MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV03

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009341	GGT	2	6	65	70	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009341	GCG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
3	NC_009341	CGG	3	9	192	200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
4	NC_009341	ACC	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
5	NC_009341	ATC	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226198
6	NC_009341	GTT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145226198
7	NC_009341	AGC	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226198
8	NC_009341	GCG	2	6	401	406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
9	NC_009341	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
10	NC_009341	GCG	2	6	461	466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
11	NC_009341	GTC	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226198
12	NC_009341	CGG	2	6	603	608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226198
13	NC_009341	CCG	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
14	NC_009341	ACC	2	6	698	703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226198
15	NC_009341	CCG	2	6	815	820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226198
16	NC_009341	TAG	2	6	821	826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226198
17	NC_009341	GTG	3	9	966	974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009341	GCG	2	6	1010	1015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009341	ACC	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_009341	GGC	2	6	1055	1060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009341	TGA	2	6	1169	1174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226199
22	NC_009341	CGT	2	6	1346	1351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
23	NC_009341	GCG	3	9	1358	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
24	NC_009341	TGC	3	9	1374	1382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
25	NC_009341	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
26	NC_009341	CTT	2	6	1397	1402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226199
27	NC_009341	GGC	2	6	1416	1421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226199
28	NC_009341	CCG	2	6	1428	1433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226199
29	NC_009341	GCT	2	6	1486	1491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
30	NC_009341	TGC	2	6	1499	1504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226199
31	NC_009341	CCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226200
32	NC_009341	GCC	2	6	1646	1651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
33	NC_009341	TCA	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226200
34	NC_009341	CGG	2	6	1855	1860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226200
35	NC_009341	GCC	2	6	1869	1874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226200
36	NC_009341	GTC	2	6	1934	1939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
37	NC_009341	TCG	3	9	2112	2120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
38	NC_009341	CTG	2	6	2156	2161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226200
39	NC_009341	CGA	3	9	2170	2178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226200
40	NC_009341	TGG	3	9	2221	2229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226200
41	NC_009341	CAA	2	6	2323	2328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009341	CGC	3	9	2437	2445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
43	NC_009341	GCC	2	6	2471	2476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
44	NC_009341	GCC	2	6	2478	2483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
45	NC_009341	GCT	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226201
46	NC_009341	CCG	2	6	2545	2550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
47	NC_009341	GGC	2	6	2563	2568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
48	NC_009341	GCG	2	6	2569	2574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
49	NC_009341	ATG	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226201
50	NC_009341	GCG	2	6	2621	2626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
51	NC_009341	AGA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226201
52	NC_009341	GGC	2	6	2752	2757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226201
53	NC_009341	CGC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226201
54	NC_009341	GCA	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226201
55	NC_009341	GGT	2	6	3052	3057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009341	AGG	2	6	3062	3067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009341	GAC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
58	NC_009341	ATC	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
59	NC_009341	AGC	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
60	NC_009341	GGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226202
61	NC_009341	GCC	2	6	3289	3294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
62	NC_009341	CGA	2	6	3300	3305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226202
63	NC_009341	ACT	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145226202
64	NC_009341	GTC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
65	NC_009341	CTT	2	6	3492	3497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226202
66	NC_009341	CGC	2	6	3500	3505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
67	NC_009341	GCC	2	6	3518	3523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226202
68	NC_009341	TGC	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226202
69	NC_009341	AGG	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226202
70	NC_009341	GTG	2	6	3706	3711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226202
71	NC_009341	AGA	2	6	3744	3749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226202
72	NC_009341	CGG	2	6	3843	3848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
73	NC_009341	CCG	2	6	3850	3855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226203
74	NC_009341	CGG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
75	NC_009341	GTG	2	6	3879	3884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
76	NC_009341	TGA	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226203
77	NC_009341	CTG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226203
78	NC_009341	CGA	2	6	4064	4069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226203
79	NC_009341	GGC	2	6	4184	4189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
80	NC_009341	GTG	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226203
81	NC_009341	CGG	2	6	4279	4284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226203
82	NC_009341	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226203
83	NC_009341	AGG	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226203
84	NC_009341	GCC	2	6	4672	4677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
85	NC_009341	AGT	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226204
86	NC_009341	CTC	2	6	4765	4770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226204
87	NC_009341	CCG	2	6	4830	4835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226204
