MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus maripaludis C7 chromosome

Total Repeats: 878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009637	TAATTT	2	12	67	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009637	ATTTAA	2	12	1051	1062	50 %	50 %	0 %	0 %	150401931
3	NC_009637	AAAGTT	2	12	1758	1769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150401931
4	NC_009637	AAAATG	2	12	2562	2573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401932
5	NC_009637	TAAATT	2	12	2722	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	150401932
6	NC_009637	ATCTAA	2	12	3253	3264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150401932
7	NC_009637	AATGCA	2	12	4540	4551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401933
8	NC_009637	TTTGCT	2	12	6971	6982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150401934
9	NC_009637	AAATAA	2	12	10182	10193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150401935
10	NC_009637	TAAAGA	2	12	12019	12030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401936
11	NC_009637	AAAAAG	2	12	16219	16230	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150401938
12	NC_009637	AAAAAG	2	12	17526	17537	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150401940
13	NC_009637	ATTGGG	2	12	22217	22228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009637	TAAAAA	2	12	22821	22832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150401944
15	NC_009637	AATTTC	2	12	23503	23514	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401945
16	NC_009637	TTTTAA	2	12	24340	24351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401946
17	NC_009637	CTTTTT	2	12	28564	28575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009637	TATTAA	2	12	30813	30824	50 %	50 %	0 %	0 %	150401948
19	NC_009637	CTTTTT	2	12	31047	31058	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401948
20	NC_009637	GAAAGT	2	12	32745	32756	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150401950
21	NC_009637	CATTTT	2	12	35551	35562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150401955
22	NC_009637	TTTCAA	2	12	36615	36626	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401956
23	NC_009637	TTTTTC	2	12	37183	37194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401957
24	NC_009637	TAATTA	2	12	37243	37254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009637	TCGTCA	2	12	37354	37365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150401958
26	NC_009637	TAAAAA	2	12	45178	45189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009637	AAGTCC	2	12	46052	46063	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150401968
28	NC_009637	AAAATC	2	12	48586	48597	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150401971
29	NC_009637	TAATTT	2	12	50727	50738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009637	TCTTGA	2	12	51037	51048	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150401973
31	NC_009637	TCATTA	2	12	51655	51666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150401973
32	NC_009637	TAATTT	2	12	54224	54235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150401974
33	NC_009637	TTGCAA	2	12	55101	55112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_009637	TTTTCT	2	12	55493	55504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150401975
35	NC_009637	AAGATC	2	12	55651	55662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401975
36	NC_009637	TGAAAC	2	12	63110	63121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150401984
37	NC_009637	GATGTA	2	12	68244	68255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150401988
38	NC_009637	TTTGAT	2	12	72329	72340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150401989
39	NC_009637	TTGAAT	2	12	73737	73748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150401989
40	NC_009637	GAAAAT	2	12	75657	75668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150401990
41	NC_009637	GTAAAT	2	12	79647	79658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150401992
42	NC_009637	GTATAT	2	12	80925	80936	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009637	TAATGC	2	12	85591	85602	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_009637	TGTATT	2	12	90206	90217	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009637	TCACGC	2	12	90983	90994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009637	AATTTA	2	12	92420	92431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009637	ACCGAT	2	12	100773	100784	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402007
48	NC_009637	TATAAA	2	12	103144	103155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009637	ATAAAA	2	12	103947	103958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402010
50	NC_009637	TTTTTA	2	12	105576	105587	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009637	AATACC	2	12	107550	107561	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150402015
52	NC_009637	TTAATT	2	12	107781	107792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402015
53	NC_009637	AATTTT	2	12	110599	110610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402020
54	NC_009637	CAATTG	2	12	112219	112230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402022
55	NC_009637	TTCAAA	2	12	113665	113676	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150402023
56	NC_009637	TTATAT	2	12	114090	114101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009637	TTTCAA	2	12	114382	114393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402024
58	NC_009637	TGAAGC	2	12	117478	117489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402028
59	NC_009637	AAAAAT	2	12	118370	118381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402029
60	NC_009637	TAAAAT	2	12	125285	125296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009637	TCACCA	2	12	128839	128850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150402038
62	NC_009637	TTCCAA	2	12	130337	130348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402039
63	NC_009637	GTTTCC	2	12	133577	133588	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150402041
64	NC_009637	TTCGAT	2	12	137879	137890	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_009637	ATTGTT	2	12	138021	138032	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150402047
66	NC_009637	CTTGGA	2	12	138075	138086	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150402047
67	NC_009637	ATTGAA	2	12	139805	139816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150402048
68	NC_009637	TCCAGG	2	12	141309	141320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150402049
69	NC_009637	ATTAAT	2	12	143113	143124	50 %	50 %	0 %	0 %	150402050
70	NC_009637	TCCAAT	2	12	143771	143782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402051
71	NC_009637	CCAAAA	2	12	145754	145765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009637	GTCAAC	2	12	146554	146565	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402054
73	NC_009637	TATTCA	2	12	147747	147758	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402055
74	NC_009637	TTTTTA	2	12	150181	150192	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009637	AAAACT	2	12	150915	150926	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402058
76	NC_009637	AAACTA	2	12	154225	154236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402062
77	NC_009637	TTAAAA	2	12	158110	158121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009637	CTTTTT	2	12	158725	158736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_009637	GACCTT	2	12	159654	159665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402068
80	NC_009637	GGAATC	2	12	160044	160055	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402068
81	NC_009637	AGACAC	2	12	160830	160841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150402068
82	NC_009637	TTGAAT	2	12	161996	162007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150402069
83	NC_009637	GTTGCA	2	12	163116	163127	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150402071
84	NC_009637	ATCAAA	2	12	163334	163345	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402071
