MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Methanoregula boonei 6A8 chromosome

Total Repeats: 30442

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009712	TTA	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009712	AGA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009712	GGA	2	6	174	179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009712	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149550
5	NC_009712	CAG	2	6	606	611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149550
6	NC_009712	ACC	2	6	622	627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149550
7	NC_009712	TGA	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149550
8	NC_009712	TGA	2	6	711	716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149550
9	NC_009712	GGA	2	6	808	813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149550
10	NC_009712	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149550
11	NC_009712	TAT	2	6	927	932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149550
12	NC_009712	CTC	2	6	984	989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149550
13	NC_009712	GAA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149550
14	NC_009712	TGC	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149550
15	NC_009712	GCC	2	6	1123	1128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149550
16	NC_009712	AGC	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149550
17	NC_009712	TCA	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149550
18	NC_009712	CTC	2	6	1666	1671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149551
19	NC_009712	GAG	2	6	1681	1686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149551
20	NC_009712	ATC	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149551
21	NC_009712	ATT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149551
22	NC_009712	GAA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149551
23	NC_009712	AGG	2	6	1988	1993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149551
24	NC_009712	TCA	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149552
25	NC_009712	CGG	2	6	2544	2549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149552
26	NC_009712	CAA	2	6	2658	2663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149552
27	NC_009712	AGG	2	6	2687	2692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149552
28	NC_009712	CGA	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149552
29	NC_009712	TGC	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149552
30	NC_009712	CCA	2	6	2922	2927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149552
31	NC_009712	AGA	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149552
32	NC_009712	CGG	2	6	3207	3212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149552
33	NC_009712	ACC	2	6	3218	3223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149552
34	NC_009712	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149552
35	NC_009712	GCC	2	6	3305	3310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009712	ACA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009712	TCT	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009712	TTG	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149553
39	NC_009712	ATC	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149553
40	NC_009712	GGT	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149553
41	NC_009712	TAT	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149553
42	NC_009712	AGA	2	6	3777	3782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149553
43	NC_009712	CGC	2	6	3840	3845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149553
44	NC_009712	GAT	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149553
45	NC_009712	CGC	2	6	4021	4026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149553
46	NC_009712	GAT	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149553
47	NC_009712	CCG	2	6	4344	4349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149553
48	NC_009712	ATC	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149553
49	NC_009712	CTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149554
50	NC_009712	CCT	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149554
51	NC_009712	TGC	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149555
52	NC_009712	AAC	2	6	4685	4690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149555
53	NC_009712	GGT	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149555
54	NC_009712	ATT	2	6	4938	4943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149555
55	NC_009712	CAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149555
56	NC_009712	AGC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149555
57	NC_009712	GCC	2	6	5053	5058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149555
58	NC_009712	TGG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149555
59	NC_009712	ACC	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149556
60	NC_009712	CCT	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149556
61	NC_009712	GGA	2	6	5485	5490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149556
62	NC_009712	GTC	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149556
63	NC_009712	GAA	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149556
64	NC_009712	CAT	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149556
65	NC_009712	GCA	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149556
66	NC_009712	GGC	2	6	5719	5724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149556
67	NC_009712	TGG	2	6	5926	5931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149556
68	NC_009712	ATC	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149556
69	NC_009712	GTG	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149556
70	NC_009712	CTG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149556
71	NC_009712	GAA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149557
72	NC_009712	GCT	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149557
73	NC_009712	GTC	2	6	6218	6223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149557
74	NC_009712	GAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149557
75	NC_009712	GTC	2	6	6614	6619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149557
76	NC_009712	CGG	2	6	6720	6725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149557
77	NC_009712	TTG	3	9	6729	6737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149557
78	NC_009712	TGA	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149557
79	NC_009712	CTG	2	6	7093	7098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149558
80	NC_009712	ACC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149558
81	NC_009712	TGG	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149558
82	NC_009712	GTA	2	6	7461	7466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149558
83	NC_009712	CAA	2	6	7743	7748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149559
84	NC_009712	CAT	2	6	7800	7805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149559
85	NC_009712	ATC	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149559
86	NC_009712	GCT	2	6	8082	8087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149559
87	NC_009712	ACC	2	6	8156	8161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149559
88	NC_009712	CCT	2	6	8195	8200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149559
89	NC_009712	GGC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149559
90	NC_009712	GGA	2	6	8407	8412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009712	TGT	2	6	8512	8517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149560
92	NC_009712	TGC	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149560
93	NC_009712	GGA	2	6	8810	8815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149560
94	NC_009712	TGG	2	6	8871	8876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149560
95	NC_009712	AAG	2	6	8894	8899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149560
96	NC_009712	TGG	2	6	9015	9020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149560
