %	0 %	159904418
39	NC_009975	ATTT	2	8	21405	21412	25 %	75 %	0 %	0 %	159904419
40	NC_009975	ATTT	2	8	21599	21606	25 %	75 %	0 %	0 %	159904419
41	NC_009975	TACC	2	8	22660	22667	25 %	25 %	0 %	50 %	159904419
42	NC_009975	TTTA	2	8	22692	22699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009975	TTTA	2	8	22728	22735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009975	GTAC	2	8	22915	22922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009975	ATAA	2	8	22929	22936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009975	AATT	2	8	23716	23723	50 %	50 %	0 %	0 %	159904421
47	NC_009975	TAAA	2	8	23923	23930	75 %	25 %	0 %	0 %	159904421
48	NC_009975	AAAT	2	8	24359	24366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009975	AAAT	2	8	24523	24530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009975	AAAT	2	8	24622	24629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009975	AACT	2	8	24854	24861	50 %	25 %	0 %	25 %	159904422
52	NC_009975	TGAT	2	8	26284	26291	25 %	50 %	25 %	0 %	159904426
53	NC_009975	CAGA	2	8	27076	27083	50 %	0 %	25 %	25 %	159904426
54	NC_009975	GATT	2	8	27749	27756	25 %	50 %	25 %	0 %	159904426
55	NC_009975	GAAA	2	8	28163	28170	75 %	0 %	25 %	0 %	159904426
56	NC_009975	AAGA	2	8	28884	28891	75 %	0 %	25 %	0 %	159904428
57	NC_009975	AAGG	2	8	29446	29453	50 %	0 %	50 %	0 %	159904429
58	NC_009975	AAGA	2	8	29662	29669	75 %	0 %	25 %	0 %	159904430
59	NC_009975	GAAC	2	8	29985	29992	50 %	0 %	25 %	25 %	159904432
60	NC_009975	GAAA	2	8	30337	30344	75 %	0 %	25 %	0 %	159904432
61	NC_009975	AATT	2	8	30381	30388	50 %	50 %	0 %	0 %	159904432
62	NC_009975	GAAA	2	8	30913	30920	75 %	0 %	25 %	0 %	159904432
63	NC_009975	TAAA	2	8	31003	31010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009975	ATTT	2	8	31474	31481	25 %	75 %	0 %	0 %	159904433
65	NC_009975	TGAA	2	8	31545	31552	50 %	25 %	25 %	0 %	159904433
66	NC_009975	AAGT	2	8	31563	31570	50 %	25 %	25 %	0 %	159904433
67	NC_009975	ATAA	2	8	31628	31635	75 %	25 %	0 %	0 %	159904433
68	NC_009975	AGGA	2	8	31930	31937	50 %	0 %	50 %	0 %	159904433
69	NC_009975	AAGT	2	8	32046	32053	50 %	25 %	25 %	0 %	159904433
70	NC_009975	TTTA	2	8	32236	32243	25 %	75 %	0 %	0 %	159904433
71	NC_009975	TAAA	2	8	32910	32917	75 %	25 %	0 %	0 %	159904434
72	NC_009975	GACA	2	8	33278	33285	50 %	0 %	25 %	25 %	159904434
73	NC_009975	AATT	2	8	34125	34132	50 %	50 %	0 %	0 %	159904435
74	NC_009975	TGTT	2	8	34431	34438	0 %	75 %	25 %	0 %	159904435
75	NC_009975	CTTC	2	8	34880	34887	0 %	50 %	0 %	50 %	159904435
76	NC_009975	TACT	2	8	35671	35678	25 %	50 %	0 %	25 %	159904436
77	NC_009975	TCTG	2	8	37884	37891	0 %	50 %	25 %	25 %	159904436
78	NC_009975	ATCC	2	8	38839	38846	25 %	25 %	0 %	50 %	159904437
79	NC_009975	TTAT	2	8	39122	39129	25 %	75 %	0 %	0 %	159904437
80	NC_009975	AATG	2	8	39157	39164	50 %	25 %	25 %	0 %	159904437
81	NC_009975	TTAT	2	8	39386	39393	25 %	75 %	0 %	0 %	159904437
82	NC_009975	TAAT	2	8	40404	40411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009975	AATT	2	8	40508	40515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009975	TAAT	2	8	40527	40534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009975	ATTA	2	8	40777	40784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009975	ATTA	2	8	40844	40851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009975	AGAA	2	8	42458	42465	75 %	0 %	25 %	0 %	159904444
88	NC_009975	TAAT	2	8	42689	42696	50 %	50 %	0 %	0 %	159904444
89	NC_009975	AATA	2	8	42861	42868	75 %	25 %	0 %	0 %	159904444
90	NC_009975	AAAT	2	8	42966	42973	75 %	25 %	0 %	0 %	159904444
91	NC_009975	TTTA	2	8	43380	43387	25 %	75 %	0 %	0 %	159904444
