MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum PYR-GCK plasmid pMFLV01

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009339	CACGC	2	10	4232	4241	20 %	0 %	20 %	60 %	145225877
2	NC_009339	CCCGG	2	10	5529	5538	0 %	0 %	40 %	60 %	145225878
3	NC_009339	CCCGG	2	10	5661	5670	0 %	0 %	40 %	60 %	145225878
4	NC_009339	GCGCA	2	10	6658	6667	20 %	0 %	40 %	40 %	145225878
5	NC_009339	ACGGC	2	10	9416	9425	20 %	0 %	40 %	40 %	145225878
6	NC_009339	ATCGC	2	10	10277	10286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_009339	CAGGT	2	10	10476	10485	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009339	CTTGG	2	10	10582	10591	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009339	CGGTC	2	10	12540	12549	0 %	20 %	40 %	40 %	145225880
10	NC_009339	AAGCG	2	10	19373	19382	40 %	0 %	40 %	20 %	145225886
11	NC_009339	CGACG	2	10	20952	20961	20 %	0 %	40 %	40 %	145225888
12	NC_009339	TCACT	2	10	22404	22413	20 %	40 %	0 %	40 %	145225890
13	NC_009339	CGACG	2	10	22702	22711	20 %	0 %	40 %	40 %	145225890
14	NC_009339	CTGTC	2	10	24666	24675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_009339	CCGCA	2	10	25072	25081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_009339	TCCGG	2	10	28793	28802	0 %	20 %	40 %	40 %	145225897
17	NC_009339	CGGTG	2	10	28886	28895	0 %	20 %	60 %	20 %	145225897
18	NC_009339	GCCTC	2	10	29047	29056	0 %	20 %	20 %	60 %	145225897
19	NC_009339	CCACG	2	10	30348	30357	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NC_009339	GACTG	2	10	30741	30750	20 %	20 %	40 %	20 %	145225899
21	NC_009339	CGCGG	2	10	34324	34333	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009339	ATGCC	2	10	35973	35982	20 %	20 %	20 %	40 %	145225904
23	NC_009339	AGCGG	2	10	36799	36808	20 %	0 %	60 %	20 %	145225906
24	NC_009339	CGCGT	2	10	44287	44296	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009339	CCAGG	2	10	44620	44629	20 %	0 %	40 %	40 %	145225913
26	NC_009339	GGTCG	2	10	45441	45450	0 %	20 %	60 %	20 %	145225915
27	NC_009339	GAGTT	2	10	45529	45538	20 %	40 %	40 %	0 %	145225915
28	NC_009339	GACCG	2	10	47012	47021	20 %	0 %	40 %	40 %	145225915
29	NC_009339	GTGCC	2	10	47110	47119	0 %	20 %	40 %	40 %	145225915
30	NC_009339	GAATC	2	10	48244	48253	40 %	20 %	20 %	20 %	145225917
31	NC_009339	GGCCG	2	10	51429	51438	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_009339	TGGGG	2	10	52354	52363	0 %	20 %	80 %	0 %	145225921
33	NC_009339	CAGCG	2	10	57211	57220	20 %	0 %	40 %	40 %	145225925
34	NC_009339	CCAGC	2	10	57976	57985	20 %	0 %	20 %	60 %	145225926
35	NC_009339	TGCCC	2	10	58246	58255	0 %	20 %	20 %	60 %	145225926
36	NC_009339	CGCTG	2	10	60053	60062	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009339	GTCTC	2	10	62373	62382	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009339	TGGCC	2	10	62857	62866	0 %	20 %	40 %	40 %	145225933
39	NC_009339	CACCG	2	10	64065	64074	20 %	0 %	20 %	60 %	145225934
40	NC_009339	CACGA	2	10	66788	66797	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009339	GCCAG	2	10	67863	67872	20 %	0 %	40 %	40 %	145225935
42	NC_009339	CAGGA	2	10	68177	68186	40 %	0 %	40 %	20 %	145225935
43	NC_009339	GGGGC	2	10	68927	68936	0 %	0 %	80 %	20 %	145225935
44	NC_009339	CGGGG	2	10	68963	68972	0 %	0 %	80 %	20 %	145225935
45	NC_009339	GCGTA	2	10	70104	70113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009339	CTCGC	2	10	70145	70154	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_009339	GCGCT	2	10	70680	70689	0 %	20 %	40 %	40 %	145225937
