MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 1610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009440	TTTAT	2	10	1	10	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009440	CTCTT	2	10	2574	2583	0 %	60 %	0 %	40 %	146302788
3	NC_009440	TCTTA	2	10	3647	3656	20 %	60 %	0 %	20 %	146302790
4	NC_009440	TTTCC	2	10	4931	4940	0 %	60 %	0 %	40 %	146302792
5	NC_009440	TTCGG	2	10	6650	6659	0 %	40 %	40 %	20 %	146302794
6	NC_009440	GGTAG	2	10	7641	7650	20 %	20 %	60 %	0 %	146302795
7	NC_009440	CTATT	2	10	8521	8530	20 %	60 %	0 %	20 %	146302796
8	NC_009440	CTACA	2	10	9901	9910	40 %	20 %	0 %	40 %	146302797
9	NC_009440	CTAGT	2	10	11333	11342	20 %	40 %	20 %	20 %	146302799
10	NC_009440	AGTTA	2	10	12568	12577	40 %	40 %	20 %	0 %	146302800
11	NC_009440	TCTTT	2	10	13016	13025	0 %	80 %	0 %	20 %	146302800
12	NC_009440	TCCTC	2	10	14211	14220	0 %	40 %	0 %	60 %	146302801
13	NC_009440	TTCGG	2	10	14301	14310	0 %	40 %	40 %	20 %	146302801
14	NC_009440	TCTCA	2	10	20467	20476	20 %	40 %	0 %	40 %	146302806
15	NC_009440	GAAAT	2	10	21342	21351	60 %	20 %	20 %	0 %	146302808
16	NC_009440	TGTGG	2	10	22269	22278	0 %	40 %	60 %	0 %	146302809
17	NC_009440	ACCCA	2	10	23783	23792	40 %	0 %	0 %	60 %	146302811
18	NC_009440	TCTCC	2	10	25752	25761	0 %	40 %	0 %	60 %	146302815
19	NC_009440	GTCTT	2	10	26432	26441	0 %	60 %	20 %	20 %	146302815
20	NC_009440	ATGAT	2	10	27136	27145	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009440	TCATT	2	10	27368	27377	20 %	60 %	0 %	20 %	146302816
22	NC_009440	TGCCA	2	10	27457	27466	20 %	20 %	20 %	40 %	146302816
23	NC_009440	CCCTT	2	10	27522	27531	0 %	40 %	0 %	60 %	146302816
24	NC_009440	AGTTA	2	10	27565	27574	40 %	40 %	20 %	0 %	146302816
25	NC_009440	GATGA	2	10	33558	33567	40 %	20 %	40 %	0 %	146302819
26	NC_009440	TTATC	2	10	37713	37722	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009440	GTACC	2	10	39171	39180	20 %	20 %	20 %	40 %	146302826
28	NC_009440	TTAAC	2	10	40718	40727	40 %	40 %	0 %	20 %	146302828
29	NC_009440	CTACT	2	10	41094	41103	20 %	40 %	0 %	40 %	146302828
30	NC_009440	ATCTT	2	10	41445	41454	20 %	60 %	0 %	20 %	146302828
31	NC_009440	ATTCT	2	10	43193	43202	20 %	60 %	0 %	20 %	146302831
32	NC_009440	GGGAT	2	10	45126	45135	20 %	20 %	60 %	0 %	146302835
33	NC_009440	TAATT	2	10	47272	47281	40 %	60 %	0 %	0 %	146302838
34	NC_009440	TGAAT	2	10	47691	47700	40 %	40 %	20 %	0 %	146302838
35	NC_009440	TCAGG	2	10	48413	48422	20 %	20 %	40 %	20 %	146302838
36	NC_009440	GAGAA	2	10	48583	48592	60 %	0 %	40 %	0 %	146302838
37	NC_009440	AGGGA	2	10	51760	51769	40 %	0 %	60 %	0 %	146302840
38	NC_009440	CTAAA	2	10	54720	54729	60 %	20 %	0 %	20 %	146302844
39	NC_009440	AAAGA	2	10	54840	54849	80 %	0 %	20 %	0 %	146302844
40	NC_009440	TCTTT	2	10	56651	56660	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009440	AGGAA	2	10	57441	57450	60 %	0 %	40 %	0 %	146302845
42	NC_009440	AGTTC	2	10	57536	57545	20 %	40 %	20 %	20 %	146302845
43	NC_009440	CAGTC	2	10	58028	58037	20 %	20 %	20 %	40 %	146302845
44	NC_009440	ATTTA	2	10	58907	58916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009440	AGAGG	2	10	59813	59822	40 %	0 %	60 %	0 %	146302848