92	NC_009975	GGAA	2	8	43847	43854	50 %	0 %	50 %	0 %	159904445
93	NC_009975	CATA	2	8	44653	44660	50 %	25 %	0 %	25 %	159904446
94	NC_009975	TTAA	2	8	45194	45201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009975	TTTA	2	8	45722	45729	25 %	75 %	0 %	0 %	159904449
96	NC_009975	ATTA	2	8	45940	45947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009975	AATG	2	8	46436	46443	50 %	25 %	25 %	0 %	159904450
98	NC_009975	AAAG	2	8	46732	46739	75 %	0 %	25 %	0 %	159904450
99	NC_009975	AATT	2	8	46774	46781	50 %	50 %	0 %	0 %	159904450
100	NC_009975	TAAA	2	8	46822	46829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009975	CTTC	2	8	47149	47156	0 %	50 %	0 %	50 %	159904451
102	NC_009975	TGGA	2	8	47474	47481	25 %	25 %	50 %	0 %	159904451
103	NC_009975	ATTC	2	8	47515	47522	25 %	50 %	0 %	25 %	159904451
104	NC_009975	CAAC	2	8	47533	47540	50 %	0 %	0 %	50 %	159904451
105	NC_009975	GATA	2	8	48252	48259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009975	GATA	2	8	48305	48312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009975	TTAA	2	8	48469	48476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009975	TCCC	2	8	48549	48556	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_009975	CAAT	2	8	48874	48881	50 %	25 %	0 %	25 %	159904452
110	NC_009975	AGAA	2	8	50058	50065	75 %	0 %	25 %	0 %	159904453
111	NC_009975	AAAT	2	8	50384	50391	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009975	ATTT	2	8	50968	50975	25 %	75 %	0 %	0 %	159904454
113	NC_009975	GATT	2	8	53377	53384	25 %	50 %	25 %	0 %	159904460
114	NC_009975	ATTT	2	8	53759	53766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009975	TAAT	2	8	53813	53820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009975	ACCC	2	8	54193	54200	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_009975	ATTT	2	8	54734	54741	25 %	75 %	0 %	0 %	159904464
118	NC_009975	AATT	2	8	56264	56271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009975	TTTG	2	8	56798	56805	0 %	75 %	25 %	0 %	159904467
120	NC_009975	GAAA	2	8	56953	56960	75 %	0 %	25 %	0 %	159904467
121	NC_009975	AAAT	2	8	56993	57000	75 %	25 %	0 %	0 %	159904467
122	NC_009975	TTTA	2	8	57191	57198	25 %	75 %	0 %	0 %	159904467
123	NC_009975	TAAC	2	8	57872	57879	50 %	25 %	0 %	25 %	159904467
124	NC_009975	TATT	2	8	58797	58804	25 %	75 %	0 %	0 %	159904468
125	NC_009975	AACT	2	8	58827	58834	50 %	25 %	0 %	25 %	159904468
126	NC_009975	CAAG	2	8	58898	58905	50 %	0 %	25 %	25 %	159904468
127	NC_009975	ATCT	2	8	59029	59036	25 %	50 %	0 %	25 %	159904468
128	NC_009975	GTAC	2	8	59133	59140	25 %	25 %	25 %	25 %	159904468
129	NC_009975	GATT	2	8	59998	60005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009975	GGAA	2	8	60758	60765	50 %	0 %	50 %	0 %	159904471
131	NC_009975	CTCA	2	8	61255	61262	25 %	25 %	0 %	50 %	159904471
132	NC_009975	CTGC	2	8	62729	62736	0 %	25 %	25 %	50 %	159904472
133	NC_009975	TCGC	2	8	63192	63199	0 %	25 %	25 %	50 %	159904473
134	NC_009975	CTGG	2	8	63821	63828	0 %	25 %	50 %	25 %	159904473
135	NC_009975	TCCA	2	8	64131	64138	25 %	25 %	0 %	50 %	159904473
136	NC_009975	CCTG	2	8	64399	64406	0 %	25 %	25 %	50 %	159904473
137	NC_009975	TTTC	2	8	65006	65013	0 %	75 %	0 %	25 %	159904473
138	NC_009975	CCTG	2	8	65305	65312	0 %	25 %	25 %	50 %	159904473
139	NC_009975	CCAG	2	8	66333	66340	25 %	0 %	25 %	50 %	159904474
140	NC_009975	ATCC	2	8	66355	66362	25 %	25 %	0 %	50 %	159904474
141	NC_009975	GCTT	2	8	66410	66417	0 %	50 %	25 %	25 %	159904474
142	NC_009975	ATGC	2	8	66649	66656	25 %	25 %	25 %	25 %	159904474
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