48	NC_009339	CCGTG	2	10	72366	72375	0 %	20 %	40 %	40 %	145225938
49	NC_009339	ACGGC	2	10	73722	73731	20 %	0 %	40 %	40 %	145225939
50	NC_009339	GACCG	2	10	74068	74077	20 %	0 %	40 %	40 %	145225939
51	NC_009339	CGGGG	2	10	77896	77905	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_009339	GCACG	2	10	78813	78822	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009339	CCGTG	2	10	79829	79838	0 %	20 %	40 %	40 %	145225946
54	NC_009339	GCGCA	2	10	80359	80368	20 %	0 %	40 %	40 %	145225947
55	NC_009339	AGCGT	2	10	81483	81492	20 %	20 %	40 %	20 %	145225948
56	NC_009339	TGATC	2	10	85266	85275	20 %	40 %	20 %	20 %	145225951
57	NC_009339	CCCTG	2	10	86725	86734	0 %	20 %	20 %	60 %	145225952
58	NC_009339	CACCT	2	10	88750	88759	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_009339	CGGGC	2	10	90633	90642	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009339	AGCAG	2	10	92434	92443	40 %	0 %	40 %	20 %	145225955
61	NC_009339	GGCGC	2	10	94551	94560	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
62	NC_009339	GCGCT	2	10	94597	94606	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_009339	CGCGC	2	10	96619	96628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009339	ATGTC	2	10	97777	97786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009339	CAGCG	2	10	99464	99473	20 %	0 %	40 %	40 %	145225962
66	NC_009339	CCAGC	2	10	100230	100239	20 %	0 %	20 %	60 %	145225963
67	NC_009339	ACTCA	2	10	101248	101257	40 %	20 %	0 %	40 %	145225964
68	NC_009339	CGAGT	2	10	104586	104595	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009339	CACCG	2	10	108026	108035	20 %	0 %	20 %	60 %	145225970
70	NC_009339	TCGTC	2	10	109426	109435	0 %	40 %	20 %	40 %	145225970
71	NC_009339	CGCGA	2	10	110215	110224	20 %	0 %	40 %	40 %	145225971
72	NC_009339	GGCTC	2	10	110361	110370	0 %	20 %	40 %	40 %	145225971
73	NC_009339	GAATG	2	10	110570	110579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009339	GCACC	2	10	111399	111408	20 %	0 %	20 %	60 %	145225972
75	NC_009339	GCCCA	2	10	111820	111829	20 %	0 %	20 %	60 %	145225972
76	NC_009339	CGGCG	2	10	113235	113244	0 %	0 %	60 %	40 %	145225973
77	NC_009339	CTGCC	2	10	113366	113375	0 %	20 %	20 %	60 %	145225973
78	NC_009339	CGGGG	2	10	117222	117231	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009339	ACCAC	2	10	117584	117593	40 %	0 %	0 %	60 %	145225977
80	NC_009339	GCCGC	2	10	117845	117854	0 %	0 %	40 %	60 %	145225977
81	NC_009339	CCGTG	2	10	119143	119152	0 %	20 %	40 %	40 %	145225979
82	NC_009339	GCGCA	2	10	119673	119682	20 %	0 %	40 %	40 %	145225980
83	NC_009339	CCAGA	2	10	120774	120783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009339	CGGTG	2	10	121658	121667	0 %	20 %	60 %	20 %	145225982
85	NC_009339	GGACG	2	10	126529	126538	20 %	0 %	60 %	20 %	145225986
86	NC_009339	CCAGC	2	10	126602	126611	20 %	0 %	20 %	60 %	145225986
87	NC_009339	CGGTG	2	10	127786	127795	0 %	20 %	60 %	20 %	145225989
88	NC_009339	GCCGC	2	10	132175	132184	0 %	0 %	40 %	60 %	145225993
89	NC_009339	CGTTC	2	10	134053	134062	0 %	40 %	20 %	40 %	145225994
90	NC_009339	AACTG	2	10	136018	136027	40 %	20 %	20 %	20 %	145225996
91	NC_009339	CGCGG	2	10	136080	136089	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_009339	TTCGA	2	10	138818	138827	20 %	40 %	20 %	20 %	145225999
93	NC_009339	TGATC	2	10	140923	140932	20 %	40 %	20 %	20 %	145226000
