MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus vannielii SB chromosome

Total Repeats: 41945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009634	CCG	2	6	166	171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009634	TTAAC	2	10	251	260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009634	TGG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009634	CCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009634	CGAT	2	8	407	414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009634	GA	3	6	424	429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009634	GCA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009634	G	6	6	518	523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009634	CAG	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009634	CTG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009634	GGA	2	6	794	799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009634	GGT	2	6	937	942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009634	CGC	2	6	965	970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009634	CAC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009634	ATG	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009634	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009634	GGT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009634	CGAG	2	8	1185	1192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009634	ACT	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009634	AGGA	2	8	1265	1272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009634	GCT	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009634	GTA	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009634	ATA	2	6	1449	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009634	CA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009634	CAC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009634	GGCCTT	2	12	1523	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009634	G	6	6	1563	1568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009634	CCT	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009634	A	7	7	1620	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009634	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009634	T	7	7	1671	1677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009634	ATG	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009634	TGGCT	2	10	1798	1807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009634	AGGCG	2	10	1848	1857	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009634	TAG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009634	CTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009634	CG	3	6	2172	2177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009634	AGGT	2	8	2295	2302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009634	GGC	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009634	GAA	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009634	TCC	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009634	TTG	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009634	CAA	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009634	GTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009634	GAA	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009634	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009634	TGAG	2	8	2797	2804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009634	CAG	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009634	AGC	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009634	G	6	6	3046	3051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009634	GTA	3	9	3115	3123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009634	CCG	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009634	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009634	TGA	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009634	GT	3	6	3671	3676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009634	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009634	ACC	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009634	CCT	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009634	AGG	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009634	AGCC	2	8	4167	4174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009634	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009634	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009634	GCA	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009634	CGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009634	GGTT	2	8	4435	4442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009634	CTG	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009634	AGC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009634	AGA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009634	TTC	2	6	4686	4691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009634	GA	3	6	4724	4729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009634	TTTAA	2	10	4777	4786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009634	ATCCC	2	10	4826	4835	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009634	TA	4	8	4925	4932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009634	TA	3	6	4937	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009634	TTGA	2	8	4943	4950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009634	T	6	6	4971	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009634	A	6	6	5042	5047	100 %	0 %	0 %	0 %	150398761
78	NC_009634	A	8	8	5053	5060	100 %	0 %	0 %	0 %	150398761
79	NC_009634	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150398761
80	NC_009634	A	6	6	5092	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	150398761
81	NC_009634	TAA	2	6	5098	5103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398761
82	NC_009634	TAA	2	6	5173	5178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398761
83	NC_009634	TAT	2	6	5200	5205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398761
84	NC_009634	A	7	7	5212	5218	100 %	0 %	0 %	0 %	150398761
85	NC_009634	TAC	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398761
86	NC_009634	TAA	2	6	5493	5498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398761
87	NC_009634	AT	3	6	5527	5532	50 %	50 %	0 %	0 %	150398761
88	NC_009634	TAAT	2	8	5549	5556	50 %	50 %	0 %	0 %	150398761
89	NC_009634	A	6	6	5587	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009634	T	7	7	5709	5715	0 %	100 %	0 %	0 %	150398762
91	NC_009634	ATC	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398762
92	NC_009634	ATC	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398762
93	NC_009634	A	7	7	5852	5858	100 %	0 %	0 %	0 %	150398762
94	NC_009634	GATTTG	2	12	5870	5881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150398762
95	NC_009634	ATT	2	6	5884	5889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398762
96	NC_009634	AAGCAA	2	12	5900	5911	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150398762
97	NC_009634	TGG	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150398762
98	NC_009634	T	7	7	6009	6015	0 %	100 %	0 %	0 %	150398762
99	NC_009634	AAT	2	6	6028	6033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398762
100	NC_009634	ATT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398762
101	NC_009634	AAT	2	6	6171	6176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398762
102	NC_009634	A	6	6	6192	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009634	A	6	6	6208	6213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009634	AAT	2	6	6220	6225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009634	T	6	6	6247	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009634	TA	3	6	6260	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009634	TAA	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009634	AAT	2	6	6340	6345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398763
109	NC_009634	AAT	2	6	6376	6381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398763
110	NC_009634	TAC	2	6	6427	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398763
111	NC_009634	A	6	6	6487	6492	100 %	0 %	0 %	0 %	150398763
112	NC_009634	T	6	6	6547	6552	0 %	100 %	0 %	0 %	150398763
113	NC_009634	CAA	2	6	6612	6617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150398763
114	NC_009634	TGCT	2	8	6648	6655	0 %	50 %	25 %	25 %	150398763
115	NC_009634	A	6	6	6675	6680	100 %	0 %	0 %	0 %	150398763
116	NC_009634	T	7	7	6708	6714	0 %	100 %	0 %	0 %	150398763
117	NC_009634	T	6	6	6716	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	150398763
118	NC_009634	T	6	6	6763	6768	0 %	100 %	0 %	0 %	150398763
119	NC_009634	CAG	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150398763
120	NC_009634	CTT	2	6	6881	6886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150398763
121	NC_009634	T	7	7	6894	6900	0 %	100 %	0 %	0 %	150398763
122	NC_009634	ATTT	2	8	6901	6908	25 %	75 %	0 %	0 %	150398763
123	NC_009634	ATT	2	6	6979	6984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398763
124	NC_009634	AAT	2	6	7093	7098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398763
125	NC_009634	ATA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398763
126	NC_009634	TAA	2	6	7187	7192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398763
127	NC_009634	A	6	6	7219	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009634	TTG	2	6	7272	7277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150398764
129	NC_009634	ATT	2	6	7300	7305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398764
130	NC_009634	CCA	2	6	7334	7339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150398764
131	NC_009634	CTTTT	2	10	7356	7365	0 %	80 %	0 %	20 %	150398764
132	NC_009634	CTC	2	6	7437	7442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	150398764
133	NC_009634	TCA	2	6	7469	7474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150398764
134	NC_009634	TTA	2	6	7476	7481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398764
135	NC_009634	T	6	6	7505	7510	0 %	100 %	0 %	0 %	150398764
136	NC_009634	T	6	6	7545	7550	0 %	100 %	0 %	0 %	150398764
137	NC_009634	AT	3	6	7577	7582	50 %	50 %	0 %	0 %	150398764
138	NC_009634	ATTA	2	8	7654	7661	50 %	50 %	0 %	0 %	150398764
139	NC_009634	CTT	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150398764
140	NC_009634	TTA	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398764
141	NC_009634	T	7	7	7803	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	150398764
142	NC_009634	TAT	2	6	7821	7826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150398764
143	NC_009634	AAAC	2	8	7830	7837	75 %	0 %	0 %	25 %	150398764
144	NC_009634	CA	3	6	7863	7868	50 %	0 %	0 %	50 %	150398764
145	NC_009634	T	6	6	8003	8008	0 %	100 %	0 %	0 %	150398764
146	NC_009634	TA	3	6	8029	8034	50 %	50 %	0 %	0 %	150398764
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269	NC_009634	ATAA	2	8	12865	12872	75 %	25 %	0 %	0 %	150398773
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271	NC_009634	TAT	3	9	12923	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_009634	TTA	2	6	12988	12993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_009634	TA	3	6	12995	13000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_009634	AT	3	6	13015	13020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_009634	TGG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_009634	AAAT	2	8	13161	13168	75 %	25 %	0 %	0 %	150398774
280	NC_009634	TAA	2	6	13227	13232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150398774
281	NC_009634	AAGG	2	8	13268	13275	50 %	0 %	50 %	0 %	150398774
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