85	NC_009637	GCAATA	2	12	163578	163589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402071
86	NC_009637	TCAAAA	2	12	163608	163619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402071
87	NC_009637	TATATT	2	12	168960	168971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402078
88	NC_009637	CATTTA	2	12	170342	170353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402079
89	NC_009637	TTTTCT	2	12	170356	170367	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	150402079
90	NC_009637	CACCGA	2	12	174122	174133	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	150402086
91	NC_009637	GCGTAA	2	12	178370	178381	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402092
92	NC_009637	ATCTGT	2	12	178438	178449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402092
93	NC_009637	ATTCCA	2	12	179033	179044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402093
94	NC_009637	CTGCAA	2	12	179373	179384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402093
95	NC_009637	TTTACA	2	12	180428	180439	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150402094
96	NC_009637	AAATTT	2	12	180614	180625	50 %	50 %	0 %	0 %	150402094
97	NC_009637	CTGAAG	2	12	185248	185259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402101
98	NC_009637	AAGAGA	2	12	187268	187279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150402101
99	NC_009637	AAAGAT	2	12	195295	195306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402111
100	NC_009637	ACAAAA	2	12	196407	196418	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150402112
101	NC_009637	CATGAA	2	12	196652	196663	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402112
102	NC_009637	ATGCAA	2	12	198862	198873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402115
103	NC_009637	CAAGCG	2	12	200760	200771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150402118
104	NC_009637	CCAAAA	2	12	200879	200890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150402118
105	NC_009637	ATGCAA	2	12	201567	201578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402118
106	NC_009637	TGAAAA	2	12	203492	203503	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402119
107	NC_009637	TAAAAA	2	12	207251	207262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150402123
108	NC_009637	AAGGAA	2	12	208615	208626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150402124
109	NC_009637	TTCTAC	2	12	210627	210638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	150402126
110	NC_009637	TCCATG	2	12	210697	210708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402126
111	NC_009637	ATTTTT	2	12	213037	213048	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009637	AAAAGA	2	12	215810	215821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150402130
113	NC_009637	CCAAAA	2	12	216438	216449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150402130
114	NC_009637	ATTTGC	2	12	220819	220830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402135
115	NC_009637	CAAAAA	2	12	223531	223542	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150402139
116	NC_009637	CCAGTT	2	12	224898	224909	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150402140
117	NC_009637	AAATGA	2	12	230918	230929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402146
118	NC_009637	ATAATT	2	12	231119	231130	50 %	50 %	0 %	0 %	150402147
119	NC_009637	TCTTGT	2	12	233552	233563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	150402150
120	NC_009637	CAATTC	2	12	235677	235688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150402152
121	NC_009637	AAACTA	2	12	236442	236453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402152
122	NC_009637	TTTATC	2	12	238722	238733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402154
123	NC_009637	TTATAA	2	12	243553	243564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009637	AATAAA	2	12	243790	243801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009637	ATTGAA	2	12	246256	246267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150402160
126	NC_009637	AACTAA	2	12	248685	248696	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402164
127	NC_009637	TCTGCA	2	12	249420	249431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009637	TAAAAC	2	12	251531	251542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150402168
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132	NC_009637	TTTTCA	2	12	264154	264165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402181
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142	NC_009637	ATTTTA	2	12	290513	290524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150402202
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144	NC_009637	ATTTAT	2	12	293110	293121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009637	AGTTTT	2	12	295833	295844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150402207
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148	NC_009637	GTTTTT	2	12	300154	300165	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150402212
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150	NC_009637	ATCTAA	2	12	300751	300762	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_009637	TTTCAT	2	12	309236	309247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150402220
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220	NC_009637	TTTAAA	2	12	445031	445042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
221	NC_009637	ACTGTA	2	12	445551	445562	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402366
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224	NC_009637	TGCAAC	2	12	452375	452386	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402368
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238	NC_009637	TGTTTT	2	12	474093	474104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150402390
239	NC_009637	CCTGTT	2	12	474809	474820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150402391
240	NC_009637	TTAAAT	2	12	477634	477645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_009637	GCAACA	2	12	480093	480104	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150402395
242	NC_009637	AGACAG	2	12	480216	480227	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150402395
243	NC_009637	AACCCT	2	12	484145	484156	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	150402398
244	NC_009637	ATTTAA	2	12	486588	486599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_009637	AACTGT	2	12	489969	489980	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150402406
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249	NC_009637	CTGGAA	2	12	503394	503405	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150402424
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259	NC_009637	CTGAAA	2	12	525198	525209	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150402442
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263	NC_009637	CACCGC	2	12	531261	531272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	150402447
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270	NC_009637	TTTAAA	2	12	539202	539213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_009637	AAAGAT	2	12	539928	539939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402458
272	NC_009637	TGTGGT	2	12	542660	542671	0 %	50 %	50 %	0 %	150402461
273	NC_009637	AAACGG	2	12	544775	544786	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150402462
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299	NC_009637	CAACGT	2	12	600779	600790	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150402522
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345	NC_009637	AAAAGT	2	12	701967	701978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150402642
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349	NC_009637	GTTTTT	2	12	706303	706314	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	150402645
350	NC_009637	AAACTT	2	12	706443	706454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150402645
351	NC_009637	TTACTG	2	12	712558	712569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150402651
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