MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Methanococcus aeolicus Nankai-3 chromosome

Total Repeats: 1030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009635	ATTTTT	2	12	73	84	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009635	AAAAAT	2	12	909	920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
3	NC_009635	AAATAA	2	12	1416	1427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400440
4	NC_009635	GATACA	2	12	1665	1676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400441
5	NC_009635	TTATAG	2	12	1741	1752	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400441
6	NC_009635	ATATTT	2	12	2624	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009635	TAAAGT	2	12	3905	3916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400443
8	NC_009635	ATTTTT	2	12	4891	4902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150400444
9	NC_009635	ATTATC	2	12	5271	5282	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400444
10	NC_009635	ATGGTC	2	12	8369	8380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400446
11	NC_009635	AAATTA	2	12	11124	11135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400449
12	NC_009635	TAACAA	2	12	12859	12870	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400450
13	NC_009635	CATAAA	2	12	18203	18214	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400454
14	NC_009635	TTTTTA	2	12	18282	18293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009635	TAATTA	2	12	19200	19211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009635	TTTTTG	2	12	21748	21759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009635	CAATTT	2	12	23485	23496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400460
18	NC_009635	ATTATA	2	12	27008	27019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009635	TGTGCC	2	12	27712	27723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150400465
20	NC_009635	AATGTG	2	12	28854	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400465
21	NC_009635	AATTAT	2	12	30872	30883	50 %	50 %	0 %	0 %	150400467
22	NC_009635	TTGAAG	2	12	33719	33730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400469
23	NC_009635	ATCTCC	2	12	35558	35569	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	150400471
24	NC_009635	ATTCAT	2	12	35890	35901	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400471
25	NC_009635	AGGAAA	2	12	36541	36552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150400472
26	NC_009635	GTTGAT	2	12	36725	36736	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400472
27	NC_009635	AAATGC	2	12	39361	39372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400473
28	NC_009635	TATATT	2	12	40234	40245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400474
29	NC_009635	GTATAT	2	12	40485	40496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009635	AAATAA	2	12	40854	40865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400475
31	NC_009635	CTATTG	2	12	41637	41648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150400475
32	NC_009635	ATATAA	2	12	46107	46118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400479
33	NC_009635	TATGAA	2	12	49343	49354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400482
34	NC_009635	TGAAAA	2	12	50711	50722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150400483
35	NC_009635	AAAAAG	3	18	54012	54029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400486
36	NC_009635	ATTTTT	2	12	55075	55086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009635	CAATAT	2	12	56234	56245	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400487
38	NC_009635	TTTTAT	2	12	57509	57520	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009635	TTAATT	2	12	61484	61495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400492
40	NC_009635	AGCTGA	2	12	65860	65871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150400497
41	NC_009635	ATGTAG	2	12	66712	66723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400498
42	NC_009635	TTGAAA	2	12	66916	66927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400498
43	NC_009635	TCAGGT	2	12	73500	73511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400504
44	NC_009635	TTGGAT	2	12	75061	75072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400505
45	NC_009635	CTGTAC	2	12	75095	75106	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150400505
46	NC_009635	TTGAAA	2	12	75107	75118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400505
47	NC_009635	TAATAT	2	12	75943	75954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009635	AAAATA	2	12	80142	80153	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400513
49	NC_009635	TGGGGT	2	12	85436	85447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150400521
50	NC_009635	TAGAAT	2	12	85968	85979	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400521
51	NC_009635	TTGGAG	2	12	86322	86333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	150400521
52	NC_009635	CCAAAA	2	12	87447	87458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150400522
53	NC_009635	GGCTAA	2	12	88176	88187	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150400523
54	NC_009635	ATTCAA	2	12	88277	88288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400523
55	NC_009635	TTCATT	2	12	89761	89772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400524
56	NC_009635	TTTAAA	2	12	90671	90682	50 %	50 %	0 %	0 %	150400524
57	NC_009635	AATATT	2	12	92977	92988	50 %	50 %	0 %	0 %	150400526
58	NC_009635	TGGTAT	2	12	94399	94410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400528
59	NC_009635	ATAAAA	2	12	95067	95078	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400529
60	NC_009635	AGAAAA	2	12	96806	96817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400529
61	NC_009635	TCAAGT	2	12	101701	101712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400533
62	NC_009635	CCATAT	2	12	101737	101748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400533
63	NC_009635	TATATT	2	12	102805	102816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009635	ATTTAT	2	12	104068	104079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009635	TTAATT	2	12	104109	104120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400535
66	NC_009635	TATTTT	2	12	106517	106528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009635	TTTTAA	2	12	106585	106596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400537
68	NC_009635	ATTTAT	2	12	107608	107619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400538
69	NC_009635	TTTAAT	2	12	109385	109396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009635	CTGCTT	2	12	109711	109722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150400540
71	NC_009635	GTAAAT	2	12	111055	111066	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400542
72	NC_009635	TATAGA	2	12	111087	111098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400542
73	NC_009635	AAAAGA	2	12	111969	111980	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400542
74	NC_009635	TTAAAT	2	12	112453	112464	50 %	50 %	0 %	0 %	150400543
75	NC_009635	GTAATG	2	12	113274	113285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150400544
76	NC_009635	ATAGAA	2	12	113912	113923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150400544
77	NC_009635	TTTATT	2	12	114939	114950	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009635	CAATTT	2	12	116067	116078	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400546
79	NC_009635	AATAAA	2	12	117941	117952	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400547
80	NC_009635	GATATT	2	12	120065	120076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400547
81	NC_009635	TAATTA	2	12	120923	120934	50 %	50 %	0 %	0 %	150400548
82	NC_009635	ATGCCG	2	12	123958	123969	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150400550
83	NC_009635	CTTGAA	2	12	124653	124664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400551
84	NC_009635	TTGTAT	2	12	128346	128357	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150400553