46	NC_009440	GGATA	2	10	61241	61250	40 %	20 %	40 %	0 %	146302850
47	NC_009440	CTTTA	2	10	62390	62399	20 %	60 %	0 %	20 %	146302852
48	NC_009440	GGGAA	2	10	63223	63232	40 %	0 %	60 %	0 %	146302853
49	NC_009440	TAGAA	2	10	63497	63506	60 %	20 %	20 %	0 %	146302853
50	NC_009440	TAGGC	2	10	67255	67264	20 %	20 %	40 %	20 %	146302858
51	NC_009440	TTACC	2	10	67816	67825	20 %	40 %	0 %	40 %	146302859
52	NC_009440	AAAGA	2	10	68486	68495	80 %	0 %	20 %	0 %	146302860
53	NC_009440	AAGTG	2	10	68906	68915	40 %	20 %	40 %	0 %	146302860
54	NC_009440	CACTC	2	10	70929	70938	20 %	20 %	0 %	60 %	146302863
55	NC_009440	GAAAG	2	10	72358	72367	60 %	0 %	40 %	0 %	146302867
56	NC_009440	TTTAG	2	10	72518	72527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009440	GGAAA	2	10	72678	72687	60 %	0 %	40 %	0 %	146302868
58	NC_009440	AGATG	2	10	73002	73011	40 %	20 %	40 %	0 %	146302868
59	NC_009440	GACAA	2	10	74100	74109	60 %	0 %	20 %	20 %	146302869
60	NC_009440	GTAAC	2	10	75337	75346	40 %	20 %	20 %	20 %	146302869
61	NC_009440	CCTTG	2	10	77157	77166	0 %	40 %	20 %	40 %	146302871
62	NC_009440	GGGAA	2	10	79042	79051	40 %	0 %	60 %	0 %	146302873
63	NC_009440	AGGGA	2	10	81091	81100	40 %	0 %	60 %	0 %	146302874
64	NC_009440	CCTTA	2	10	82677	82686	20 %	40 %	0 %	40 %	146302875
65	NC_009440	CAACC	2	10	83801	83810	40 %	0 %	0 %	60 %	146302876
66	NC_009440	GCCAG	2	10	84114	84123	20 %	0 %	40 %	40 %	146302876
67	NC_009440	CGAGG	2	10	87870	87879	20 %	0 %	60 %	20 %	146302883
68	NC_009440	ACTAT	2	10	88627	88636	40 %	40 %	0 %	20 %	146302886
69	NC_009440	AGGAG	2	10	92312	92321	40 %	0 %	60 %	0 %	146302894
70	NC_009440	GAGAA	2	10	92622	92631	60 %	0 %	40 %	0 %	146302895
71	NC_009440	CTTAA	2	10	95031	95040	40 %	40 %	0 %	20 %	146302899
72	NC_009440	CAATC	2	10	95680	95689	40 %	20 %	0 %	40 %	146302899
73	NC_009440	ATATT	2	10	96788	96797	40 %	60 %	0 %	0 %	146302901
74	NC_009440	TAAAC	2	10	97153	97162	60 %	20 %	0 %	20 %	146302901
75	NC_009440	GAATC	2	10	100305	100314	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009440	CTGAT	2	10	106233	106242	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009440	AGGGC	2	10	106298	106307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_009440	AAAGA	2	10	107534	107543	80 %	0 %	20 %	0 %	146302916
79	NC_009440	AGAAA	2	10	107555	107564	80 %	0 %	20 %	0 %	146302916
80	NC_009440	ATTCA	2	10	107748	107757	40 %	40 %	0 %	20 %	146302917
81	NC_009440	TAAAA	2	10	107866	107875	80 %	20 %	0 %	0 %	146302917
82	NC_009440	ACTCC	2	10	109164	109173	20 %	20 %	0 %	60 %	146302919
83	NC_009440	CACTA	2	10	112696	112705	40 %	20 %	0 %	40 %	146302923
84	NC_009440	AGTTA	2	10	113362	113371	40 %	40 %	20 %	0 %	146302925
85	NC_009440	GTAGG	2	10	114083	114092	20 %	20 %	60 %	0 %	146302927
86	NC_009440	GAGCT	2	10	115533	115542	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009440	TATAA	2	10	118064	118073	60 %	40 %	0 %	0 %	146302931
88	NC_009440	GATCT	2	10	118727	118736	20 %	40 %	20 %	20 %	146302932
89	NC_009440	TCAGG	2	10	119999	120008	20 %	20 %	40 %	20 %	146302933
