MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis F11 chromosome

Total Repeats: 110190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009565	TGG	2	6	207641	207646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821367
5003	NC_009565	GGT	3	9	207773	207781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821368
5004	NC_009565	ACC	2	6	207795	207800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821368
5005	NC_009565	CGGG	2	8	207843	207850	0 %	0 %	75 %	25 %	148821368
5006	NC_009565	TGC	2	6	207868	207873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821368
5007	NC_009565	GGC	2	6	207887	207892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821368
5008	NC_009565	GCC	2	6	207920	207925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821368
5009	NC_009565	GGT	2	6	207940	207945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821368
5010	NC_009565	GTT	3	9	207995	208003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821368
5011	NC_009565	CGA	2	6	208006	208011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821368
5012	NC_009565	GGT	2	6	208052	208057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821368
5013	NC_009565	TGG	2	6	208117	208122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821368
5014	NC_009565	TGT	2	6	208192	208197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821368
5015	NC_009565	CGG	3	9	208258	208266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821368
5016	NC_009565	GGC	3	9	208274	208282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821368
5017	NC_009565	GGT	2	6	208319	208324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821368
5018	NC_009565	AATG	2	8	208332	208339	50 %	25 %	25 %	0 %	148821368
5019	NC_009565	CG	3	6	208356	208361	0 %	0 %	50 %	50 %	148821368
5020	NC_009565	CCGC	2	8	208469	208476	0 %	0 %	25 %	75 %	148821368
5021	NC_009565	TGT	2	6	208585	208590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821368
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5023	NC_009565	CG	3	6	208666	208671	0 %	0 %	50 %	50 %	148821368
5024	NC_009565	CGA	2	6	208685	208690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821368
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5030	NC_009565	TGG	2	6	209157	209162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821369
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5042	NC_009565	CCG	2	6	209612	209617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821370
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5047	NC_009565	TGC	2	6	209790	209795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821370
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5051	NC_009565	GAC	2	6	209949	209954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821370
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5053	NC_009565	CCG	2	6	210000	210005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_009565	GCCA	2	8	210029	210036	25 %	0 %	25 %	50 %	148821371
5055	NC_009565	C	6	6	210157	210162	0 %	0 %	0 %	100 %	148821371
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5113	NC_009565	CTGT	2	8	212575	212582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_009565	ACCGC	2	10	212688	212697	20 %	0 %	20 %	60 %	148821373
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5119	NC_009565	CG	3	6	212807	212812	0 %	0 %	50 %	50 %	148821373
5120	NC_009565	GCT	2	6	212827	212832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821373
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5122	NC_009565	TCG	2	6	212906	212911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821373
5123	NC_009565	CTG	2	6	212920	212925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821373
5124	NC_009565	GCCG	2	8	213031	213038	0 %	0 %	50 %	50 %	148821373
5125	NC_009565	CGG	2	6	213081	213086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821373
5126	NC_009565	GCA	2	6	213111	213116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821373
5127	NC_009565	GTC	2	6	213181	213186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821373
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5129	NC_009565	GTG	2	6	213208	213213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821373
5130	NC_009565	CGT	2	6	213274	213279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821373
5131	NC_009565	GGT	2	6	213380	213385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821375
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5135	NC_009565	CGG	2	6	213605	213610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821375
5136	NC_009565	CGG	2	6	213628	213633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821375
5137	NC_009565	CGG	2	6	213736	213741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821375
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5141	NC_009565	TGC	2	6	213894	213899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821375
5142	NC_009565	GCC	2	6	213903	213908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821375
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5149	NC_009565	GCC	2	6	214045	214050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821375
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5151	NC_009565	CAGG	2	8	214097	214104	25 %	0 %	50 %	25 %	148821375
5152	NC_009565	TGG	2	6	214108	214113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821375
5153	NC_009565	GCA	2	6	214180	214185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821375
5154	NC_009565	CGT	2	6	214210	214215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821375
5155	NC_009565	TCG	2	6	214299	214304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821375
