MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009464	TCG	2	6	182490	182495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918856
3502	NC_009464	ACG	2	6	182640	182645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918856
3503	NC_009464	TCC	2	6	182709	182714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918856
3504	NC_009464	AC	3	6	182771	182776	50 %	0 %	0 %	50 %	147918856
3505	NC_009464	GTC	2	6	182975	182980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918856
3506	NC_009464	ATC	2	6	183020	183025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918856
3507	NC_009464	ATC	2	6	183036	183041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918856
3508	NC_009464	TCT	2	6	183245	183250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_009464	TCT	2	6	183279	183284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_009464	CTCTTC	2	12	183292	183303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_009464	CCG	2	6	183304	183309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_009464	TTC	2	6	183340	183345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_009464	TCA	2	6	183348	183353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_009464	CCG	2	6	183389	183394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_009464	TAT	2	6	183469	183474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918857
3516	NC_009464	TTC	2	6	183542	183547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918857
3517	NC_009464	CTGT	2	8	183563	183570	0 %	50 %	25 %	25 %	147918857
3518	NC_009464	GTA	2	6	183611	183616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918857
3519	NC_009464	TACG	2	8	183628	183635	25 %	25 %	25 %	25 %	147918857
3520	NC_009464	CTC	2	6	183653	183658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918857
3521	NC_009464	CTT	2	6	183720	183725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918857
3522	NC_009464	T	6	6	183724	183729	0 %	100 %	0 %	0 %	147918857
3523	NC_009464	GCT	2	6	183730	183735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918857
3524	NC_009464	ATA	2	6	183741	183746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918857
3525	NC_009464	TA	3	6	183756	183761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009464	GGC	2	6	183804	183809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_009464	ATT	2	6	183852	183857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_009464	GA	4	8	183867	183874	50 %	0 %	50 %	0 %	147918858
3529	NC_009464	ATCA	2	8	183919	183926	50 %	25 %	0 %	25 %	147918858
3530	NC_009464	ATCG	2	8	184030	184037	25 %	25 %	25 %	25 %	147918858
3531	NC_009464	CTC	2	6	184129	184134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918858
3532	NC_009464	ACC	2	6	184170	184175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918858
3533	NC_009464	TA	3	6	184201	184206	50 %	50 %	0 %	0 %	147918858
3534	NC_009464	GGT	2	6	184216	184221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918858
3535	NC_009464	TATGA	2	10	184266	184275	40 %	40 %	20 %	0 %	147918858
3536	NC_009464	TCC	2	6	184331	184336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918858
3537	NC_009464	GATC	2	8	184351	184358	25 %	25 %	25 %	25 %	147918858
3538	NC_009464	TAG	2	6	184544	184549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918858
3539	NC_009464	CGG	2	6	184578	184583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918858
3540	NC_009464	TTC	2	6	184649	184654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918858
3541	NC_009464	GA	3	6	184656	184661	50 %	0 %	50 %	0 %	147918858
3542	NC_009464	CTT	2	6	184677	184682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918858
3543	NC_009464	TCT	2	6	184691	184696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918858
3544	NC_009464	GCC	2	6	184779	184784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918858
3545	NC_009464	GCCG	2	8	184890	184897	0 %	0 %	50 %	50 %	147918858
3546	NC_009464	A	6	6	184920	184925	100 %	0 %	0 %	0 %	147918858
3547	NC_009464	CGC	2	6	184966	184971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918858
3548	NC_009464	T	6	6	185030	185035	0 %	100 %	0 %	0 %	147918858
3549	NC_009464	ATAA	2	8	185093	185100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_009464	ATTACG	2	12	185169	185180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	147918859
3551	NC_009464	CGAG	2	8	185182	185189	25 %	0 %	50 %	25 %	147918859
3552	NC_009464	CTGA	2	8	185215	185222	25 %	25 %	25 %	25 %	147918859
3553	NC_009464	TCC	2	6	185225	185230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918859
3554	NC_009464	GGA	2	6	185279	185284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918859
3555	NC_009464	GGTGTC	2	12	185379	185390	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147918859
3556	NC_009464	GAT	2	6	185435	185440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918859
3557	NC_009464	AAAC	2	8	185458	185465	75 %	0 %	0 %	25 %	147918859
3558	NC_009464	TCGA	2	8	185570	185577	25 %	25 %	25 %	25 %	147918859
3559	NC_009464	CTGG	2	8	185584	185591	0 %	25 %	50 %	25 %	147918859
3560	NC_009464	TTG	2	6	185608	185613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918859
