MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 109952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009525	TCA	2	6	127306	127311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659870
3003	NC_009525	CGT	2	6	127341	127346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659870
3004	NC_009525	CGG	3	9	127393	127401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659870
3005	NC_009525	GAC	2	6	127403	127408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659870
3006	NC_009525	GCA	2	6	127429	127434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659870
3007	NC_009525	GCTC	2	8	127494	127501	0 %	25 %	25 %	50 %	148659870
3008	NC_009525	CGT	2	6	127528	127533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659870
3009	NC_009525	CAG	3	9	127601	127609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659870
3010	NC_009525	GCCC	2	8	127629	127636	0 %	0 %	25 %	75 %	148659870
3011	NC_009525	GCC	2	6	127685	127690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659870
3012	NC_009525	TGC	2	6	127729	127734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659870
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3015	NC_009525	CGG	2	6	127792	127797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659870
3016	NC_009525	GGC	2	6	127805	127810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659870
3017	NC_009525	CGT	2	6	127867	127872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659870
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3019	NC_009525	CGG	2	6	127975	127980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659870
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3021	NC_009525	CG	3	6	128037	128042	0 %	0 %	50 %	50 %	148659870
3022	NC_009525	CCG	2	6	128044	128049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659870
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3029	NC_009525	CGG	2	6	128446	128451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659870
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3033	NC_009525	GCGTGC	2	12	128568	128579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148659870
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3052	NC_009525	CGA	2	6	129115	129120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659870
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3108	NC_009525	TGCGG	2	10	131274	131283	0 %	20 %	60 %	20 %	148659870
3109	NC_009525	CGA	2	6	131408	131413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659870
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3118	NC_009525	CTGT	2	8	131839	131846	0 %	50 %	25 %	25 %	148659870
3119	NC_009525	CAC	2	6	131863	131868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659870
3120	NC_009525	GCGA	2	8	132025	132032	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3121	NC_009525	CGGG	2	8	132068	132075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_009525	ACG	2	6	132125	132130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_009525	G	6	6	132233	132238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_009525	CGA	2	6	132240	132245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_009525	TGG	2	6	132323	132328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659871
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3129	NC_009525	CGG	2	6	132574	132579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_009525	GCTC	2	8	132580	132587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_009525	GGT	2	6	132591	132596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_009525	CCA	2	6	132703	132708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3133	NC_009525	ATCAC	2	10	132753	132762	40 %	20 %	0 %	40 %	148659872
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3135	NC_009525	ATCGG	2	10	132801	132810	20 %	20 %	40 %	20 %	148659872
3136	NC_009525	CGA	2	6	132844	132849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659872
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3139	NC_009525	ATC	2	6	133110	133115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659872
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3142	NC_009525	CGG	2	6	133202	133207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659872
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3221	NC_009525	CGGG	2	8	135292	135299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3222	NC_009525	GTCG	2	8	135360	135367	0 %	25 %	50 %	25 %	148659874
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3232	NC_009525	GCT	2	6	135611	135616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3233	NC_009525	GCGAT	2	10	135697	135706	20 %	20 %	40 %	20 %	148659874
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3235	NC_009525	GGA	2	6	135815	135820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659874
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3237	NC_009525	GTTCG	2	10	135918	135927	0 %	40 %	40 %	20 %	148659874
3238	NC_009525	CCG	2	6	135970	135975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659874
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3240	NC_009525	CTG	2	6	136071	136076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3241	NC_009525	GTG	2	6	136106	136111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659874
3242	NC_009525	CGG	2	6	136134	136139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659874
3243	NC_009525	TCG	2	6	136159	136164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3244	NC_009525	GGCT	2	8	136165	136172	0 %	25 %	50 %	25 %	148659874
3245	NC_009525	GAC	2	6	136184	136189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3246	NC_009525	CTG	2	6	136230	136235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3247	NC_009525	GTG	2	6	136239	136244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659874
3248	NC_009525	AGC	2	6	136285	136290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3249	NC_009525	CCTGG	2	10	136310	136319	0 %	20 %	40 %	40 %	148659874
3250	NC_009525	GGCCC	2	10	136416	136425	0 %	0 %	40 %	60 %	148659874
3251	NC_009525	GGT	2	6	136451	136456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148659874
3252	NC_009525	CGT	2	6	136468	136473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3253	NC_009525	GCG	2	6	136539	136544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659874
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3262	NC_009525	TCG	2	6	136942	136947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659874