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5163	NC_009565	ACC	2	6	214594	214599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821374
5164	NC_009565	GA	3	6	214637	214642	50 %	0 %	50 %	0 %	148821374
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5175	NC_009565	CG	3	6	214995	215000	0 %	0 %	50 %	50 %	148821374
5176	NC_009565	CTG	2	6	215001	215006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821374
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5178	NC_009565	TGC	2	6	215062	215067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821374
5179	NC_009565	TG	3	6	215121	215126	0 %	50 %	50 %	0 %	148821374
5180	NC_009565	CGA	2	6	215207	215212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821374
5181	NC_009565	GCCGA	2	10	215244	215253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5182	NC_009565	CTG	2	6	215321	215326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821376
5183	NC_009565	CGG	2	6	215397	215402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821376
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5185	NC_009565	CACCAT	2	12	215473	215484	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	148821376
5186	NC_009565	GCG	2	6	215489	215494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821376
5187	NC_009565	CGG	2	6	215541	215546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821376
5188	NC_009565	ACG	2	6	215550	215555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821376
5189	NC_009565	TGG	2	6	215646	215651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821376
5190	NC_009565	CCTCG	2	10	215680	215689	0 %	20 %	20 %	60 %	148821376
5191	NC_009565	CGA	2	6	215709	215714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821376
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5193	NC_009565	TAC	2	6	215873	215878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821376
5194	NC_009565	CGT	2	6	215879	215884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821376
5195	NC_009565	GC	3	6	215894	215899	0 %	0 %	50 %	50 %	148821376
5196	NC_009565	AGCC	2	8	215911	215918	25 %	0 %	25 %	50 %	148821376
5197	NC_009565	TCG	2	6	215936	215941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821376
5198	NC_009565	GC	3	6	215950	215955	0 %	0 %	50 %	50 %	148821376
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5201	NC_009565	TCGGT	3	15	216180	216194	0 %	40 %	40 %	20 %	148821377
5202	NC_009565	GAC	2	6	216217	216222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821377
5203	NC_009565	CGG	2	6	216236	216241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821377
5204	NC_009565	GC	3	6	216283	216288	0 %	0 %	50 %	50 %	148821377
5205	NC_009565	GGC	2	6	216291	216296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821377
5206	NC_009565	GGC	2	6	216322	216327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821377
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5209	NC_009565	CGT	2	6	216510	216515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821377
5210	NC_009565	AGG	2	6	216524	216529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821377
5211	NC_009565	CGA	3	9	216590	216598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5212	NC_009565	TG	3	6	216682	216687	0 %	50 %	50 %	0 %	148821378
5213	NC_009565	TTG	2	6	216729	216734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821378
5214	NC_009565	CCG	2	6	216802	216807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821378
5215	NC_009565	GC	3	6	216876	216881	0 %	0 %	50 %	50 %	148821378
5216	NC_009565	CAAT	2	8	216913	216920	50 %	25 %	0 %	25 %	148821378
5217	NC_009565	GC	3	6	216924	216929	0 %	0 %	50 %	50 %	148821378
5218	NC_009565	GTT	2	6	216974	216979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821378
5219	NC_009565	ATC	2	6	217005	217010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821378
5220	NC_009565	CAG	3	9	217017	217025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5221	NC_009565	CGA	3	9	217036	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5222	NC_009565	CTGG	2	8	217082	217089	0 %	25 %	50 %	25 %	148821378
5223	NC_009565	TTG	2	6	217128	217133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821378
5224	NC_009565	GGC	2	6	217178	217183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
5225	NC_009565	ACA	2	6	217186	217191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148821378
5226	NC_009565	ACG	2	6	217234	217239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5227	NC_009565	GC	3	6	217309	217314	0 %	0 %	50 %	50 %	148821378
5228	NC_009565	GGCC	2	8	217316	217323	0 %	0 %	50 %	50 %	148821378
5229	NC_009565	GTGCG	2	10	217334	217343	0 %	20 %	60 %	20 %	148821378
5230	NC_009565	ACCG	2	8	217380	217387	25 %	0 %	25 %	50 %	148821378
5231	NC_009565	GCC	2	6	217395	217400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821378
5232	NC_009565	CGG	2	6	217446	217451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
5233	NC_009565	GCGCCG	2	12	217497	217508	0 %	0 %	50 %	50 %	148821378
5234	NC_009565	TGC	3	9	217561	217569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5235	NC_009565	GCT	2	6	217580	217585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5236	NC_009565	CGCT	2	8	217588	217595	0 %	25 %	25 %	50 %	148821378
5237	NC_009565	CGG	2	6	217625	217630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
5238	NC_009565	G	6	6	217685	217690	0 %	0 %	100 %	0 %	148821378
5239	NC_009565	CTG	2	6	217752	217757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821378
5240	NC_009565	TGAG	2	8	217771	217778	25 %	25 %	50 %	0 %	148821378
5241	NC_009565	AGTTCG	2	12	217804	217815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148821378
5242	NC_009565	CGG	2	6	217831	217836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
5243	NC_009565	GCTG	2	8	217844	217851	0 %	25 %	50 %	25 %	148821378
