MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 11379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009565	CGAC	2	8	412	419	25 %	0 %	25 %	50 %	148821192
2	NC_009565	CGTT	2	8	628	635	0 %	50 %	25 %	25 %	148821192
3	NC_009565	CCCG	2	8	690	697	0 %	0 %	25 %	75 %	148821192
4	NC_009565	GGCA	2	8	761	768	25 %	0 %	50 %	25 %	148821192
5	NC_009565	CCCA	2	8	1019	1026	25 %	0 %	0 %	75 %	148821192
6	NC_009565	CCGA	2	8	1826	1833	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009565	GTGG	2	8	2233	2240	0 %	25 %	75 %	0 %	148821193
8	NC_009565	GCCA	2	8	2251	2258	25 %	0 %	25 %	50 %	148821193
9	NC_009565	TCAG	2	8	2595	2602	25 %	25 %	25 %	25 %	148821193
10	NC_009565	CGTT	2	8	2821	2828	0 %	50 %	25 %	25 %	148821193
11	NC_009565	ACGG	2	8	3173	3180	25 %	0 %	50 %	25 %	148821193
12	NC_009565	GCCT	2	8	3235	3242	0 %	25 %	25 %	50 %	148821193
13	NC_009565	CGTC	2	8	3386	3393	0 %	25 %	25 %	50 %	148821194
14	NC_009565	GGTA	2	8	3566	3573	25 %	25 %	50 %	0 %	148821194
15	NC_009565	GGTT	2	8	3748	3755	0 %	50 %	50 %	0 %	148821194
16	NC_009565	CCGC	2	8	3976	3983	0 %	0 %	25 %	75 %	148821194
17	NC_009565	CCAC	2	8	5600	5607	25 %	0 %	0 %	75 %	148821196
18	NC_009565	CAAG	2	8	5814	5821	50 %	0 %	25 %	25 %	148821196
19	NC_009565	CGCC	2	8	5910	5917	0 %	0 %	25 %	75 %	148821196
20	NC_009565	CGGC	2	8	6725	6732	0 %	0 %	50 %	50 %	148821196
21	NC_009565	GACA	2	8	7405	7412	50 %	0 %	25 %	25 %	148821197
22	NC_009565	CGGT	2	8	7625	7632	0 %	25 %	50 %	25 %	148821197
23	NC_009565	CGAG	2	8	8557	8564	25 %	0 %	50 %	25 %	148821197
24	NC_009565	CCAC	2	8	9087	9094	25 %	0 %	0 %	75 %	148821197
25	NC_009565	CGAC	2	8	9456	9463	25 %	0 %	25 %	50 %	148821197
26	NC_009565	GGTT	2	8	9684	9691	0 %	50 %	50 %	0 %	148821197
27	NC_009565	CCCG	2	8	10233	10240	0 %	0 %	25 %	75 %	148821198
28	NC_009565	GCAC	2	8	11709	11716	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009565	GAGC	2	8	12193	12200	25 %	0 %	50 %	25 %	148821199
30	NC_009565	CTCA	2	8	12404	12411	25 %	25 %	0 %	50 %	148821199
31	NC_009565	GCCC	2	8	12554	12561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_009565	AACC	2	8	13439	13446	50 %	0 %	0 %	50 %	148821201
33	NC_009565	CCCG	2	8	13548	13555	0 %	0 %	25 %	75 %	148821201
34	NC_009565	ATTC	2	8	13792	13799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_009565	ACCC	2	8	14199	14206	25 %	0 %	0 %	75 %	148821203
36	NC_009565	TGAT	2	8	14236	14243	25 %	50 %	25 %	0 %	148821203
37	NC_009565	TGCT	2	8	14283	14290	0 %	50 %	25 %	25 %	148821203
38	NC_009565	GCCC	2	8	14770	14777	0 %	0 %	25 %	75 %	148821203
39	NC_009565	GGGC	2	8	15551	15558	0 %	0 %	75 %	25 %	148821204
40	NC_009565	CTGA	2	8	16006	16013	25 %	25 %	25 %	25 %	148821205
41	NC_009565	TGGC	2	8	16149	16156	0 %	25 %	50 %	25 %	148821205
42	NC_009565	GCTT	2	8	16208	16215	0 %	50 %	25 %	25 %	148821205
43	NC_009565	CAGT	2	8	16236	16243	25 %	25 %	25 %	25 %	148821205
44	NC_009565	CGGT	2	8	16607	16614	0 %	25 %	50 %	25 %	148821205
45	NC_009565	GCCG	2	8	16666	16673	0 %	0 %	50 %	50 %	148821205
46	NC_009565	CGGG	2	8	17901	17908	0 %	0 %	75 %	25 %	148821206
47	NC_009565	CTGG	2	8	18009	18016	0 %	25 %	50 %	25 %	148821206
