MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 4920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009440	TTTC	2	8	167	174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009440	CAGA	2	8	612	619	50 %	0 %	25 %	25 %	146302786
3	NC_009440	AGGG	2	8	1003	1010	25 %	0 %	75 %	0 %	146302786
4	NC_009440	AGGG	2	8	1816	1823	25 %	0 %	75 %	0 %	146302787
5	NC_009440	CAGG	2	8	2517	2524	25 %	0 %	50 %	25 %	146302788
6	NC_009440	ACAT	2	8	3214	3221	50 %	25 %	0 %	25 %	146302789
7	NC_009440	TAGA	2	8	3895	3902	50 %	25 %	25 %	0 %	146302790
8	NC_009440	AAGG	2	8	4058	4065	50 %	0 %	50 %	0 %	146302790
9	NC_009440	GATA	2	8	4655	4662	50 %	25 %	25 %	0 %	146302791
10	NC_009440	AGAT	2	8	4987	4994	50 %	25 %	25 %	0 %	146302792
11	NC_009440	TGAT	2	8	7821	7828	25 %	50 %	25 %	0 %	146302795
12	NC_009440	GAAG	2	8	8041	8048	50 %	0 %	50 %	0 %	146302796
13	NC_009440	GAAA	2	8	8051	8058	75 %	0 %	25 %	0 %	146302796
14	NC_009440	CGGA	2	8	8532	8539	25 %	0 %	50 %	25 %	146302796
15	NC_009440	CCAA	2	8	9773	9780	50 %	0 %	0 %	50 %	146302797
16	NC_009440	CGTG	2	8	10091	10098	0 %	25 %	50 %	25 %	146302798
17	NC_009440	ACAT	2	8	10708	10715	50 %	25 %	0 %	25 %	146302798
18	NC_009440	CTTC	2	8	11492	11499	0 %	50 %	0 %	50 %	146302799
19	NC_009440	ATTT	2	8	12541	12548	25 %	75 %	0 %	0 %	146302800
20	NC_009440	GTTC	2	8	12657	12664	0 %	50 %	25 %	25 %	146302800
21	NC_009440	AGCT	2	8	13150	13157	25 %	25 %	25 %	25 %	146302800
22	NC_009440	CCAA	2	8	13331	13338	50 %	0 %	0 %	50 %	146302800
23	NC_009440	ACGA	2	8	13739	13746	50 %	0 %	25 %	25 %	146302801
24	NC_009440	TCTA	2	8	13894	13901	25 %	50 %	0 %	25 %	146302801
25	NC_009440	TGGC	2	8	14504	14511	0 %	25 %	50 %	25 %	146302801
26	NC_009440	ATTT	2	8	14568	14575	25 %	75 %	0 %	0 %	146302802
27	NC_009440	CCTA	2	8	15084	15091	25 %	25 %	0 %	50 %	146302802
28	NC_009440	GATT	2	8	15217	15224	25 %	50 %	25 %	0 %	146302802
29	NC_009440	ATCC	2	8	15931	15938	25 %	25 %	0 %	50 %	146302803
30	NC_009440	CCTT	2	8	16554	16561	0 %	50 %	0 %	50 %	146302803
31	NC_009440	AATT	2	8	16612	16619	50 %	50 %	0 %	0 %	146302803
32	NC_009440	CTGG	2	8	17436	17443	0 %	25 %	50 %	25 %	146302804
33	NC_009440	TAGT	2	8	17700	17707	25 %	50 %	25 %	0 %	146302804
34	NC_009440	AGTT	2	8	17781	17788	25 %	50 %	25 %	0 %	146302804
35	NC_009440	TAGT	2	8	17799	17806	25 %	50 %	25 %	0 %	146302804
36	NC_009440	GGTT	2	8	18005	18012	0 %	50 %	50 %	0 %	146302804
37	NC_009440	TGCT	2	8	18251	18258	0 %	50 %	25 %	25 %	146302805
38	NC_009440	TAAC	2	8	18505	18512	50 %	25 %	0 %	25 %	146302805
39	NC_009440	GGCT	2	8	18557	18564	0 %	25 %	50 %	25 %	146302805
40	NC_009440	GAGG	2	8	18806	18813	25 %	0 %	75 %	0 %	146302805
41	NC_009440	GACG	2	8	19127	19134	25 %	0 %	50 %	25 %	146302805
42	NC_009440	AAGG	2	8	19368	19375	50 %	0 %	50 %	0 %	146302805
43	NC_009440	GTTA	2	8	20245	20252	25 %	50 %	25 %	0 %	146302806
44	NC_009440	ACCT	2	8	21668	21675	25 %	25 %	0 %	50 %	146302808
45	NC_009440	CTTT	2	8	21959	21966	0 %	75 %	0 %	25 %	146302809
46	NC_009440	GATA	2	8	22969	22976	50 %	25 %	25 %	0 %	146302809
47	NC_009440	AATG	2	8	23396	23403	50 %	25 %	25 %	0 %	146302810