88	NC_009341	GCG	2	6	4875	4880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
89	NC_009341	CGG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
90	NC_009341	CGG	2	6	4926	4931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226204
91	NC_009341	AGA	2	6	4995	5000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145226204
92	NC_009341	AGC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
93	NC_009341	ACG	2	6	5079	5084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226204
94	NC_009341	TGG	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226204
95	NC_009341	CGA	2	6	5209	5214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
96	NC_009341	CGA	2	6	5230	5235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
97	NC_009341	CGG	2	6	5268	5273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
98	NC_009341	GCG	2	6	5284	5289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226205
99	NC_009341	CCG	2	6	5380	5385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226205
100	NC_009341	AGG	2	6	5421	5426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226205
101	NC_009341	TGG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226205
102	NC_009341	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145226205
103	NC_009341	TGA	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226205
104	NC_009341	TGC	3	9	5667	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
105	NC_009341	ACG	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
106	NC_009341	GAC	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226205
107	NC_009341	CTG	2	6	5873	5878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
108	NC_009341	TCG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226205
109	NC_009341	CGC	2	6	6039	6044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226206
110	NC_009341	CAC	2	6	6237	6242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226206
111	NC_009341	CAA	2	6	6300	6305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145226206
112	NC_009341	ATC	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009341	GAT	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009341	ACC	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_009341	ACC	2	6	6738	6743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_009341	GCC	2	6	6807	6812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009341	CGA	2	6	6872	6877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009341	GCG	2	6	6881	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009341	CGC	2	6	6887	6892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009341	ACG	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009341	CGC	2	6	6932	6937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_009341	GGC	2	6	6940	6945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009341	GCC	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009341	GCC	2	6	7095	7100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226207
125	NC_009341	CCT	2	6	7105	7110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226207
126	NC_009341	CCA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226207
127	NC_009341	CTG	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226207
128	NC_009341	CCG	2	6	7172	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226207
129	NC_009341	TCG	2	6	7184	7189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226207
130	NC_009341	GCC	2	6	7230	7235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226207
131	NC_009341	ACC	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145226207
132	NC_009341	TTG	2	6	7385	7390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145226207
133	NC_009341	AGG	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145226207
134	NC_009341	GCC	2	6	7446	7451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226207
135	NC_009341	CGA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226207
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137	NC_009341	GAC	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226208
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163	NC_009341	CGT	2	6	8731	8736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226208
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261	NC_009341	GCG	2	6	14075	14080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
262	NC_009341	CGC	2	6	14110	14115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226211
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264	NC_009341	CGG	2	6	14174	14179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
265	NC_009341	GGC	2	6	14188	14193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
266	NC_009341	CGG	2	6	14211	14216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
267	NC_009341	TCG	2	6	14240	14245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145226211
268	NC_009341	GCG	2	6	14249	14254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
269	NC_009341	TGT	2	6	14271	14276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145226211
270	NC_009341	CAG	2	6	14305	14310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226211
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272	NC_009341	CGG	2	6	14400	14405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
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281	NC_009341	GGT	3	9	14599	14607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226211
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290	NC_009341	CGG	2	6	15150	15155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
291	NC_009341	GGT	2	6	15160	15165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226211
292	NC_009341	CGG	2	6	15179	15184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
293	NC_009341	CGG	2	6	15236	15241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
294	NC_009341	CGG	2	6	15252	15257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
295	NC_009341	GCG	2	6	15288	15293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145226211
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297	NC_009341	TCG	2	6	15431	15436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_009341	CCT	2	6	15546	15551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145226212
299	NC_009341	GCA	2	6	15728	15733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226212
300	NC_009341	GCA	2	6	15785	15790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145226212
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302	NC_009341	TGT	2	6	16060	16065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_009341	GTC	2	6	16103	16108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
304	NC_009341	GTC	2	6	16163	16168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_009341	GGT	2	6	16312	16317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145226213
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307	NC_009341	TGA	2	6	16365	16370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145226213
308	NC_009341	CGC	2	6	16392	16397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145226213
309	NC_009341	CTT	2	6	16578	16583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.