48	NC_009565	GTGC	2	8	18509	18516	0 %	25 %	50 %	25 %	148821206
49	NC_009565	GCCG	2	8	18527	18534	0 %	0 %	50 %	50 %	148821206
50	NC_009565	CCGC	2	8	18892	18899	0 %	0 %	25 %	75 %	148821207
51	NC_009565	GCCG	2	8	20356	20363	0 %	0 %	50 %	50 %	148821208
52	NC_009565	CCAG	2	8	20844	20851	25 %	0 %	25 %	50 %	148821208
53	NC_009565	CACC	2	8	21027	21034	25 %	0 %	0 %	75 %	148821208
54	NC_009565	CGGG	2	8	21983	21990	0 %	0 %	75 %	25 %	148821209
55	NC_009565	GCCG	2	8	22074	22081	0 %	0 %	50 %	50 %	148821209
56	NC_009565	GCTG	2	8	22454	22461	0 %	25 %	50 %	25 %	148821209
57	NC_009565	CGGC	2	8	22474	22481	0 %	0 %	50 %	50 %	148821209
58	NC_009565	GCCG	2	8	23145	23152	0 %	0 %	50 %	50 %	148821209
59	NC_009565	CCCA	2	8	23157	23164	25 %	0 %	0 %	75 %	148821209
60	NC_009565	GCTG	2	8	24296	24303	0 %	25 %	50 %	25 %	148821211
61	NC_009565	CGGC	2	8	24344	24351	0 %	0 %	50 %	50 %	148821211
62	NC_009565	GCCG	2	8	24444	24451	0 %	0 %	50 %	50 %	148821211
63	NC_009565	CGGG	2	8	24519	24526	0 %	0 %	75 %	25 %	148821211
64	NC_009565	TCAA	2	8	25615	25622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009565	GAGC	2	8	25643	25650	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009565	GGCC	2	8	25657	25664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009565	GCTC	2	8	26606	26613	0 %	25 %	25 %	50 %	148821212
68	NC_009565	CCAA	2	8	26823	26830	50 %	0 %	0 %	50 %	148821212
69	NC_009565	CAGC	2	8	26889	26896	25 %	0 %	25 %	50 %	148821212
70	NC_009565	CGGC	2	8	27709	27716	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
71	NC_009565	CCGG	2	8	28195	28202	0 %	0 %	50 %	50 %	148821214
72	NC_009565	GCTC	2	8	28751	28758	0 %	25 %	25 %	50 %	148821215
73	NC_009565	TGCG	2	8	28890	28897	0 %	25 %	50 %	25 %	148821215
74	NC_009565	CCGG	2	8	29155	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	148821215
75	NC_009565	CGTC	2	8	29486	29493	0 %	25 %	25 %	50 %	148821216
76	NC_009565	CACG	2	8	29846	29853	25 %	0 %	25 %	50 %	148821217
77	NC_009565	ACCG	2	8	29927	29934	25 %	0 %	25 %	50 %	148821217
78	NC_009565	CCGG	2	8	30246	30253	0 %	0 %	50 %	50 %	148821217
79	NC_009565	GTCG	2	8	30422	30429	0 %	25 %	50 %	25 %	148821217
80	NC_009565	CCCG	2	8	31044	31051	0 %	0 %	25 %	75 %	148821217
81	NC_009565	ACCA	2	8	31225	31232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009565	CGAG	2	8	31556	31563	25 %	0 %	50 %	25 %	148821218
83	NC_009565	CGAC	2	8	31853	31860	25 %	0 %	25 %	50 %	148821219
84	NC_009565	GCCG	2	8	32580	32587	0 %	0 %	50 %	50 %	148821220
85	NC_009565	CCGA	2	8	33569	33576	25 %	0 %	25 %	50 %	148821221
86	NC_009565	GCTA	2	8	33956	33963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009565	GGCC	2	8	34704	34711	0 %	0 %	50 %	50 %	148821222
88	NC_009565	ATCG	2	8	35197	35204	25 %	25 %	25 %	25 %	148821222
89	NC_009565	GATC	2	8	35535	35542	25 %	25 %	25 %	25 %	148821222
90	NC_009565	CCAC	2	8	36356	36363	25 %	0 %	0 %	75 %	148821222
91	NC_009565	ACCG	2	8	36750	36757	25 %	0 %	25 %	50 %	148821223
92	NC_009565	CTGG	2	8	37094	37101	0 %	25 %	50 %	25 %	148821224
93	NC_009565	GCAT	2	8	37489	37496	25 %	25 %	25 %	25 %	148821225