3263	NC_009525	CGACC	2	10	137000	137009	20 %	0 %	20 %	60 %	148659874
3264	NC_009525	AGCG	2	8	137038	137045	25 %	0 %	50 %	25 %	148659874
3265	NC_009525	CAC	2	6	137084	137089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659874
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3269	NC_009525	CCG	2	6	137368	137373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3270	NC_009525	TG	3	6	137414	137419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_009525	TGA	2	6	137435	137440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_009525	GTG	2	6	137451	137456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_009525	GC	4	8	137549	137556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3274	NC_009525	ATG	2	6	137678	137683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659875
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3277	NC_009525	CGG	2	6	137877	137882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659875
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3281	NC_009525	ATT	2	6	137978	137983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148659875
3282	NC_009525	TCG	2	6	137993	137998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659875
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3286	NC_009525	CGT	2	6	138139	138144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659875
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3288	NC_009525	TGATGC	2	12	138312	138323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148659875
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3291	NC_009525	ATC	2	6	138476	138481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148659875
3292	NC_009525	GCA	2	6	138492	138497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659875
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3296	NC_009525	GAG	2	6	138630	138635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3297	NC_009525	CTG	2	6	138694	138699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659876
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3300	NC_009525	TCG	2	6	138936	138941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659876
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3304	NC_009525	TACG	2	8	139381	139388	25 %	25 %	25 %	25 %	148659877
3305	NC_009525	GGC	2	6	139394	139399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659877
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3319	NC_009525	TCGA	2	8	140070	140077	25 %	25 %	25 %	25 %	148659878
3320	NC_009525	TC	3	6	140088	140093	0 %	50 %	0 %	50 %	148659878
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3327	NC_009525	TCG	2	6	140271	140276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659878
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3338	NC_009525	GACGCG	2	12	140547	140558	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148659878
3339	NC_009525	CACT	2	8	140567	140574	25 %	25 %	0 %	50 %	148659878
3340	NC_009525	TCT	2	6	140606	140611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148659878
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3342	NC_009525	ATG	2	6	140784	140789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659878
3343	NC_009525	CGCA	2	8	140819	140826	25 %	0 %	25 %	50 %	148659878
3344	NC_009525	GGA	2	6	140844	140849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659878
3345	NC_009525	TG	3	6	140977	140982	0 %	50 %	50 %	0 %	148659878
3346	NC_009525	CGA	2	6	140998	141003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659878
3347	NC_009525	GAC	2	6	141106	141111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3348	NC_009525	GT	3	6	141118	141123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3349	NC_009525	GAG	2	6	141133	141138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_009525	TTCT	2	8	141208	141215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3351	NC_009525	ACGC	2	8	141280	141287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3352	NC_009525	GAA	2	6	141308	141313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3353	NC_009525	GAT	2	6	141323	141328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148659879
3354	NC_009525	TGT	2	6	141338	141343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148659879
3355	NC_009525	CGA	2	6	141364	141369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659879
3356	NC_009525	GGGC	2	8	141372	141379	0 %	0 %	75 %	25 %	148659879
3357	NC_009525	GCT	2	6	141386	141391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659879
3358	NC_009525	CG	5	10	141556	141565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3359	NC_009525	ACC	2	6	141633	141638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148659880
3360	NC_009525	GACC	2	8	141740	141747	25 %	0 %	25 %	50 %	148659880
3361	NC_009525	CGC	2	6	141769	141774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148659880
3362	NC_009525	GGC	2	6	141910	141915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659880
3363	NC_009525	ACG	2	6	141928	141933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659880
3364	NC_009525	GGA	2	6	141946	141951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148659880
3365	NC_009525	CTG	2	6	141963	141968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659880
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3367	NC_009525	CACC	2	8	142091	142098	25 %	0 %	0 %	75 %	148659880
3368	NC_009525	CGGCG	2	10	142174	142183	0 %	0 %	60 %	40 %	148659880
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3374	NC_009525	GATA	2	8	142356	142363	50 %	25 %	25 %	0 %	148659880
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3486	NC_009525	TAGC	2	8	146983	146990	25 %	25 %	25 %	25 %	148659883
3487	NC_009525	GCG	3	9	147011	147019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148659884
3488	NC_009525	AACG	2	8	147047	147054	50 %	0 %	25 %	25 %	148659884
3489	NC_009525	AGCG	2	8	147080	147087	25 %	0 %	50 %	25 %	148659884
3490	NC_009525	ACG	2	6	147184	147189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3491	NC_009525	CGA	2	6	147216	147221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3492	NC_009525	TCG	2	6	147224	147229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
3493	NC_009525	TCG	2	6	147276	147281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148659884
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3499	NC_009525	GAC	2	6	147682	147687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148659884
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