5244	NC_009565	CGC	2	6	217952	217957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821378
5245	NC_009565	CAT	2	6	218042	218047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821378
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5247	NC_009565	GGC	2	6	218340	218345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
5248	NC_009565	CGGTTG	2	12	218442	218453	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148821378
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5252	NC_009565	CGG	2	6	218599	218604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821378
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5254	NC_009565	GGCC	2	8	218663	218670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5255	NC_009565	TCG	2	6	218725	218730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5258	NC_009565	AT	3	6	218933	218938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_009565	CTG	2	6	218985	218990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5261	NC_009565	CGGT	2	8	218999	219006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5281	NC_009565	TGC	2	6	219777	219782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5344	NC_009565	CTG	2	6	222361	222366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821382
5345	NC_009565	CCGTG	2	10	222393	222402	0 %	20 %	40 %	40 %	148821382
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5349	NC_009565	CGC	2	6	222479	222484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5350	NC_009565	CAC	2	6	222506	222511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5351	NC_009565	GGTGC	2	10	222517	222526	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5352	NC_009565	ACG	2	6	222635	222640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821383
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5355	NC_009565	GCCGC	2	10	222853	222862	0 %	0 %	40 %	60 %	148821383
5356	NC_009565	TGG	2	6	222870	222875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821383
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5360	NC_009565	GC	3	6	223036	223041	0 %	0 %	50 %	50 %	148821383
5361	NC_009565	ACG	2	6	223043	223048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821383
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5365	NC_009565	CGGCG	2	10	223150	223159	0 %	0 %	60 %	40 %	148821383
5366	NC_009565	GCC	2	6	223175	223180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821383
5367	NC_009565	TGC	2	6	223203	223208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821383
5368	NC_009565	GC	3	6	223207	223212	0 %	0 %	50 %	50 %	148821383
5369	NC_009565	CAC	2	6	223247	223252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148821383
5370	NC_009565	GAT	2	6	223288	223293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148821383
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5372	NC_009565	GTG	2	6	223331	223336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148821383
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5374	NC_009565	CGT	2	6	223348	223353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821383
5375	NC_009565	CTGGC	2	10	223373	223382	0 %	20 %	40 %	40 %	148821383
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5378	NC_009565	TCG	2	6	223467	223472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821383
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5380	NC_009565	CTG	2	6	223550	223555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821383
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5389	NC_009565	GTT	2	6	223780	223785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821383
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5392	NC_009565	CGC	2	6	223964	223969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148821384
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5401	NC_009565	CGC	2	6	224271	224276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5402	NC_009565	GCC	2	6	224284	224289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5403	NC_009565	TCA	2	6	224340	224345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148821385
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5421	NC_009565	AGC	2	6	225080	225085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821386
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5485	NC_009565	GTC	2	6	227782	227787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5486	NC_009565	GCG	2	6	227791	227796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821387
5487	NC_009565	GTC	2	6	227812	227817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5488	NC_009565	AGG	2	6	227831	227836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148821387
5489	NC_009565	CG	3	6	227869	227874	0 %	0 %	50 %	50 %	148821387
5490	NC_009565	TGC	2	6	227880	227885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5491	NC_009565	GCT	2	6	227925	227930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5492	NC_009565	CGG	2	6	227973	227978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148821387
5493	NC_009565	ATGG	2	8	227979	227986	25 %	25 %	50 %	0 %	148821387
5494	NC_009565	GCA	2	6	227996	228001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5495	NC_009565	TTG	2	6	228017	228022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148821387
5496	NC_009565	GCCT	2	8	228031	228038	0 %	25 %	25 %	50 %	148821387
5497	NC_009565	CGGC	2	8	228052	228059	0 %	0 %	50 %	50 %	148821387
5498	NC_009565	CAG	2	6	228091	228096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148821387
5499	NC_009565	GC	4	8	228097	228104	0 %	0 %	50 %	50 %	148821387
5500	NC_009565	GCCG	2	8	228137	228144	0 %	0 %	50 %	50 %	148821387

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