MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009440	AAGA	2	8	199118	199125	75 %	0 %	25 %	0 %	146303023
3502	NC_009440	AT	3	6	199164	199169	50 %	50 %	0 %	0 %	146303023
3503	NC_009440	ACC	2	6	199182	199187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303023
3504	NC_009440	CCT	2	6	199223	199228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303023
3505	NC_009440	AT	3	6	199272	199277	50 %	50 %	0 %	0 %	146303023
3506	NC_009440	GCT	2	6	199374	199379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303023
3507	NC_009440	AGA	2	6	199435	199440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303023
3508	NC_009440	TAGA	2	8	199463	199470	50 %	25 %	25 %	0 %	146303023
3509	NC_009440	TCA	2	6	199482	199487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303023
3510	NC_009440	TCCC	2	8	199573	199580	0 %	25 %	0 %	75 %	146303023
3511	NC_009440	CTG	2	6	199594	199599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303023
3512	NC_009440	AG	3	6	199619	199624	50 %	0 %	50 %	0 %	146303023
3513	NC_009440	CAA	3	9	199720	199728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303023
3514	NC_009440	GA	3	6	199729	199734	50 %	0 %	50 %	0 %	146303023
3515	NC_009440	A	6	6	199847	199852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009440	TAA	2	6	199957	199962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303024
3517	NC_009440	TCT	2	6	200022	200027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303024
3518	NC_009440	ATC	2	6	200057	200062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303024
3519	NC_009440	TTC	2	6	200169	200174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303024
3520	NC_009440	AAGA	2	8	200304	200311	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009440	TAA	2	6	200335	200340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009440	TCG	2	6	200368	200373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_009440	TC	3	6	200443	200448	0 %	50 %	0 %	50 %	146303025
3524	NC_009440	CTC	2	6	200475	200480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303025
3525	NC_009440	CTCC	2	8	200523	200530	0 %	25 %	0 %	75 %	146303025
3526	NC_009440	CGG	2	6	200583	200588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146303025
3527	NC_009440	CCT	2	6	200673	200678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303025
3528	NC_009440	GAC	2	6	200686	200691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303025
3529	NC_009440	AC	3	6	200790	200795	50 %	0 %	0 %	50 %	146303025
3530	NC_009440	CTC	2	6	200898	200903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303025
3531	NC_009440	TC	3	6	200902	200907	0 %	50 %	0 %	50 %	146303025
3532	NC_009440	TCC	2	6	201029	201034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303025
3533	NC_009440	GTA	2	6	201063	201068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303025
3534	NC_009440	AT	3	6	201077	201082	50 %	50 %	0 %	0 %	146303025
3535	NC_009440	TTCT	2	8	201227	201234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3536	NC_009440	AGTT	2	8	201287	201294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_009440	TC	3	6	201343	201348	0 %	50 %	0 %	50 %	146303026
3538	NC_009440	GAG	2	6	201358	201363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303026
3539	NC_009440	GTA	2	6	201448	201453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303026
3540	NC_009440	TTC	2	6	201479	201484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303026
3541	NC_009440	GT	3	6	201487	201492	0 %	50 %	50 %	0 %	146303026
3542	NC_009440	TCC	2	6	201515	201520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
3543	NC_009440	CA	3	6	201718	201723	50 %	0 %	0 %	50 %	146303026
3544	NC_009440	TCG	2	6	201752	201757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303026
3545	NC_009440	CTC	2	6	201778	201783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
3546	NC_009440	ATCT	2	8	202048	202055	25 %	50 %	0 %	25 %	146303026
3547	NC_009440	CATG	2	8	202112	202119	25 %	25 %	25 %	25 %	146303026
3548	NC_009440	TCC	2	6	202202	202207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303026
3549	NC_009440	CCTTT	2	10	202282	202291	0 %	60 %	0 %	40 %	146303026
3550	NC_009440	CCCA	2	8	202407	202414	25 %	0 %	0 %	75 %	146303026
3551	NC_009440	TCT	2	6	202478	202483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_009440	GAA	2	6	202571	202576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
3553	NC_009440	CT	3	6	202594	202599	0 %	50 %	0 %	50 %	146303027
3554	NC_009440	AGT	2	6	202609	202614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303027
3555	NC_009440	TGAAG	2	10	202658	202667	40 %	20 %	40 %	0 %	146303027
3556	NC_009440	TCA	2	6	202678	202683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303027
3557	NC_009440	GTT	2	6	202685	202690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303027
3558	NC_009440	TCC	2	6	202769	202774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
3559	NC_009440	CT	3	6	202811	202816	0 %	50 %	0 %	50 %	146303027
3560	NC_009440	GAA	2	6	202838	202843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
3561	NC_009440	AAC	2	6	202859	202864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303027
3562	NC_009440	AGA	2	6	202866	202871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303027
3563	NC_009440	TCC	2	6	202901	202906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
3564	NC_009440	TCC	2	6	202916	202921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303027
3565	NC_009440	CCAAT	2	10	202956	202965	40 %	20 %	0 %	40 %	146303027
3566	NC_009440	TTG	2	6	203184	203189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303027
3567	NC_009440	CCAT	2	8	203222	203229	25 %	25 %	0 %	50 %	146303027
3568	NC_009440	CT	3	6	203252	203257	0 %	50 %	0 %	50 %	146303027
3569	NC_009440	ATG	2	6	203343	203348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303027
3570	NC_009440	TTGA	2	8	203451	203458	25 %	50 %	25 %	0 %	146303027
3571	NC_009440	ACAA	2	8	203490	203497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3572	NC_009440	A	6	6	203503	203508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_009440	GTTA	2	8	203564	203571	25 %	50 %	25 %	0 %	146303028
3574	NC_009440	CT	3	6	203705	203710	0 %	50 %	0 %	50 %	146303028
3575	NC_009440	CAT	2	6	203770	203775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303028
3576	NC_009440	ATA	2	6	203785	203790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146303028