94	NC_009339	CCCTG	2	10	142382	142391	0 %	20 %	20 %	60 %	145226001
95	NC_009339	CACCT	2	10	142971	142980	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_009339	ACGGC	2	10	144210	144219	20 %	0 %	40 %	40 %	145226002
97	NC_009339	GCGCG	2	10	145770	145779	0 %	0 %	60 %	40 %	145226005
98	NC_009339	GCAGC	2	10	150160	150169	20 %	0 %	40 %	40 %	145226010
99	NC_009339	CGGCC	2	10	151654	151663	0 %	0 %	40 %	60 %	145226010
100	NC_009339	CCCGC	2	10	154960	154969	0 %	0 %	20 %	80 %	145226012
101	NC_009339	TGCAA	2	10	156736	156745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009339	ACGCC	2	10	156828	156837	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_009339	CCGCG	2	10	157003	157012	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_009339	CACCG	2	10	157645	157654	20 %	0 %	20 %	60 %	145226014
105	NC_009339	CGCCC	2	10	158229	158238	0 %	0 %	20 %	80 %	145226014
106	NC_009339	TCCAC	2	10	158438	158447	20 %	20 %	0 %	60 %	145226014
107	NC_009339	GCACC	2	10	158572	158581	20 %	0 %	20 %	60 %	145226014
108	NC_009339	CCCTC	2	10	158626	158635	0 %	20 %	0 %	80 %	145226015
109	NC_009339	TCGCA	2	10	159134	159143	20 %	20 %	20 %	40 %	145226015
110	NC_009339	GCCGC	2	10	159155	159164	0 %	0 %	40 %	60 %	145226015
111	NC_009339	TGCCG	2	10	160262	160271	0 %	20 %	40 %	40 %	145226016
112	NC_009339	GGTCC	2	10	160969	160978	0 %	20 %	40 %	40 %	145226016
113	NC_009339	ACGCG	2	10	161847	161856	20 %	0 %	40 %	40 %	145226017
114	NC_009339	GCGCC	2	10	163517	163526	0 %	0 %	40 %	60 %	145226019
115	NC_009339	AGACG	2	10	167414	167423	40 %	0 %	40 %	20 %	145226022
116	NC_009339	GCGCC	2	10	168743	168752	0 %	0 %	40 %	60 %	145226023
117	NC_009339	GCCCA	2	10	168851	168860	20 %	0 %	20 %	60 %	145226023
118	NC_009339	CTCCA	2	10	169078	169087	20 %	20 %	0 %	60 %	145226023
119	NC_009339	CACGA	2	10	170091	170100	40 %	0 %	20 %	40 %	145226025
120	NC_009339	ACTGA	2	10	170338	170347	40 %	20 %	20 %	20 %	145226025
121	NC_009339	AACGC	2	10	171927	171936	40 %	0 %	20 %	40 %	145226027
122	NC_009339	TCCCG	2	10	172188	172197	0 %	20 %	20 %	60 %	145226028
123	NC_009339	ACCTC	2	10	173284	173293	20 %	20 %	0 %	60 %	145226029
124	NC_009339	CCCGG	2	10	173584	173593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
125	NC_009339	GCCTG	2	10	173606	173615	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_009339	GAACC	2	10	174839	174848	40 %	0 %	20 %	40 %	145226030
127	NC_009339	ACCCC	2	10	174854	174863	20 %	0 %	0 %	80 %	145226030
128	NC_009339	GTGGG	2	10	175285	175294	0 %	20 %	80 %	0 %	145226031
129	NC_009339	GGCAT	2	10	175767	175776	20 %	20 %	40 %	20 %	145226031
130	NC_009339	CGCGG	2	10	175865	175874	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
131	NC_009339	GCGCC	2	10	176962	176971	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_009339	GGTGA	2	10	179610	179619	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009339	GTCGA	2	10	181257	181266	20 %	20 %	40 %	20 %	145226039
134	NC_009339	GGACT	2	10	181352	181361	20 %	20 %	40 %	20 %	145226039
135	NC_009339	GTCGA	2	10	182195	182204	20 %	20 %	40 %	20 %	145226040
136	NC_009339	CGGGC	2	10	182520	182529	0 %	0 %	60 %	40 %	145226041
137	NC_009339	GGGGC	2	10	186992	187001	0 %	0 %	80 %	20 %	145226045
138	NC_009339	ACGCG	2	10	187497	187506	20 %	0 %	40 %	40 %	145226045
139	NC_009339	AGGTG	2	10	187695	187704	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009339	CTGCG	2	10	189586	189595	0 %	20 %	40 %	40 %	145226048