90	NC_009440	CATCT	2	10	121488	121497	20 %	40 %	0 %	40 %	146302935
91	NC_009440	ATGAG	2	10	126362	126371	40 %	20 %	40 %	0 %	146302941
92	NC_009440	GAAGA	2	10	127302	127311	60 %	0 %	40 %	0 %	146302942
93	NC_009440	GAAAA	2	10	127584	127593	80 %	0 %	20 %	0 %	146302942
94	NC_009440	TGGGA	2	10	129050	129059	20 %	20 %	60 %	0 %	146302944
95	NC_009440	TCTCC	2	10	130916	130925	0 %	40 %	0 %	60 %	146302947
96	NC_009440	CATCT	2	10	135232	135241	20 %	40 %	0 %	40 %	146302951
97	NC_009440	CCCCA	2	10	140477	140486	20 %	0 %	0 %	80 %	146302959
98	NC_009440	ATTTC	2	10	141745	141754	20 %	60 %	0 %	20 %	146302960
99	NC_009440	CTTCT	2	10	143122	143131	0 %	60 %	0 %	40 %	146302962
100	NC_009440	GGTAT	2	10	143423	143432	20 %	40 %	40 %	0 %	146302963
101	NC_009440	ACTGA	2	10	144809	144818	40 %	20 %	20 %	20 %	146302964
102	NC_009440	GGTAA	2	10	146519	146528	40 %	20 %	40 %	0 %	146302967
103	NC_009440	CATTT	2	10	146571	146580	20 %	60 %	0 %	20 %	146302967
104	NC_009440	AGAGC	2	10	147176	147185	40 %	0 %	40 %	20 %	146302968
105	NC_009440	ACGCG	2	10	148844	148853	20 %	0 %	40 %	40 %	146302969
106	NC_009440	CCTCA	2	10	153273	153282	20 %	20 %	0 %	60 %	146302974
107	NC_009440	GCCTT	2	10	153906	153915	0 %	40 %	20 %	40 %	146302975
108	NC_009440	CTTAA	2	10	154519	154528	40 %	40 %	0 %	20 %	146302975
109	NC_009440	TTACG	2	10	154832	154841	20 %	40 %	20 %	20 %	146302975
110	NC_009440	TAGAT	2	10	155204	155213	40 %	40 %	20 %	0 %	146302976
111	NC_009440	GTTAG	2	10	156021	156030	20 %	40 %	40 %	0 %	146302977
112	NC_009440	CATGA	2	10	156209	156218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009440	GTTAG	2	10	157908	157917	20 %	40 %	40 %	0 %	146302979
114	NC_009440	TTCCC	2	10	159012	159021	0 %	40 %	0 %	60 %	146302980
115	NC_009440	GCAAT	2	10	164193	164202	40 %	20 %	20 %	20 %	146302985
116	NC_009440	TCTGC	2	10	165715	165724	0 %	40 %	20 %	40 %	146302986
117	NC_009440	CGGAA	2	10	165977	165986	40 %	0 %	40 %	20 %	146302986
118	NC_009440	AGAGG	2	10	166828	166837	40 %	0 %	60 %	0 %	146302987
119	NC_009440	GTTCA	2	10	167678	167687	20 %	40 %	20 %	20 %	146302989
120	NC_009440	GGGTT	2	10	167867	167876	0 %	40 %	60 %	0 %	146302990
121	NC_009440	CTCAA	2	10	169486	169495	40 %	20 %	0 %	40 %	146302991
122	NC_009440	TAACA	2	10	170567	170576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009440	GAGCG	2	10	172783	172792	20 %	0 %	60 %	20 %	146302995
124	NC_009440	CGCGA	2	10	173339	173348	20 %	0 %	40 %	40 %	146302995
125	NC_009440	CAAGG	2	10	173917	173926	40 %	0 %	40 %	20 %	146302997
126	NC_009440	TGAGC	2	10	174651	174660	20 %	20 %	40 %	20 %	146302997
127	NC_009440	ATTTG	2	10	174847	174856	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009440	AGAGG	2	10	175772	175781	40 %	0 %	60 %	0 %	146302999
129	NC_009440	TAAGC	2	10	178974	178983	40 %	20 %	20 %	20 %	146303002
130	NC_009440	GTGGA	2	10	183139	183148	20 %	20 %	60 %	0 %	146303006
131	NC_009440	TTACC	2	10	184115	184124	20 %	40 %	0 %	40 %	146303007
132	NC_009440	AGGGT	2	10	185686	185695	20 %	20 %	60 %	0 %	146303008
133	NC_009440	CTTAA	2	10	187348	187357	40 %	40 %	0 %	20 %	146303011