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3562	NC_009464	AT	3	6	185672	185677	50 %	50 %	0 %	0 %	147918859
3563	NC_009464	CTGG	2	8	185725	185732	0 %	25 %	50 %	25 %	147918859
3564	NC_009464	TTG	2	6	185749	185754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918859
3565	NC_009464	CGGTT	2	10	185867	185876	0 %	40 %	40 %	20 %	147918859
3566	NC_009464	TAT	2	6	185902	185907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918859
3567	NC_009464	TCA	2	6	185970	185975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918859
3568	NC_009464	TCGA	2	8	185993	186000	25 %	25 %	25 %	25 %	147918859
3569	NC_009464	TAT	2	6	186029	186034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918859
3570	NC_009464	TCG	2	6	186153	186158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918859
3571	NC_009464	TGT	3	9	186170	186178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918859
3572	NC_009464	TTG	2	6	186313	186318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918859
3573	NC_009464	GGTGT	2	10	186327	186336	0 %	40 %	60 %	0 %	147918859
3574	NC_009464	GCA	2	6	186582	186587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918859
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3576	NC_009464	AT	3	6	186716	186721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_009464	AT	3	6	186723	186728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_009464	ATT	2	6	186742	186747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_009464	AAT	2	6	186772	186777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_009464	TGCC	2	8	186858	186865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_009464	TTG	2	6	186898	186903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_009464	CTGT	2	8	186920	186927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_009464	CGT	2	6	186974	186979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_009464	GGC	2	6	187012	187017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_009464	T	7	7	187036	187042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_009464	CCCG	2	8	187082	187089	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3587	NC_009464	GAA	2	6	187100	187105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918860
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3590	NC_009464	AGA	2	6	187152	187157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918860
3591	NC_009464	CTGA	2	8	187174	187181	25 %	25 %	25 %	25 %	147918860
3592	NC_009464	TGTCGG	2	12	187316	187327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	147918860
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3594	NC_009464	AAT	2	6	187370	187375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918860
3595	NC_009464	TC	3	6	187376	187381	0 %	50 %	0 %	50 %	147918860
3596	NC_009464	ATT	2	6	187511	187516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918860
3597	NC_009464	AAT	2	6	187585	187590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918860
3598	NC_009464	CAG	2	6	187840	187845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918860
3599	NC_009464	TAT	2	6	187900	187905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918860
3600	NC_009464	ATT	2	6	188058	188063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147918860
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3606	NC_009464	TCG	2	6	188463	188468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918860
3607	NC_009464	TTG	2	6	188482	188487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918860
3608	NC_009464	ATC	2	6	188561	188566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918860
3609	NC_009464	GAA	2	6	188729	188734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009464	TTG	2	6	188764	188769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918861
3611	NC_009464	GGTGT	2	10	188778	188787	0 %	40 %	60 %	0 %	147918861
3612	NC_009464	GTA	2	6	188855	188860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918861
3613	NC_009464	CGT	2	6	188908	188913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918861
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3616	NC_009464	TAAT	2	8	189225	189232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_009464	AGC	2	6	189274	189279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_009464	CGT	2	6	189329	189334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_009464	A	6	6	189346	189351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_009464	CTT	2	6	189391	189396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918862
3621	NC_009464	TCTT	2	8	189462	189469	0 %	75 %	0 %	25 %	147918862
3622	NC_009464	TAA	2	6	189496	189501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918862
3623	NC_009464	TCG	2	6	189513	189518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918862
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3997	NC_009464	TTAAT	2	10	209720	209729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4000	NC_009464	TGC	2	6	209811	209816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918880

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