141	NC_009339	TGGGG	2	10	190336	190345	0 %	20 %	80 %	0 %	145226048
142	NC_009339	TGGCG	2	10	190990	190999	0 %	20 %	60 %	20 %	145226049
143	NC_009339	GTGCC	2	10	191878	191887	0 %	20 %	40 %	40 %	145226049
144	NC_009339	CCGCA	2	10	192018	192027	20 %	0 %	20 %	60 %	145226049
145	NC_009339	GGCCG	2	10	192198	192207	0 %	0 %	60 %	40 %	145226049
146	NC_009339	GCGGA	2	10	194838	194847	20 %	0 %	60 %	20 %	145226051
147	NC_009339	CGGCG	2	10	196583	196592	0 %	0 %	60 %	40 %	145226054
148	NC_009339	GCGCT	2	10	196605	196614	0 %	20 %	40 %	40 %	145226054
149	NC_009339	GTGAT	2	10	197001	197010	20 %	40 %	40 %	0 %	145226054
150	NC_009339	ACTTC	2	10	198399	198408	20 %	40 %	0 %	40 %	145226056
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152	NC_009339	AGTCC	2	10	199263	199272	20 %	20 %	20 %	40 %	145226056
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156	NC_009339	AACCG	2	10	205435	205444	40 %	0 %	20 %	40 %	145226059
157	NC_009339	AACCC	2	10	206965	206974	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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159	NC_009339	ACCCG	2	10	211787	211796	20 %	0 %	20 %	60 %	145226065
160	NC_009339	ACCAC	2	10	211854	211863	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
161	NC_009339	CCGCG	2	10	213020	213029	0 %	0 %	40 %	60 %	145226067
162	NC_009339	CGACA	2	10	213197	213206	40 %	0 %	20 %	40 %	145226067
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175	NC_009339	GCTCG	2	10	231244	231253	0 %	20 %	40 %	40 %	145226087
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177	NC_009339	CGGTC	2	10	234971	234980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
178	NC_009339	CCGTC	2	10	235538	235547	0 %	20 %	20 %	60 %	145226090
179	NC_009339	CTGGG	2	10	236757	236766	0 %	20 %	60 %	20 %	145226092
180	NC_009339	ACACC	2	10	237324	237333	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
181	NC_009339	ACCAC	2	10	237367	237376	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
182	NC_009339	ACACC	2	10	237506	237515	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
183	NC_009339	TCATC	2	10	237879	237888	20 %	40 %	0 %	40 %	145226093
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189	NC_009339	GATCA	2	10	242977	242986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
190	NC_009339	CGGCA	2	10	244394	244403	20 %	0 %	40 %	40 %	145226099
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192	NC_009339	GGCGC	2	10	247667	247676	0 %	0 %	60 %	40 %	145226103
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197	NC_009339	ACGCA	2	10	252008	252017	40 %	0 %	20 %	40 %	145226106
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199	NC_009339	CTGTC	2	10	253499	253508	0 %	40 %	20 %	40 %	145226107
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216	NC_009339	TCGAG	2	10	278288	278297	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
217	NC_009339	CGGGG	2	10	278995	279004	0 %	0 %	80 %	20 %	145226128
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246	NC_009339	CGCGT	2	10	315863	315872	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
247	NC_009339	TGATC	2	10	316253	316262	20 %	40 %	20 %	20 %	145226162
248	NC_009339	CTGGC	2	10	316854	316863	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
249	NC_009339	CTGTG	2	10	317291	317300	0 %	40 %	40 %	20 %	145226163

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.