3577	NC_009440	TCG	2	6	203852	203857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303028
3578	NC_009440	GA	3	6	203882	203887	50 %	0 %	50 %	0 %	146303028
3579	NC_009440	TTC	2	6	203904	203909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303028
3580	NC_009440	TTCC	2	8	203921	203928	0 %	50 %	0 %	50 %	146303028
3581	NC_009440	ATT	2	6	203950	203955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146303028
3582	NC_009440	TCA	2	6	204032	204037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303028
3583	NC_009440	GTT	2	6	204118	204123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303028
3584	NC_009440	CT	3	6	204222	204227	0 %	50 %	0 %	50 %	146303028
3585	NC_009440	CCA	2	6	204267	204272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146303028
3586	NC_009440	ACTCT	2	10	204357	204366	20 %	40 %	0 %	40 %	146303028
3587	NC_009440	CT	3	6	204411	204416	0 %	50 %	0 %	50 %	146303028
3588	NC_009440	CTC	2	6	204485	204490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303028
3589	NC_009440	CTC	2	6	204504	204509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303028
3590	NC_009440	TATCC	2	10	204517	204526	20 %	40 %	0 %	40 %	146303028
3591	NC_009440	TCTA	2	8	204655	204662	25 %	50 %	0 %	25 %	146303028
3592	NC_009440	TCC	2	6	204680	204685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303028
3593	NC_009440	ATCT	2	8	204742	204749	25 %	50 %	0 %	25 %	146303028
3594	NC_009440	CCT	2	6	204836	204841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303028
3595	NC_009440	GCA	2	6	204893	204898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303028
3596	NC_009440	TAA	2	6	205004	205009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_009440	GAT	2	6	205031	205036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_009440	AG	3	6	205071	205076	50 %	0 %	50 %	0 %	146303029
3599	NC_009440	GGA	2	6	205122	205127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303029
3600	NC_009440	GGT	2	6	205177	205182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303029
3601	NC_009440	AG	3	6	205263	205268	50 %	0 %	50 %	0 %	146303029
3602	NC_009440	TCC	2	6	205273	205278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303029
3603	NC_009440	AGG	2	6	205536	205541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303030
3604	NC_009440	GAA	2	6	205601	205606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303030
3605	NC_009440	AGA	2	6	205614	205619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303030
3606	NC_009440	GAG	2	6	205647	205652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303031
3607	NC_009440	GAGG	2	8	205667	205674	25 %	0 %	75 %	0 %	146303031
3608	NC_009440	AGA	2	6	205723	205728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303031
3609	NC_009440	GTA	2	6	205786	205791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303031
3610	NC_009440	CCT	2	6	205856	205861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303031
3611	NC_009440	TAC	2	6	205899	205904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303031
3612	NC_009440	AGGA	2	8	205907	205914	50 %	0 %	50 %	0 %	146303031
3613	NC_009440	TGG	2	6	205939	205944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303031
3614	NC_009440	TGG	2	6	206002	206007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146303031
3615	NC_009440	AAAAT	2	10	206032	206041	80 %	20 %	0 %	0 %	146303031
3616	NC_009440	AGG	2	6	206100	206105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146303031
3617	NC_009440	AGGG	2	8	206330	206337	25 %	0 %	75 %	0 %	146303031
3618	NC_009440	GA	3	6	206394	206399	50 %	0 %	50 %	0 %	146303031
3619	NC_009440	GTT	2	6	206550	206555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146303031
3620	NC_009440	TCT	2	6	206633	206638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303031
3621	NC_009440	GAA	2	6	206747	206752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303031
3622	NC_009440	ATG	2	6	206827	206832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146303031
3623	NC_009440	CTA	2	6	206835	206840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303031
3624	NC_009440	ACG	3	9	206917	206925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303031
3625	NC_009440	AAC	2	6	206973	206978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146303031
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3730	NC_009440	TATAC	2	10	213185	213194	40 %	40 %	0 %	20 %	146303037
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3734	NC_009440	ATAC	2	8	213380	213387	50 %	25 %	0 %	25 %	146303037
3735	NC_009440	A	6	6	213409	213414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3736	NC_009440	AT	3	6	213416	213421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3737	NC_009440	AC	3	6	213473	213478	50 %	0 %	0 %	50 %	146303038
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3742	NC_009440	TCA	2	6	213730	213735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303038
3743	NC_009440	TCA	2	6	213743	213748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303038
3744	NC_009440	CAT	2	6	213791	213796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303038
3745	NC_009440	AT	3	6	213823	213828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3746	NC_009440	A	6	6	213866	213871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3747	NC_009440	CGT	2	6	213933	213938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146303039
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3866	NC_009440	ACT	2	6	220895	220900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146303043
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3869	NC_009440	TA	3	6	221029	221034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3870	NC_009440	ACG	2	6	221200	221205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146303044
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3873	NC_009440	AAG	2	6	221367	221372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146303044
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3997	NC_009440	C	6	6	227907	227912	0 %	0 %	0 %	100 %	146303055
3998	NC_009440	TTGC	2	8	227928	227935	0 %	50 %	25 %	25 %	146303055
3999	NC_009440	TTC	2	6	227949	227954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146303055
4000	NC_009440	CTC	2	6	228205	228210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146303055

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