48	NC_009440	TAAA	2	8	23419	23426	75 %	25 %	0 %	0 %	146302810
49	NC_009440	TTAT	2	8	23811	23818	25 %	75 %	0 %	0 %	146302811
50	NC_009440	ATGT	2	8	24033	24040	25 %	50 %	25 %	0 %	146302811
51	NC_009440	GTGG	2	8	24060	24067	0 %	25 %	75 %	0 %	146302811
52	NC_009440	CTTC	2	8	24520	24527	0 %	50 %	0 %	50 %	146302812
53	NC_009440	GCCA	2	8	24768	24775	25 %	0 %	25 %	50 %	146302813
54	NC_009440	CAAA	2	8	24824	24831	75 %	0 %	0 %	25 %	146302813
55	NC_009440	TGAA	2	8	25327	25334	50 %	25 %	25 %	0 %	146302814
56	NC_009440	TCCA	2	8	26687	26694	25 %	25 %	0 %	50 %	146302815
57	NC_009440	TAAG	2	8	27166	27173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009440	TTGA	2	8	27187	27194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009440	GATT	2	8	27717	27724	25 %	50 %	25 %	0 %	146302816
60	NC_009440	TGAT	2	8	28254	28261	25 %	50 %	25 %	0 %	146302816
61	NC_009440	AGAT	2	8	28561	28568	50 %	25 %	25 %	0 %	146302817
62	NC_009440	CAAT	2	8	28699	28706	50 %	25 %	0 %	25 %	146302817
63	NC_009440	CTGA	2	8	29303	29310	25 %	25 %	25 %	25 %	146302818
64	NC_009440	GAAC	2	8	29533	29540	50 %	0 %	25 %	25 %	146302818
65	NC_009440	GACA	2	8	30847	30854	50 %	0 %	25 %	25 %	146302818
66	NC_009440	GAAG	2	8	31838	31845	50 %	0 %	50 %	0 %	146302818
67	NC_009440	AGTT	2	8	32121	32128	25 %	50 %	25 %	0 %	146302818
68	NC_009440	TGAG	2	8	32164	32171	25 %	25 %	50 %	0 %	146302818
69	NC_009440	GAAG	2	8	32301	32308	50 %	0 %	50 %	0 %	146302819
70	NC_009440	CTCC	2	8	32707	32714	0 %	25 %	0 %	75 %	146302819
71	NC_009440	AGAA	2	8	32732	32739	75 %	0 %	25 %	0 %	146302819
72	NC_009440	GCTG	2	8	33368	33375	0 %	25 %	50 %	25 %	146302819
73	NC_009440	TCAG	2	8	33581	33588	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
74	NC_009440	AGTC	2	8	33833	33840	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
75	NC_009440	CTTC	2	8	33842	33849	0 %	50 %	0 %	50 %	146302819
76	NC_009440	GGAG	2	8	33962	33969	25 %	0 %	75 %	0 %	146302819
77	NC_009440	TCAG	2	8	34431	34438	25 %	25 %	25 %	25 %	146302819
78	NC_009440	TCCA	2	8	34744	34751	25 %	25 %	0 %	50 %	146302819
79	NC_009440	TAGA	2	8	34783	34790	50 %	25 %	25 %	0 %	146302819
80	NC_009440	GTTG	2	8	34806	34813	0 %	50 %	50 %	0 %	146302819
81	NC_009440	ATAA	2	8	34832	34839	75 %	25 %	0 %	0 %	146302820
82	NC_009440	CAAT	2	8	35045	35052	50 %	25 %	0 %	25 %	146302820
83	NC_009440	CCAA	2	8	35947	35954	50 %	0 %	0 %	50 %	146302820
84	NC_009440	TGAA	2	8	36005	36012	50 %	25 %	25 %	0 %	146302820
85	NC_009440	CAAT	2	8	36021	36028	50 %	25 %	0 %	25 %	146302821
86	NC_009440	GCAG	2	8	36696	36703	25 %	0 %	50 %	25 %	146302822
87	NC_009440	TAAT	2	8	36760	36767	50 %	50 %	0 %	0 %	146302822
88	NC_009440	CGTT	2	8	37035	37042	0 %	50 %	25 %	25 %	146302823
89	NC_009440	TTCT	2	8	37231	37238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009440	ATCT	2	8	37268	37275	25 %	50 %	0 %	25 %	146302824
91	NC_009440	TTAG	2	8	38097	38104	25 %	50 %	25 %	0 %	146302825
92	NC_009440	AAGA	2	8	39341	39348	75 %	0 %	25 %	0 %	146302826
93	NC_009440	ACCC	2	8	39384	39391	25 %	0 %	0 %	75 %	146302826
94	NC_009440	GAAG	2	8	39932	39939	50 %	0 %	50 %	0 %	146302827
95	NC_009440	GAAT	2	8	40289	40296	50 %	25 %	25 %	0 %	146302828