134	NC_009440	GGTCT	2	10	187500	187509	0 %	40 %	40 %	20 %	146303011
135	NC_009440	GAAAG	2	10	188881	188890	60 %	0 %	40 %	0 %	146303013
136	NC_009440	ACAGC	2	10	189158	189167	40 %	0 %	20 %	40 %	146303013
137	NC_009440	TGAAA	2	10	190842	190851	60 %	20 %	20 %	0 %	146303016
138	NC_009440	GAAAG	2	10	190912	190921	60 %	0 %	40 %	0 %	146303016
139	NC_009440	TTCCA	2	10	193265	193274	20 %	40 %	0 %	40 %	146303017
140	NC_009440	CCTTC	2	10	194394	194403	0 %	40 %	0 %	60 %	146303018
141	NC_009440	TTCTT	2	10	194511	194520	0 %	80 %	0 %	20 %	146303018
142	NC_009440	ATAAG	2	10	194711	194720	60 %	20 %	20 %	0 %	146303018
143	NC_009440	ATCAT	2	10	195662	195671	40 %	40 %	0 %	20 %	146303020
144	NC_009440	AGTTA	2	10	196198	196207	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009440	CTTCT	2	10	197600	197609	0 %	60 %	0 %	40 %	146303022
146	NC_009440	CCTTT	2	10	202282	202291	0 %	60 %	0 %	40 %	146303026
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150	NC_009440	TATCC	2	10	204517	204526	20 %	40 %	0 %	40 %	146303028
151	NC_009440	AAAAT	2	10	206032	206041	80 %	20 %	0 %	0 %	146303031
152	NC_009440	CACAT	2	10	207010	207019	40 %	20 %	0 %	40 %	146303031
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154	NC_009440	GCCTG	2	10	213079	213088	0 %	20 %	40 %	40 %	146303037
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156	NC_009440	CAGCC	2	10	214143	214152	20 %	0 %	20 %	60 %	146303039
157	NC_009440	ATTGC	2	10	215360	215369	20 %	40 %	20 %	20 %	146303040
158	NC_009440	TATAC	2	10	218023	218032	40 %	40 %	0 %	20 %	146303042
159	NC_009440	GGAAG	2	10	218185	218194	40 %	0 %	60 %	0 %	146303042
160	NC_009440	AAAGT	2	10	222965	222974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009440	AGTCC	2	10	224755	224764	20 %	20 %	20 %	40 %	146303052
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163	NC_009440	GCCTC	2	10	227544	227553	0 %	20 %	20 %	60 %	146303055
164	NC_009440	ATCCC	2	10	229820	229829	20 %	20 %	0 %	60 %	146303057
165	NC_009440	AGCCT	2	10	231460	231469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
166	NC_009440	ATTAT	2	10	232655	232664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009440	CAGGA	2	10	233728	233737	40 %	0 %	40 %	20 %	146303060
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169	NC_009440	CCTTC	2	10	238715	238724	0 %	40 %	0 %	60 %	146303063
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175	NC_009440	GATGG	2	10	251556	251565	20 %	20 %	60 %	0 %	146303080
176	NC_009440	AGTTG	2	10	252052	252061	20 %	40 %	40 %	0 %	146303080
177	NC_009440	GGCAG	2	10	252594	252603	20 %	0 %	60 %	20 %	146303080
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179	NC_009440	TAGGT	2	10	255010	255019	20 %	40 %	40 %	0 %	146303082
180	NC_009440	GTTAG	2	10	257364	257373	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
181	NC_009440	GGTTC	2	10	257836	257845	0 %	40 %	40 %	20 %	146303085
182	NC_009440	CTGTA	2	10	260598	260607	20 %	40 %	20 %	20 %	146303087
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189	NC_009440	ATCAT	2	10	272075	272084	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_009440	TATCC	2	10	272465	272474	20 %	40 %	0 %	40 %	146303100
