MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009464	CAG	2	6	51197	51202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918730
1002	NC_009464	GCCT	2	8	51204	51211	0 %	25 %	25 %	50 %	147918730
1003	NC_009464	CAT	2	6	51214	51219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918730
1004	NC_009464	GGC	2	6	51238	51243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918730
1005	NC_009464	TGC	2	6	51253	51258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918730
1006	NC_009464	AC	3	6	51322	51327	50 %	0 %	0 %	50 %	147918730
1007	NC_009464	CTT	3	9	51347	51355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918730
1008	NC_009464	GTC	2	6	51377	51382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918730
1009	NC_009464	GTC	2	6	51407	51412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009464	CT	3	6	51449	51454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_009464	GCCG	2	8	51478	51485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_009464	CGTA	2	8	51505	51512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_009464	GCTC	2	8	51626	51633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_009464	GTATA	2	10	51656	51665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009464	GTT	2	6	51703	51708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_009464	AAT	2	6	51941	51946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_009464	CGT	2	6	51960	51965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_009464	GGC	2	6	51990	51995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_009464	ACAGC	2	10	52055	52064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1020	NC_009464	GTC	2	6	52119	52124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_009464	GCC	2	6	52196	52201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918731
1022	NC_009464	GCC	3	9	52229	52237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918731
1023	NC_009464	GCC	2	6	52244	52249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918731
1024	NC_009464	CGT	2	6	52273	52278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1025	NC_009464	TCATGA	2	12	52285	52296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	147918731
1026	NC_009464	GCG	2	6	52308	52313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918731
1027	NC_009464	TCT	2	6	52360	52365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1028	NC_009464	TGCT	2	8	52431	52438	0 %	50 %	25 %	25 %	147918731
1029	NC_009464	GCC	3	9	52604	52612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918731
1030	NC_009464	CTT	2	6	52622	52627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1031	NC_009464	ACCG	2	8	52643	52650	25 %	0 %	25 %	50 %	147918731
1032	NC_009464	CTA	2	6	52687	52692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918731
1033	NC_009464	TGC	2	6	52702	52707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1034	NC_009464	CGA	2	6	52750	52755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1035	NC_009464	TCG	2	6	52767	52772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1036	NC_009464	CTG	2	6	52798	52803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1037	NC_009464	GCTCA	2	10	52820	52829	20 %	20 %	20 %	40 %	147918731
1038	NC_009464	GTC	2	6	52943	52948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1039	NC_009464	ACG	2	6	52968	52973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1040	NC_009464	CTT	2	6	52985	52990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1041	NC_009464	TCT	2	6	52993	52998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1042	NC_009464	TCT	2	6	53017	53022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1043	NC_009464	TCT	2	6	53089	53094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1044	NC_009464	GAG	2	6	53114	53119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918731
1045	NC_009464	GCC	2	6	53216	53221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918731
1046	NC_009464	TCT	2	6	53227	53232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1047	NC_009464	GTC	2	6	53243	53248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1048	NC_009464	TCG	2	6	53268	53273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1049	NC_009464	CTT	2	6	53363	53368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1050	NC_009464	AGC	2	6	53370	53375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1051	NC_009464	GAGT	2	8	53405	53412	25 %	25 %	50 %	0 %	147918731
1052	NC_009464	CTGC	2	8	53437	53444	0 %	25 %	25 %	50 %	147918731
1053	NC_009464	TGA	2	6	53458	53463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918731
1054	NC_009464	CTT	2	6	53501	53506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1055	NC_009464	CGG	2	6	53530	53535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918731
1056	NC_009464	TGG	2	6	53536	53541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918731
1057	NC_009464	ATC	2	6	53586	53591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918731
1058	NC_009464	CGT	2	6	53638	53643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1059	NC_009464	TGA	3	9	53647	53655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918731
1060	NC_009464	CTG	2	6	53778	53783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918731
1061	NC_009464	CTT	2	6	53788	53793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918731
1062	NC_009464	TTG	3	9	53819	53827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918731
1063	NC_009464	CCG	2	6	53843	53848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_009464	A	6	6	53879	53884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009464	TA	3	6	53900	53905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009464	TA	4	8	53954	53961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009464	AGA	2	6	54056	54061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918732
1068	NC_009464	CAGG	2	8	54066	54073	25 %	0 %	50 %	25 %	147918732
1069	NC_009464	CT	3	6	54087	54092	0 %	50 %	0 %	50 %	147918732
1070	NC_009464	CCT	2	6	54188	54193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918732
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1072	NC_009464	TGG	2	6	54223	54228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918732
1073	NC_009464	CCG	2	6	54241	54246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918732
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1076	NC_009464	CTC	2	6	54408	54413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918732
1077	NC_009464	GAT	2	6	54533	54538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918733
1078	NC_009464	TAC	2	6	54581	54586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918733
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1080	NC_009464	TCC	2	6	54603	54608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918733
1081	NC_009464	TCG	2	6	54705	54710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918733
1082	NC_009464	GAT	2	6	54740	54745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918733
1083	NC_009464	CTG	2	6	54746	54751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918733
1084	NC_009464	AG	3	6	54756	54761	50 %	0 %	50 %	0 %	147918733
1085	NC_009464	ATA	2	6	54787	54792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918733
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1087	NC_009464	CAG	2	6	54823	54828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918733
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1089	NC_009464	ATT	2	6	54931	54936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_009464	TAA	2	6	54982	54987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_009464	GTA	3	9	54988	54996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009464	AGG	2	6	55079	55084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009464	AAT	2	6	55117	55122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009464	CTG	2	6	55198	55203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_009464	CAG	2	6	55338	55343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_009464	GTCCCG	2	12	55373	55384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_009464	GTC	2	6	55598	55603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918734
1098	NC_009464	ACAAGC	2	12	55662	55673	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	147918734
1099	NC_009464	CTT	2	6	55680	55685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918734
1100	NC_009464	ACG	2	6	55752	55757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918734
1101	NC_009464	CGA	2	6	55855	55860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918734
1102	NC_009464	GAG	2	6	55877	55882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918734
1103	NC_009464	ACG	2	6	55932	55937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918734
1104	NC_009464	GAT	2	6	56030	56035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918734
1105	NC_009464	AG	3	6	56183	56188	50 %	0 %	50 %	0 %	147918734
1106	NC_009464	GCA	2	6	56207	56212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918734
1107	NC_009464	ATA	2	6	56300	56305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147918734
1108	NC_009464	ACA	2	6	56335	56340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_009464	AT	3	6	56341	56346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009464	T	6	6	56399	56404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009464	A	6	6	56442	56447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009464	GT	3	6	56462	56467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009464	TGG	2	6	56496	56501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_009464	CA	3	6	56591	56596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_009464	AGT	2	6	56610	56615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009464	TCC	2	6	56697	56702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_009464	T	7	7	56708	56714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009464	CTG	2	6	56806	56811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_009464	TGC	2	6	56866	56871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_009464	TCC	2	6	56973	56978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918735
1121	NC_009464	TGCC	2	8	57050	57057	0 %	25 %	25 %	50 %	147918735
1122	NC_009464	ATC	2	6	57078	57083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918735
1123	NC_009464	CGA	2	6	57133	57138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918735
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1125	NC_009464	TCC	2	6	57242	57247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918735
1126	NC_009464	ATGA	2	8	57248	57255	50 %	25 %	25 %	0 %	147918735
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1128	NC_009464	ACG	2	6	57360	57365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918735
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1254	NC_009464	GAT	2	6	63860	63865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918741
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