96	NC_009440	AATA	2	8	41007	41014	75 %	25 %	0 %	0 %	146302828
97	NC_009440	AGTC	2	8	41120	41127	25 %	25 %	25 %	25 %	146302828
98	NC_009440	AAGG	2	8	41194	41201	50 %	0 %	50 %	0 %	146302828
99	NC_009440	AGAC	2	8	41655	41662	50 %	0 %	25 %	25 %	146302829
100	NC_009440	ACCT	2	8	42657	42664	25 %	25 %	0 %	50 %	146302830
101	NC_009440	CTGG	2	8	42912	42919	0 %	25 %	50 %	25 %	146302831
102	NC_009440	GATT	2	8	43674	43681	25 %	50 %	25 %	0 %	146302832
103	NC_009440	TGCT	2	8	44502	44509	0 %	50 %	25 %	25 %	146302834
104	NC_009440	AGGT	2	8	44919	44926	25 %	25 %	50 %	0 %	146302834
105	NC_009440	CATC	2	8	45684	45691	25 %	25 %	0 %	50 %	146302835
106	NC_009440	TTGA	2	8	46482	46489	25 %	50 %	25 %	0 %	146302836
107	NC_009440	TTCC	2	8	46723	46730	0 %	50 %	0 %	50 %	146302836
108	NC_009440	CTTT	2	8	46941	46948	0 %	75 %	0 %	25 %	146302837
109	NC_009440	GTAA	2	8	47006	47013	50 %	25 %	25 %	0 %	146302837
110	NC_009440	TCAT	2	8	47290	47297	25 %	50 %	0 %	25 %	146302838
111	NC_009440	AGAT	2	8	47858	47865	50 %	25 %	25 %	0 %	146302838
112	NC_009440	ATCC	2	8	47949	47956	25 %	25 %	0 %	50 %	146302838
113	NC_009440	AGGA	2	8	49440	49447	50 %	0 %	50 %	0 %	146302839
114	NC_009440	GCTA	2	8	49529	49536	25 %	25 %	25 %	25 %	146302839
115	NC_009440	AGAC	2	8	49809	49816	50 %	0 %	25 %	25 %	146302839
116	NC_009440	AGGG	2	8	50142	50149	25 %	0 %	75 %	0 %	146302839
117	NC_009440	TATC	2	8	50986	50993	25 %	50 %	0 %	25 %	146302839
118	NC_009440	GTAT	2	8	52211	52218	25 %	50 %	25 %	0 %	146302842
119	NC_009440	GGAA	2	8	52373	52380	50 %	0 %	50 %	0 %	146302842
120	NC_009440	CAGA	2	8	53438	53445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_009440	CGAA	2	8	54501	54508	50 %	0 %	25 %	25 %	146302844
122	NC_009440	GGAA	2	8	54681	54688	50 %	0 %	50 %	0 %	146302844
123	NC_009440	CAAG	2	8	54708	54715	50 %	0 %	25 %	25 %	146302844
124	NC_009440	ATCA	2	8	55654	55661	50 %	25 %	0 %	25 %	146302844
125	NC_009440	AAAT	2	8	55892	55899	75 %	25 %	0 %	0 %	146302844
126	NC_009440	ACTT	2	8	56964	56971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009440	AGTT	2	8	57056	57063	25 %	50 %	25 %	0 %	146302845
128	NC_009440	GTGG	2	8	57463	57470	0 %	25 %	75 %	0 %	146302845
129	NC_009440	CATT	2	8	57842	57849	25 %	50 %	0 %	25 %	146302845
130	NC_009440	TTCT	2	8	58645	58652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009440	GAAG	2	8	59054	59061	50 %	0 %	50 %	0 %	146302846
132	NC_009440	GGAA	2	8	59696	59703	50 %	0 %	50 %	0 %	146302848
133	NC_009440	ATAG	2	8	59823	59830	50 %	25 %	25 %	0 %	146302848
134	NC_009440	CTTT	2	8	60439	60446	0 %	75 %	0 %	25 %	146302849
135	NC_009440	ATGG	2	8	60880	60887	25 %	25 %	50 %	0 %	146302849
136	NC_009440	GCAG	2	8	61045	61052	25 %	0 %	50 %	25 %	146302850
137	NC_009440	AGGG	2	8	61268	61275	25 %	0 %	75 %	0 %	146302850
138	NC_009440	AAAT	2	8	61391	61398	75 %	25 %	0 %	0 %	146302850
139	NC_009440	AAAG	2	8	61405	61412	75 %	0 %	25 %	0 %	146302850
140	NC_009440	GAGG	2	8	61798	61805	25 %	0 %	75 %	0 %	146302851
141	NC_009440	AATG	2	8	62138	62145	50 %	25 %	25 %	0 %	146302851
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