191	NC_009440	CTCTT	2	10	272782	272791	0 %	60 %	0 %	40 %	146303100
192	NC_009440	CCAGA	2	10	273292	273301	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_009440	TTCAT	2	10	274833	274842	20 %	60 %	0 %	20 %	146303103
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199	NC_009440	ATATC	2	10	282844	282853	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_009440	GTTCT	2	10	283154	283163	0 %	60 %	20 %	20 %	146303112
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204	NC_009440	CTAGG	2	10	285704	285713	20 %	20 %	40 %	20 %	146303114
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214	NC_009440	CAGGA	2	10	298336	298345	40 %	0 %	40 %	20 %	146303128
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219	NC_009440	AGATT	2	10	303509	303518	40 %	40 %	20 %	0 %	146303134
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221	NC_009440	TAAAT	2	10	307844	307853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_009440	AAGTC	2	10	310899	310908	40 %	20 %	20 %	20 %	146303142
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234	NC_009440	TCTCC	2	10	327505	327514	0 %	40 %	0 %	60 %	146303163
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236	NC_009440	TCACC	2	10	328969	328978	20 %	20 %	0 %	60 %	146303165
237	NC_009440	TGACT	2	10	330398	330407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
238	NC_009440	CCATT	2	10	331143	331152	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
239	NC_009440	CCCTG	2	10	331492	331501	0 %	20 %	20 %	60 %	146303168
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242	NC_009440	TGAAT	2	10	333683	333692	40 %	40 %	20 %	0 %	146303170
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245	NC_009440	TGAAG	2	10	336880	336889	40 %	20 %	40 %	0 %	146303173
246	NC_009440	AGGTC	2	10	336928	336937	20 %	20 %	40 %	20 %	146303174
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252	NC_009440	ATGGG	2	10	342896	342905	20 %	20 %	60 %	0 %	146303179
253	NC_009440	CCTTC	2	10	347340	347349	0 %	40 %	0 %	60 %	146303183
254	NC_009440	TTTCC	2	10	347526	347535	0 %	60 %	0 %	40 %	146303183
255	NC_009440	TGACT	2	10	349401	349410	20 %	40 %	20 %	20 %	146303184
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257	NC_009440	TTCCC	2	10	356324	356333	0 %	40 %	0 %	60 %	146303189
258	NC_009440	CCTCA	2	10	357151	357160	20 %	20 %	0 %	60 %	146303190
259	NC_009440	TGAAT	2	10	362414	362423	40 %	40 %	20 %	0 %	146303194
260	NC_009440	AATTT	2	10	363847	363856	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_009440	GAGAG	2	10	367468	367477	40 %	0 %	60 %	0 %	146303201
262	NC_009440	AGGGG	2	10	369289	369298	20 %	0 %	80 %	0 %	146303202
263	NC_009440	GCGTT	2	10	372656	372665	0 %	40 %	40 %	20 %	146303205
264	NC_009440	ACTCC	2	10	373148	373157	20 %	20 %	0 %	60 %	146303206
265	NC_009440	GGTAA	2	10	373942	373951	40 %	20 %	40 %	0 %	146303207
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267	NC_009440	CCAGA	2	10	376608	376617	40 %	0 %	20 %	40 %	146303209
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