85	NC_009635	TATCTT	2	12	128885	128896	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400554
86	NC_009635	ACTTTA	2	12	129559	129570	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400555
87	NC_009635	ATATAA	2	12	130074	130085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400556
88	NC_009635	ATACAG	2	12	131388	131399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150400556
89	NC_009635	AAACAA	2	12	132190	132201	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150400557
90	NC_009635	CAACTA	2	12	133552	133563	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150400557
91	NC_009635	TAAAAT	2	12	134476	134487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009635	TCATAA	2	12	136160	136171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150400558
93	NC_009635	AAAATA	2	12	139531	139542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400560
94	NC_009635	ACGGGA	2	12	140269	140280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150400561
95	NC_009635	TATCAA	2	12	142009	142020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009635	ATTAAT	2	12	143157	143168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009635	ATAAAA	2	12	143528	143539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400566
98	NC_009635	TGATAT	2	12	144700	144711	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400567
99	NC_009635	CAAAAT	2	12	145525	145536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400568
100	NC_009635	ATTCTT	2	12	146546	146557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400569
101	NC_009635	AGAAAA	2	12	147747	147758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150400569
102	NC_009635	AAAATA	2	12	147857	147868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400569
103	NC_009635	CTATGG	2	12	149912	149923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	150400572
104	NC_009635	AACAAA	2	12	150176	150187	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	150400572
105	NC_009635	TTAAAA	2	12	153873	153884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400574
106	NC_009635	TAATTT	2	12	153956	153967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400574
107	NC_009635	TAATTC	2	12	154502	154513	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400575
108	NC_009635	AAATAA	2	12	156092	156103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400576
109	NC_009635	TTAAAA	2	12	158538	158549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400578
110	NC_009635	AGATTT	2	12	159068	159079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400578
111	NC_009635	ATTGCC	2	12	160269	160280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150400580
112	NC_009635	TATAAT	2	12	162306	162317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009635	GATATT	2	12	162393	162404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400582
114	NC_009635	ATCTAT	2	12	167614	167625	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400587
115	NC_009635	TCCTCT	2	12	167663	167674	0 %	50 %	0 %	50 %	150400587
116	NC_009635	TATAAA	2	12	170404	170415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009635	ATTGAA	2	12	175571	175582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400594
118	NC_009635	TTATTC	2	12	175945	175956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400595
119	NC_009635	ATAAAA	2	12	177763	177774	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400596
120	NC_009635	TAATTT	3	18	179859	179876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009635	TTTAAT	2	12	187550	187561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400608
122	NC_009635	AAATAA	2	12	188440	188451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400608
123	NC_009635	CAATAA	2	12	188494	188505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	150400608
124	NC_009635	ATTAAT	2	12	188604	188615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009635	ATTTTC	2	12	191383	191394	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150400610
126	NC_009635	GACCTG	2	12	192179	192190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150400611
127	NC_009635	TAAAAA	2	12	196433	196444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009635	TTAAAT	2	12	196508	196519	50 %	50 %	0 %	0 %	150400617
129	NC_009635	TCTAAC	3	18	196718	196735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400617
130	NC_009635	TATGAT	2	12	202397	202408	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150400622
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132	NC_009635	AATTTA	2	12	204122	204133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009635	TTATAT	2	12	204601	204612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009635	AGGAGC	2	12	205331	205342	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150400626
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145	NC_009635	TATAAA	2	12	215979	215990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009635	TTAAAT	2	12	216385	216396	50 %	50 %	0 %	0 %	150400640
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151	NC_009635	TTATAT	2	12	220214	220225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009635	GAATTA	2	12	221590	221601	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400645
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165	NC_009635	AATAAA	2	12	237599	237610	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_009635	AATATA	2	12	299786	299797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_009635	TTTATT	2	12	315251	315262	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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224	NC_009635	ATGAAA	2	12	332712	332723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150400742
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226	NC_009635	TAAATA	2	12	335244	335255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_009635	AAATAA	2	12	335496	335507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150400744
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229	NC_009635	GATAAT	2	12	337249	337260	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150400745
230	NC_009635	GGCAAG	2	12	339557	339568	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150400747
231	NC_009635	TAAAAA	2	12	339904	339915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_009635	TAAAAA	2	12	339946	339957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_009635	TATAAT	2	12	341059	341070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_009635	TAATTT	2	12	346753	346764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150400756
235	NC_009635	TAATTA	2	12	348565	348576	50 %	50 %	0 %	0 %	150400759
236	NC_009635	GCAATT	2	12	348770	348781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400759
237	NC_009635	GGCCTC	2	12	350111	350122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	150400761
238	NC_009635	ATATGC	2	12	351259	351270	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150400765
239	NC_009635	TATTGG	2	12	354549	354560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150400768
240	NC_009635	AAATAT	2	12	355818	355829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150400769
241	NC_009635	ATATAA	2	12	356161	356172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_009635	TGCAAG	2	12	357462	357473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150400770
243	NC_009635	ACTTTA	2	12	360085	360096	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150400772
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245	NC_009635	TTTTAT	2	12	361600	361611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150400773
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353	NC_009635	TTGTGG	2	12	521448	521459	0 %	50 %	50 %	0 %	150400930
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356	NC_009635	ATTACC	2	12	527541	527552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150400938
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367	NC_009635	TAAAAT	2	12	547155	547166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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