94	NC_009565	GCTG	2	8	38003	38010	0 %	25 %	50 %	25 %	148821225
95	NC_009565	AACG	2	8	38758	38765	50 %	0 %	25 %	25 %	148821225
96	NC_009565	CCGA	2	8	38819	38826	25 %	0 %	25 %	50 %	148821225
97	NC_009565	CCAC	2	8	38975	38982	25 %	0 %	0 %	75 %	148821225
98	NC_009565	CAGC	2	8	39202	39209	25 %	0 %	25 %	50 %	148821226
99	NC_009565	CCGG	2	8	39698	39705	0 %	0 %	50 %	50 %	148821226
100	NC_009565	GGCC	2	8	40229	40236	0 %	0 %	50 %	50 %	148821227
101	NC_009565	CGAT	2	8	40679	40686	25 %	25 %	25 %	25 %	148821227
102	NC_009565	GCCG	2	8	40979	40986	0 %	0 %	50 %	50 %	148821227
103	NC_009565	CACC	2	8	41004	41011	25 %	0 %	0 %	75 %	148821227
104	NC_009565	ACCG	2	8	41227	41234	25 %	0 %	25 %	50 %	148821227
105	NC_009565	GCGT	2	8	41253	41260	0 %	25 %	50 %	25 %	148821227
106	NC_009565	CCAC	2	8	41982	41989	25 %	0 %	0 %	75 %	148821228
107	NC_009565	CGAT	2	8	41991	41998	25 %	25 %	25 %	25 %	148821228
108	NC_009565	GGCC	2	8	42687	42694	0 %	0 %	50 %	50 %	148821230
109	NC_009565	CCCG	2	8	43278	43285	0 %	0 %	25 %	75 %	148821230
110	NC_009565	CGGG	2	8	43307	43314	0 %	0 %	75 %	25 %	148821230
111	NC_009565	CGAC	2	8	43946	43953	25 %	0 %	25 %	50 %	148821231
112	NC_009565	GAGC	2	8	44326	44333	25 %	0 %	50 %	25 %	148821231
113	NC_009565	GGGC	2	8	45485	45492	0 %	0 %	75 %	25 %	148821231
114	NC_009565	CGGC	2	8	45580	45587	0 %	0 %	50 %	50 %	148821231
115	NC_009565	GCCG	2	8	46543	46550	0 %	0 %	50 %	50 %	148821231
116	NC_009565	TTGC	2	8	46707	46714	0 %	50 %	25 %	25 %	148821232
117	NC_009565	CCGC	2	8	46855	46862	0 %	0 %	25 %	75 %	148821232
118	NC_009565	CCGC	2	8	46888	46895	0 %	0 %	25 %	75 %	148821232
119	NC_009565	GGTC	2	8	46996	47003	0 %	25 %	50 %	25 %	148821232
120	NC_009565	CTAC	2	8	47320	47327	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009565	CGGG	2	8	47547	47554	0 %	0 %	75 %	25 %	148821233
122	NC_009565	GCAG	2	8	47620	47627	25 %	0 %	50 %	25 %	148821233
123	NC_009565	GTGC	2	8	48520	48527	0 %	25 %	50 %	25 %	148821234
124	NC_009565	GCCG	2	8	48804	48811	0 %	0 %	50 %	50 %	148821234
125	NC_009565	CAGC	2	8	49989	49996	25 %	0 %	25 %	50 %	148821235
126	NC_009565	CGGG	2	8	50178	50185	0 %	0 %	75 %	25 %	148821236
127	NC_009565	GCCG	2	8	50278	50285	0 %	0 %	50 %	50 %	148821236
128	NC_009565	GGTG	2	8	50601	50608	0 %	25 %	75 %	0 %	148821236
129	NC_009565	CTCA	2	8	51217	51224	25 %	25 %	0 %	50 %	148821236
130	NC_009565	CGCT	2	8	51356	51363	0 %	25 %	25 %	50 %	148821237
131	NC_009565	GGTA	2	8	52222	52229	25 %	25 %	50 %	0 %	148821238
132	NC_009565	CTGG	2	8	52817	52824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009565	GCCG	2	8	53671	53678	0 %	0 %	50 %	50 %	148821240
134	NC_009565	ACCA	2	8	53842	53849	50 %	0 %	0 %	50 %	148821240
135	NC_009565	GTGC	2	8	54727	54734	0 %	25 %	50 %	25 %	148821240
136	NC_009565	ACCG	2	8	55605	55612	25 %	0 %	25 %	50 %	148821240
137	NC_009565	CCCG	2	8	55770	55777	0 %	0 %	25 %	75 %	148821240
138	NC_009565	GGCC	2	8	56444	56451	0 %	0 %	50 %	50 %	148821241
139	NC_009565	CGCT	2	8	57171	57178	0 %	25 %	25 %	50 %	148821241
140	NC_009565	GCGG	2	8	58928	58935	0 %	0 %	75 %	25 %	148821244
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