97	NC_009712	ATC	2	6	9068	9073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149560
98	NC_009712	GGC	2	6	9085	9090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149560
99	NC_009712	ATC	2	6	9332	9337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149561
100	NC_009712	CCG	2	6	9569	9574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149561
101	NC_009712	GTC	2	6	9605	9610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149561
102	NC_009712	ACA	2	6	9633	9638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149561
103	NC_009712	CTC	2	6	9644	9649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154149561
104	NC_009712	CTT	2	6	9728	9733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149561
105	NC_009712	ACC	2	6	9747	9752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149561
106	NC_009712	TGT	2	6	9803	9808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149561
107	NC_009712	GAA	2	6	9873	9878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009712	GGC	2	6	10110	10115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149562
109	NC_009712	GCT	2	6	10168	10173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149562
110	NC_009712	GCC	2	6	10293	10298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149562
111	NC_009712	TCA	2	6	10409	10414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009712	GAA	2	6	10529	10534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149563
113	NC_009712	GTT	2	6	10554	10559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149563
114	NC_009712	CCG	2	6	10632	10637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149563
115	NC_009712	GGT	2	6	10871	10876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149563
116	NC_009712	CAG	2	6	10931	10936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149563
117	NC_009712	CGG	2	6	11319	11324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149564
118	NC_009712	AGA	2	6	11344	11349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149564
119	NC_009712	CGC	2	6	11449	11454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149564
120	NC_009712	CAG	2	6	11560	11565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149564
121	NC_009712	CGC	2	6	11599	11604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149564
122	NC_009712	CAT	2	6	11698	11703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149564
123	NC_009712	CTG	2	6	11752	11757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149564
124	NC_009712	TCT	2	6	11766	11771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149564
125	NC_009712	GCA	2	6	11777	11782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149564
126	NC_009712	AAG	2	6	11802	11807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149564
127	NC_009712	CTT	2	6	11848	11853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149564
128	NC_009712	TGG	2	6	11904	11909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149564
129	NC_009712	GGA	2	6	11926	11931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009712	GAG	2	6	12044	12049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149565
131	NC_009712	GAA	2	6	12077	12082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149565
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133	NC_009712	GAG	2	6	12275	12280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149565
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251	NC_009712	AGA	2	6	20419	20424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009712	TAA	2	6	20523	20528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_009712	TCT	2	6	20570	20575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149573
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256	NC_009712	ATC	2	6	20793	20798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149573
257	NC_009712	TCG	2	6	20848	20853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149573
258	NC_009712	GTG	3	9	20898	20906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149573
259	NC_009712	ATC	2	6	20937	20942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149573
260	NC_009712	ATC	2	6	20952	20957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149573
261	NC_009712	ATC	3	9	21057	21065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149573
262	NC_009712	TCT	2	6	21097	21102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149573
263	NC_009712	TCT	4	12	21121	21132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149573
264	NC_009712	GAG	2	6	21183	21188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149573
265	NC_009712	CGG	2	6	21337	21342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149573
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269	NC_009712	CGC	2	6	21812	21817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149573
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271	NC_009712	GCG	2	6	21882	21887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149573
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273	NC_009712	TGG	2	6	22030	22035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149573
274	NC_009712	GGT	2	6	22079	22084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149573
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277	NC_009712	ATG	2	6	22194	22199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149573
278	NC_009712	GAG	2	6	22276	22281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149573
279	NC_009712	GAC	2	6	22286	22291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154149573
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281	NC_009712	GCT	2	6	22484	22489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149574
282	NC_009712	CGG	2	6	22516	22521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149574
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285	NC_009712	TCT	2	6	22701	22706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154149574
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287	NC_009712	GTG	2	6	22880	22885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154149574
288	NC_009712	CCA	2	6	23029	23034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149574
289	NC_009712	ACC	2	6	23054	23059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149574
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293	NC_009712	ACA	2	6	23211	23216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154149574
294	NC_009712	CAT	2	6	23324	23329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149575
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314	NC_009712	CCA	2	6	24609	24614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154149577
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343	NC_009712	ATT	2	6	26416	26421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_009712	ATC	2	6	28135	28140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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371	NC_009712	GTA	2	6	28407	28412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
372	NC_009712	GCG	2	6	28490	28495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154149583
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381	NC_009712	ACT	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149583
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445	NC_009712	TGG	2	6	34125	34130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_009712	GCT	2	6	38438	38443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149593
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497	NC_009712	AGA	2	6	39689	39694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154149593
498	NC_009712	GAG	2	6	39969	39974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154149594
499	NC_009712	TGC	2	6	40145	40150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154149594
500	NC_009712	CGC	2	6	40151	40156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154149594

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